Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35316 LG10 20443881 20447043 PREDICTED: disease resistance protein RPM1-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09159 Environmental adaptation   C 04626 Plant-pathogen interaction [PATH:ko04626]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 20443952 5_prime_UTR_variant
T/C 20443954 5_prime_UTR_variant
A/G 20444518 missense_variant p.Asn177Ser
T/C 20444750 synonymous_variant p.Ser254Ser
C/A 20444898 missense_variant p.Arg304Ser
G/T 20445209 synonymous_variant p.Val407Val
C/T 20445218 synonymous_variant p.Leu410Leu
C/G 20445536 missense_variant p.Asp516Glu
C/G 20445623 synonymous_variant p.Arg545Arg
T/A 20445769 missense_variant p.Leu594His
C/A 20445989 synonymous_variant p.Ala667Ala
C/T 20446070 synonymous_variant p.Leu694Leu
C/T 20446079 synonymous_variant p.Leu697Leu
A/G 20446082 synonymous_variant p.Arg698Arg
G/A 20446085 synonymous_variant p.Arg699Arg
T/A 20446088 synonymous_variant p.Leu700Leu
C/T 20446094 synonymous_variant p.Ile702Ile
A/C 20446095 synonymous_variant p.Arg703Arg
G/A 20446100 synonymous_variant p.Lys704Lys
G/A 20446105 missense_variant p.Arg706Lys
C/A 20446110 missense_variant p.Gln708Lys
A/C 20446818 3_prime_UTR_variant
G/A 20446929 3_prime_UTR_variant
T/A 20446935 3_prime_UTR_variant
A/T 20446956 3_prime_UTR_variant
T/C 20446979 3_prime_UTR_variant
G/A 20446987 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35316.1
MADSSVSFLLDKLNALLQEEVNLQRGVREDVQYIKYELERHKAILRVADAMEDRDPELKAWVKGVRCVAHDMEDAIDEFNLRLVDQHGQGNGSSLHRFTFGLKTMKARRRIALDMQSIKSKVNVISQGRPELPGIGSRSSQRLSSSLDSQGDALLLEEADLVGIDKPKRQLCDLLFNEEPGRAVIPIYGMGGLGKTTLAKQVYDDPKVKKRFRIHAWINVSQSFKLQELLKDLVQQLHNVIGKPAPEAVGQMKSEELKELIKNLLQSSRYLIVLDDVWHVKVWDSVKLALPSSSRGSRVMITTRKKDIALYSCAELGKDFDHEFLPEEEAWYLFCKKTFQGNSCPPHLEEVCRKILKMCGGLPLAIVAIGGALATRQRANIEEWQMVCRSFGSEIEGNDKLEDMKKVLSLSFNELPYYLKSCLLYLSIFPEFHAIEHMRLIRLWIAEGFVNGEDGKTREEVADSYLKELLDRSLLQVVAKTSDGRMKTCRMHDLLREIVNLKAKDQNFATIAKDQDIIWPDKVRRLSIINTLDNVRQNRASFQLRSLLMFDLSDPLEHFSIRGLCSTGYKLIRVLDLQDAPLEVFPAEIVNLYLLKYLSLKNTKVKSIPGTIKKLQQLETLDLKQSLVTVLPVEIVELQQLRHLLVYRYEIESYAYFHSRHGFKVAAPIGLMRSLQKLCFIEADQALMVELGKLTQLRRLGIRKMRQQDGAALSLSIEKMINLRSLSITAIEKHEIIDIHNIFRPPPYLHQLYLSGRLDIFPHWISSMKNLVRVFLKWSRLTEDPLVHLQDLPNLRHLEFLQVYVGETLNFKAKGFPSLKVLGLDDLDELKSMTVEEGAMPGLKRLIIQRCGSLKQLPFGIEHLTKLKSIEFFDMPEELITRLHPKGGQDYLRAKNVPAVYSSYWRDGGWDVYSLETLEERETDFNRSTAVRSLENCPLWKV*


CDS Sequence:
>Vu_35316.1
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Promoter Sequence:
>Vu_35316::LG10:20441881-20443881(+)
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Gene Sequence:
>Vu_35316(+)
ATAAATCCCAAGATCAAATCCTACAAACTGTTTCTATTCTTATACACAAAAAATCGACCCAGAAATCTCATGATAAAGTTCTGCAACAACTCTTGGAATTAGAAAAAAATGGCAGATAGTTCAGTATCGTTTTTACTGGACAAGCTGAATGCTTTACTTCAAGAAGAAGTGAATCTGCAGAGAGGGGTTCGGGAAGATGTTCAGTACATCAAATATGAGCTTGAACGTCACAAAGCCATCTTAAGGGTGGCTGATGCTATGGAGGACAGAGACCCTGAACTCAAAGCATGGGTCAAAGGAGTGAGATGTGTTGCTCATGACATGGAAGATGCCATAGACGAATTCAACCTTCGCCTTGTTGATCAACATGGACAAGGCAACGGTTCTTCTCTTCATAGGTTTACTTTCGGCCTTAAGACCATGAAAGCTCGGCGTAGAATTGCTTTAGATATGCAAAGTATCAAATCCAAAGTGAACGTTATATCCCAGGGACGACCAGAGTTACCTGGGATAGGCTCCAGGTCAAGTCAACGGCTTTCTTCAAGCCTTGATAGCCAAGGAGATGCGCTTCTGCTTGAAGAAGCTGATCTGGTGGGTATTGACAAACCCAAAAGGCAGCTTTGTGATTTGCTTTTCAATGAAGAACCAGGGAGGGCTGTGATTCCAATCTATGGAATGGGAGGGTTGGGAAAAACCACCTTGGCAAAACAGGTCTATGATGATCCAAAAGTGAAGAAGCGTTTTAGGATTCATGCTTGGATTAACGTTTCTCAGTCTTTTAAGCTACAAGAGCTCCTTAAAGACCTGGTTCAACAGCTGCATAATGTCATTGGAAAACCAGCTCCGGAAGCAGTTGGGCAAATGAAAAGTGAGGAGCTCAAAGAGTTGATCAAGAACTTGCTTCAAAGTAGCAGGTACCTCATTGTGCTGGATGATGTGTGGCATGTAAAGGTATGGGATTCTGTCAAACTTGCTTTGCCTAGTAGCAGCCGTGGAAGTAGAGTGATGATTACTACACGCAAAAAAGATATAGCTTTGTATTCTTGTGCTGAACTGGGTAAGGATTTTGACCATGAATTCTTACCTGAGGAAGAAGCTTGGTATCTTTTCTGCAAGAAAACATTTCAGGGTAACTCATGTCCTCCTCATCTGGAGGAGGTTTGCAGAAAGATCTTAAAAATGTGTGGTGGGTTGCCACTAGCAATTGTGGCAATTGGTGGTGCTTTGGCTACCAGACAGAGGGCAAACATTGAAGAGTGGCAGATGGTTTGCAGAAGTTTTGGGTCTGAAATTGAAGGCAATGACAAACTGGAGGATATGAAGAAAGTGCTTTCCCTCAGTTTCAATGAGTTGCCTTACTATCTTAAATCCTGTTTGTTGTACCTAAGCATCTTCCCTGAGTTTCATGCTATTGAGCACATGAGACTGATTCGCTTGTGGATTGCTGAAGGTTTTGTGAATGGTGAAGATGGAAAGACAAGGGAGGAAGTTGCTGACAGTTATCTCAAGGAGCTCTTGGACAGAAGTCTGCTGCAAGTTGTTGCAAAAACCAGTGATGGCAGAATGAAGACTTGTCGAATGCATGATCTTCTAAGGGAGATTGTGAATTTGAAGGCAAAAGATCAAAACTTTGCGACAATAGCCAAAGATCAAGACATAATCTGGCCAGACAAAGTTCGACGCCTATCAATCATAAATACATTGGATAATGTGCGACAAAATAGAGCTTCATTCCAACTACGCTCTCTACTAATGTTTGACTTATCAGATCCACTGGAGCATTTTTCTATACGTGGATTATGTTCCACTGGTTATAAGTTAATCAGGGTGTTAGATTTGCAGGATGCACCATTGGAGGTTTTCCCTGCTGAAATTGTCAACCTTTACCTTCTCAAGTATCTGAGTCTGAAGAATACAAAGGTGAAAAGCATTCCAGGTACTATTAAGAAGCTGCAGCAGCTAGAGACACTGGATCTTAAACAATCCCTGGTCACTGTACTACCAGTTGAAATTGTGGAGCTGCAACAATTACGACATCTTTTGGTGTATCGCTATGAGATTGAATCTTATGCTTATTTCCATTCAAGGCACGGCTTCAAGGTGGCTGCCCCTATAGGACTCATGAGATCTTTGCAAAAGCTATGTTTTATAGAGGCAGACCAGGCTTTGATGGTTGAGCTAGGAAAACTCACTCAACTCAGAAGGCTTGGCATCAGAAAGATGAGGCAACAAGATGGTGCTGCTTTAAGTTTATCCATTGAGAAGATGATCAATCTCCGCTCACTGTCCATCACAGCAATTGAAAAACATGAGATAATTGATATTCACAACATTTTCAGGCCTCCTCCTTATCTCCACCAGTTATACTTGAGTGGCCGTTTAGACATTTTCCCCCACTGGATAAGTTCTATGAAGAATTTGGTCAGAGTGTTTCTTAAATGGAGCAGGCTAACAGAGGATCCTCTGGTACACCTTCAAGATTTGCCAAATCTAAGACATCTGGAATTTCTTCAAGTTTATGTAGGTGAGACATTGAATTTCAAGGCTAAAGGGTTTCCTAGTCTGAAGGTTTTAGGCCTTGATGATTTAGATGAACTCAAATCTATGACTGTGGAGGAGGGAGCAATGCCTGGTCTTAAAAGGCTCATCATCCAACGCTGTGGTTCACTGAAGCAGCTACCCTTTGGCATTGAACATCTAACAAAACTAAAATCAATTGAGTTTTTTGACATGCCTGAAGAATTGATCACAAGACTGCATCCAAAAGGAGGTCAAGATTATTTGAGAGCTAAAAATGTTCCAGCAGTTTATTCCTCATATTGGAGGGATGGAGGTTGGGATGTGTACTCATTGGAGACTCTAGAGGAGCGAGAGACTGATTTCAATCGCAGTACTGCAGTGAGAAGTCTTGAAAATTGTCCTCTCTGGAAGGTTTAAATCTCATTTTTTCTATTCTAACATGCATATGTGAGTGATGACAAGTTTTTGTTTCACATCTGCTTGCATATGCTAATGAATTCAGTCTTTCATTTCTGCAGTCATTTCACTGCAAATTCTTAAACTTTCTACCAAATAATTCAGGGAGCATTATCTGTTTCTTGAACATGTATTCTGAGGTTAATGAATAAAATAAAGTGTTCAACTTTTAGCTTTTGAATGTTTC