Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34680 LG10 13367658 13368182 PREDICTED: bZIP transcription factor 53-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 13367735 missense_variant p.Ile150Val
A/C 13367776 missense_variant p.Leu136Arg
C/A 13367778 missense_variant p.Trp135Cys
C/T 13367829 synonymous_variant p.Gly118Gly
A/T 13367908 missense_variant p.Met92Lys
C/G 13367967 synonymous_variant p.Thr72Thr
T/G 13368076 missense_variant p.His36Pro
G/A 13368135 synonymous_variant p.Phe16Phe

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34680.1
MLSHLTSSDSLLGNAFPAFDYALAPWDGLDFLAFNHTSPNPVTSSSASDDPKTTPAHQKPPSDQSNRVVSLTEERKRRRMISNRDSARRSRMRKQRHLENLRNQMNLFRVENRELNNGFQFLLHHCNRLRTENEWLRSERTMLRQKLADINQILLFRQLQPFSTAWPCNIVMAE*


CDS Sequence:
>Vu_34680.1
ATGCTTTCTCATCTTACTTCTTCCGATTCTCTGCTGGGAAATGCATTCCCGGCGTTCGACTATGCTCTCGCGCCCTGGGATGGGCTTGATTTTTTGGCCTTCAACCACACTAGCCCCAACCCCGTCACCTCCAGTTCCGCTTCGGACGACCCCAAAACAACCCCTGCCCACCAAAAACCGCCCTCGGACCAGTCCAACCGGGTTGTGTCCCTCACGGAGGAGCGAAAACGCAGGAGAATGATATCGAACCGGGATTCCGCCCGAAGGTCACGCATGCGTAAACAGAGACACCTAGAGAACTTACGGAACCAGATGAACCTGTTTCGCGTTGAAAACCGGGAACTGAACAACGGGTTTCAGTTCCTCCTTCACCACTGTAACCGTTTACGAACCGAAAACGAGTGGCTCCGGTCCGAACGAACCATGCTCCGCCAAAAACTGGCCGACATAAACCAAATTTTGCTCTTCCGACAATTACAACCATTTTCCACTGCATGGCCGTGCAATATTGTCATGGCAGAATAA


Promoter Sequence:
>Vu_34680::LG10:13368182-13370182(-)
TTATGTACATATAATCAGATCTGTAAAAATAGAATTTATCAAAAAGATAACATCAGAATTGAAGCAAAGCTTAATCTTATATAATAACTAAAGGTGTGTGAAAAAAAAGGTTTATCTAAGATAAACAAAAGCATATAAGCTATGCTTGATGCACAAAAAGTAGAGTAAGTGCATCTTACAATAATAAATAAAGAAGATAATGGTATATTTACAGACAGGATATTGGGTATGCTTATTTTTCCTTTGGAACGACCAAATATTTAATTGAACTCGTGTTACCAAAAACATAAACTTTAAATTCGATTGAGGTTTTAACTGAAAAAGAAATATGTCATAGTAATATGCAAATTAATAATACTTAAGGTTAAGGGGAGTTAGCAGTTATACTCTCCAGTGTTTCTCTTCCCTCTTGTGGTTTTTTATCAGCAAACTAGTGTTTGATTTAAAGTTGACGAACTAAAGTTTGAGTTAAAAGTAGGTTGAGAACTTAATCTTGTCCAGAGAAAAGCTAGTAGAACATAGTTTATATTTGGATGTTTTTCTTTGTCCAAAAGTATACGTTTAACGAAACGAAAATCGTTCATTTAAAGCTAAGATACTTTTACTGTGTAATGGTTTAAAAGGGTTTCAAATCTATTGAAGGGATTAATTGACTACATATACAAATTTGTAAAAGAATAATAAATGGTTAGTGATTAAAATCCAAACTTAGAAAAACAAAACGTAAAATGAGTCAATCTCTGCTTCCAAAATAAACTCTATTTTGGGAATAATATTAATGATAAAATGGTTTCTTGAGACAACCAAACATATAAAAACATGTATAAGGCACAATATCTTGATGTTCCAAAGTGAAGTTTAAAGTCACCAAACATAATCAGTCACATAATGATAGTGGTCTCTTGGACTTGTAACAAAGGTTAATTTGAATCATATAGATTCACCAGTCTGTTTCCCTATATTATATTGATTTAATTAGTTTATAAAAAATTAAAACAAAAAATATATAATTAATAAGCTAATCTCATTACGTTATAATAATGTTAAAAAACTATTTAACAGTAATTGAAGGTGACTTTTTAACTTTTAACCACGTTAATTATTTATATCTCTTTCAAAATATAAAACAATCATAACAACAGAGAGAGTAAGTAGGAAAATATATTTGTTTTCCAACCTTGTTTCCAACTCCTATTATGATTCTAGCAACCTAGAGATTCTCCTACCTCAGACTTTTAAGTACCATTATACTCCGAACAATACAATACCTAGCTGCTTGGCCATTTCCATACAATACGTGCGTATGATAGCATGTACAATACGTGGCCATTTTCATACACATCATTTAATAATTTAATGCTACTGAAAGACTGCATACGTGAATTTTTTCAACAACTTTTATTGATGTACTAATTAATATCAGAATTGCGGTTAACCAATTTTCTGCCTTTAACATGGTGGGAGATGGATATAGCCGAATTTAAAGATAAAACAATATATTTAACATTAATGATAGGCATAATGATAAATAATTTGCGTATGCGCGAAGATGACCTACTACCAAATCCGGCCACTTGTGTTAATTAGATGTCATGAATGAATAAGCAAATTAGATGGTTTAAGTGGAGTGTGTTGATACACCCGCTACAACTGCTAGCTCTGGTTTGGGTTAGAATGGAGGATCAACGTCATCAACATATACTCCCAATCATTGGACATTCATAGACACGCTCTCACACGTGTCAAGCGTGGACCCCTGCTCGTAATTTTACCTTCGCCCGTAAGCTTAAAATGCAGGGACCCACTGGCTGAGGTCACTGAATAAAAAAGTAATTCCACCACCCTAGTGCTCACTGACTCAAAAGCCATCCCCATAATACCCTCTTAACCCTACCCAATTACGCAGATTTAGCCCTACCCCATCTCTTTAAATACGACCACCCTAAGCTGCGTTTCTTCCCTTTCTCTCTCCTTCCTTTCCCCCTCCCAAGTTTCACACC


Gene Sequence:
>Vu_34680(-)
ATGCTTTCTCATCTTACTTCTTCCGATTCTCTGCTGGGAAATGCATTCCCGGCGTTCGACTATGCTCTCGCGCCCTGGGATGGGCTTGATTTTTTGGCCTTCAACCACACTAGCCCCAACCCCGTCACCTCCAGTTCCGCTTCGGACGACCCCAAAACAACCCCTGCCCACCAAAAACCGCCCTCGGACCAGTCCAACCGGGTTGTGTCCCTCACGGAGGAGCGAAAACGCAGGAGAATGATATCGAACCGGGATTCCGCCCGAAGGTCACGCATGCGTAAACAGAGACACCTAGAGAACTTACGGAACCAGATGAACCTGTTTCGCGTTGAAAACCGGGAACTGAACAACGGGTTTCAGTTCCTCCTTCACCACTGTAACCGTTTACGAACCGAAAACGAGTGGCTCCGGTCCGAACGAACCATGCTCCGCCAAAAACTGGCCGACATAAACCAAATTTTGCTCTTCCGACAATTACAACCATTTTCCACTGCATGGCCGTGCAATATTGTCATGGCAGAATAA