Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35116 LG10 17709151 17710282 squamosa promoter-binding-like protein 3
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 17709244 missense_variant p.Glu32Lys
T/A 17709542 intron_variant
T/G 17709546 intron_variant
A/T 17709684 upstream_gene_variant
G/A 17709814 upstream_gene_variant
A/G 17710052 upstream_gene_variant
T/G 17710068 upstream_gene_variant
G/A 17710235 missense_variant p.Met106Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35116.1
MENGNEKDEGEAVKEGEMVKKITIKLVCGNGEGSRRGSSSSSIFCQADECGMNLNMAKSYNRRHKVCDRHSKAPVVLLSSIRQRFHELAEFDETKRSCRKTLAEHNERRRKSRTDMSLGGD*


CDS Sequence:
>Vu_35116.1
ATGGAAAATGGAAATGAGAAGGATGAAGGGGAAGCAGTGAAAGAGGGTGAAATGGTGAAGAAGATAACAATAAAGTTAGTGTGTGGTAATGGGGAGGGTTCAAGAAGAGGGTCATCATCATCTTCTATTTTTTGTCAGGCAGATGAATGTGGTATGAACTTGAACATGGCCAAGAGTTACAACCGCCGTCACAAGGTTTGTGACAGACATTCTAAGGCTCCTGTTGTTTTACTTTCTAGCATTCGTCAGAGGTTCCATGAACTTGCAGAATTTGATGAGACGAAAAGAAGTTGCAGGAAAACATTGGCTGAGCATAATGAACGTAGAAGAAAAAGTCGCACAGACATGTCCTTAGGAGGTGATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_35116::LG10:17707151-17709151(+)
CAAAATTTAATATCTCTATTCATTTTAACTATACAATAGGATAAGTATACTTCATTATTTATCATCAAATAAACGTACAAAGCTTTACATTTTAATTCTTTTATTTATTTATTTATTTGGTGTATTAGCATCTGTAACGAAAGCAAAACGATATACATAGAACGGTAATTCACATGATATATTTTTTGCAAGTGTATTACATTATTTAAAATATCTTTACTTGAGTTTTTCCTCTTTTACGGAAACTTTACTTTATTTAAGTATTTGTTTAAATCTATCTCGCATTCAAAAGATAGATTTATGAAGACAAAAAAAGATATACCAACTTTAAAAATCAAGTTGTCATCTGTCCATGTGATACGGAGAATCATGTAAGAAAAGCTTTAAATGTAAGCTTCATTTAAAAGAAAAACGAGTCTCTTATTTACATATTAAAACAAAAATAATTATAAAATTAGATCATTGTGTAAAATTGGTTAAGAAAATATCATCAAATAAAGTAAAAAATACAAAGTTATTTTTATATAATTAAGAAAAAAATAGATTTTTAATAAATGAGATGAGAGTATTTTTTCTACACCCGTGAAATTTATTGGGTGCAATAACATGCATGGAATGCAGATGTTGGCGAGGACGGGGTTGCCTATTGATGACTATTCTTTGCCCAGAAGACTACATCCAACGGTAGATCACATTTCAGTAGCAGACAGCAAACCGTATCCGACCGTCAGTGTTTGGTATGAATTTTTCACATATTGAATCTTAACTACGTAAGCTCTGATCGAATAACAGCGACTGCGAGTACATTGGGGAGCAGTGGAGATCGAATGGTAAGGAATTACACAACGCATAGAAGAATGAAGGGTGAAGATTCAATAGGGAAACAGATGGTACGGCACCCAAAATTTCATTACATGTGCCCCCAATTATGATCCGTACAAGTACTACTTTTCTGTTTCTGTCTTTGATTGGATAGACCCTTCTAGATCCTCTTGATATACATTATTATTTTATTGTAATATAATATTTTATTGTAATATAATATTTTATTGAAAAGTAGATGTAAAGTAAATTGTTTTAATAAACAGTGGTATAAAAACATATTTTTCTAAGAAAATAACAATCCTATTCTCCTAACTTATTTCATGTTTCACGTGCAAAATTTCATATTAGCCTACTTTTTCAATGTACCACAAAACATGAAAGAATAAATAGATATAATAAATGATGTCATAAAACCTTAGAAAAAAAGGGAAAGTGAGTTAACATAAAATACAAGAGAAAGTAAAAAATTCTGTTTATTCTTAATTAATATATATAAAGTATCTACTAAAATACATAGATGGTTATTTTTATTTGTTTTATTGATTGTGATGCATTATATTTTCGGATTTTAATATCTTTATATCATCTACTACATTTTAACGATGATTAATAGAAGTACAATCCGAATATCATTAAGAGTAACTCGGTTATTTGTATTCATACAAGTAACCTTGTTGTACATGTTTTATAATTAATATAGATTAAACGGATTATATAATATATTTAACGTGTGTTTTACTATGCAATTATAATTATGTAATAACTTTATTATTCAAGTTTTTTCATAAATTTATCAAAATATTTTTTTAATTTGTCTGTAGTTTAACCATTCATTACATGTATAACGGTGTGTCGTGAAATATTTTAAAAAGAGAAATAAGATAATTTTGTTATCCTTTCTTATATGTCCACCGAATTTGTAACGAGTGAAAAAAAAAGTGGCAAAATTTGAAAGATAAATATACAGTAGTAAGTATTTAATGATGGTGTATGGTCACAATTATAAAAAGTAGTGATTGCTATAATTATGAGGATGAAAATTAAGAAGGCAAGAAAATTGTTATAATGTTTTGAGATCTCATTACAATATAAAACAGTTTTTTTTTCAGTAGGGTAGACAGGATAAAACTGAAAAGTCCAGTGTAGTGGGAGAAAAGAAGATCAGAAGAGAAGCA


Gene Sequence:
>Vu_35116(+)
ATGGAAAATGGAAATGAGAAGGATGAAGGGGAAGCAGTGAAAGAGGGTGAAATGGTGAAGAAGATAACAATAAAGTTAGTGTGTGGTAATGGGGAGGGTTCAAGAAGAGGGTCATCATCATCTTCTATTTTTTGTCAGGCAGATGAATGTGGTATGAACTTGAACATGGCCAAGAGTTACAACCGCCGTCACAAGGTTTGTGACAGACATTCTAAGGCTCCTGTTGTTTTACTTTCTAGCATTCGTCAGAGGTTCTGCCAACAATGTAGCAAGTATGTATCATCTCATATAACATCAACATTGTCTACTCTTTATTTTCATGTCTTTACTTTTCTCACTTCTCAGCACAGATTTTTCCTTTTTTCCATGTTAATGTATGCTTTCAATATTATGTGTCCTTAAGGGTATAATGTGAGATTTGGGGAGGGTTTTGGAGACATTAGGTTAAGGAGGGATGAAATAATTACCAGATAATCCTAATTCATTCTTGTAAATTCAGTTTATAAGATAAGTATTATAACACATTTCTCTTAAATAATATAAATAAACTAATTTGTCTTCTATTTAAATGATAAAAATATTTCAATGTTGAGGCATAAAAATCTTATGTACGAGATTACATATTCTTAAGGGATTTCACAATGTTCCTATAATAAATGGTATGATAAATTTAATAAATCAATCTAAATCTCTTAACTATTACTCATTAGAGGTAAGTCTCATCCAGTAATTTTAACTCCAATAACTTAAGTTGTTGTGATTAAAAAGTTTGTAGTTAGACTTTGAGCTAAGTCAATCGGTTTATTTCTGGTGTGCATCGGTCTATCTTTGGTGTACACCAGTTTATTCGGGATAGATTAGTATGGAATCTTGTTGGAATGGGTTTTAATATTATATTAGAAAATGAGTTTAAACATTTGAAGCGAAGATTGATTCATGTTATAATTGGCTTTTTATTTAATGAAAATGAGATCTCCTTTGATAATATGTTATTGTTTTGGATCGAATGGCACGCAGGTTCCATGAACTTGCAGAATTTGATGAGACGAAAAGAAGTTGCAGGAAAACATTGGCTGAGCATAATGAACGTAGAAGAAAAAGTCGCACAGACATGTCCTTAGGAGGTGATTAA