Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34679 LG10 13346818 13350032 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 13346844 missense_variant p.Asn593Ser
G/T 13346852 synonymous_variant p.Ser590Ser
A/T 13346862 missense_variant p.Phe587Tyr
A/T 13347669 intron_variant
G/A 13347704 intron_variant
C/G 13347820 intron_variant
G/A 13347827 intron_variant
G/T 13348174 intron_variant
C/T 13348187 missense_variant p.Arg354Gln
T/C 13348282 intron_variant
G/T 13348373 missense_variant p.Leu324Ile
A/G 13348406 synonymous_variant p.Leu313Leu
A/T 13348573 intron_variant
T/A 13348611 intron_variant
G/T 13348612 intron_variant
A/G 13348640 intron_variant
T/A 13349179 missense_variant p.Ser254Cys
T/G 13349186 missense_variant p.Glu251Asp
A/C 13349898 synonymous_variant p.Ala45Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34679.1
MKPVENGETVDINYQNSWLGFSLSPQMNITVPSHSHQTHPSSAAAAETVPPTYYHHTPLHNYGILGEHVGMFSSLPIVPLKSNVSFYGIEAISRSQAQEMATTSAIPLSLDSMFYNQLSCHGSNDPNNQNHVQENISKQQPPYYSSLRNNHDVILEGSKQQLPCIAEDEVACLKSWFSRDFPACQAQESRMFVPLEDNGSKSGPNIGSITYGDLHSLNLSVSPTRPSSRVTGSPAINDTKKRGLEMVDQNQKKIVHRKSIDTFGQRTSQYRGVTRHRWTGRYEAHLWDNSCKKEGQGRKGRQGGYDMEEKAARAYDMAALKYWGPSSHINFPLENYQNELEEMKNMTRQEYVAHLRRKSSGFSRGASMYRGVTRHHQHGRWQARIGRVAGNKDLYLGTFSTQEEAAEAYDIAAIKFRGVNAVTNFDITRYDVEKIMASDNLLSSEQAKRSREKEDGTRNEAFVNQNPCAYEHNKETIVMQKSCKMVPYPPHQQLDQNPPRIESCRTHSFSTAIDNIFHQEVEESSNMGTHLSNPSSLVTSLSSSREESPDKTSLPMLFGMPSTVSKLFTNIPTSDGDSWELSSNLRPALSLPPMPIFASWTDA*


CDS Sequence:
>Vu_34679.1
ATGAAGCCTGTAGAAAATGGTGAAACCGTTGACATAAACTATCAAAATAGCTGGTTAGGTTTCTCCCTCTCCCCGCAAATGAATATAACTGTTCCTTCACACTCTCATCAAACACACCCTTCATCTGCTGCTGCTGCTGAAACAGTTCCACCAACGTATTACCACCACACACCTCTTCATAACTATGGAATCCTAGGTGAACATGTTGGAATGTTTTCTTCCTTGCCTATCGTGCCCCTTAAATCCAATGTCTCGTTCTATGGAATAGAGGCTATCAGCAGGTCACAAGCACAAGAAATGGCAACTACTTCGGCAATACCTCTGAGCTTGGATAGTATGTTTTACAACCAACTCTCATGTCATGGATCGAACGATCCAAATAACCAAAACCATGTACAAGAGAACATCAGCAAGCAACAGCCACCATATTATTCTTCCTTAAGAAACAACCATGATGTGATTTTAGAAGGGTCTAAGCAGCAACTCCCTTGTATAGCTGAGGATGAAGTTGCTTGTCTGAAAAGTTGGTTCTCGAGGGACTTTCCTGCTTGTCAAGCGCAGGAGTCAAGGATGTTTGTTCCTTTGGAGGATAATGGAAGCAAATCTGGACCCAATATTGGATCAATAACATATGGGGATTTACATTCGTTGAATTTGTCTGTGAGCCCTACCAGACCATCAAGCCGTGTTACAGGTTCGCCTGCCATCAATGATACGAAGAAAAGGGGGCTTGAAATGGTGGACCAGAATCAGAAGAAAATAGTACATAGGAAATCCATAGACACCTTTGGGCAAAGAACATCTCAATATAGAGGTGTAACAAGGCATAGGTGGACTGGTAGATATGAAGCTCATCTATGGGACAACAGTTGCAAGAAGGAGGGCCAAGGAAGGAAAGGAAGGCAAGGGGGTTATGATATGGAAGAAAAAGCTGCAAGAGCTTACGACATGGCCGCACTCAAGTATTGGGGACCCTCCTCTCATATAAATTTCCCTTTGGAAAATTATCAAAACGAACTTGAGGAAATGAAAAACATGACGAGACAAGAATATGTTGCTCATTTACGAAGGAAAAGCAGCGGATTCTCAAGAGGAGCATCCATGTATAGAGGAGTAACAAGGCACCACCAACATGGAAGGTGGCAAGCTCGAATTGGGAGAGTGGCTGGAAACAAAGATCTATATCTTGGAACCTTCAGCACCCAAGAGGAAGCAGCAGAAGCCTATGATATTGCTGCCATTAAATTCAGAGGAGTTAATGCTGTTACTAACTTTGATATAACAAGATATGACGTGGAAAAAATTATGGCGAGCGACAACCTTCTCAGCAGTGAACAAGCCAAGAGGAGCAGAGAGAAGGAGGATGGAACAAGAAACGAGGCCTTCGTTAACCAAAATCCTTGTGCATATGAACACAATAAAGAAACCATTGTAATGCAGAAAAGCTGCAAGATGGTTCCTTATCCACCCCACCAACAGCTTGACCAGAATCCACCAAGAATCGAGAGTTGCAGAACTCATTCCTTCTCAACGGCTATAGATAACATATTTCATCAAGAAGTAGAGGAATCGAGTAACATGGGAACACACTTGTCAAATCCTTCTTCTCTGGTGACAAGTTTGAGTAGCTCAAGAGAAGAGAGCCCAGATAAGACAAGCTTGCCAATGCTCTTTGGAATGCCTTCAACAGTGTCTAAATTATTCACTAACATTCCAACAAGTGACGGAGATTCTTGGGAGCTATCGTCCAATCTCAGGCCAGCTCTTTCTTTGCCTCCGATGCCAATTTTTGCTTCCTGGACCGATGCCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_34679::LG10:13350032-13352032(-)
CAGTTTTAATATAAAAAATAGTTATTAAATATATGGATAAAGGTTTTAAAATATATTAAGAAAAGTTTGGTGAGTCATCATGATTCCTAACGTCATCCAACCGAGATCTGCCTCTGCTCTCTCCATTAATTCAATTTTAGTGGCTCAGTTGGTAGTTGCATCTAATGTTAGGTATAATTGTACCAAAGAAAAAAAACTAAAAATATATATAATTATTTAGGTGATTTTGTTATTAACTTTTAGTTAAGCTTTTAAGTTTAGTTTTGAAAATTTTGGTATCGAAGATTTGTATTTCAAATATCGAATTGGAATTTTCCTCTTGGTATGAGCGTAAAACAAAAAGTAAAGAAAAAACTTTAAAGATCGTAAATAAATTTTGTCCACTCCATCTTGGGTGCATTACAGGACTGCCTGTCTCGTTCTCTCCTTTTTTTTCCTTACTAATATTAAGCATGGTGATAATTACGTGTTGCTTTAATGCTTTAACATCAAATAATTACATTTTTCACACTTTAATAAACTTTTTCCTTTTATCTCATTTTATTATCATTTAAGGTAACGTATGTATTAAAAATTTAATTAAATCAAATTTTATAATATAATAAGGTCGATGATAAAGATTACTTCAATAAATATGTCCCACTTTCTTCAATAAAATAGTATAATCTAACTCAAATAACTTTATTTCATATATATATAACTATACTATTAACAATATATTTTCTCGTACATTTATTTCTCGACAGTGTTATTGAGAAAAGAGAGCAAGTGATACTTTCTTATGTTCAAAAGTGACTTAACTAATTTGAGACAAACTAACATTAAATAAGGACAAATAAGATGTGATAGAAGGAGTAATTCGTAACAGCCCAATTATTATTAACTACAAATACGGAACTAAACAATAAATTAATAGTTAAATTTGAGCTTACTTAGGAAATATTAAGTTATCGAAAAATTAAAAAGTAGCGTAAGGCAGTTAATTAAAAGATAAAATTAGCCACTAAGAAGATGAGGGGTTTAAAAAAATATGCATGTGTTAGATTCCTACATAAATGAGATCATTGTTTAAAAAGGTAAAGAAAGTGTTGAAAGTCTCACATCGACCACTGATAAGGCCAAATTATAATATATAATTGAGGCGCAAACCTCACCTTACAAACCGGTTGTGTGGGTTGAGTTAGGCTTAAAGTACACTTCTAATATGACATCACATCAGAGTTATGGTTAAAGCCTATCCTAACAAGTTTTAAGTAGACATTTCTGTTTCTATTCCACCCATTTAAGCCTAACTCAACTCTAAGAGTTCATAATAACTAGCATTGTCAAATTTGTTACATAAAAATTTCATCACCTATTTAATCAGATTGTTATTTGTATGTTTTGAATAAATAAATGAGATAAATTTTGTGTCATTTTGTAGAGTATTACCATCAGCATTTTGAAAAATGAATTGAAAGAAGGTATAGAAAAGAGTAGAGAAATATGGTGAATTACGTACATAAGATGAAAAACAAGAGTAAAAGAGAAAAAGGAAAGTGAAGAAGGGACAGGGAGCGTAGAATAAAGCAAAAGGGAATGTCTTTCTCAAGCACGGATCCCAATAGAAGGCGGGAAGTATACCTAGCAATGCTTGCTGGAACACATTCTTTTTGTTTAGTTTAAAGCATTTTGCTTTGTTCCATACACATATCTGTCCATTCACACCCTCGTTTATACACGCACAAAAACTCATTTATTTTTACACACTCGGATAGAATTTAGATTTCGCCTATTCAGTTCTGCAACCATCAAAACATAGGTGTATATTTAACAAAGCAAATATCGGTTTCAAGGGGGAGGAAATCATAAGTTAGATATATATAAATATGTGTGTGAATCGTGACTTAGTAGTTTATCTGTTTTCCAATGATTGAGTTGTCTTGCCTTAAATCTGCCTACAGTTTCTGTTAGCCAGTGAAGTTAAGTACTCTACTGATACTCAATCAATCTACAAGATC


Gene Sequence:
>Vu_34679(-)
ATGAAGCCTGTAGAAAATGGTGAAACCGTTGACATAAACTATCAAAATAGCTGGTTAGGTTTCTCCCTCTCCCCGCAAATGAATATAACTGTTCCTTCACACTCTCATCAAACACACCCTTCATCTGCTGCTGCTGCTGAAACAGTTCCACCAACGTATTACCACCACACACCTCTTCATAACTATGGAATCCTAGGTGAACATGTTGGAATGTTTTCTTCCTTGCCTATCGTGCCCCTTAAATCCAATGTCTCGTTCTATGGAATAGAGGCTATCAGCAGGTCACAAGCACAAGGTTAGTTCCAACTCAAACTTCTGCTTTTTTTGTATGACTGTACTAATTATTCAACTCGTTCAATACTTTTCTTTTATCTATACATTGTGAAGAAATGGCAACTACTTCGGCAATACCTCTGAGCTTGGATAGTATGTTTTACAACCAACTCTCATGTCATGGATCGAACGATCCAAATAACCAAAACCATGTACAAGAGAACATCAGCAAGCAACAGCCACCATATTATTCTTCCTTAAGAAACAACCATGATGTGATTTTAGAAGGGTCTAAGCAGCAACTCCCTTGTATAGCTGAGGATGAAGTTGCTTGTCTGAAAAGTTGGTTCTCGAGGGACTTTCCTGCTTGTCAAGCGCAGGAGTCAAGGATGTTTGTTCCTTTGGAGGATAATGGAAGCAAATCTGGACCCAATATTGGATCAATAACATATGGGGATTTACATTCGTTGAATTTGTCTGTGAGCCCTACCAGACCATCAAGCCGTGTTACAGGTTCGCCTGCCATCAATGATACGAAGAAAAGGGGGCTTGAAATGGTGGACCAGAATCAGAAGAAAATAGTACATAGGAAATCCATAGACACCTTTGGGCAAAGAACATCTCAATATAGAGGTGTAACAAGGTCTGTGCTCCTCTGGTCATTTCTAAATCTTATTAGCGCTTCAGGCACATTTATTTTAAACGATAAGGCTATAATGATATTCTCTAACTTGCTTAATAACTTTTAACTTCTGTTGTGCTCTTTGCTTAAGAAGTTAAGATTTTTGTCAGGTTTCATGCAGGAACAATGCCAACAACATATTTGATTGTTTATTTCCTTGTTATTTTTTGCGTCGATTTCTAAGAATGTTTGTTCATCAGGCATAGGTGGACTGGTAGATATGAAGCTCATCTATGGGACAACAGTTGCAAGAAGGAGGGCCAAGGAAGGAAAGGAAGGCAAGGTAAGAAAGCGACTATTTTCCCATCACTTTACCTTTTTTTCTTTTTCGGTGAATATTTTTGGTCAAACAAATCCATTGACTTCATTTTTATTCCCCTTTGAAAAGCTCTGCATTTAGTGCTGATCCTCTTTTTTTTCTGTCTTTGATTCGATGATGATTCCACTCGAACATGCAATGCATCTCAGTGTATCTGGGTAAGGTTTTCCAACGCCAGAAAATTTTATTTTATTTTTAATATTGTTCTTAAGGATAGATTAACTGGAAGTTTAAGATATCGTTTTTATATCTTGGTCGTGATGATAGCAAAAGAAGAAAAACAATTTAAACAAGTAAATTCCAAAAATTTTATTGTAGGGGGTTATGATATGGAAGAAAAAGCTGCAAGAGCTTACGACATGGCCGCACTCAAGTATTGGGGACCCTCCTCTCATATAAATTTCCCTGTAATGATTACTTTCTTTCTCATTTTTCTTCTGATTGAGGCTGTATTCAGCTACCAGGACTTAATTGACAGTAACTTACGTTATTCTTTAACAGTTGGAAAATTATCAAAACGAACTTGAGGAAATGAAAAACATGACGAGACAAGAATATGTTGCTCATTTACGAAGGTAAAATATCTTTGATATCTGCATCATCTTGAACTGAATTACTAATCCATGTTCACAACCATTACATTCAACTTCCAACCATCAGGAAAAGCAGCGGATTCTCAAGAGGAGCATCCATGTATAGAGGAGTAACAAGGTCTCACAGGCTAGCATTTACATTGTATATGCATTGCAATTTAACTTAATACGATTGAAATCTGAAGAATAATTTACTTTGTTCTAAACTCGGTTCATTATTCTTATTAACTTGGTAGCAGGCACCACCAACATGGAAGGTGGCAAGCTCGAATTGGGAGAGTGGCTGGAAACAAAGATCTATATCTTGGAACCTTCAGTGAGTTCTTTCAAATTATTTGCTTTATTGTTTTTTTTTACAGTTAAATCATTATAATATTTCCTACACTACTCACCACTGTTCTTTTCATGTAAAATGTTTTAAAATAGGAAATGACTAAGAGGAAGCTTTATGACTTAAAAGCCAATCTTTGATTGAACTTTTCTTTTCAGTCACATATATAAGGCTGATCATGAGCCACTTTAATATTGTAGAGCACTGTTAGTCTTCAAGGCAGCTTTTATCAAAGCTGTTAGTTCAGAAGGATAAACAATCATGCTTTCAACTAATATTTTTAATTATATAAAATTCTGATTTCGTTCTCATTCTCATGCTTTAGGCCAAACAGTAATATAATACTCATCCACTGTCGGTACGGAAAAAGCTAATTCTTACCTTCATTGAAATAAAACTTTAGGCACCCAAGAGGAAGCAGCAGAAGCCTATGATATTGCTGCCATTAAATTCAGAGGAGTTAATGCTGTTACTAACTTTGATATAACAAGATATGACGTGGAAAAAATTATGGCGAGCGACAACCTTCTCAGCAGTGAACAAGCCAAGAGGAGCAGAGAGAAGGAGGATGGAACAAGAAACGAGGCCTTCGTTAACCAAAATCCTTGTGCATATGAACACAATAAAGAAACCATTGTAATGCAGAAAAGCTGCAAGATGGTTCCTTATCCACCCCACCAACAGCTTGACCAGAATCCACCAAGAATCGAGAGTTGCAGAACTCATTCCTTCTCAACGGCTATAGATAACATATTTCATCAAGAAGTAGAGGAATCGAGTAACATGGGAACACACTTGTCAAATCCTTCTTCTCTGGTGACAAGTTTGAGTAGCTCAAGAGAAGAGAGCCCAGATAAGACAAGCTTGCCAATGCTCTTTGGAATGCCTTCAACAGTGTCTAAATTATTCACTAACATTCCAACAAGTGACGGAGATTCTTGGGAGCTATCGTCCAATCTCAGGCCAGCTCTTTCTTTGCCTCCGATGCCAATTTTTGCTTCCTGGACCGATGCCTAA