Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34883 LG10 15507825 15509965 PREDICTED: scarecrow-like protein 15
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 15507957 3_prime_UTR_variant
G/C 15507964 3_prime_UTR_variant
C/T 15508002 3_prime_UTR_variant
C/T 15508582 missense_variant p.Ala447Thr
G/A 15508648 missense_variant p.Arg425Trp
C/A 15508655 synonymous_variant p.Ala422Ala
G/A 15508667 synonymous_variant p.Ala418Ala
G/T 15508705 missense_variant p.Leu406Ile
G/A 15508727 synonymous_variant p.Asp398Asp
G/A 15508763 synonymous_variant p.Phe386Phe
G/T 15508847 missense_variant p.Ser358Arg
T/C 15509480 synonymous_variant p.Leu147Leu
G/A 15509548 missense_variant p.His125Tyr
C/T 15509549 synonymous_variant p.Leu124Leu
A/T 15509639 synonymous_variant p.Arg94Arg
G/A 15509682 missense_variant p.Thr80Met
G/T 15509713 missense_variant p.Arg70Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34883.1
MHTSKDKRATVVTTKSPLLQASTIPLLHHSHHRAQQGHTATPSGSLHQAMRVPVPSSPQANPKPTNNLLRTIALPNLNTTGLCYEPTSVLDLCRSPSPGSEKPTDHSVVVTDSQDCLDLDDHALHNLDWDSIMKDLGLHDDSGAPLLKTIPHPDNNNNNPCDDFTIAPFDHAIEFSTLSDIYSNQNLTFDFNHLVHDFSNQHHNNGFDFIEELIRAADCFDTKQLHVAQVILERLNQRLRSPVGKPLQRAAFYFKEALQSLLSGSNRTPRISSLVEIVHGIRTFKAFSGISPIPMFSIFTTNQVVLDHAACSFMHVIDFDIGLGIQYASLMKEIAEKATESPLLRITAVVPEEYAVESTLVRENLAQFALELRIRVQVDFVPLRTFETLSFKAVKLVDGESTTVLLSPVIFRHLGNAAAFLADLRLVSPSVVVLVDSEGWADMATAAASSFRRGVVSSLEYYSMMLESLDVSTAGGGGEWVRRIEMIHLRPKILAAVESSWGRMPPWRETFYSAGMRPVHLSQFVDFQAECLLAKSQIRGFHVEKRQNELILFWHDRAMVSSSAWRF*


CDS Sequence:
>Vu_34883.1
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Promoter Sequence:
>Vu_34883::LG10:15509965-15511965(-)
ATTAGAAAATGATAATTAGTTTATCTTTATTCACACACATAAAAAAATTAATTATAAAAAAATGAATTTTGTATTTAAAAAAAACATCAAATAAATGGGAAAAAAAATTGTGTGTCAGAATATATTTTTGTTTTAAGGTAATCGTGTAATGCAATTTGCTCACAGGAATGAAATGTATTTCTAACGGCTAATATTTGTAGTTTGGTAAGAAGGTAGCAATGCAAAACTTTCCGCAACCCTCACAAAGTAGTTAATGATGGACCTTTACCAATACTTTTCTTTTTTGTTTTTTGGTATAAATAAAGAGTTAAAGATGAGTAGTGGTATGCTTTGTCTTGGGGCCCATTTAAAACTTTTGTGGGCCCACATTATAAAAAGCACGACTTAAGTAGCTGCTTTAAGCCTTTAACGCCCACTATTTGACTCTTTTGTCGTTTTACAGTTGAAACATCCTTTGCCATATATAAAGGAAGGGAACCGTCTTTTCTAGATACGTGAAAATAAATCCACTCAATCATCTTTTGTTCTTTAAGTAAAACAAAATCACTATAATCATTATTTATTTTTAACTTCTTTTTTTTCATTTATTTAAAATATATGGGTGATGTAAACACGGTTCAAGTTTTCTTTTTGTATTTTTGAGAAATGCATATCAAACTTTTCTAATGTCATGTAAAAAGTAGTTATTTCTATAGAAATAAATTAAGAAACATTTTTTAAGAATTTTGTTGAAATTAATTTTCCATACTATTCTCTTTTCTCACTCAATCTCAAGACCATCTCCTTTAAGTTTAAAAAATATAAGTTATCAGGTAATCTTTTAGTTTTACGATTGTATTTTTCAAATATCATCAATGAATGAAAACCCATGCCGATATGATTTTATAAATTTTTAATATAAAAGTTAATAAATTTATCGTAACAACAGTTTGGTATAATTAATATTAAAATTTAAATCATTAAATTTTTTCGATTGAATAAAAGTATAAATTACTTTATTATATTTGTCGTTTTTTGTTTTCTTAAAAGAAAATGCACCCAAAACTTATGAATAATAGGAACACCTAACCATTATGTTAACTTTCACGAATAAACATTATACGCAATACTTTTAACATTTATTATGTCAAATTTCAAGTAAAATTATAATTTTATAATAATAATTGGCTTCAAAGTTTAATAAAAAAAATTATACTTGTTGACATTGAAACGATTTTTTGTTTATTTTAATTTTAACTAAAAAGAATACTAAAATACCTAATTTTGTGGGAATGAAATTCGAATTAGCTTTGTCCAAGTCCTTGTCTTAGACTTGGTACATTTGGCTTGATTTGAAAGGTGATTGGACATAACTAACTTTTGGGCTATTCTCGAAAGACACAATTACAGTTTACTCAAATTGATGGATAATTTTTGTCCACAAAACATAACGTGTAAGTACAGCAATCAATGACGCAAAGTCAAAGCTTATATAGGATATAGCTACGTCACTAACATGTGTTTTTACATTCATAATTTTTAACCCACCTAAAAATTTTACACATTCATTTCATATTATCTTTATTATTTTTTATTTTTTAAATATAAATATTTTATTATTAAATAAATGTAAAAGTGTGTTCTTATTTTTAACCTTATCTAAAAAAATTTGAGCTTTCAAAAGAGGATCTCAAGGGTCACGGAAATAAAAAAAGAAGGTATAGGTTTGCTGATTTTAAGTTAACTACGTTTTTCAAATTAAATAAATTGGATTATATAATTAATAATTTAAATATTTGAGCAGAGAAGAAGTAACTAATGTAAAGTAATATATTGGAATTAAAAATAAAAATACATTTTAAAAAAAAAAGTAAAAATGAATGAAAAGTATTAAATGAATGTAAAAATTTATGTGGGTAAAAATCTATTTTTTTAAAATATATGTTAAGTCCATTATTGAGCGATTGAGTTAGATGGCTAGTTAGGTTTCTATATATATTTGGAGGCATGTAGGAAGACAC


Gene Sequence:
>Vu_34883(-)
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