Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34678 LG10 13335521 13336890 PREDICTED: inactive LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase BIR2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   signal transduction
Cellular Component   located in   plasma membrane, extracellular region, plasma membrane
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 13335556 3_prime_UTR_variant
A/G,* 13335626 3_prime_UTR_variant
G/A 13335632 3_prime_UTR_variant
G/A 13335696 3_prime_UTR_variant
T/G 13335713 3_prime_UTR_variant
A/T 13335875 missense_variant p.Phe240Ile
C/T 13335942 synonymous_variant p.Arg217Arg
C/T 13336185 synonymous_variant p.Gln136Gln
A/T 13336660 5_prime_UTR_variant
T/G 13336680 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34678.1
MDVGCVLLLWWVTLIPGILSDPSDEACLTHLSKSLEDSTNLPHNWKEENFAKPCNDSTSILQGVICNNGRIYKLSLNNLSLRGTISPFLSNCTNLQALDLSSNFLTAQIPLELESLVNLAVLNLSSNRLEGDIPPQLALCAYLNIIDLHDNLLTGPIPQQFGLLARLSAFDVSNNRLSGPIPASLSNRSGNLPRFNASSFLGNKDLYGYPLPPFRNRGLSILAIVGIGMGSGLASLVLSFTGVCVWLKITERKMALEEGKISHLMPDY*


CDS Sequence:
>Vu_34678.1
ATGGATGTGGGGTGCGTGCTGTTACTGTGGTGGGTGACTTTGATTCCGGGGATTTTATCAGATCCAAGCGACGAGGCATGTCTGACACACCTCAGCAAGTCCTTGGAAGATTCCACCAACTTGCCCCATAACTGGAAAGAAGAGAACTTTGCCAAGCCCTGCAACGATTCCACCTCCATTCTCCAAGGTGTCATCTGCAACAATGGCCGCATTTACAAGCTCTCTCTCAACAACCTATCGCTCCGGGGAACCATATCCCCATTCCTCTCCAACTGTACCAATCTCCAAGCTCTTGACCTCTCCTCCAACTTCCTCACCGCTCAAATCCCCCTGGAACTTGAGTCTCTTGTCAACCTCGCCGTTCTGAACCTCTCCTCCAACCGTCTCGAAGGGGATATTCCCCCGCAGCTGGCATTATGCGCCTATCTCAACATCATCGACCTCCACGATAATTTGCTTACCGGGCCTATTCCCCAGCAATTTGGCCTGCTCGCTCGTCTTTCCGCCTTCGATGTGTCCAATAACCGCCTCTCCGGGCCCATCCCCGCCTCCCTGTCGAACCGTAGCGGGAACTTGCCCAGATTCAACGCCAGCTCCTTCCTGGGGAATAAGGATCTCTACGGTTACCCGTTGCCGCCTTTTAGGAATAGGGGGTTGTCCATTTTAGCCATTGTTGGGATTGGCATGGGGAGTGGCCTCGCCAGTTTGGTTCTTAGCTTCACCGGAGTTTGTGTCTGGTTAAAAATCACCGAGCGCAAGATGGCGCTGGAGGAAGGCAAAATCAGCCACCTTATGCCCGATTATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_34678::LG10:13336890-13338890(-)
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Gene Sequence:
>Vu_34678(-)
GCGCTCGAGTGAAGAAGACCAGTTTTTCAAAGAGTCTGCCCTCTTTCTCTCTCATTCCCTCATCTCGCTTTGGCCTAAGACAACAATAACAACATCAAAAAATCCGACATCTCTCGCTTTCCCAACTTCACACCCTGTTTCTTTTGGATAGAAGGAACCCTTAAATACACAGTCTCTCTCTTCTTCTTTCACTCTTCATGCTTCTCAATTACTTCTGTTTGGATGAATCTTGATCTCTGTCTCCACCACTCTCCTACAAGGTAACAAAAGCAATCGGAGAGGGCGAGGTTGTCTGGTAATGGATGTGGGGTGCGTGCTGTTACTGTGGTGGGTGACTTTGATTCCGGGGATTTTATCAGATCCAAGCGACGAGGCATGTCTGACACACCTCAGCAAGTCCTTGGAAGATTCCACCAACTTGCCCCATAACTGGAAAGAAGAGAACTTTGCCAAGCCCTGCAACGATTCCACCTCCATTCTCCAAGGTGTCATCTGCAACAATGGCCGCATTTACAAGCTCTCTCTCAACAACCTATCGCTCCGGGGAACCATATCCCCATTCCTCTCCAACTGTACCAATCTCCAAGCTCTTGACCTCTCCTCCAACTTCCTCACCGCTCAAATCCCCCTGGAACTTGAGTCTCTTGTCAACCTCGCCGTTCTGAACCTCTCCTCCAACCGTCTCGAAGGGGATATTCCCCCGCAGCTGGCATTATGCGCCTATCTCAACATCATCGACCTCCACGATAATTTGCTTACCGGGCCTATTCCCCAGCAATTTGGCCTGCTCGCTCGTCTTTCCGCCTTCGATGTGTCCAATAACCGCCTCTCCGGGCCCATCCCCGCCTCCCTGTCGAACCGTAGCGGGAACTTGCCCAGATTCAACGCCAGCTCCTTCCTGGGGAATAAGGATCTCTACGGTTACCCGTTGCCGCCTTTTAGGAATAGGGGGTTGTCCATTTTAGCCATTGTTGGGATTGGCATGGGGAGTGGCCTCGCCAGTTTGGTTCTTAGCTTCACCGGAGTTTGTGTCTGGTTAAAAATCACCGAGCGCAAGATGGCGCTGGAGGAAGGCAAAATCAGCCACCTTATGCCCGATTATTGAAACATTAATCACAAATTACAATACTTTCAAATATTCCAACCCATCTCTCATTCAACTGCATCCAAAAAAAAAAAAAAATAGTGCCCGTACCAGGTACTTATTTTTTTTGTGTTTATAAAAGCGAGGTTGGGTGTGGGCTACCCCTAATTTCTTCGTACTTATGGGTGGTTCAGATCATTGTCTCTTATCTATCACGGGGACATATTTTATTTTGTAGTAATTTATAAATTTATAATTTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCTTTCCATC