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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34864 LG10 15286906 15288783 PREDICTED: lysM domain receptor-like kinase 4
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 15287060 missense_variant p.Phe575Ser
G/A 15287125 synonymous_variant p.Arg553Arg
T/C 15287723 missense_variant p.Lys354Arg
A/T 15288013 synonymous_variant p.Ser257Ser
A/C 15288049 synonymous_variant p.Ala245Ala
G/T 15288053 missense_variant p.Pro244Gln
A/T 15288693 missense_variant p.Leu31Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34864.1
MHLFPFTAIIIFTVLIHNFSLILGQQPYIGLGTVACPRRGNRNSIRGYTCNGANSCQAFLTFRSQPIYDSVSTISTLLGSDPSQLAKINSVSLNDTFETNKLVLVPVNCSCAGEYYQTNTSYVFQNAETYFLVANNTFEGLTTCQALQNQNQNPANIYPGRKLLVPLRCACPTKNQTQKGIRYLLSYLVNWGDSVSLIADKFGVGSVTALEANNLTLTQSMIYPFTTLLIPLHDKPSSSQTVSPAQLTPPPSSPPSSHQKKTWVYVVVGVVAGAVALTSALCAVIFFTRRRKNRNEDESVVVSKSFEATKKKPPMSVNEKLSEIISGIAQSFKVYDFEDLKRATDNFSPSHWIKGSVYRGVINGDLAAIKKIEGDVTKELEILSKINHSNVVRLSGVSFHEGRWYFVYEYAANGDLSEWIYFNNADGKFLSWTQRIQIALDVATGLDYLHSFSSPYIHKDIKSTNILLDGDFRGKVANLSLVRRVEGGDDQFPATRHIVGTRGYMAPEYLEHGLVSTKLVVYAFGVVMLEMITGKEAAAIVTEDETKLSHVLRVMLGEERLKEFVDPSLRENFPFELGMFVVEMIDNCISNDPASRPSVPEIVQSLSRTLNSSLSWERSMNVPRS*


CDS Sequence:
>Vu_34864.1
ATGCATCTCTTTCCCTTCACTGCCATAATCATCTTCACCGTTTTGATTCACAACTTCTCTCTGATTCTGGGGCAGCAACCTTATATTGGTTTAGGAACAGTAGCATGCCCTCGAAGAGGTAACAGAAACTCTATTCGTGGATACACTTGTAATGGTGCAAACAGCTGCCAAGCATTCCTTACCTTCAGATCTCAACCCATTTACGACTCTGTCTCCACAATATCTACTTTATTGGGTTCTGACCCCTCCCAACTTGCTAAAATAAATTCCGTTTCCCTGAATGACACCTTCGAAACAAACAAGTTGGTGCTTGTTCCGGTCAACTGTTCCTGTGCAGGTGAGTATTATCAAACAAACACATCCTATGTGTTCCAGAATGCAGAAACTTACTTCTTGGTTGCTAACAACACTTTCGAGGGCCTCACAACATGTCAAGCTTTGCAGAATCAAAACCAAAACCCAGCAAACATATACCCCGGCAGAAAACTTCTAGTGCCTCTCAGATGTGCTTGCCCCACAAAAAACCAAACCCAGAAAGGCATCAGGTACCTCTTAAGCTACTTGGTGAATTGGGGTGATTCTGTTTCCCTCATTGCTGACAAATTTGGTGTTGGCTCTGTGACCGCTCTTGAGGCTAATAACCTCACTTTGACACAATCCATGATCTATCCCTTTACTACACTTCTAATTCCCCTTCATGATAAGCCCTCAAGTTCTCAAACCGTTTCTCCAGCTCAACTTACGCCACCACCCTCATCACCCCCCTCTTCTCATCAAAAGAAAACATGGGTGTATGTTGTTGTTGGAGTTGTTGCAGGAGCTGTTGCCTTAACATCAGCTCTCTGTGCTGTCATTTTCTTCACACGCAGGAGAAAAAATAGAAACGAAGACGAGTCGGTGGTAGTGTCAAAGAGTTTTGAGGCAACTAAGAAAAAACCACCAATGAGTGTAAATGAAAAATTGTCAGAGATCATATCTGGCATAGCTCAATCGTTCAAGGTTTATGATTTTGAGGACCTAAAGCGAGCAACAGATAACTTTAGTCCTAGCCACTGGATCAAAGGGTCTGTTTATCGCGGAGTGATTAATGGTGATTTGGCTGCAATTAAAAAGATAGAAGGTGATGTGACAAAGGAGTTGGAGATACTGAGCAAAATCAACCATTCTAATGTTGTACGCCTTTCCGGTGTTAGCTTCCACGAGGGACGATGGTACTTTGTTTATGAGTATGCTGCTAATGGAGATTTGAGTGAATGGATCTACTTCAACAACGCGGATGGGAAGTTTCTGAGTTGGACGCAGAGAATACAGATTGCATTGGATGTGGCCACAGGACTTGATTATCTTCACAGTTTCAGTTCTCCTTATATCCACAAGGATATTAAGAGTACTAACATTCTTCTGGATGGTGACTTCAGAGGAAAGGTCGCAAATTTAAGCCTTGTGAGGCGTGTGGAAGGAGGGGACGACCAGTTTCCTGCCACTAGGCACATTGTTGGGACAAGAGGCTACATGGCTCCCGAGTATTTGGAACACGGTCTTGTGTCTACAAAGCTTGTTGTGTATGCTTTTGGGGTAGTGATGCTGGAAATGATCACAGGAAAAGAGGCTGCTGCTATTGTAACAGAAGACGAGACAAAATTGTCACATGTTTTGCGCGTCATGCTTGGTGAGGAGAGGTTGAAGGAGTTTGTGGATCCCTCTTTGCGAGAAAATTTTCCATTTGAACTTGGTATGTTTGTGGTTGAGATGATTGATAATTGCATATCGAATGATCCAGCAAGTCGTCCTAGTGTGCCTGAGATTGTGCAATCTCTGTCAAGAACCCTGAATTCTTCATTGAGTTGGGAAAGGTCAATGAATGTCCCACGAAGCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_34864::LG10:15288783-15290783(-)
GTTTGAGACATAAATAAAATTTAATTTCACTTTCAAGACTAAAAAGTATTTAACTTAAAGATTTAAATAATATTGTAAGGGTGATAATAATTACAGTCACCTTTCATAGTAATATACACCCATAAGAATGCTGATGATAAATTATTGGCAATTTAAAACAAAACTAAGGAATACTCTTTCAAGTTATATTCTTTATTATCTTTTGTTTTAATTAAGAAAGATTATGTCAAATTCTCAAGAATTATTATCTTTATATATTCGAAACACTAAAAAAGAATAAAAGAATAATGAGTAATGCTTTCAGAACGAGCTTTGTTTTATTATCTTATAGTTAGTTTCTTATACTTTAAGGATGTGTTTTTTTAGTTTTGTCAAGTCTTTTATTTATAAGATCTAGCGAATTTGCTCTAATTAGATTACATCTAAAAATTTGTACTAGATTTTTAAATTGAAATAATTAAATTTATTGACAACTAATTTTATTGAAATGTTATTTCATCTTTAAGATTTCAATTTAATTGATTTTTATAATTGAAATAATTCAATTTATTGATAATTAATTTTGTTGATATATTATTCAATATTTCGTGATTTACACAATATTTTTACAAATAATAAAAAAATATTTCTATTTTTTATTTATTAAATAAAAATCTTAATTATCTAAAAATAATAATAATAATAATTTCAATAAAAAAACAAAATAAAATCAATTATCAATTCCATTTGAAATAAACGGAAGTACCATTGGCTCGTTCATATTTTATCAACTAAAAGTAGCTTCGAACTTTTGAGGTTAGGAACGAAGCATGCGTTCTTCAATATTTTAGCGTGATTGAATTTTTCAGCTTGAACTTCGTAGTTGTTGCTTGAACAGAATTTATAATTACTTAAGATGTTCGAAAACATAATTTAAAACTTCCTTTAGAGGAATCAAAGCTCATATCCGCGTTAGCCGGTGGAAATTGCGAAGTGTACACAAAAAGGGATTGCAAAATGGGTTGCTTAAAGATGTTATTATAATATAAAACATTATCAGTGAGAGTTAACCAATAATGCCGCACACAGAAGACATAAGCAAAACATAAACAACTGATTCGCGTCAGTTAGGAATGCTTCATCCAACAAAAAAATCCACCCGTTATCTAATCTTTATTAATACGGATATTTGCTTAAAAAATGTTTGCGGATATTTTAAAATCCGCAAATACAGATACTCGCAAATATTTAAAAAAAATATTTTAATAAATTATTAAAATAAAATTATAAAAAATATATAAAATATAATATAAATTAAATTAAATATAAATTTAAATTCAATTTTAATTAAACTTAATCTTGTAAAATCTAAATTAATGTTAACTTAATAAAATATAAATTATATTTTTATTTTTATATTTTACAGATAGCGAGTATTCGCGAATACGAATAGTATAATATCTGTATCCGACCCATTTATAAACGGATATTAAAATATCCGCTACCAGCGAATTAGAGATAATAAATATCCACATATATTAATTATTAGTCGCAGATTTTATCCACATTGCTATCCTAATATCAGTCAATTGAAGCTGTCTTTTTTCTGCCTTTTTTTTTAATTGATTCTTTTAGTTCTATTCCCGTGAAGTGATGAGACAGACAGTAAGGTAAACGTATAATCCAATCCAAGTGTTGTTGAGTAATAGAGCTATCCACTGTGTAGTCAACAACAATCCAAGCGAATCTCCTGTTTGAAATTTTTTTAACTTCCAAGTCAACTTCAACGAGAAAAAACAAAATAAAATGGTTATTTCTCAGAATTTAGCTTCTCTCAGAAATCATCATCAATCGATCAAATAATTCCATAAAACAAAATTGGAAATGCACTCCCAAAATCATTTAATAAAGTGCTACACAATTTCTAGGATTAGGCATGCGTGTGTACAAAAGAAAAATAAGTTGTTCATAATTGCAGTCACTGAGAAATCCTTTTTACACCTTTCCTGTCTGCAACAGCA


Gene Sequence:
>Vu_34864(-)
ATGCATCTCTTTCCCTTCACTGCCATAATCATCTTCACCGTTTTGATTCACAACTTCTCTCTGATTCTGGGGCAGCAACCTTATATTGGTTTAGGAACAGTAGCATGCCCTCGAAGAGGTAACAGAAACTCTATTCGTGGATACACTTGTAATGGTGCAAACAGCTGCCAAGCATTCCTTACCTTCAGATCTCAACCCATTTACGACTCTGTCTCCACAATATCTACTTTATTGGGTTCTGACCCCTCCCAACTTGCTAAAATAAATTCCGTTTCCCTGAATGACACCTTCGAAACAAACAAGTTGGTGCTTGTTCCGGTCAACTGTTCCTGTGCAGGTGAGTATTATCAAACAAACACATCCTATGTGTTCCAGAATGCAGAAACTTACTTCTTGGTTGCTAACAACACTTTCGAGGGCCTCACAACATGTCAAGCTTTGCAGAATCAAAACCAAAACCCAGCAAACATATACCCCGGCAGAAAACTTCTAGTGCCTCTCAGATGTGCTTGCCCCACAAAAAACCAAACCCAGAAAGGCATCAGGTACCTCTTAAGCTACTTGGTGAATTGGGGTGATTCTGTTTCCCTCATTGCTGACAAATTTGGTGTTGGCTCTGTGACCGCTCTTGAGGCTAATAACCTCACTTTGACACAATCCATGATCTATCCCTTTACTACACTTCTAATTCCCCTTCATGATAAGCCCTCAAGTTCTCAAACCGTTTCTCCAGCTCAACTTACGCCACCACCCTCATCACCCCCCTCTTCTCATCAAAAGAAAACATGGGTGTATGTTGTTGTTGGAGTTGTTGCAGGAGCTGTTGCCTTAACATCAGCTCTCTGTGCTGTCATTTTCTTCACACGCAGGAGAAAAAATAGAAACGAAGACGAGTCGGTGGTAGTGTCAAAGAGTTTTGAGGCAACTAAGAAAAAACCACCAATGAGTGTAAATGAAAAATTGTCAGAGATCATATCTGGCATAGCTCAATCGTTCAAGGTTTATGATTTTGAGGACCTAAAGCGAGCAACAGATAACTTTAGTCCTAGCCACTGGATCAAAGGGTCTGTTTATCGCGGAGTGATTAATGGTGATTTGGCTGCAATTAAAAAGATAGAAGGTGATGTGACAAAGGAGTTGGAGATACTGAGCAAAATCAACCATTCTAATGTTGTACGCCTTTCCGGTGTTAGCTTCCACGAGGGACGATGGTACTTTGTTTATGAGTATGCTGCTAATGGAGATTTGAGTGAATGGATCTACTTCAACAACGCGGATGGGAAGTTTCTGAGTTGGACGCAGAGAATACAGATTGCATTGGATGTGGCCACAGGACTTGATTATCTTCACAGTTTCAGTTCTCCTTATATCCACAAGGATATTAAGAGTACTAACATTCTTCTGGATGGTGACTTCAGAGGAAAGGTCGCAAATTTAAGCCTTGTGAGGCGTGTGGAAGGAGGGGACGACCAGTTTCCTGCCACTAGGCACATTGTTGGGACAAGAGGCTACATGGCTCCCGAGTATTTGGAACACGGTCTTGTGTCTACAAAGCTTGTTGTGTATGCTTTTGGGGTAGTGATGCTGGAAATGATCACAGGAAAAGAGGCTGCTGCTATTGTAACAGAAGACGAGACAAAATTGTCACATGTTTTGCGCGTCATGCTTGGTGAGGAGAGGTTGAAGGAGTTTGTGGATCCCTCTTTGCGAGAAAATTTTCCATTTGAACTTGGTATGTTTGTGGTTGAGATGATTGATAATTGCATATCGAATGATCCAGCAAGTCGTCCTAGTGTGCCTGAGATTGTGCAATCTCTGTCAAGAACCCTGAATTCTTCATTGAGTTGGGAAAGGTCAATGAATGTCCCACGAAGCTAA

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