Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35041 LG10 17042872 17048825 PREDICTED: calcium-dependent protein kinase 28-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09159 Environmental adaptation   C 04626 Plant-pathogen interaction [PATH:ko04626]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 17043035 5_prime_UTR_variant
C/A 17043295 missense_variant p.Pro37His
G/T 17043483 missense_variant p.Gly100Cys
G/T 17043527 synonymous_variant p.Gly114Gly
C/T 17043949 intron_variant
G/A 17044076 intron_variant
T/G 17044082 intron_variant
G/A 17044620 intron_variant
C/G 17044671 intron_variant
C/T 17044947 intron_variant
G/C 17044950 intron_variant
T/A 17045100 intron_variant
C/T 17045103 intron_variant
C/A 17045289 intron_variant
T/A 17045592 intron_variant
T/A 17045593 intron_variant
T/G 17045624 intron_variant
G/A 17045791 missense_variant p.Arg337His
C/A 17045884 intron_variant
A/G 17046530 intron_variant
A/T 17046917 intron_variant
G/A 17046966 intron_variant
G/T 17047158 missense_variant p.Arg371Leu
G/A 17047273 intron_variant
C/G 17047462 intron_variant
C/T 17047516 intron_variant
T/C 17047656 intron_variant
T/A 17047690 intron_variant
A/T 17047691 intron_variant
C/T 17047735 intron_variant
A/T 17047896 intron_variant
G/T 17047898 intron_variant
A/G 17047904 intron_variant
A/C 17047905 intron_variant
T/C 17047955 intron_variant
T/C 17048163 intron_variant
T/A 17048165 intron_variant
T/G 17048178 intron_variant
G/C 17048201 intron_variant
T/G 17048290 intron_variant
T/A 17048307 intron_variant
G/A 17048371 missense_variant p.Asp516Asn
A/C 17048627 3_prime_UTR_variant
T/C 17048628 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35041.1
MGICFSSTKVSGSSSNNAGASNRNRKCSEPVAAQGEPAEHKQQSSHGQRRREESRKPPRTKEKANGRRPGGTLPCGKRTDFGYEKDFDKRFSLGKLLGHGQFGYTYVGIDKANGDRVAVKRLEKNKMVLPIAVEDVKREVKILKELTGHENVVQFYNAFEDDSYVYIVMELCEGGELLDRILAKKDSRYTEKDAAVVVRQMLKVAAECHLHGLVHRDMKPENFLLKSTREDSPLKATDFGLSDFIKPGKRFQDIVGSAYYVAPEVLKRKSGPESDVWSIGVITYILLCGRRPFWDKTEDGIFKEVLRNKPDFRRKPWPTISNGAKDFVKKLLVKDPRARYTAAQALSHPWVREGGEALEIPIDISVLNNMRQFVKYSRLKQFALRALASTLNEEELSDLKDQFDAIDVDKNGSISLEEMRQALAQDLPWKLKESRVLEILQAIDSNTDGLVDFSEFVAATLHVHQLEEHDSFKWQQRSQAAFEKFDLDKDGYITPDELRMHTGLRGSIDPLLEEADIDKDGKISLPEFRRLLRTASIGSRNVLSPNRLHRKM*


CDS Sequence:
>Vu_35041.1
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Promoter Sequence:
>Vu_35041::LG10:17040872-17042872(+)
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Gene Sequence:
>Vu_35041(+)
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