Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34692 LG10 13469783 13473669 PREDICTED: telomere repeat-binding factor 2-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 13469855 missense_variant p.Ala25Thr
G/A 13469907 missense_variant p.Arg42His
C/G 13469944 downstream_gene_variant
G/A 13470054 downstream_gene_variant
G/A 13470065 downstream_gene_variant
T/G 13470376 downstream_gene_variant
T/C 13470585 downstream_gene_variant
G/A 13470678 downstream_gene_variant
A/G 13470692 downstream_gene_variant
A/T 13470697 downstream_gene_variant
A/G 13470724 downstream_gene_variant
G/T 13470733 downstream_gene_variant
G/A 13470837 missense_variant p.Arg141Gln
G/T 13470906 downstream_gene_variant
G/C 13470969 downstream_gene_variant
A/T 13470997 downstream_gene_variant
C/T 13471114 downstream_gene_variant
T/C 13471450 downstream_gene_variant
A/T 13471513 downstream_gene_variant
A/G 13471610 downstream_gene_variant
G/C 13471645 downstream_gene_variant
T/C 13471732 downstream_gene_variant
C/G 13471883 downstream_gene_variant
A/G 13471934 downstream_gene_variant
A/C 13472300 missense_variant p.Arg163Ser
T/A 13472528 downstream_gene_variant
C/T 13472631 downstream_gene_variant
T/A 13472715 downstream_gene_variant
A/T 13472855 stop_gained p.Arg199*
A/T 13473119 downstream_gene_variant
A/G 13473123 downstream_gene_variant
A/T 13473378 downstream_gene_variant
A/G 13473491 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34692.1
MGAPKQKWTAEEEAALKAGVVKHGAGKWRTILTDPEFSSILRMRSNVDLKDKWRNINVTAIWGSRQKAKLALKKNLLPSPKIDNNHMALSTAVQRDRGAADPKPLAVSGAISPNSKEKVSRLQNFQLDNIILESIIKLKEPKGSDRAAIASYIEDQYCSTPTLRKLLSTKLKHMVASGKLMKVKHKYRIATNLTISEKRRCSSLLLLEGRPKDSPKTEKNGVNILSKSEIDAELSKMKGVTPQEAAAAAAKAVAEAEAAIAEAEAAAREADTAEAEAEAARMVSASAVLI*


CDS Sequence:
>Vu_34692.1
ATGGGTGCTCCTAAGCAAAAGTGGACCGCAGAGGAAGAAGCGGCATTGAAAGCTGGAGTTGTCAAACATGGGGCTGGAAAATGGCGCACCATACTTACTGACCCAGAGTTCAGTTCCATTCTGCGCATGCGTTCTAATGTTGATCTCAAGGACAAATGGAGGAACATAAATGTGACAGCAATATGGGGATCAAGGCAGAAGGCAAAGCTTGCTCTTAAAAAGAACCTACTACCATCCCCAAAAATTGACAATAATCACATGGCCTTGAGTACCGCAGTTCAACGTGACAGAGGAGCAGCAGATCCCAAACCTCTGGCAGTTTCTGGTGCAATATCTCCTAATTCAAAGGAAAAAGTATCAAGGCTACAGAACTTCCAGTTGGATAATATTATATTAGAGTCTATTATCAAGTTGAAGGAGCCGAAGGGTTCTGACAGGGCAGCAATTGCTTCATATATTGAGGATCAATACTGTTCTACACCAACCCTCAGAAAGTTACTGTCAACAAAACTGAAGCACATGGTGGCAAGTGGAAAATTAATGAAGGTAAAGCATAAGTACAGGATTGCAACAAATTTAACTATATCTGAGAAAAGAAGATGTTCTTCCTTGTTACTCCTGGAAGGAAGGCCCAAAGATTCTCCAAAAACTGAGAAGAATGGTGTCAACATTCTTTCAAAATCCGAAATTGATGCAGAGCTATCAAAAATGAAGGGTGTGACACCACAAGAAGCAGCAGCTGCTGCTGCAAAAGCAGTTGCTGAGGCGGAAGCTGCCATTGCCGAGGCTGAGGCAGCAGCTAGGGAGGCAGACACTGCAGAAGCCGAGGCAGAGGCTGCACGAATGGTGTCAGCTTCTGCAGTGCTGATATGA


Promoter Sequence:
>Vu_34692::LG10:13467783-13469783(+)
CTACTTTTTATTTATTTAGTTTTTAATCTCCTGGTTTCAAAACAATATAGTGATGATTCTTTGCTGCTATTCTCAAGTGCAATTTGTAAAATGGTGATTTCCCAGTTGAAGGATGCTTATTACTTATTATGGTATGATTTTTGTTCTTCAATAATATTTCCAATTTAAGCTTCCATTCCTTTTGATTGTGATCTTTTTAAGCAAATTGAATAGACGAGAGTACATTAATGATTTTTCAGGATTACTCAAGGAGAAGAGTTATTTTTAATAGAAACAATTTATACAAATATACGAGTTTGAATTTTCAAAATAAATATGAAAACATTTGTATAGAAATTTACTTATTAGGTCTTTTATATAACTAATTAATGAAAACATATTAATTTATATTTATGTTCACCTTTTTATAATAATAAAATTATTACTATTATAATTATAAAAATAAATATAAATAATTTTTATTTATTTTATAGATGTTTTTATAAGTAACTATTTTAGGTTAAAAAATAATTAAATTGAAAAACTACTTAAAAAGTAAAATTGATAAAATAATTATTTTAATTTAAAAAGTAGTTGTCTAAAAAATAAAATTAGAAAAAAAAATATACATCAAAAGATTTATTATAACATAATAAATATGGATTATAATTTATAATATAATCTATTATATTATAAATATTTTAATAATATTTATATTTTTTATTACAATAAAGTAATTAAAATATAAATATAAATAAAATAAAAAATTATTAATGATAAATAAATAAAATTTATTTTCCCTTTAATTTTTATTCTATTTTCACCTTTAAATTGTACTTAAATTGAGTAGTAGACCACCATTGGTGGTTGGCCTTTTATGGAGTTCTGTGCATCGAGATCCAGTCCAAAAGAAAAGTAAAATTATAGAGAAAAGCTAAAAACAAATTTGGATACAATAAAGGGATCATCTAGAAATTTAAAAAAATATTGAATTGCTAGTTTTTTCTCAGAAAAAACAACATTAAAACAAATAAACCAGAAGACATCAATTATTTTTTCTCTTGTTATTTTCCTGTTCCTCACAGGTACCAATTCCATTTATCTGCGTGTATGTACTCCAACGTCTCCCAATTCACATCTTTGCCCCGCGATTCTTCTTCGATGCGTTACATCTTCTTCCGTCGATTCTTTGCTAATTTTCTTTCCTTTTTCTCCCAAGTCAACTAAATTTTGTGTCATCTATATTTCCAGGTTAGTTAATGTGCACTGATATAGTTTACACATCGCCGATTGTTTTCTCTGTTACTTTTATTAAGTGTCCTGTGCGAGTTGAAGAGTCGGCCACTTTTCCTTGTCATTGTATTTGTTTAATTAATGTAAGATTTATGTGTGCATAATGAATTTGAAACCGAATCAAAAGCATCAGTTGGGTTTTTATTTGAGGCGGTGATGTAATAACCCTTTGAGGTAATTCTGCACTGTTGTTAATGTTATGAGAGTTATGGAATCAGATGTAGAATTAGAGTAACTCTTTCTGTACGAGGACATGCGGTGCCATTTTGCTATGTTTGCAAGGACTTGTCTAATTGTATTGCCATTGCAAAAATAATGTGCATTTTTTTTTTCCTGGTCAAGATGCTTCTGACAATGTTTAACTTATATCACTTTTTCCTGATAAATAATATGAAAAGGTGATTATTAGGCTTTCCGGAGTTTCCACTGTTCAGAAGTTAGATGTCTTGTGGATGAGATTGAAGGTAATTGAAAATTGAAGTCAATGCTTGATGAGGGAGATCTTGGGTTCGATTTTTTTTGTTTTAAGAAAATATTTAAGGAAGAAAATGTGTTTAAACATGAAACTGTCTTGTCATTTGTATTTAACTTTTTTTTCACTCTCATGCCTGTAGGTAAGTTAAGGGAGAGTTTTTTGGTTGGTTGATGGACATGCAGAAGAAGACAGTCCTCAACTAAAACAAAAGCAGAGATTTGGCTGTCATAGAAAGGTTTCGGACTTATTTTAA


Gene Sequence:
>Vu_34692(+)
ATGGGTGCTCCTAAGCAAAAGTGGACCGCAGAGGAAGAAGCGGCATTGAAAGCTGGAGTTGTCAAACATGGGGCTGGAAAATGGCGCACCATACTTACTGACCCAGAGTTCAGTTCCATTCTGCGCATGCGTTCTAATGTTGATCTCAAGGTAAGTGTCGGCCTAAAATGTTACTACTCTGCACATGTGAAATGACATTCTTGTTTACTGCATCAATATTTGCAGAGTTCTATTAGCTTTCAGAAAATTTCTAAATTTTAAGCATACCAGGGTGTATCATGTGTGTTTTAAACCGTGAAACAGGACAAATGGAGGAACATAAATGTGACAGCAATATGGGGATCAAGGCAGAAGGCAAAGCTTGCTCTTAAAAAGAACCTACTACCATCCCCAAAAATTGACAATAATCACATGGCCTTGAGTACCGCAGTTCAACGTGACAGAGGAGCAGCAGATCCCAAACCTCTGGCAGTTTCTGGTGCAATATCTCCTAATTCAAAGGAAAAAGTATCAAGGCTACAGAACTTCCAGTTAAATATATCTGCCATTTACTCTTGACTAGTAATTGGTCTACTCGGTTTAGTTGAGTTAATTTTTTAAAAACTGTATGAAGAAACATGTATAATTAGGTTTAAGATTGCACAATACAGTGCACTAGTATACAATTTTTTTAATAAATAGAAAATTAAACTAAGTTTCTAGAAATGGTTTTTTAATAAATAGAAAATTAAACTAAGTTTCTAGAAATGAGGAATCATGTATTTTGATTATTCATTTCTGTTGATTTTTGTTTATTTAATTTTATGATGAATTTGAACCTAGCAAGACAAAAATACACAGAAAGTATGATATTCAGTTGCCTATTGATAAATAGTTATCTTCTGTTGTTATCTCTGTTGACAATATTCCATCAAATTTTGTGGTAATTTTGTCAAAATATTAAAACTATTGTTAATTGTGACATTATGCATTTCAATGACAGCAGCTGTATGCTTTTTAATAATGTCAGGTTGGATAATATTATATTAGAGTCTATTATCAAGTTGAAGGAGCCGAAGGGTTCTGACAGGGCAGCAATTGCTTCATATATTGAGGTATTTGTACTAGAATCTAAGCATCTCAAGAAACAAATGATGATCAAAGTGTTAGTGCATGTAAACTTTAATTCTAAAAGAATATTTAATTTGTTTTGTGGTTGGCTTCTTTTTTTCCTGATAATCTCTCATGAAAAGATTTAATTCAAGATTAGAGAGTAAATTGTCTGCATTCATTAATCTGCTATCAAATAATATATCTTTCCATGTAGACATTTTGCATTGATTGATTTATTACTTATATGTGACAAAGGAAATGTATGTGCCCGTGTTTTCTAATCTAGTTTGCAGTACACAACAAAATTCAGGAAAAAGTTTTGAAATATTTCTCTGGGTGGTCCATGGAGTGAGATATTGGATGTATTTAGTAGCTGATAAGTTAGCTTGTAAATGAACATAAGTACATAAATTTTATTGTATAGATAGGATTTGTGTTTTTTAGACAAAAATATATTATGTAATTATAATTTTATAATTTTTAACAAATAAGTAAATTCTTATTAAACATTTTAGTGCTTCTATTTCTTTTTTTAATGTCCTATATGTTTTTTGGATTTAGAAAAGGGATTTAGTTTATACTAGGTGATCTAATGTGTATTAATGAAATTTAATTTTTATTTATCTTATAAAACATAAATTTTAATTTTTAATTTAAACTACTGGTGATTTTTTTTAATTTTCATTGTATGATTTTCAAATAGTATCATGTAAAGAAAGGTTAGTTACTTCATTTATAATGTTAAATCTTTTTTTAATTTGAACTAAAAAGACTAAAAATTGTGATGACTAATTGTCAATGTAACATTCAAAATAGGTGATCATAGGTAAAAAGAAATTAAGAATAATAAGGAAATGTATTAAAATATAAATGATAGTAATAGAATAAAATAAGCTACAAGCTAGTGAAAGGAACCTCTATCTTATTAGCTATAAACTCTTAAAATTAGTTACTTTGAAGTACCTTACCAAACACTTTTGTGTTGGTAAAACTTGTTTATAAGCTAGTCAAATAAACTTGTAATTAGCTATTTTGTCTTACCAAAATTGCTAATTGTTTATTATCCATCAACAATTTCAACTTGTTATGACATGTAATCGAGAATTCCTTTCTGCGGCTATCAAAAGATTTTGACTTTTTAAATGTTTCTTTTTTCCAAGTCCAAGCTGGTGTCTCACATGTCAAGCATTAAAAGCTACTAACTCTTCTGCTCACCCATGTTTCGGAAATGTTTAGCATAGATCAACCAATAGTAATTTGATATTTATTGCTCTTTTTGTAATCTTGATTGGCTTATAGAATTATTAAATGCAGTAAATAATATCAATTTAAAAGTTTCATTTTGTGCTGGTCAGTACCAGTGCATGGAAGTAATGACAATTTTTCACCTCATCAGGATCAATACTGTTCTACACCAACCCTCAGAAAGTTACTGTCAACAAAACTGAAGCACATGGTGGCAAGTGGAAAATTAATGAAGGTAATTTTATTGTTAGTTAACTTCTTAACAAGACAGAATTTTGCTTGAATTATTGGACCCTATTTTCCTAATAAGCAGCATTTTTACTTACAAAACTTTGTAATGAAGCACAGTCAGCTTGGATAAATTTTAGTTATTGTATGACAGATACATTATTAACAACGTATTGATGTTATTTACTCAAGGTTATGAACAAAAAAATCATTTGTTACACCTAAGTAACTGGTTACATGTATCTACAGATGCAAAAAGACATATTTTCTTGTAGTAGTTGAACTATGCATATCTGACAGATTTTTCGCAAGAGTGATAAATCTATTTCAAATTTTGAATTGATAAAATATTTGCGTCTAATGCTAATTTAATTTTAGGTAAATATTGGGTATGTGATTAATATCAGTATTTGGTCAATTGATCCTGAGTGAGACATATCTAACGAGTAATGACAGGTAAAGCATAAGTACAGGATTGCAACAAATTTAACTATATCTGAGAAAAGAAGATGTTCTTCCTTGTTACTCCTGGAAGGAAGGCCCAAAGATTCTCCAAAAACTGAGAAGAATGGTGTCAACATTCTTTCAAAATCCGAAATTGATGCAGAGCTATCAAAAATGAAGGGTGTGACACCACAAGAAGCAGCAGCTGCTGCTGCAAAAGCAGTTGCTGAGGCGGAAGCTGCCATTGCCGAGGCTGAGGCAGCAGCTAGGGAGGCAGACACTGCAGAAGCCGAGGCAGAGGCTGCACGAGTGTTTGCAAAAGCAGCAATAAAGGCTCTAAAATGCAAGACGCTTCACATTTGGTAAGCTTCCTTTTCCTTACCAAGAAAATTTATCAATGCCTAAACTTGTGTTTACAGAATATTTTTTTCAATTAGAATGCTGTTGGAAAGTGTTTACCATTTCCAATGTAATTGCCCACCATTTCTTATTGCTTATTCAATTTAACAACCTTCTAGTTTATGCAGAGACTGTTTTCAAATTTGAAATCACAACTAACTAGTCAAGAAGGACAACTTCATCATTGAGTCAGGATTGTCCTCAGAATAGCATGTGACAATATCTTAGTTAAAATTCTCATCTCTCTTTTGACTCTAATTACTAGTGATCCTAATCTTAATTGTCAACAAAAACCTTGTCAATTGTGAAAAGATTCCAGTTTTGTTAACTAATACGGGTCAAAAGATTTTCTCCTTGCTTTTATTAGTACTACATTATTCTTGTTCCTGCAGAAAATTGGTTTGTGTCAGTTCTTGTAGCTAACATTTTGATTTTTCAAATGTGTACAGATGGTGTCAGCTTCTGCAGTGCTGATATGA