Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34652 LG10 13030449 13031804 hypothetical protein DEO72_LG4g2422
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 13030720 downstream_gene_variant
A/G 13030766 downstream_gene_variant
G/A 13030902 missense_variant&splice_region_variant p.Ala21Thr
G/A 13030966 missense_variant p.Cys42Tyr
T/A 13030967 stop_gained p.Cys42*
T/C 13030998 missense_variant p.Cys53Arg
T/G 13031272 downstream_gene_variant
A/G 13031492 missense_variant p.Gln100Arg
C/T 13031620 downstream_gene_variant
T/G 13031638 downstream_gene_variant
A/T 13031732 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34652.1
MPVPLAPYPPPPPYAPPPNGPQSHLVCSGCRNLLLYPVGATSVCCAVCNAVTTVPPPEMAQLVCGGCHTLLMYIRGATSVQCSCCHTVNLALEANQVAHVNCGNCKMLLRYQYGARSVKCAVCSFVTLVGASTSTTEQKFST*


CDS Sequence:
>Vu_34652.1
ATGCCGGTTCCACTTGCCCCCTACCCTCCGCCACCTCCGTATGCGCCTCCACCAAATGGTCCGCAGAGTCATCTTGTCTGTTCTGGGTGTAGAAACCTTCTGCTTTACCCAGTTGGAGCCACCTCTGTGTGCTGTGCTGTTTGCAATGCAGTCACCACTGTGCCACCTCCTGAAATGGCCCAGTTAGTATGTGGAGGCTGTCACACTTTACTCATGTACATCCGTGGAGCCACAAGTGTGCAATGTTCTTGTTGTCACACAGTCAATCTGGCTTTGGAAGCAAATCAAGTGGCACATGTCAACTGTGGGAACTGTAAGATGCTACTGAGGTACCAATATGGAGCAAGATCCGTGAAATGTGCCGTTTGCAGTTTTGTAACATTAGTTGGGGCCTCAACAAGTACCACTGAGCAGAAATTCAGCACCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_34652::LG10:13028449-13030449(+)
ATCTATAGTCAAATTTAGCCAAACATCAATGCTTTTAAAAGAAACCTGAGTGGACAATTAATGATTTTTTCTATTTTAGTCACAGATTTTCTAAATTATTGAGTTTGATGCTTCCGATTAAGTTGAGTAGATCCGTTGAACAAGTAAGTTTCATATTATTTATAAAACTAATTTTTTTAAAGAAAAATAAAAGTTACTACTTAAAAAATCAACTCTTGAAAACTTTATGATTGGCCATATATCGTACTTTTTGAAGAAGTTAAATTACCTTATTATTTTGGAAATATACCTTTCTAAAATATTTTAAAACGAAAAAAATATTTTCTAAGAGACTAACACGTGTTATAACTAAACGTCTTACATCTATATTTCAACATAAGTCTCATGTTCATGCTTCCCAATTAGAAAATTGATAAATATACACTTTCATGTGGTGCACATTAATTATTTATCTTCATATTTTCTTTCTGTATTTTTTGAACTATTGGTTAAACCAATGTAATAATTTGGTTAAATTGATCAAATTATTAGTTAAATTAATGTCTTAGACAATATGCCAACTGAGACTTTACATAATAATTAAAAGGTATTTGGAAATCTACATGATCATAACAAAATATTGTAACAACATAGAATATCAATTATCAATATATTTATCAATAATTAAAGAAGAAAAAGTCTCAGGTGAGACATTGTCATTAATATCACCTGGGAGCAATAGTAAAAATTATTAGGTCTAGTACAATTCTAAAAGACTGATTAAACATGATGAAAATTGTTATTTAAATAATTTCGAATTCAAATTGTTTCTTGTAACAAAGAAATTGTAGGAATATGAGGATTAAAAAGATATTATTAACGTTATGAATAGTTGTATTATTCAAAACCTTAGTTATCTCCAGAGTGAACAGTGTACATTAAAAAACTGGTAATGTTACAAGAGTTGGAAGAAATAAAATAGAAAAAGAATGTAAATTTTTTTGGAAAAAGGGAGAGATTGGAATATAAGTAAAAGGAAGGACCACAATTTTAGATTAAGCAGTCATGCTCCTTATCTGTCATCTTGTATCTTAGTAATAATAATTCCTATTCTTCGCTCTGTTTTCTCTGTCTTTCCCACTGTATTTGCACAAAGGAAAATGTTAAAAGTGGTCCTTTTCTGCTTCACTAATTATACTCTCACAACTCATCCTGCACATTGAACAATTTTTCTTACAAGTTATTAGGAAGAAGTATATCTTAAAAGTATTTTTTAATATAGGACATGTTGTTGAACTTTATAATTTCTATCCATTTAAACTGACATATGTATTGTTTATTATCCAAATTTTTTCAAATTCTAAAATGTTTAACCAAACAATTAAAAGTTTGGAATATGATAAAGTGCATTCAGCAAAGCTGAAATCTGAAAAGAGGAATCTAAGAGTGTTCGTAATTATCTAGGTGGACTGGACAGGAGGATCAAAACTTCTGAATACTCTTTAAATTAATTTCTGTCGCATCTAACATATTTTCTTGGCCATTGTTTTTTTTCAAATGTCCTCGTACATATGCAAAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACTTCAGCAGTAACAGTTGACAAGGATCTGTGTTTGCCCCCACTGGGAGTACACTATTCTATTTAATCTAATTTTTTCCTGAGAGTGTGTTAACTTTTTTTTCCTTGTTGTTGATCTTGTTCTTCTTTATCTCTCCCTTTTCAGTTGTTTCATGCATGGCTCCCTAAGGGAAAGAGAACTTCGTTTGTTACGTTACCCCGTCTGCAAATTTAGTTACTTTCACAATCTGCTTCGTAAAAGGTTTTTCTCTTCCTCTGATTCTGCTGCTATTAATGACAAAGGACAGTTCATTTTCCATGTTTTTTTATGCCATCGTCAGCTTTCATGTTTCAGTTCTTTTCCAAGAGTTGTTCAATGGGAGGAGAGAGAGTTTTATTCTCTACGTAGAGTTTAGTATTTTGAGAAAA


Gene Sequence:
>Vu_34652(+)
ATGCCGGTTCCACTTGCCCCCTACCCTCCGCCACCTCCGTATGCGCCTCCACCAAATGGTACCTTTGCTTACTCTACTCTTTCTTTATTTGCTCATTCATGTTGGTGGTAGAATGATTACACAATTATTATTTCCGTAAAAATCAAAAGTCCGATTTTTTCTTGTTTTGAGGACAGAGTCCCTTAGAACGATTCACAGATATAAAATAGAAATGCTCAGTTCACCCAAAGGGGGAGTGGAGAATGAAATTTCCTTTCCCAGATGGAAGATTAAACAAGAAGATGTGTTTAGTACAGTTCTGTATTTTTCATTTTGAAAAACTGGACCTGTATTAATGACACAATGAATGCTAGAACATTTATAGCCATGGCATCAAAGAGAAAAGGGTAAAAAATAAATGGTCATTTATTTGATACATGCAAACTAATGTCAAAACCTTCCTTAAGCAGGTCCGCAGAGTCATCTTGTCTGTTCTGGGTGTAGAAACCTTCTGCTTTACCCAGTTGGAGCCACCTCTGTGTGCTGTGCTGTTTGCAATGCAGTCACCACTGTGCCACCTCCTGGTACGGTGCACTTTCTCTCTCTAATTCTTGTTATTTAGGAAGTTCAATTTGTTACCTATTCCAATTTTTCGAATCATAAGCATTTGTTGCATATGCACAGAAATGGCCCAGTTAGTATGTGGAGGCTGTCACACTTTACTCATGTACATCCGTGGAGCCACAAGTGTGCAATGTTCTTGTTGTCACACAGTCAATCTGGCTTTGGAAGGTATTAAACCACAAACAGCCTGTGATGAAATTTCGATTCTTTGATTAATTTTTCTGTGTTAGTTTCTCTGTACCGAATATAAAACCAAAATCCAACAGAGAATTTGAACTCCCTGATGAGCTTTAAAAATAAAAAATGGCGAGTGTTTGTGTTATGTATACGTAATCATGTTGATATGCAGACCGAGTTTCTTTAGTATGCTAAATTGTTATTATTTGAGTCATTATTTCGTATGTATGAACATTGTAACAGCAAATCAAGTGGCACATGTCAACTGTGGGAACTGTAAGATGCTACTGAGGTACCAATATGGAGCAAGATCCGTGAAATGTGCCGTTTGCAGTTTTGTAACATTAGTTGGGGTCAGTACAATCTCTTCTTTGGTTAATACTTTACAGTGCGTCACAGATTCAAAAAGTGCTCTTTTTTATTAGAGCAACCGTGTAATTCTGTTATGCATTCTTCCTTGCTTAGCAACTTAGTGTAATAATTTGAACTGCATTCTTATATACATCTTGCTTACATTGCTGTTACTGAATGATGCAGGCCTCAACAAGTACCACTGAGCAGAAATTCAGCACCTAA