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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_35013 LG10 16659210 16660466 PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g34110
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 16659781 missense_variant p.Tyr191Ser
C/T 16659783 synonymous_variant p.Leu192Leu
G/C 16659789 missense_variant p.Asp194His
G/A 16659987 missense_variant p.Gly260Ser
A/G 16660110 missense_variant p.Ile301Val
T/A 16660153 missense_variant p.Phe315Tyr
A/T 16660155 missense_variant p.Met316Leu
G/T 16660160 synonymous_variant p.Ala317Ala
G/A 16660213 missense_variant p.Arg335Gln

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_35013.1
MGSLCVPLSTIFSICCLVLLGAESKTHWEDAEVLKELKRGLEPASVIPGSCISSWDFTVDPCDNLFGQKFTCGFRCDLVVSGLSRVTELALDQAGYVGSLTFTWNLPFLQTLDLSKNQFSAQIPDSFSNLTRLRRLSLSSNSFSGEIPPSLGTLPTLQELYLDNNNLTGAIPQGFHNLKRLELQSNKLSTYLSDLDSFTNLKYLDLSDNSIAGVLPASLPVSLVQISIRNNNLSGVLSSESFGNLTRLQVVDFSSNRISGSIPSVFFELPSLQQLTLSFNEFTKVEAPYKGVESRSGLIAIDLSNNKLEGFLPSFMAMVPKLSSLSLENNQFTGRIATQFAVKTVSPQTGVSQLGRLLLGGNYLVGGIPRPLLTLKRDSANVSLVDNCLYRCPHSFFFCQGGQQKPLTQCNRFVSTSE*


CDS Sequence:
>Vu_35013.1
ATGGGATCTCTCTGTGTCCCTCTATCTACGATCTTCTCAATTTGTTGTCTAGTATTACTGGGTGCCGAATCAAAGACGCATTGGGAAGATGCAGAGGTTCTGAAGGAGCTAAAGCGAGGTTTGGAACCAGCTTCGGTCATCCCAGGCTCTTGCATCAGTTCCTGGGACTTCACCGTCGACCCCTGCGACAACCTATTCGGCCAGAAATTCACGTGCGGCTTCAGATGCGACCTTGTCGTTTCGGGCCTCAGTCGAGTCACGGAACTTGCGCTGGACCAAGCGGGTTATGTTGGCTCTCTCACCTTCACGTGGAACCTTCCTTTTCTACAAACACTCGATCTCTCCAAGAACCAATTCTCCGCCCAAATTCCCGATTCCTTTTCAAACCTAACTCGCCTCCGCCGACTCAGTCTCTCGTCGAACTCCTTCTCCGGCGAGATACCCCCTTCTCTCGGCACACTCCCCACCCTCCAAGAGCTTTACCTCGACAACAACAACCTAACAGGAGCAATCCCACAAGGCTTCCACAACCTTAAAAGACTCGAACTCCAGTCCAACAAACTCAGCACCTATCTATCCGACTTGGACTCCTTCACAAACCTTAAATACCTCGATCTCAGCGATAACTCCATCGCCGGAGTGTTGCCGGCATCGCTCCCTGTTTCGCTGGTTCAGATATCCATTCGGAACAACAATTTAAGTGGTGTCTTGTCGAGTGAAAGCTTCGGGAATTTGACGAGGTTGCAGGTGGTGGATTTCAGCTCCAACCGAATCAGCGGTTCCATTCCTTCGGTTTTCTTCGAGCTTCCGTCGTTGCAGCAGTTGACGCTGTCCTTCAACGAGTTCACGAAGGTCGAAGCACCTTATAAGGGAGTGGAGTCCCGGAGCGGGCTTATCGCGATTGATTTAAGCAACAACAAGCTGGAGGGGTTTTTGCCGTCGTTCATGGCGATGGTGCCGAAGTTATCGTCGTTGTCGTTGGAGAATAACCAGTTCACAGGGCGAATAGCGACCCAGTTTGCGGTGAAAACGGTGTCTCCCCAAACGGGAGTGTCTCAGTTGGGGAGGCTTCTGTTGGGGGGGAATTACTTGGTAGGAGGGATTCCTCGACCCTTGTTGACGCTGAAACGCGATTCTGCGAACGTGAGTTTAGTTGATAACTGCTTGTACAGGTGCCCTCACAGTTTCTTCTTCTGCCAAGGTGGACAACAGAAGCCATTGACACAGTGTAACAGATTTGTCTCAACCAGTGAATAA


Promoter Sequence:
>Vu_35013::LG10:16657210-16659210(+)
TGTTGTAAAACTTTCATTTTTTATGAATAAAATAAACAAATGGTTTAACTGAGACAATATATTTAACGGAATAGTTATTTCGCTCGTTAAATATAGAAAAAATTATATATAGAATTAATCTTGAAGTTAAATATATAATCATTTATTTATAATAATAGAAAAAATATGAATTAAGCTTAAAATATAAATAAAAATAATAATAAATTTACTAAGATAAAAGATAAATATAAAATAAAATAATATCTTTAATCATTTACAACAAGCCATAAATTTGATCATTTTATTTTTTAAAATAAGAAATAATGTATAGTTCAGTTATTGACATTCCAACACCTGCATAATTTGTTATCAATGTGTATGCTAATATTAATGTAAAAAACTAATAGTTTATTTTACCTTTTTAAGTGAGTAACTCAAGGGTTTTTTTCTTTTTGTGTTTCTCTATTTATGCACATATTTTTTCTTTTGGTTTATGATATTTTGACTCGTTTTCATTTGACAACTAGATATAATAATATAATAATACGAATATTTGAACTAACAAGATAAATAGTGATATATTGACAACTAATATTTATCTGTATAACCACTTCTTTAGTTACTTGTTAAAAAATATTAATACTGGTTGATTAAAATGTTAGTACTATTATATTATTATTAAAAAAAAAAGTTGCCAATTGGCTGCATATAAAAAAATGGGTTGCCAAACCGTCATTCTCCTCAGAGGACAATTTTCAAATGTTATATGCTTATAATATTACATTAAAGTTATTAAGTAGTTATATTCAGTGTAAAAATATTATTAGTGCTATCTTTGTTTTTAAGTTAATACCATCAATTTTAGGTTGCACAGGCATGTGGTATTCCCATTCTGTGTTCCATCCCATCCCTAATTATAATAAGCAATCACCATAAGTTTTTTTTTTAATTAAGAAATGTAATAAATTTTTTATTATAGTAAAATATTTTTATTTCATAATAAATATACATAAAAAATAATTATAAATCAAGTAAAACTAAAAAGTTAACTCTTTCTTAAATTTAAAGATAAATGGAGAAAAAGATAACACTTTTAAAAATAAGTTGGATTTATATATTGGTTGATGTTGAAGAAATGCACGTACCAAATGCATGGACTTTGGGTGACACCTAATATATGAAATACTCTTTTTTACTTCCAATGGTTGGGTAAGTTGGTTGGAAGCAACTACAGAGATTATATATATTTGTAAAAGATAGACAAGTGATTTGAGTGACTTTGCTGAAATTTAAAGTTATGATAAAAATGTCTAAACACATATAACTAAGCTTAGCATTGGGACCCAAACTCCAAACCAAAGGGAAGCACTTTCACAACAACCTTCATGGCACAAGGTGCCACGTGGCCTCAGTATTCACCAACCTTACATTATTTCTTCTATTTCACGACTAACCAATAAGGTGCTAAACAACCTTTTAGGAAACCACCCATTTTAGCCATTAAAAATGAAAAATATAACATATATTAAAAATATATAATTTACCATAAAAAATGATGTTTAATCCTAATTATAATATGACATTTCCAACCACAATTTATGAATAGTCGGATAATAAGAAGCGGGCCCCTGGTGAGAGGAAACCACACATAACGGCTAGCCCAGCTAGACGACATATACTAAAATTAAAAAAACAACTACTAACCCAAGATTCTATATATAAATACCCACAACACTCACTACTCACTGTACAAGAAAAAGGTTGTCCCTTTCTTCTTTCTGTAAACAATAAAAATAAATTAAAAAAAAAATAAATCTGAACAGAGAAAAGGTTGTTGCATCGAACAAGCATCTGAGTTCAGTTCTGTCCGTGAAGCCACTCACTAAAAAAAGTTCTCTAACTACTTAAAGAGGAAGAATCCTACTCTTCACAAAAAACCCACCTTTCTCTCTTGTGCTTCGTTTCTTCCATCACCATCAAAATCAAAATCAAAAGCTTCACACCAGAGTGGAAAGTGCCAA


Gene Sequence:
>Vu_35013(+)
ATGGGATCTCTCTGTGTCCCTCTATCTACGATCTTCTCAATTTGTTGTCTAGTATTACTGGGTGCCGAATCAAAGACGCATTGGGAAGATGCAGAGGTTCTGAAGGAGCTAAAGCGAGGTTTGGAACCAGCTTCGGTCATCCCAGGCTCTTGCATCAGTTCCTGGGACTTCACCGTCGACCCCTGCGACAACCTATTCGGCCAGAAATTCACGTGCGGCTTCAGATGCGACCTTGTCGTTTCGGGCCTCAGTCGAGTCACGGAACTTGCGCTGGACCAAGCGGGTTATGTTGGCTCTCTCACCTTCACGTGGAACCTTCCTTTTCTACAAACACTCGATCTCTCCAAGAACCAATTCTCCGCCCAAATTCCCGATTCCTTTTCAAACCTAACTCGCCTCCGCCGACTCAGTCTCTCGTCGAACTCCTTCTCCGGCGAGATACCCCCTTCTCTCGGCACACTCCCCACCCTCCAAGAGCTTTACCTCGACAACAACAACCTAACAGGAGCAATCCCACAAGGCTTCCACAACCTTAAAAGACTCGAACTCCAGTCCAACAAACTCAGCACCTATCTATCCGACTTGGACTCCTTCACAAACCTTAAATACCTCGATCTCAGCGATAACTCCATCGCCGGAGTGTTGCCGGCATCGCTCCCTGTTTCGCTGGTTCAGATATCCATTCGGAACAACAATTTAAGTGGTGTCTTGTCGAGTGAAAGCTTCGGGAATTTGACGAGGTTGCAGGTGGTGGATTTCAGCTCCAACCGAATCAGCGGTTCCATTCCTTCGGTTTTCTTCGAGCTTCCGTCGTTGCAGCAGTTGACGCTGTCCTTCAACGAGTTCACGAAGGTCGAAGCACCTTATAAGGGAGTGGAGTCCCGGAGCGGGCTTATCGCGATTGATTTAAGCAACAACAAGCTGGAGGGGTTTTTGCCGTCGTTCATGGCGATGGTGCCGAAGTTATCGTCGTTGTCGTTGGAGAATAACCAGTTCACAGGGCGAATAGCGACCCAGTTTGCGGTGAAAACGGTGTCTCCCCAAACGGGAGTGTCTCAGTTGGGGAGGCTTCTGTTGGGGGGGAATTACTTGGTAGGAGGGATTCCTCGACCCTTGTTGACGCTGAAACGCGATTCTGCGAACGTGAGTTTAGTTGATAACTGCTTGTACAGGTGCCCTCACAGTTTCTTCTTCTGCCAAGGTGGACAACAGAAGCCATTGACACAGTGTAACAGATTTGTCTCAACCAGTGAATAA

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