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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34834 LG10 14959168 14963819 PREDICTED: wall-associated receptor kinase-like 14
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 14959370 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/T 14959450 intron_variant
T/C 14959454 intron_variant
C/T 14959543 intron_variant
G/T 14959622 5_prime_UTR_variant
A/T 14959675 5_prime_UTR_variant
G/C 14959729 synonymous_variant p.Ala18Ala
G/A 14959788 missense_variant p.Arg38Gln

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34834.1
MFVHHRTNLVIVLTILIACTTRAQNLTCNRQCGKQSVRFPFGFSEGCEIILNCSDNKVRLHEFLVQNITNSNILVNLPAKCNRSMESIEPLFGNNFAPSVNNSFLVQDCSDASRGCAFPASNFVETCDKTSGNISCFSKQDEAGVLTYKDLKETKCNYLFSAIYFGQSKEITLQFQVVELAWWLQGQCDECSENATCSTVQRGFRCQCIHGFTGDGFINGTGCRKTSASSCSASTLASGGCGKATKIGVAVGASIAGALVVAGLFLLCYCARRRSIWLGKHTRVKRQLREAAGNSSIPFYPYKEVEKATNSFSEKHRLGTGAFGTVYAGKLHSDEWVAIKKLRQRDTNSADQVMNEIKLLSSVSHPNLVRLLGCCIEKGEQILVYEYMQNGTLSQHLQRERSEGLPWTVRLTIATETANAIAYLHSAIHPPIYHRDIKSSNILLDYHFKSKIADFGLSRLGMTETSHISTAPQGTPGYVDPQYHQNFHLSDKSDVYSFGVVLVEIITAMKAVDFSRPRSEVNLAALAVDRIRRGAVDEIIDPFLEPHRDAWTLYSIHKVAELAFRCLAFHSDMRPTMMEVAEELEHIKRSGWATMEETAMTSSNGSTCSSPRSGSEKSLSGIKKAGQGSARLIVPQKIERFFHSVEVKDSSPVSVHDPIHWSSGHSSLSSNSLLVNVIP*


CDS Sequence:
>Vu_34834.1
ATGTTTGTTCACCACCGTACGAATCTCGTTATAGTCCTCACGATCTTGATAGCGTGCACAACAAGAGCGCAAAACCTCACCTGTAATAGGCAATGCGGGAAGCAGAGTGTTCGGTTCCCTTTCGGATTCTCCGAAGGTTGTGAAATCATACTAAACTGTTCCGACAACAAAGTTCGTCTTCACGAATTTCTGGTCCAAAACATTACCAACAGCAACATACTCGTCAATCTCCCTGCAAAATGCAACCGCAGCATGGAATCCATCGAGCCACTTTTCGGTAACAATTTTGCTCCCTCTGTTAACAACAGCTTTCTGGTGCAAGATTGCAGCGATGCGTCTCGAGGGTGCGCTTTTCCGGCTTCGAATTTTGTGGAAACCTGCGATAAGACAAGTGGTAATATCAGTTGCTTTTCGAAACAAGATGAGGCGGGTGTTCTGACGTACAAAGATTTGAAAGAAACTAAGTGTAATTACTTGTTCTCTGCGATTTATTTTGGGCAGAGCAAGGAGATTACGCTGCAGTTTCAGGTGGTCGAGTTGGCGTGGTGGCTTCAAGGACAGTGTGATGAATGTTCTGAAAACGCTACCTGCTCAACGGTCCAAAGAGGGTTTCGGTGCCAGTGTATCCATGGTTTCACCGGCGACGGCTTCATAAATGGCACCGGTTGCCGGAAAACTTCGGCTTCAAGTTGCAGTGCATCGACACTGGCTTCCGGAGGATGTGGAAAAGCAACCAAAATCGGCGTTGCTGTTGGAGCGAGCATAGCTGGAGCTTTGGTGGTGGCTGGTCTATTTCTTCTATGCTACTGTGCTAGGCGCCGCTCTATTTGGTTGGGAAAACATACCAGAGTAAAGCGGCAATTACGTGAAGCTGCAGGAAACTCAAGTATACCTTTCTATCCCTACAAAGAAGTAGAAAAAGCCACAAATTCTTTCTCTGAGAAACACAGGCTGGGAACCGGGGCATTTGGTACAGTTTACGCCGGAAAACTGCACAGTGATGAATGGGTTGCTATCAAGAAGTTAAGGCAAAGAGACACCAACAGTGCTGACCAAGTCATGAATGAGATCAAGCTCCTTTCTTCAGTGAGTCATCCAAATTTAGTTCGGCTCTTAGGTTGCTGCATAGAGAAGGGAGAGCAGATCCTTGTTTATGAATATATGCAAAATGGAACACTTTCTCAGCACTTGCAAAGAGAGAGGAGTGAAGGACTGCCGTGGACAGTAAGACTTACCATAGCTACTGAAACTGCTAATGCTATAGCATATCTCCATTCCGCAATTCACCCCCCAATTTACCACAGAGACATAAAATCTAGTAATATACTTTTGGATTATCACTTCAAATCTAAGATAGCTGATTTTGGGCTTTCTAGGCTTGGCATGACAGAAACATCTCATATCTCAACCGCTCCACAGGGGACTCCTGGTTATGTGGATCCCCAATACCACCAGAACTTCCATCTTTCTGATAAAAGTGATGTGTACAGTTTTGGAGTGGTCTTGGTAGAGATAATAACTGCCATGAAAGCGGTTGATTTTTCTCGACCTAGGAGTGAGGTTAACTTAGCTGCACTTGCCGTAGATAGGATTAGGAGGGGTGCTGTAGATGAGATCATAGACCCCTTCCTTGAACCACACAGAGATGCTTGGACACTGTATTCTATTCATAAGGTAGCTGAGCTTGCATTTAGATGCCTTGCTTTTCACAGTGACATGAGGCCTACTATGATGGAAGTGGCAGAGGAGCTAGAACACATTAAACGCAGTGGATGGGCAACTATGGAGGAAACTGCCATGACTTCATCGAATGGATCCACTTGTTCATCACCTCGCAGTGGAAGTGAAAAGTCATTGAGTGGTATCAAAAAGGCTGGCCAAGGGAGTGCGAGATTGATAGTTCCCCAGAAGATTGAGAGATTTTTTCATTCTGTGGAGGTGAAAGACAGCTCTCCTGTATCAGTACATGATCCTATTCATTGGTCGAGTGGACACAGCTCACTTTCGTCAAACAGCTTGTTAGTAAATGTCATCCCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_34834::LG10:14957168-14959168(+)
ACTAAAAAAGAAAATAAATTATTTTTTATTTGAATATATCTTCATTTTGAAATCATAATTAAAATCTCAACAAAAAAACTAATTAAAAGTTATAACATTTTGAAATTATAGTTTTTTTAGTATATATGGAAATGAATAAATTGATTTATAACTCCTTGAGATCTGTTTGAGTGACCAGTTAAGTGGATCTATCTTCATTAAAATAAAAAAAGACAGTCATCATCTATTTTAAGTCTTACAAACATGTAATTTGATTAGAAATAAAGTAATCATGATAGATATGGTGGAAACCTGGTAGCAGATTAGTGGTCATAAGCCGAAGAGAAACAACAAAATGAAAAGGAGGGCACCATTCATTTCACACCAAACAATCTGATTAATTTATAGCCAAACATAAAAGTTCCATGATTTTGTTATAGGTTTAATGTCTCAATAGTCCCTGTTTTTGTTCAGAATTTGAAATAGGTTCCTTTATTTTTTGGCGTCTCAATTGGGTCCTTATTTTTGTTAATTTGATGCAAATAAATCATTTCCGTCAATTTTATCAAACGGCGTTAATGAATGTGTGACGTGACCGGCCTGAGGACAGTATTGACACGTGTAAGGCCACGTCACACATTCATTAACGCCGTTTGATGAAATTGACGGAAATGATTTATTTGCATCAAATTAACAAAAATAAGGATCCAATTGAGACGTCAAAAAATAAAGGAACCTATTTCAAATTCTGAACAAAAATAGGGACCTAAACCTTTTGTTATATCAACGCTTCCCCCTAACTGATATAAGAGTGTAAATTATTTATCTCCTACAAACAAAATTGTTTATGTTTATTTCCCTTAATTCAGTTATACATTGTTAACGATAATTTAAATATATTTTCAACTTTTTATTGTTTTAAAATGTATTTTAAGAAAATTGTGATGAACTTTAATTTTTTAAAATAGTTTAATTCAACAAATTTAAAGTCAAAACATTTTAGAGTTATTTAAATAAATGTAAAAATAGTTTCAAAACGGATCCTTATTTACAAATCAATATTAAAGATAAGTTTTTAAAATAATTTTTTAGAACAATCTGTGAGAGAACTTCCAATTTAGAATATATCAAATAATTTTCTAAAAGTTTTACATAAGTTAAAATAAAAAAGTGTTATTGTTTATACCATTAAGGGTATTCTTTTTTTTTTTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATTTAATTTTACATTTTAAGTAATTATTATTTTAAATTACAATAATTATATTTTCATTTTTACCTTTAAAATGACTGTTAATTTAAATTTAATCATTTTTTGAATTAAAGTAATTATTTTATCATTTTATTTTTTAATTGAATATTTATTTAATTTTTTTGAATTAAATTAATTGTCTGTATCAAGAAAAAGAGAAAAACATATATTTTTACTAGTAATAATAACTAAAAGGATATTTTAAATTACAACGTTTAATATTGAGTTGATTAATATAGTTGAGTCTAAATTCATTTTATAATTAGTTCTTAATAAATAATACAAATTTGATTGATTTTGGGAGTTTATAGAAAATTTGTGTGATTTTACGGTAGATATTGAACCTATCATTATGTATATATAAACTTCTAAAACTTAATTGATGCATAAATTAATTTATGATAATTTTTTTTGTTTTCTAAAAGAATTTTAATCTTGTTAAATCATGTCTTATACAGCCATAGCAAACATTTTTAGTAAAAAAGTACAATCGGAGAAAACAATACTGTGTATATATAGGGCTCAAACTAGAAAATGTGTGGTATAAGTCAAACTTCTTACAATTTGCCTTGTTTTGACCAACTAAAATTTTACGTGCAGTGGGCGTAATTTGGCTATGGAAGAGGGGCATTTTGTGCAGAAGAAAGTTCATTGAGGGGTACATTCGGTATTTCATGTTCAGAAAAAGATGTCGACTGTCACATGTATTTTATTTCCAAGACATTAACAAAGTGTGAATG


Gene Sequence:
>Vu_34834(+)
GTGGTGGCTAACTTTCTTACTATTAGAGTATTCTTCAATTCACAACCTACGCTCTGCTGCAACTTCCGTTTTATTGTTTTCCCGTCGGAGAAGAACGTTAAGCAGACAAAACACATATCTTAGAAGGGTGTTGTGTTGTGTGTGCTGTGCTGAATTACTTCTTCAACTGCTGCAGTCATTAATTTCAACCTTTGCAGAACCTCTGAAGGTATGCATATTTATGTCTCTGGGCAATTAATTCATTTTTTTTTCAGTTTTCTTTTTTAAATTTTCCCTCAAAGGGGATTGGTTCTCTTGTATGAGCACGCATTTATTGAGATAGATGGCTACCCAACGGCACCGATCACAACCTTTAATTTTCATTTAATCCATCATCTGAAAGATTATCGTCTTACCATGTTTCGGGAGAATTCAAGTTGAATTTTTGTTTTAATAATTTTCAGCAAGGGAAGGGGGATGATAGTGATTACCAATTTGAAGTTAGTTCAGTTTCAATGAGCATCTAAAAATGTTTGTTCACCACCGTACGAATCTCGTTATAGTCCTCACGATCTTGATAGCGTGCACAACAAGAGCGCAAAACCTCACCTGTAATAGGCAATGCGGGAAGCAGAGTGTTCGGTTCCCTTTCGGATTCTCCGAAGGTTGTGAAATCATACTAAACTGTTCCGACAACAAAGTTCGTCTTCACGAATTTCTGGTCCAAAACATTACCAACAGCAACATACTCGTCAATCTCCCTGCAAAATGCAACCGCAGCATGGAATCCATCGAGCCACTTTTCGGTAACAATTTTGCTCCCTCTGTTAACAACAGCTTTCTGGTGCAAGATTGCAGCGATGCGTCTCGAGGGTGCGCTTTTCCGGCTTCGAATTTTGTGGAAACCTGCGATAAGACAAGTGGTAATATCAGTTGCTTTTCGAAACAAGATGAGGCGGGTGTTCTGACGTACAAAGATTTGAAAGAAACTAAGTGTAATTACTTGTTCTCTGCGATTTATTTTGGGCAGAGCAAGGAGATTACGCTGCAGTTTCAGGTGGTCGAGTTGGCGTGGTGGCTTCAAGGACAGTGTGATGAATGTTCTGAAAACGCTACCTGCTCAACGGTCCAAAGAGGGTTTCGGTGCCAGTGTATCCATGGTTTCACCGGCGACGGCTTCATAAATGGCACCGGTTGCCGGAAAAGTGAGTTCACATTATTTATATAATCATATATTTATCTATCTACTGGTTTTATTATTTTATTATTATATGGTTTGGTTCTTGCTTGTGGAAAAATTGCGGGGTTTGACTGAGAATTTAACACCTGCTTGCGGCTTTATGTGCTGGATAACCATGTGGCAAGACCCCAATTTTGACCCGTCTCAAACAAATACCCATCTTCTTTAAAATGTTAGGTGCCTAGTGTATATCTATCACACCATATCGAGAGACTGCACTCATTTTTTTCACATTCTATTTGCAGAAAACATGCACATTTTCTTCTTAATTTGCAGAGTTAACATCGTACAAGAGCATTGATTTCCTTTTTAGCTTGAGAATGACCTAAACTCAATGGATGGAATGGAAAAATTTGTTAATATGTTATAACAATATAATCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATTTTATAATTAATTATTTTAGATTTTTTCAGTAAAATATTTTATCATGTTTTATAAGTAATGTACAAAATAATACTTATATATCTTTCTTAAATATAAACATTGACTTTATATTCGAATATGTTTGTACTCGTAAAATATTTGAGTGCATACTACTGAATTATTAATGATGTATTCAAAAGTTAAGAAAAAAACAAATATTTTTTAAAACAAAAGTATGAAGAGACGTACACTGTACTAGCTCACCTAAACCCTACCTGTAAAACCACGTTGACTTTCCCTTTCTGATAAAACAACTTGCATTTTGTTTTTCTTCTGGTGGTCGTGTAGTTCACAAGGCATTGCAGGTTCCCTAATTTTGGATAGATATGGAAGAACAGCTATTGATAGCTTTGCTTATAAACCTATTTAATTTTTACCCCATTATAATTTTCGTGTTACTTCTCTAAGGAATCCAATCTCATGGAAGATAGGGAGTATGGCAACTGCATAGATTATTGGCGTTATGTTCTGAGTTTTCTTTTATTTGAGTAGGGTTGGAGGGAATAACGAACGCGTTATTTGTTTTAAATGGTAACTTAACCGAACAGAATCCTTGAGAAATCAAAAGTCAACATGTTTTGGCTGCACATGCGTGGTTGAATGGAATTGAATTTTCAATGTATTAGACGTGGTCAAACGGGAGATATTGCTCAACGTGAGCAATTAGTATTAGGAACTTGCCAAATTTAAGGTAGTAATTACTACTCGTAACATTAGGCATATGGCATCACTGAAAATTTATTTATCACCCATATGTTGACAACGCAAATTGAATGTGATTCGAATTACCCTTTCTACTAGACATTTTCTCAATATAGATATCTCATATTGACATAAAACCTTAGTTCGAACATTTTCTGTGCCACGTCTTGACGATTTTTCCTATTGCACGTGTTTGGTTTATTTTTTAATTCAGACGGGTTTATAATTAAAACTTTACAGAATTCAAACATTAATAAAAACTGAAGCAATTTCTGATCAATAACAATCATGTCTTCAAAAGCTATAGATCAAACGAGGAAGATTTTAGTAGATACTGCATATCCAGAACATATGTTTTTATCATCTAATGTGATATATTAGTTTTTTTAGCATATATCGTCATTGATTTTAATCTGTTCCTACGGTTGCCTTGTCATCAGCTTCGGCTTCAAGTTGCAGTGCATCGACACTGGCTTCCGGAGGATGTGGAAAAGCAACCAAAATCGGCGTTGCTGTTGGAGGTATTATAGAATAGAACCTTAACATCTTAATGTCCTACTCGTTTCACTGTATATAGTCATATGTTGGAAATTTGTTTCACACGAGAATCTTTGTTAACCTGTCAAACTTTTATTGAATGCATATTTTTTCACGTTCTTGATACAAACATGAATACAGAAGAGAAGTTCTTAAATTTCATATTTGGATTAATTCTGCATGATTGTTCACACTTGACAGCGAGCATAGCTGGAGCTTTGGTGGTGGCTGGTCTATTTCTTCTATGCTACTGTGCTAGGCGCCGCTCTATTTGGTTGGGAAAACATACCAGAGTAAAGCGGCAATTACGTGAAGCTGCAGGAAACTCAAGTATACCTTTCTATCCCTACAAAGAAGTAGAAAAAGCCACAAATTCTTTCTCTGAGAAACACAGGCTGGGAACCGGGGCATTTGGTACAGTTTACGCCGGAAAACTGCACAGTGATGAATGGGTTGCTATCAAGAAGTTAAGGCAAAGAGACACCAACAGTGCTGACCAAGTCATGAATGAGATCAAGCTCCTTTCTTCAGTGAGTCATCCAAATTTAGTTCGGCTCTTAGGTTGCTGCATAGAGAAGGGAGAGCAGATCCTTGTTTATGAATATATGCAAAATGGAACACTTTCTCAGCACTTGCAAAGAGAGAGGAGTGAAGGACTGCCGTGGACAGTAAGACTTACCATAGCTACTGAAACTGCTAATGCTATAGCATATCTCCATTCCGCAATTCACCCCCCAATTTACCACAGAGACATAAAATCTAGTAATATACTTTTGGATTATCACTTCAAATCTAAGATAGCTGATTTTGGGCTTTCTAGGCTTGGCATGACAGAAACATCTCATATCTCAACCGCTCCACAGGGGACTCCTGGTTATGTGGATCCCCAATACCACCAGAACTTCCATCTTTCTGATAAAAGTGATGTGTACAGTTTTGGAGTGGTCTTGGTAGAGATAATAACTGCCATGAAAGCGGTTGATTTTTCTCGACCTAGGAGTGAGGTTAACTTAGCTGCACTTGCCGTAGATAGGATTAGGAGGGGTGCTGTAGATGAGATCATAGACCCCTTCCTTGAACCACACAGAGATGCTTGGACACTGTATTCTATTCATAAGGTAGCTGAGCTTGCATTTAGATGCCTTGCTTTTCACAGTGACATGAGGCCTACTATGATGGAAGTGGCAGAGGAGCTAGAACACATTAAACGCAGTGGATGGGCAACTATGGAGGAAACTGCCATGACTTCATCGAATGGATCCACTTGTTCATCACCTCGCAGTGGAAGTGAAAAGTCATTGAGTGGTATCAAAAAGGCTGGCCAAGGGAGTGCGAGATTGATAGTTCCCCAGAAGATTGAGAGATTTTTTCATTCTGTGGAGGTGAAAGACAGCTCTCCTGTATCAGTACATGATCCTATTCATTGGTCGAGTGGACACAGCTCACTTTCGTCAAACAGCTTGTTAGTAAATGTCATCCCTTGACATGTATACTTACTTTGGGGTGGCTAGCCTCCATAAATGTGAATACTAAAGGCATATAACACTTCCTTTTCTCTGTCGCAGTTGTTGCTATACCTATTTTTGTGTATGATTAACTTCCAAATATTATATTCATAAATCATCAGTGATCAATATGCAGAATTCACTACTCAGTCAGGATCAACACTATGCTAGTTACTGTATATAATTATGGTTGAAAGAAACCACCTTTGGCTACAATTGTC

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