Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35390 LG10 21508283 21509251 PREDICTED: mitogen-activated protein kinase kinase 10
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   MAPK cascade
Cellular Component   is active in   cytoplasm
Molecular Function   enables   MAP kinase kinase activity, MAP kinase kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, MAP kinase kinase activity, protein serine/threonine kinase activity
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 21508595 synonymous_variant p.Thr219Thr
C/G 21508809 missense_variant p.Arg148Thr
T/A 21508810 stop_gained p.Arg148*
C/G 21508811 missense_variant p.Leu147Phe
C/T 21508922 synonymous_variant p.Val110Val
G/T 21509109 stop_gained p.Ser48*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35390.1
MTLVIRERRHKQALRLSLPKSPSIPSSNSDSPHQIHVHSSPGMIKDLSHLEKREVLGHGNGGTVYKVYHKKTSSFYALKVLRLNENGFGIRQTAKLEADILKRVDSPYIVKCHAVFDSCNSNNDGDNGGDISFVMEYMEGGSLNDVLRIHHRLSEKVISVLGRRVLEGLRYLHGMNIVHRDIKPSNLLVNDKGEVKIADFGVSHVVEGRFEGNEYDAGTCAYMSPERIDPERWGGENADEFAGDVWSMGVVMLECLLGYFPLIGAGQRPDWATLMCAICFGEKLEMPEKASPEFQNFVRRCLEKNWRKRATVLELLHHPFVS*


CDS Sequence:
>Vu_35390.1
ATGACATTGGTTATCAGAGAGAGGAGACACAAGCAAGCTCTGAGGCTTTCATTACCAAAATCTCCTTCAATCCCATCGTCAAATTCAGATTCCCCTCACCAAATTCATGTACACTCTTCTCCCGGCATGATTAAGGATCTTTCGCATCTTGAAAAGCGAGAAGTTCTTGGCCATGGTAATGGTGGCACAGTTTACAAAGTTTATCACAAAAAAACCAGCTCCTTTTATGCCTTGAAAGTGCTACGTTTGAATGAGAATGGCTTTGGCATTCGCCAAACCGCTAAACTGGAGGCTGACATTCTAAAACGAGTGGATTCACCGTATATAGTGAAGTGTCATGCAGTTTTTGACAGTTGTAATAGCAATAATGATGGCGACAACGGAGGTGACATTAGCTTTGTTATGGAATACATGGAAGGAGGGTCGTTGAATGATGTATTGAGAATACATCATAGACTGTCAGAAAAGGTTATCTCGGTGTTGGGTAGGCGTGTTTTGGAAGGACTTAGGTATTTACATGGCATGAACATTGTGCACAGAGATATTAAACCATCAAACTTACTTGTGAACGATAAAGGGGAGGTAAAGATTGCAGATTTTGGAGTGAGTCATGTGGTGGAAGGTAGGTTTGAAGGAAATGAGTACGATGCAGGCACCTGTGCTTACATGAGTCCAGAAAGGATTGATCCAGAAAGATGGGGTGGTGAAAATGCAGATGAGTTTGCAGGAGATGTGTGGTCAATGGGAGTAGTAATGTTGGAATGTCTTTTGGGTTATTTTCCATTGATTGGAGCAGGGCAGAGACCAGATTGGGCAACTTTGATGTGTGCAATTTGCTTTGGTGAGAAGCTGGAGATGCCAGAAAAAGCATCACCAGAGTTTCAAAATTTTGTGAGGAGGTGTCTTGAGAAGAATTGGAGGAAGAGAGCAACAGTGTTAGAACTTCTGCATCACCCTTTTGTGAGTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_35390::LG10:21509251-21511251(-)
ATAACTTTGTCTAAAGTCATTTAAGTGATGTTTGCACTTAATGTGTGAGGTTATGGAATGTTGTGATTTGAGAATATATATTTTAAATTTCTCATCTTCAAGTCTTGCATAAGCAATTTATACAAAATTAAAAGAATTATTTCTCACATAAAACAATGGTTTAATAAATGTGTCACCCAAAGACAATACATATGTTAGCGTGGTCTAAAGCATAAAACAAATGTGATGAAAAATAGATTGAAAACCGTGATCATTCCTAAGATTTTAATCTACGGTTTTGAAAATTTAATTATATAAAAAATCATGACTAATTACTTACGACCATACAAACCTAGTCCACAGTTGGAAAATCATAACCTAAATTTTAGGCTACGATTTTAATGTTTTATGCTATAGTTTTGGCTCTAGCGTGAAGTGATTTTTGTTATAGTAACTAATACATGTGAGATTGATGTATTAATTATTTTATTGACTTAGGAATTCGCATTGCTTGGGATGACTGTTTTCTACACATGACTGTATGATGTTAAATATCATAAGTTGACACCCAAAGTGTTCCATCAGAACCCAGCAATAATACTTCTTTGTATTTAAAAAAAAAAAAAAAGTTAGGATTGCATGTTTTATCAATTACCAATTTATGTTGAACAATTTGGCTAAGAAAAATATAGTGGACTTTTTCTCTAGTTTTCCGTTTAAATTTAAAACTTTGTTTAAAGAATTTTAATATCTTTTACATCAACAACTTAAGATTTGTACTGATATTTTAATTTATTAAGTTATTAAATGTACACAGTTTTTTGCACGTAACTTTTACCTTTCGAAATTATGCATATCTAATAAGAAAACAAAATGCTAACAACATACTCTATTGGACTCTATTCATGACTCAAATTTTATTACAATTACAGAATATTATAAATCCACTTCTTGATAAGTCTCTATCCTCATTTTGTAACTTTTAATAAAACGTGTTCGAACTCGCCATGAAAAAAATGTGTTTGCTCCTTCACATACAAAGACAGTGTGTTATATATATTGTTATTATGCAGTGAGCAGATACTAATTTACCTTCATAAAAAAATTTATCTGCAACTATTATTCTTGGTTCTTTTTACCCTGAACACTCATCTCTAGGAAGATAATTTGTTGCAGACCTTTTATATTTTATTTTTCATCATCTATTTTTCCTTATAAATATAAAAATACATCTTTTTAATAATTATATTATCCTTAAAAGTAACTAGTTAAATGGCTGATATATATAGAGTGTGAAAACATATTTTCTCAAATTTCTTTCAAAGCCATGGCACCATATTATTCATCAAAGTTCCAGTTTGCACACTCACATTAAATGATCTCTGCAACTCTTGTCATTATATAGGTTAAAAAAAACATGCAGAATTTGTAAATGGTGAGTGAAAACCACAATGTTATTTTGGTTTGGCCTTGAAGTTAGGGTTTTGATACGAAAAATCTTATTTAATTGGATCCTGACTGCTCGGGCATTAATTCTATTTATTTCATCATTTGGGGTTATGTCACTGCTTTGCATGCTTCCATTCTCCACAATCGCACCATCATTCCTTTGTAATGATTTCTCCAACTTACACACTATAGTTAGGTGTGCATGATGGCCACCTTCATCCTAACTTTAACAAACACCGCAGGGTTAGAGATGCACATGTTTAACCAGAACCATGAAATTTGAGATTTTAACTAAATTTGGAACTGAATTCAAGTAAATTGTTAAAAAAGATAAATAAACAACAATTATCACGACCATGCAGTGATATGTAAGCTCTGATATATCACCACCAAAACCTCACCTGTCCATTCATTTCGGTAACACTTGTCATCACTCTTGTAAGCCAAAATTTACAGTCAAGCACGTGGCTTTCTTTTATGGAAAAATTTCCCTTTCTTCCATTCTTTAAACCCCATTTTTTATTTTTTCTTTGTTTAGGCTCAGAGAGTGTTTTCAAGTGTGAACCACGTAA


Gene Sequence:
>Vu_35390(-)
ATGACATTGGTTATCAGAGAGAGGAGACACAAGCAAGCTCTGAGGCTTTCATTACCAAAATCTCCTTCAATCCCATCGTCAAATTCAGATTCCCCTCACCAAATTCATGTACACTCTTCTCCCGGCATGATTAAGGATCTTTCGCATCTTGAAAAGCGAGAAGTTCTTGGCCATGGTAATGGTGGCACAGTTTACAAAGTTTATCACAAAAAAACCAGCTCCTTTTATGCCTTGAAAGTGCTACGTTTGAATGAGAATGGCTTTGGCATTCGCCAAACCGCTAAACTGGAGGCTGACATTCTAAAACGAGTGGATTCACCGTATATAGTGAAGTGTCATGCAGTTTTTGACAGTTGTAATAGCAATAATGATGGCGACAACGGAGGTGACATTAGCTTTGTTATGGAATACATGGAAGGAGGGTCGTTGAATGATGTATTGAGAATACATCATAGACTGTCAGAAAAGGTTATCTCGGTGTTGGGTAGGCGTGTTTTGGAAGGACTTAGGTATTTACATGGCATGAACATTGTGCACAGAGATATTAAACCATCAAACTTACTTGTGAACGATAAAGGGGAGGTAAAGATTGCAGATTTTGGAGTGAGTCATGTGGTGGAAGGTAGGTTTGAAGGAAATGAGTACGATGCAGGCACCTGTGCTTACATGAGTCCAGAAAGGATTGATCCAGAAAGATGGGGTGGTGAAAATGCAGATGAGTTTGCAGGAGATGTGTGGTCAATGGGAGTAGTAATGTTGGAATGTCTTTTGGGTTATTTTCCATTGATTGGAGCAGGGCAGAGACCAGATTGGGCAACTTTGATGTGTGCAATTTGCTTTGGTGAGAAGCTGGAGATGCCAGAAAAAGCATCACCAGAGTTTCAAAATTTTGTGAGGAGGTGTCTTGAGAAGAATTGGAGGAAGAGAGCAACAGTGTTAGAACTTCTGCATCACCCTTTTGTGAGTTAA