Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34855 LG10 15196842 15199058 PREDICTED: lysM domain receptor-like kinase 4
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 15196854 3_prime_UTR_variant
A/G 15196937 3_prime_UTR_variant
G/A 15196962 3_prime_UTR_variant
T/A 15197451 missense_variant p.Arg493Trp
C/T 15197915 missense_variant p.Arg338Lys
C/A 15198015 missense_variant p.Ala305Ser
G/A 15198065 missense_variant p.Thr288Ile
T/A 15198151 missense_variant p.Gln259His
T/A 15198186 missense_variant p.Thr248Ser
A/G 15198970 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34855.1
MHLFPFTTIIIFTVLIHNFSLILGQQPYIGLGTVACPRRGNRNSIRGYTCNGANSCQAFLTFRSQPIYDSVSTISTLLGSDPSQLAKINSVSLNDTFETNKLVLVPVNCSCAGEYYQTNTSYVFQNAETYFLVANNTFEGLTTCQALQNQNHNPANIYPGRKLLVPLRCACPTKNQTQKGIRYLLSYLVNWGDSVSLIADKFGVGSVTALEANNLTLTQSMIYPFTTLLIPLHDKPSSSQTVSPAQLTPPPSSPPSSHQKKTWVYVVVGVVAGAVALTSALCAVIFFTRRRKNRNEDESVVVSKATKKKPPMSVNEKLSEIISGIAQSFKVYDFEDLRRATDNFSPSYWIKGSVYRGVINGDLAAIKKIEGDVTKELEILSKINHSNVVRLSGVSFHEGRWYFVYEYAANGDLSEWIYFNNADGKFLSWTQRIQIALDVATGLDYLHSFSSPYIHKDIKSTNILLNGDFRGKVANLSLVRRVEGGDDQFPATRHIVGTRGYMAPEYLEHGLVSTKLVVYAFGVVMLEMITGKEAAAIVTEDETNLSHVLRVMLGEERLKEFVDPSLRENFPFELGMFVVELIDNCISNDPASRPSVPEIVQSLSRTLNSSLSWERSMNVPRS*


CDS Sequence:
>Vu_34855.1
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Promoter Sequence:
>Vu_34855::LG10:15199058-15201058(-)
TTTTAGGTTTAATGTCTCAATAGGTCCCCTATTTTTGTTCAAAATTTCAAATAGGTCCCTTTATTTTTTGACGTCTCAATTGTGTCCTTATTTTTGTTAATTTGATGCAAATAAATCCTTTCCGTGAATTTCATCAAACAGCATTAATGAATGTGTGACGTGGCCTGTCTCAATTGGGTCCTTAATTTTGTTAATTTGATGCAAATAAATCCTTTCCGTCAATTTCATCAAACGGCGTTAATGAATGTGTGACGTGGCCTTACACGTGTCAATACTGTCCTCAGGCCACGTCACACATTCATTAATGCCGTTTGATGAAATTGACGGAAAGGATTTATTTGCATCAAATTAACAAAAATAAGGACCCAATTGAGACGCCAAAAAATAAAGGGACTTATTTCAAATTCTGAACAAAAATAGGGACATATCAAGACATTAAACCTTTCTTTTATTATCTTATAGTTAGTTTCTTATACTTTAAGGATGTGTTTTTTTAGTTTTGTCAAGTCTTTTATTTATAAGATCTAGCGAATTTGCTCTAATTAGATTACATCTAAAAATTTGCACTAGATTTTTAAATTGAAATAATTAAATTTATTGACAACTAATTTTATTGAAATGTTATTTCATCTTTAAGATTTCAATTTAATTGATTTTTATAATTGAAATAATTCAATTTATTGATAATTAATTTTGTTGAGATATTATTCAATATTTCGTTGTTTACACAATATTTTTACAAATAATAAAAAATATTTCCATTTTTTATTTATTAAATAAAAATCTTAATTATCTAAAAATAATAATAATAATAATTTCAATAAAAAAATAAAATAAAATCAATTATCAATTCCATTTGAAATAAACGGAAGTACCATTGGCTCGTTCATATTTTATCAACTAAAAGTAGCTTCGAACTTTTGAGGTTAGGAACGAAGCATGCGTTCTTCAATATTTTAGCGTGATTGAATTTTTCAGCTTGAACTTCGTAGTTGTTGCTTGAACAGAATTTATAATTACTTAAGATGTTCGAAAACATAATTTAAAACTTCCTTTAGAGGAATCAAAGCTCATATCCGCGTTAGCCGGTGGAAATTGCGAAGTGTACACAAAAAGGGATTGCAAAATGGGTTGCTTAAAGATGTTATTATAATATAAAACATTATCAGTGAGAGTTAACCAATAATGCCGCACACAGAAGCAAAACATAAAAACTGATTCGCGTCAGTTAGGAATGTTTATCCGACAAAAAAAAATCCACCTATTATCTAATCTGTTACTAGTACGAATATTTGCTTAAAAAATATTTACGGATATTTTAAAATCTGCGATATCCGCAAATATTTAAAAAAATATATATTTTAATAAATTATTAAAATAAAATTTAAATAGAATTATAAAAAATATATAAAATATAATATAAATTAAATTAAATATAAATTTAATTTTAATTTTAATTAAATTTAATCTTGTAAAATCCAAATTAATGTTAACTTAATAAAATATAAATTAAATTTTTATTTTTATTTTTTGCGGATAGCGAGTATTCGCGAATACGAATAGTATAATATCTGTATTCGACCTATTTATAAGCGGATATTAAAATATCCGCTACCAACATATTAGAGATAATAAATATCCACATATATTAATTATTCGTAGCAAATTTTATCCATGGTTGCTATCCTAATATCAGTCAATTGAAGCTGTCTTTTTTCTGCCTTTTTTTTAATTGATTCTTTTAGTTCTATTCCCGTGAAGTGATGAGACAGACAGTAAGGTAAACGTATAATCCAATCCAAGTGTTGTTGAGTAATAGAGCTATCCACTGTGTAGTCAACAACAATCCAAGCGAATCTCCTGTTTGAAATATTTTTAACTTCCAAGTCAACTTCAACGAGAAAAAACAAAATATAATGGTTATTTCTCAGAATTTAGCTTCTCTCAGAAATCATCATCAATCGATCAAATAATTCCATAAAACAAAATTGGAAATGCAC


Gene Sequence:
>Vu_34855(-)
TCCCAAAATCATTTAATAAAGTGCTACACAATTTCTAGGATTAGGCATGCGTGTGTACAAAAGAAAAATAAGTTGTTCATAATTGCAGTCACTGAGAAATCCTTTTTACACCTTTCCTGTCTGCAACAGCAATGCATCTCTTTCCCTTCACTACCATAATCATCTTCACCGTTTTGATTCACAACTTCTCTCTGATTCTGGGGCAGCAACCTTATATTGGTTTAGGAACAGTAGCATGCCCTCGAAGAGGTAACAGAAACTCTATTCGTGGATACACTTGTAATGGTGCAAACAGCTGCCAAGCATTCCTTACCTTCAGATCTCAACCCATTTACGACTCTGTCTCCACAATATCTACTTTATTGGGTTCTGACCCCTCCCAACTTGCTAAAATAAATTCCGTTTCCCTGAATGACACCTTCGAAACAAACAAGTTGGTGCTTGTTCCGGTCAACTGTTCCTGTGCAGGTGAGTATTATCAAACAAACACATCCTATGTGTTCCAGAATGCAGAAACTTACTTCTTGGTTGCTAACAACACTTTCGAGGGCCTCACAACATGTCAAGCTTTGCAGAATCAAAACCACAACCCAGCAAACATATACCCCGGCAGAAAACTTCTAGTGCCTCTCAGATGTGCTTGCCCCACAAAAAACCAAACCCAGAAAGGCATCAGGTACCTCTTAAGCTACTTGGTGAATTGGGGTGATTCTGTTTCCCTCATTGCTGACAAATTTGGTGTTGGCTCTGTGACCGCTCTTGAGGCTAATAACCTCACTTTGACACAATCCATGATCTATCCCTTTACTACACTTCTAATTCCCCTTCATGATAAGCCCTCAAGTTCTCAAACCGTTTCTCCAGCTCAACTTACGCCACCACCTTCATCACCCCCCTCTTCTCATCAAAAGAAAACATGGGTGTATGTTGTTGTTGGAGTTGTTGCAGGAGCTGTTGCCTTAACATCAGCTCTCTGTGCTGTCATTTTCTTCACACGCAGGAGAAAAAATAGAAACGAAGACGAGTCGGTGGTAGTGTCAAAGGCAACTAAGAAAAAACCACCAATGAGTGTAAATGAAAAATTGTCAGAGATCATATCTGGCATAGCTCAATCGTTCAAGGTTTATGATTTTGAGGACCTAAGGCGAGCAACAGATAACTTTAGTCCTAGCTACTGGATCAAAGGGTCTGTTTATCGCGGAGTGATTAATGGTGATTTGGCTGCAATTAAAAAGATAGAAGGTGATGTGACAAAGGAGTTGGAGATACTGAGCAAAATCAACCATTCTAATGTTGTACGCCTTTCCGGTGTTAGCTTCCACGAGGGACGATGGTACTTTGTTTATGAGTATGCTGCTAATGGAGATTTGAGTGAATGGATCTACTTCAACAACGCAGATGGGAAGTTTCTGAGTTGGACGCAGAGAATACAGATTGCATTGGATGTGGCCACAGGACTTGATTATCTTCACAGTTTCAGTTCTCCTTATATCCACAAGGATATTAAGAGTACTAACATTCTTCTGAATGGTGACTTCAGAGGAAAGGTCGCAAATTTAAGCCTTGTGAGGCGTGTGGAAGGAGGGGACGACCAGTTTCCTGCCACTAGGCACATTGTTGGGACAAGAGGCTACATGGCTCCCGAGTATTTGGAACATGGTCTTGTGTCTACAAAGCTTGTTGTGTATGCTTTTGGGGTAGTGATGCTGGAAATGATCACAGGAAAAGAGGCTGCTGCTATTGTAACAGAAGACGAGACAAATTTGTCACATGTTTTGCGCGTCATGCTTGGTGAGGAGAGGTTGAAGGAGTTTGTGGATCCCTCTTTGCGAGAAAATTTTCCATTTGAACTTGGTATGTTTGTGGTTGAGCTGATTGATAATTGCATATCGAATGATCCAGCAAGTCGTCCTAGTGTGCCTGAGATTGTGCAATCTCTGTCAAGAACCCTGAATTCTTCATTGAGTTGGGAAAGGTCAATGAATGTCCCACGAAGCTAAAGTTTCGGTGAGCCTCTTGATGTTACAGCAGTTGAAGCAGGATGCTTCTATCAGCCAACGATTTTCTGTGTTTCCGTTAACTTCTGTTGTTTTCTTCGTCGATTATGCTGTAGAATAGTAGTCTTAGTGTGTTTGGAACTCTAGTTTTATCTTCAATAATTCAGTTGTAAAATTTGGAATAACTTCAGCAATATATGTAGTATATAATTAAAGTTCA