Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35177 LG10 18447454 18451480 PREDICTED: protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 18447720 missense_variant p.Glu38Asp
T/A 18447723 synonymous_variant p.Val39Val
A/T 18447800 missense_variant p.His65Leu
T/C 18448091 missense_variant p.Val162Ala
T/C 18448677 downstream_gene_variant
T/C 18450444 downstream_gene_variant
A/C 18450691 downstream_gene_variant
C/T 18450706 downstream_gene_variant
T/G 18450820 downstream_gene_variant
A/C 18450838 downstream_gene_variant
T/C 18450842 downstream_gene_variant
A/T 18451179 downstream_gene_variant
T/G 18451180 downstream_gene_variant
G/T 18451210 downstream_gene_variant
T/G 18451274 downstream_gene_variant
T/C 18451329 missense_variant p.Ile320Thr
A/C 18451435 missense_variant p.Gln355His
G/A 18451442 missense_variant p.Val358Ile
T/G 18451443 missense_variant p.Val358Gly
T/C 18451444 synonymous_variant p.Val358Val
A/T 18451452 missense_variant p.Gln361Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35177.1
MHASPLLWFRRGQIVLSMHINDDGDDEGLFEPLSLSNEVIEFDMIGLGYDATIDMEHPVEDGEDHVNIDYSPAAANSVLAAGVGPHIFGGDTNLEPCQGMDFESEEAAKAFYNSYARRVGFSTRVSMSRRSRRDGSIIQRSFVCAKEGFRVEKEKHLIDGRVKRPRAETRVGCKAMLVVKIQDSGRWVVSSFVKEHNHDLVPPDKVHCLRSHRHVSGPAKSLIDTLQSAGIGPSGIINLRQQALKYVEEGVTSSEVYDVAISALREAASKVASATKNDGRQVIVNGTCEEYLHQNNETTIRRSDPPFCSQQSSYKDDQDRIIEKLTRQLDRARRKCEVYRSNLLSILKDIEEQKLQLSVKVQNVKLGMKE*


CDS Sequence:
>Vu_35177.1
ATGCATGCATCTCCATTGTTATGGTTTCGTAGAGGTCAAATTGTGTTATCCATGCACATAAACGATGACGGTGATGATGAAGGATTGTTTGAGCCTTTGAGTCTTAGCAACGAGGTTATTGAATTTGATATGATTGGTTTGGGGTATGATGCTACCATTGACATGGAGCACCCTGTTGAGGACGGTGAGGACCATGTTAATATTGATTATAGTCCAGCTGCTGCTAATTCTGTTCTTGCTGCTGGTGTGGGCCCTCACATTTTTGGAGGGGACACTAATCTCGAACCTTGTCAAGGTATGGACTTTGAATCGGAAGAGGCTGCAAAGGCCTTCTACAATTCCTACGCTCGCCGTGTTGGCTTTAGCACGCGGGTGAGCATGTCTCGGCGCTCCAGGCGTGACGGTTCTATAATTCAGAGGTCCTTTGTGTGTGCCAAGGAAGGTTTTCGTGTGGAGAAGGAGAAGCATTTGATCGATGGAAGAGTCAAGCGGCCACGTGCCGAAACCCGCGTTGGTTGCAAGGCCATGTTGGTTGTGAAAATTCAAGATTCTGGCAGATGGGTTGTTTCTTCATTTGTCAAAGAACATAATCATGACTTGGTTCCGCCGGACAAGGTGCATTGCCTTCGTTCTCATCGTCATGTTTCGGGTCCAGCTAAGTCGTTGATTGATACTTTGCAGAGTGCTGGAATAGGACCTAGTGGAATAATAAATCTTCGTCAACAGGCCCTTAAATATGTTGAAGAGGGAGTAACCTCTTCGGAAGTTTATGATGTAGCAATAAGTGCTCTTCGGGAAGCTGCGAGTAAGGTGGCATCTGCAACAAAAAATGATGGAAGACAGGTTATTGTAAACGGAACTTGTGAAGAATACCTTCATCAGAACAATGAAACAACTATAAGACGCAGTGATCCTCCATTTTGCTCGCAACAATCTTCATATAAGGATGACCAGGATAGAATAATTGAGAAGTTGACACGGCAACTAGACCGAGCTCGAAGGAAATGTGAAGTTTACAGGTCCAACTTGCTGTCAATTTTAAAAGACATTGAAGAGCAGAAGCTACAATTATCAGTTAAAGTCCAAAATGTTAAGTTGGGAATGAAAGAGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_35177::LG10:18445454-18447454(+)
CAAACATTTTTTGTTTCTTCAAAATATCTGAATGACTAGAAACACAATTCAAACAAGTTTTGGATGTTTCATTGCAGGTATCAATCTCAGCTAAAATCAAAGACCTATCAGGAAAGTTTTTTGGCAACTCCAATTTCAAAGCCGTATTTTCACCAACAACTCTTGGATCGGTAGGATACATGTTTTTCCCTTGGACATCATTGAACTGAACTTACGTTAGTGAAATACTGAAGATTGTTTTTGGTAATGCAGATTATTGGGTTTATTGTTGGGGTGGTTCCCCTGATACGTAAACTCATGATTGGCAGCGACGCGCCACTTCATGTGATTGAAGACTCTGTTACCATGTTGGGGTATGTCTGCAACCCAAAACTTCTAAGATTTTCAGATTAAAAATCCCAAGAAACCAATGAATAAAAGTTTGTACTTTGGAAAACTCTAACACACGACCAGTTTCTTACTTTTCTTGGTGATTCACTTTGAACCTTACACTGTGTTATTACATGCAGTGAAGCTACAATCCCAGTTATAACTCTTATAATGGGAGCAAACCTCCTTAAAGGCAATAGTTTCTGGCATAGCCATACCGTTTTGTTTCTACTCCTCTTTGGCAATGACAGATTTTGAATAATTTCTTAATTTCTTGGATGAACATTGGAACAGGCTTGAAGGGAGCAGATACTTCATTCAGTACAATCATTGGAATATTAGTAGTTCGATATATCATGCTTCCAATTTTGGGTATTCTAGTTATTAAAGGAGCTACTCAATTGGGTTTGGTGCAACCGGATCCCTTGTATCAGTTTGTTCTTCTCCTTGAATATGCACTTCCTCCAGCAATGGCTATAGGTATAATAATATCATCAAACATGTACTTCATAATTGTCTCTCATGGATCATGCAAAACACACACAACATACACAATTATAAGGTTTCATGGCATTTTTATGTATGATGTCGTTTGTATCTACTTTTTTTACCTTTGCAATTTGACAGTAGTAACAGTAGATAAGGAACTTTATATTTGACATATATACCTATTTTCAGGAACCATTGCCCAGCTGTTTGGAGCAGGTGAAGCTGAATGTTCAGTTATCATGCTATGGACATATGCTTTGGCGTCAGTTGCAGTCACTTTATGGTCAACCTACTTCATGTGGCTTGTGGCTTAATTTTATTATTATTTTCTTGACATTATTTGCCTTATAAGTTCTCTCTTTTATGCCATGGTTAGTGGAAGTACCTATGCTGAATGTAATTTTGTACAAGCTTCCTCAAAATGGTGAAATCTGTAACATATTGCAAAATTTATCAAATATACGTGTTTGCTTGGTAGATGGTATAAATGATTGACCCTTCGGATAAATTACAATTTCTTTTACAAGAGAAGATGCTTCATAACTTTACCATGATGATTAGAGGAGTTGAAATAAAGAAATTGTATAAATTTGTCTCATTATAGCACGTCAAATTAAATATATTGAGATTACTATATTATATTTATTACTATAGTCATCGTTATTTTTATTTATGTATTTTTTTTAATTACCTATGATATTTATTTTGCCGATAAAAAATCAATGTCTCGTTCTTAGATGCAAAATTTGACGTGCTTTGAGAAAGCATAACCAAGTTATGGTACGGTTTGCCTTTATACAAAACATGTTTCTTTCTTCTTCGTGTTCAAATTTCTCTCTCCACTTTTTGAAATGTAACGCTGAACACAGTAATTGCTGTTTCTCATTGTCGTTTCTCACTTACCTCACCCAAAAACCCAACTTTGGTTCCACCCATTACTTGTAAACAATCCAGCACGATCGATTCTGCTTCTCTTTTTTCACTTTCATTCTACTCCTGCTCCCTCTCCTTTCCAAGATCCGCATTTGTCCCTTTTCCTTATCCAATTTTTACTTCTAAATCGTTATTCTCCCCTGAATAATTCGTCTCCGCCATCTTCATGTTGATTCATTCTCCCATTCTTCTTTCCTGTATTCCGATCA


Gene Sequence:
>Vu_35177(+)
ATGCATGCATCTCCATTGTTATGGTTTCGTAGAGGTCAAATTGTGTTATCCATGCACATAAACGATGACGGTGATGATGAAGGATTGGTATGTTTTCTTAATGGCTTCAGTTGTGTTTAATTATTTGAACCCTTTAACCCCTTTTCTATTATGCACCACTACTCTCTAATTTTCGACAAAGATAGTGTCTTGTTGAGAGGTTAATGCTATTTTGATTACTGGGTTTTCTGTAAAATGGAGTTTGAGCCTTTGAGTCTTAGCAACGAGGTTATTGAATTTGATATGATTGGTTTGGGGTATGATGCTACCATTGACATGGAGCACCCTGTTGAGGACGGTGAGGACCATGTTAATATTGATTATAGTCCAGCTGCTGCTAATTCTGTTCTTGCTGCTGGTGTGGGCCCTCACATTTTTGGAGGGGACACTAATCTCGAACCTTGTCAAGGTATGGACTTTGAATCGGAAGAGGCTGCAAAGGCCTTCTACAATTCCTACGCTCGCCGTGTTGGCTTTAGCACGCGGGTGAGCATGTCTCGGCGCTCCAGGCGTGACGGTTCTATAATTCAGAGGTCCTTTGTGTGTGCCAAGGAAGGTTTTCGTGTGGAGAAGGAGAAGCATTTGATCGATGGAAGAGTCAAGCGGCCACGTGCCGAAACCCGCGTTGGTTGCAAGGCCATGTTGGTTGTGAAAATTCAAGATTCTGGCAGATGGGTTGTTTCTTCATTTGTCAAAGAACATAATCATGACTTGGTTCCGCCGGACAAGGTGCATTGCCTTCGTTCTCATCGTCATGTTTCGGGTCCAGCTAAGTCGTTGATTGATACTTTGCAGAGTGCTGGAATAGGACCTAGTGGAATAATGTCTGCTCTAATAAAAGAATACGGTGGAATTAGCAATATTGGTTTCACCGAGCGTGACTGTAGGAATTATATGAGAAGCAGTAGGCAAAGGACCCTTGGAGGTGACACTCAAATCCTTTTGGACTACTTGAAGAGCAAGCAAGCAGAGAATCCTTCATTTTTCTTTGATGTACAAGGTGACGAAGATCACTGCATGAGTAATATCCTCTGGGTTGATCCCAATGCTAGGACTAATTATACTTACTTCGGAGACACTGTCACCTTTGATACAACATATAGGTCTAACCGCTATAGATTACCTTTTGCACCTTTCACTGGCATAAATCATCATGGACAGCCTGTATTATTTGGTTGTGCTCTTCTGATAAATGAATCCGAGGCATCTTTTGTCTGGCTTTTCAAAACCTGGCTTGAAGCAATGTCAGATAGACCTCCAGTTTCAATTACTACTGATCATGATAGGGTGATATGTGCAGCCATCAACCATGTATTTCCCAGTACCCGTCACCGATTTTGTAAGTGGCACATTTTTAAGGAGTGCCAAGAGAAGTTGTCTCATATGCTTTCTGAACATCATAATTTTGAAGTTGACCTGCATAAATGCATTAACCTGACCGAGTCCATTGAGGAGTTTGAGTCTTGTTGGTCCTGTCTAATTGATAGGTATGATCTCACGAAACATGAATGGCTTCAAGCAATTTACAGTGATAGGCGGCAGTGGGTACCGGTGTACTTGAGGGATACATTTTTTGCAGAAATGTCAATAACACAGCGAAGTGATAGCATAAACTCTTATTTTGATGGATATATCAATGCATCAACAACGCTTCAGCTTTTTGTCAAGCAGTATGAGAAGGCTTTGGAGAGCCGTTTTGAAAAAGAAGTCAAAGCTGACTATGATACTATTAACACTACTCCAATTCTGAAGACTCCATCACCTATGGAGAAACAGGCAGCGGGAGTTTACACAAGGAGGTTGTTTATCAAATTTCAAGAAGAATTGGTTGAGACATTAACATTCTTGGCAAACAAAGTAGACGAAGAAGAAATTATTACCGTGTACAGAGTTGCCAAATATGGGGAAATGCACCGAGCCTACTTTGTCAACTTTAATTCGTTTGAGATGAAAGCTACTTGTAGCTGCCAGATGTTTGAGTTTTGTGGTCTAGTTTGTAGACATATATTGACTGTTTTTAGGGTGACAAACCTTCTTACTTTACCATCTCATTATATTTTAAAAAGATGGACCAGGATTGCTAAAAGTGGTGTCATATTGGATGAACATACTACTAATTTGTCAAATGGTTCTCACGAATCTCTAACCTTCCGATTCAGAAATCTTCGTCAACAGGCCCTTAAATATGTTGAAGAGGGAGTAACCTCTTCGGAAGTTTATGATGTAGCAATAAGTGCTCTTCGGGAAGCTGCGAGTAAGGTGGCATCTGCAACAAAAAATGATGGAAGACAGGTTATTGTAAACGGAACTTGTGAAGAATACCTTCATCAGAACAATGAAACAACTATAAGACGCAGTGATCCTCCATTTTGCTCGCAACAATCTTCATATAAGGTCTGTTGTTTTTGGTAATTTATGATATAGCATATTTTTCTGCTGGAACATTTCTGTATTCTGTACTTTTGTTGTTCATAGATTTTCTCATATGTTATATTATTATGCTCTTTTCAAGTTTAAAGGAAAGTGGTTTATAAGAGAAGACAGTAATTCTTCTAACCTTTTATTTCAAAGGAAAATAAGTCCCACTTGTCCTCTTCATTAAGTAGTATTCTCAAAGGTTGTTTATGAGCCAGTTAAACTGGTATGATAATATGGTGCAATATCAAAAACTCTCCCAATTGGTATGAAATATTTTTCCCATTTAAAAGATTAGATATTTTTGAAGTTTCCATTCTACTAATCATAATGATGCTGTTCCAAAATTTCTATGGATAACATTCTTCGTTGTGATTTTTTTTGAAAAAGATTAACAGTTCAACTGTTAACTTTCTCCCTTCAAATTTTGGAGAACTTCTCCCTCAAAACTCTCATAAAGTAAATCGGTGAGGACTTGAAAAGGCCCTGCTCCAGTGCATTCAGTTAATTCTTCCGCATCAATTTAGATTTCTTTTTTTAAACAATAGTCTCTGGTCTTGTTCTGGAATTTCATTGTTTGCACATATGCTGCCTGGAGCCTCTTTCTGCTAGTTATAGTTGCTAAAGCTTTTCAGCCAATTGAATGTTCAATTGCATCCAGAATAACTATCAATATGGACCTTTGGTATATATAATCTTGTAATTGTAGTACAAAAAATATCATACGTACCCGTATGAAACTGACATGCTACAGTTAGTTGAAACCTAGTTGATGTAGGACAAAGATTTCTGATACCACTGGATGTGATTTGAATAGTACAATCAACAATGAAGAGGAGACAAAAAAATTACGAAGAGTAGAGAGATATCATTATCTGATGAGAATTATGATATCCTCATTCAAACTCAGTTTTGCCAGTGAAAATTACTATCTTTTGCAATTAAGTGAACCCTTTGTTAATTCTGATTCTATCAGGACAAGACACCTTGAATCCAAATCAAACAAACAATGTCAATTTTATGATTAACTTTTAAGAGTAAAATCAAAATCAAACTTTCTGAGAGGGTTTGGCATATCTGGTTTAAGGAAATTAAAGAGCTTGGTTAGTGAGAGGGTTAAATGTCTCGAGACCTAGAGACACCATTCCTGTTACTGGAAGAGTTGTAATAGATACTTTGACAGTCTATATTAGTGATAATAGTTCTGAAAGATTAAAATTTGTCAAGAAAATCTTGGTCCCTTATCATAGATAATCTTATTAATTTGCTGTATGATATTTTCAGAGGGATTACACATGTATTGATTTAGATCTTCTAAAACAAACACTTTTTGTTGTTTTCTAACCTCCACCCCTCTCCCAACTTATCCTCTAATGTTTCTAACGAACAATATAATTTGTTGTAGGATGACCAGGATAGAATAATTGAGAAGTTGACACGGCAACTAGACCGAGCTCGAAGGAAATGTGAAGTTTACAGGTCCAACTTGCTGTCAATTTTAAAAGACATTGAAGAGCAGAAGCTACAATTATCAGTTAAAGTCCAAAATGTTAAGTTGGGAATGAAAGAGTGA