Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35291 LG10 20149248 20152822 PREDICTED: growth-regulating factor 4-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 20149269 3_prime_UTR_variant
G/T 20149551 3_prime_UTR_variant
A/G 20149594 3_prime_UTR_variant
G/C 20149707 missense_variant p.Thr313Ser
A/C 20149775 synonymous_variant p.Gly290Gly
T/A 20150043 splice_region_variant&intron_variant
C/G 20150141 intron_variant
C/G 20150154 intron_variant
A/T 20150155 intron_variant
T/A 20150156 intron_variant
A/C 20150164 intron_variant
G/A 20150198 intron_variant
G/A 20150293 intron_variant
T/C 20150303 intron_variant
G/C 20150420 intron_variant
G/A 20150584 intron_variant
A/G 20150673 intron_variant
A/C 20150704 intron_variant
G/T 20150876 intron_variant
C/T 20150882 intron_variant
G/A 20151057 intron_variant
A/G 20151108 intron_variant
G/A 20151300 intron_variant
T/A 20151401 intron_variant
A/G 20151406 intron_variant
A/T 20151489 intron_variant
T/C 20151579 intron_variant
T/C 20151593 intron_variant
G/A 20151736 intron_variant
C/T 20151803 intron_variant
G/T 20152027 synonymous_variant p.Pro180Pro
T/G 20152030 synonymous_variant p.Thr179Thr
A/G 20152261 synonymous_variant p.Arg102Arg
G/A 20152381 synonymous_variant p.Tyr62Tyr
A/G 20152428 intron_variant
C/T 20152438 intron_variant
G/T 20152532 missense_variant p.Pro40Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35291.1
MSVPPPSTAAMWTPFTAAQWHELEHQALIFKYLKAGLSVPPDLLLPIRKSLQFMAHPSLGGYYGKKIDPEPGRCRRTDGKKWRCSRDAHPDSKYCDRHMIRRRYRSRKPVESQPHSSSASSNPVAASASAASSATGSATSSATGSAAASATTLNTLPLHTNGAREGFTFTLGNSATTATPTLPHLHMDPLTLSGDNTKKTYRFGLNSEADEHVLQKDLGSVRYQGYDFTSDSMWSHMSPIPSSTVSESRSGSTMLGNCFQQQTMRDAELLNLETARTKDLIFSSQLSSAGSLKQEYQSPQSLFSDWDWKKDLTSSAIEYRPNKDFNCNPDANVD*


CDS Sequence:
>Vu_35291.1
ATGAGCGTTCCTCCGCCGTCCACGGCGGCGATGTGGACGCCGTTCACGGCGGCCCAGTGGCACGAGCTGGAGCACCAGGCTCTCATCTTCAAGTACCTCAAGGCGGGGCTCTCCGTTCCGCCCGACCTCCTTCTCCCCATTCGCAAGAGCCTCCAATTCATGGCACACCCATCTCTTGGGGGGTACTATGGGAAGAAGATAGACCCTGAACCGGGTCGGTGCAGGAGAACCGATGGGAAGAAGTGGAGGTGTTCGAGGGATGCTCACCCTGACTCCAAGTACTGCGACCGCCATATGATACGACGTCGTTACCGTTCAAGAAAGCCTGTGGAATCTCAACCTCACTCTTCTTCTGCTTCTTCAAACCCTGTTGCTGCTTCTGCTTCTGCTGCTTCCTCTGCAACGGGTTCTGCTACATCTTCTGCAACTGGTTCTGCTGCTGCATCTGCGACAACCCTCAACACCCTTCCTTTGCATACCAATGGTGCTCGGGAGGGTTTCACTTTCACCCTTGGGAACAGCGCCACCACTGCCACACCCACACTCCCCCACCTTCACATGGACCCCCTCACTCTTTCAGGTGACAACACCAAGAAAACTTACCGGTTTGGACTGAACTCAGAAGCAGATGAACACGTCTTACAGAAAGATCTGGGAAGTGTGAGATATCAAGGTTATGACTTCACCTCAGACAGCATGTGGTCTCATATGTCTCCAATTCCATCAAGTACTGTTTCGGAATCGAGAAGTGGTTCTACCATGCTGGGCAACTGCTTCCAACAGCAAACAATGCGAGATGCCGAGCTGTTGAACCTTGAAACTGCAAGGACCAAAGACCTTATATTTAGTAGCCAGTTAAGTTCAGCAGGTAGTTTGAAACAGGAATATCAGTCTCCTCAGTCTCTCTTCAGTGACTGGGACTGGAAGAAGGATTTAACTTCCTCTGCCATCGAGTATAGACCCAACAAGGATTTTAACTGCAATCCAGATGCCAATGTTGATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_35291::LG10:20152822-20154822(-)
ACTCAAAAATGAACAAAATGTAAACTTATTTTATTTTGAACTTTGATCCGTTGGATTTGTACATACAACTTCATGCAAGGATCATTTTTATTGTCTTTGTTCTTAGACAAAAGATAGGATCAAAGATATAAAAAATAGAGATTTTAGAAAAAAATAAAATAAATTAGAAAGATGATGATTTCAACTATAATGTTTGTATAAATAATAATTTTGATCATAATTTGAAAAAACAACATTACTTTATTTTAGAAAAATTTGTGACGAAATTAAATAAAAAAAACTTATTGAAATTAAATTGAATACAAAATAATGACACTTGACACTCAGAGTAACATGTGACATTCATATTGACACGTAACATTGATTTATCTTATATGATACTCACATGTGTTATGACACGGATTTGACACTTAAACAAAAAAAATAGTTACAAAAAATAATAAAAGAAAACACTACAAACATGTTAAAAAAATTTAAATACTATCGATATAATTTTAACGATAATAACATAATTGAATTATTTTTTAAAAATTTAATTTAATTAAAATAAAAACGAAAATAATGACTTACTTGAATTTTTTAATCAAAATTGAAATCAAATAATTAATTAAGTCAAATTGTATTTATAGCTTATTATTTTAAATAATAAAATAATTAAGTGTTTTTTAAATTACTATTACTTTTTATTATTTTTATTAATTTTTACAATTTTTTCTGTCTTTAAAGAAACAATTTTTTACTACAAAGTTACATATTTTGATAAAATTAAATTTCACTCATTTTGTGAGTAATAGCTGATTGAATGATTAGAAAAATACGTAGAAACATAAATGTTACTATATTTAGGAATGAAAAAATTAACAATTAAATGATACTCGTTTTGTGAGACACTTTAAACCATGGGAGATAATATACAATATGAATGTACAAATACAACATGATAAAATTTACCTTCGTAGAATAAGCAACACATCTTAGTTTTAGGAAAATGAAAAACTCCTACCACTGGATACTATTTCAATACAATTGGGCTTGTAAAAGTATTAAATGACCTGACAATATGCATTTAAATTATAATGGAAAAATATGTAGTAATTTATGAAAAAAATTTAAGTTGTAGCATAACTATGGAGAGCTTATATTTAACTAAAGAAAAAATAATTAAAGTTATATAATTGTAAGTTAATTTTCACGTCGTGATTATCGTCTTAATATTTGTTGTTTTACCTTATGCTTCCAATAATTTTATTCTCTACTTTCCATTTGAAATTTGATAAGAAATATAAAAATTGTTGATCGAATTTCAAAATTTGATAAAAAAATTAAAAAATCTTTCATCATATTTCGAAATCTATAAAGAACAAAATTTTCATCAATATTTGTAAAGTAAAAAAATTGAACTGTAAGTATTTTCGAATTGTGAAAACAGTTTTAAAATTAAAAAAAAAATATTCAAAAGTGTAGGTGAAATGATTGGAAGTACATGATAAAAGAATCTCTTGACATTTATGAGAAACAAACTCTAGTGATTGTAATTTTATTCAAGTAATACAAAACGTATGTAAAAGGTTCAATGTTACATTTAAATATATTTTTAAAAATAAAGATCAATAAATTTTTTATATGACAAAATAAAAAAGAAATGGAGAGAATTTCTTTATGTTAGAGTAACCTTCATTTTATGTACAATATTTATTTGTGTAAAAATTTCAAAAGTTGTTATTTTTGAAGTAGTTTTAGCTATTCTCAAACAAAAATGATTTTTGTTCCAAAACTTATAATTTTGAAACGCCAACAAGTCCTCCTAATGAATGATTATTTTGATTAAAAAAACGAAAGAAATTTAATTGGTGAGGAAAAAAGACGCTAAAATGAAATGGATTAAATTGTCTTAAAAGAAAATAAAAGAGAAGGAGGAGATAAGAACAAAAAATAAAATAAAAAAGAAATAAAGATTTAAAAGAAAACAATAAATAAAGGTGGAAGGTTCCCTTGTTGAG


Gene Sequence:
>Vu_35291(-)
TAGTAGAAGTAGTAGTTAATATGCAGCAATAGCATTCTTGAATCCCTACCATTTCATTTTTACCTATCCAAACCAAATCATGTCTCAACTCTCACAGGTAACCGCCCATCCCCTTCTCTAATGCTCTTCTCCCCACCCAGATTCGCCCTTTTCCCCTCTTTTTTATCGCAACCATGAGCGTTCCTCCGCCGTCCACGGCGGCGATGTGGACGCCGTTCACGGCGGCCCAGTGGCACGAGCTGGAGCACCAGGCTCTCATCTTCAAGTACCTCAAGGCGGGGCTCTCCGTTCCGCCCGACCTCCTTCTCCCCATTCGCAAGAGCCTCCAATTCATGGCACACCCATCTCGTGAGTAATCGCAAACAATGACCTATTTTGCGTTTTGTGCCTCTTATTTATGTGAAGTTTGAGTCTTTATGGTTTTTCTGCAGTTGGGGGGTACTATGGGAAGAAGATAGACCCTGAACCGGGTCGGTGCAGGAGAACCGATGGGAAGAAGTGGAGGTGTTCGAGGGATGCTCACCCTGACTCCAAGTACTGCGACCGCCATATGATACGACGTCGTTACCGTTCAAGAAAGCCTGTGGAATCTCAACCTCACTCTTCTTCTGCTTCTTCAAACCCTGTTGCTGCTTCTGCTTCTGCTGCTTCCTCTGCAACGGGTTCTGCTACATCTTCTGCAACTGGTTCTGCTGCTGCATCTGCGACAACCCTCAACACCCTTCCTTTGCATACCAATGGTGCTCGGGAGGGTTTCACTTTCACCCTTGGGAACAGCGCCACCACTGCCACACCCACACTCCCCCACCTTCACATGGACCCCCTCACTCTTTCAGGTGACAACACCAAGAAAACTTACCGGTATGTATGCCCATTCGCCTCTTTCAGATTGAGCCCTTTGTGAGAGTTTTTGAATTGATTACCTTTTTTTTTACTTTACCGTATTTAATTATGTGTGAATGGCATCTGAAGGCGAGCCGCCGTGTAATCCATGTACTCGACCTCATCAGGAGAAACAAGACTGTTGCTGATGTTGTAGTGTGAATAGGGTAGGGTATTGTGTGTATGTACATTTGTCTTTAAGGGCGTTTGACTTTTGGGGTTGTGGTAATGATTGCTGTGATTTTCTAGTGGAGTGTGTGGGTGTTTTACTTCACGGTAACAGGTAGTGTATTATTATGTTATAGTTCTGTACAGCAAACATGGTAGCGGTGATGTTAAGTTACCTAACATGTGGACCATTATGATGTGTGGGGTGAGATTCTGGGAGTGAGGTGTAAGTTATCTGCCTAGAGTTTGGGTTAGATTTGTATTCTATTCAACTTGATTTGTCTCTATTTTGATAAGATGCAGTGCCGATGAGCTATCTTCATAAATTCATTTTGGCGTTTTTTTTCCCAAATCTTTTTGCATACATTTTGAAGCAAATTTCAACTTTGCCCCTTAGAAACGGCATCCGAGTTCTGATAAGCTATCTTCTTAGATTCAACTGTGAGTTTTTTCCTATAGTTTCCGTCGTGTTCAATGAATGCTTTGAAGCAATTTTCAATATTGACCCTTTGAGACCGCATGCAAGTTCTGATGAGCTATCTTCATTAATTCAACTGTGTTTTTTCTCCCAAAACTTTTTTGCGTGTTCAATGAACCACTTTACCCCTCAGAAACAGCATATAAGTTTTCCATTTTTTTTGGGTTTGCATTTAATCAGATGTTGTAGTTTATTGTTGAACATTTGTGAAGTTCTTGATTTTCTTGTGACCATGTTCTGGATGTTCTCTGAGATCATGAGGTGGGGTTTCAGGTTTAGATATTCAAGTATTTTGTTGAAATGTTTTTCATGCTTGAAACATATTGTAAGAAATGTAGGCCATTTTTCACCTTGCCTTGTCACAGTGAATGATGTAGTATCATGGTGTAATTTGATAAAATTGGAAATCAAGGATTTACCAATGATTGCATGGTAGCAAACTGAAATTATAGCGGTGCATTGATGTTTATGTTTGATGCAGTTAATGCAATGGTAAAAGGTAGCTTTGTTTTGGTGGACCATGCATCCAAATAGTGATAGATAGTTGTCTGGTGACTTGGGATAGGTTTTCTAAGGGAATATTGAAATTTTCTATTTTCTCTAATTGTTTGGTGAAGTTATTTTTCAACGTTGGTGAGCGCTACTCGAATCTTCCATTTCCTTCAATGTCCTCCATCTTGTGCTTCATGCATTATTGTTTTCCTTCCCTACTACTTTGAGATACAATTCTAATAAAGCTTTGTGATAGTTTACTATTTTGTGTGTGTGAATAGAAACTAATTGATATTTGATACTGTTAATGACTAAGACATGCATGCTTTGAAGGTGACTTTTTTTATTTGTAAAGTAAAAAGAAAAAAGGTGTTATGAAAATCAGAGGGAAGATAACGATCAATCTCATTAAAGTACGTGTTTCTTATTCATCATAAGGAACTGGTGTAATTTGAGGTCATTTGGATATTGACTTATTTTTGTGAAGATAGAATCAGGGAGCATCTAAACTGCCCTGTGCAGAGTATGTAAGAACAGTTTTCTTCTTGTCAGTAGTGTCTAAATCATTCATCTCAATAGATCCATGTGCAGCCGGTTGCTTTTTCATTTCATGGCTTCAGTGACCCAGCCTCTAAGTTTAAGATCCATGTGTATAAATTTTGATAATTTTTTCTTCAAAATTTCTAAAATCTTTTGGTAATTTCCTGTTATGCGTACTTGAAATAAATGAAACATCATGATGTTAAAAATAAACACTCCACAGGTTTGGACTGAACTCAGAAGCAGATGAACACGTCTTACAGAAAGATCTGGGAAGTGTGAGATATCAAGGTTATGACTTCACCTCAGACAGCATGTGGTCTCATATGTCTCCAATTCCATCAAGTACTGTTTCGGAATCGAGAAGTGGTTCTACCATGCTGGGCAACTGCTTCCAACAGCAAACAATGCGAGATGCCGAGCTGTTGAACCTTGAAACTGCAAGGACCAAAGACCTTATATTTAGTAGCCAGTTAAGTTCAGCAGGTAGTTTGAAACAGGAATATCAGTCTCCTCAGTCTCTCTTCAGTGACTGGGACTGGAAGAAGGATTTAACTTCCTCTGCCATCGAGTATAGACCCAACAAGGATTTTAACTGCAATCCAGATGCCAATGTTGATTAAAATGGTTCTTTACAAGGCTTGGAAGGAGTGTTTTGTGTCTTGATGTGTGCAGCATCCACCGAAGGAAACATTTGAATCAGGAACTGGTCCCCCACCACCCTTTGTTTTTTCCCCCGAATCCATGGAAAATACAGGTCCTCAGGAAGTGATAAATTTTCATTCATAGCATTCAGACACCCGAGGAATGATGTTTTAATTTCGTGTTGTTCTCTTATATATCTTAAATACTTAAATACTTGAAGGAGTTATGCGTTCTTTACTTGTAAACTTGTAATATTTGTGTTTAGTTTGAGTGGTGTGTTCCTAATGATTGATTGTTAGAGGGGGGTTATGGTATTTTAAGGCAAGAAGGAAGTTTTAATTAGAATTGAATGAATGATTTATAATGACCA