Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34854 LG10 15184183 15190039 Serine/threonine receptor-like kinase NFP
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 15184210 missense_variant p.Val10Leu
G/C 15184221 missense_variant p.Leu13Phe
G/C 15184232 missense_variant p.Ser17Thr
T/A 15184301 missense_variant p.Leu40His
G/T 15184904 missense_variant p.Arg241Met
C/A 15184980 missense_variant p.Asn266Lys
C/T 15185018 missense_variant p.Pro279Leu
C/T 15186168 splice_region_variant&intron_variant
G/A 15186357 intron_variant
G/T 15186726 intron_variant
G/A 15186759 intron_variant
T/G 15186887 intron_variant
C/A 15186913 intron_variant
A/G 15186935 intron_variant
A/T 15187004 intron_variant
A/G 15187009 intron_variant
T/G 15187026 intron_variant
A/G 15187074 intron_variant
T/A 15187100 intron_variant
C/A 15187108 intron_variant
A/C 15187127 intron_variant
C/G 15187181 intron_variant
C/T 15187206 intron_variant
T/C 15187207 intron_variant
T/A 15187212 intron_variant
C/T 15187348 intron_variant
T/G 15187350 intron_variant
T/A 15187354 intron_variant
T/A 15187423 intron_variant
T/G 15187474 intron_variant
A/C 15187480 intron_variant
C/T 15187551 intron_variant
G/A 15187567 intron_variant
T/C 15187568 intron_variant
G/A 15187618 intron_variant
C/T 15187644 intron_variant
T/C 15187680 intron_variant
T/C 15187708 intron_variant
G/C 15187794 intron_variant
A/G 15187864 intron_variant
G/A 15187932 intron_variant
A/G 15188757 synonymous_variant p.Pro795Pro
G/T 15188973 missense_variant p.Gln867His
C/T 15189062 missense_variant p.Ser897Phe
C/T 15189096 synonymous_variant p.Ile908Ile
C/T 15189154 missense_variant p.His928Tyr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34854.1
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CDS Sequence:
>Vu_34854.1
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Promoter Sequence:
>Vu_34854::LG10:15182183-15184183(+)
TTTTTTTAGTTACCATAATATTTTCAAAATAAAATTACACCAAAATGGTTAAAAACCCTTTCTAAACCTATATTCCTATGAGTCATATCTACATCTACTTAACAACACTGACATCAGTTCTCTAGCTATCATTTGCCTACTAGTTGGGCCGTGTTGTTGGATTTTGTTTTTTTCTTTTCTAGTTTCTTTTATTTTTTTCGTTTTGATTTGGCCAGATTCTTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTCTTGCATTTACGCATATAAAAAATTTTGAATAGCATTTTAAATATGTAGACAACAAATTTAATGTTTACGTTTTTAGGCAAGTGGTGGAGGTTAGACGACTTCAAATGAAGAAGTCGTGCTCTCTTATACGATTTCACCCTGACACGATGATCAAAGGTAAAGTTGTATACTTTCAAAACGATTTTGAACTCTGATAATTGATTATCATGACTTGTATTCGATTACACCATGTTGAACTCGTATAGGAGACACAACTTCATCTATAATCAATTACACTTTTCTTGTCAGTAGGGTTGTAATATATTGTCAATAGTGTAATTTTTTGTTTAAATAGTAACTTATTTCTTTTAGGATATATTTATTACTCGAATTGATATTTCGACATCCATCCTAGATTGGAGCATATGAGAGAAATGATGAGAAAGCCCATAGTACGGCAGCAGGCACAAGCTGAGTTAAGACAAGCTTTTAGAGGAAAGAAACTAATCCATGAAAGTGATTTAGAGGAAATTAGTTACTTAAAGTTTGTGATCAAAGAGACATTGAGACTGCATCCTCCTGCTCTTGTTGCTTCCCATCATTGATGGGTATGAAATACCTATAAAGACGAAAGTCATGGTAATTGTATGGGCAATGGGAAGAGATCCTCAATATTGGGATGATGCTGAGAGACGAAAAGCTTTTAATGTCTATTTATATCGAGTATATATTTATGTATATATATTTCTCTTTCATTTATACATAAATGATTAAATGAAAATAGTATAGAGAAAATAATTATTGTTTTGTAGAATCAAAAACTTTGAAAAGACAACTAAGAAAGAAAGTTGGAAGATTATAAAAAAAGAAATTAAAGTAGGACCATTATACATTAACAATTTCTTTTAACAATTTTTTACAATAAATTACGTGTCACTAATTTATTGATCCATATATTTGAAATAAACTAATAACAAACTATCATTTGTAAAAAATTTGTCAAAAAAGTTGTCAAACAAAATAAATTAGATTGAATTTGGATGGTGATATCTCAATTGAATTTGACAAATTTTTGGTTAGAACTTACTGAATTGAATTTTACTAAAGAAAAGTCTAACTCGATCAAATTTTAATTAAGACTAATTCGATCATTTCAACTGTGACTGTCTCAACTAAATTCGATTGATTTTTCATCTCCGTTTCAGATTTCCCATTCCAGGGCTTTCTTGCACGGCCGCAAGCCTTCTCTACTGCTCCAAATGTGTGCCAAAAATTTCAACAAAAGGCCACATACTTACAGGAAAAGAGAAAACACAAATATCCACGTAGTGGGTGGATGGGAGAACACTCAGCTGCATAGGGAAGGAGAAGGAGATGAAAAAAATTAGGATTTAATTAAATAGCCATAAAGTTACTTTTGGTATTTTACATATTTGATGGGGTGCAGGAAGCAGTTACCAAAACACAATGCACGGAAGTCCCACTATTGTTGGGCCTGGTAAAAGAGGCTTGGATTTTTCAAGCACACCAATTGAAAAAGAAATATTTGAGCCCGCTGAACCTGGTTTGTGTAATTCTTTTGCCCCGTGTATCAGCTCATCCACGGCCTCGCACACCAAGTGTTTGATTATTTGTGTCACCCCGACGAAGAATACTAACGGTTCCTGGATTATGAATTGTAAGCACAAACAACCTTCGCAGTGCTGACTGAGGA


Gene Sequence:
>Vu_34854(+)
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