Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34586 LG10 12432814 12438421 PREDICTED: GATA transcription factor 26-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 12433074 5_prime_UTR_variant
A/C 12433088 5_prime_UTR_variant
G/T 12433147 5_prime_UTR_variant
G/T 12433237 missense_variant p.Gly2Cys
G/T 12433246 missense_variant p.Gly5Cys
T/G 12435295 intron_variant
C/A 12435348 intron_variant
C/G 12435472 intron_variant
T/A 12435533 intron_variant
T/A 12435785 synonymous_variant p.Leu190Leu
T/C 12437223 synonymous_variant p.Leu383Leu
G/T 12437408 missense_variant p.Gly414Val
A/G 12437505 upstream_gene_variant
C/T 12437516 upstream_gene_variant
T/C 12437550 upstream_gene_variant
C/T 12437584 upstream_gene_variant
A/G 12437588 upstream_gene_variant
T/C 12437596 upstream_gene_variant
C/T 12437618 upstream_gene_variant
A/T 12437636 upstream_gene_variant
C/T 12437650 upstream_gene_variant
T/C 12437717 upstream_gene_variant
C/A 12437721 upstream_gene_variant
C/A 12437776 upstream_gene_variant
T/A 12437777 upstream_gene_variant
T/C 12437805 upstream_gene_variant
G/A 12437808 upstream_gene_variant
A/T 12437809 upstream_gene_variant
T/C 12437811 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34586.1
MGKQGPCYHCGVTSTPLWRNGPPEKPVLCNACGSRWRTKGTLANYTPLHARTETDACGDQRVSRIKSISNKKREMTLLKPNNDHDNELSGEFAPDYNQGCQIFADEDASNRSSSGSAISNSESCAQYGAMDACDLTGPVQSVVWDAMVPSKKRTCVGRPKASSVEKLTKDLCTILHEQQSYFSASSQEDLLFESETPMVSVEIGHGSILIRHPSYIVRDEESEASSLSVDNKQCPTSEAYSYVGPIMMHNDSSYLKPSSLEVEKIRNYTDQGWQPEQHKSDKSQLERVQILGNHESPLCSIDLNDIVNYEEFLRILTNEEQQQLLKLLPGVDTAKLPDSLKVMFNSSQFKENITCFQQLLAEGVFDISLLGAKPEDCKTLKRLAISNLSKSKWVEHYNFLKKCKNKGGKFDSFGSAVTATTNAANKRTRDSRNQNFPELNTEMRSPKRMITKVSCEVKEGVEDGACYSPKSLFALPTDASSLMLGSLNFVEEISEQDLLLEVPSNTSFPQAELLHPSASSSSVYSHLIHH*

>Vu_34586.2
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CDS Sequence:
>Vu_34586.1
ATGGGTAAACAAGGTCCTTGCTATCACTGTGGAGTTACAAGCACACCACTCTGGCGCAATGGACCACCCGAGAAGCCGGTACTATGCAATGCATGTGGGTCTCGGTGGAGGACCAAGGGAACTCTTGCAAATTATACCCCTTTACATGCTCGAACAGAAACTGATGCTTGTGGGGATCAAAGGGTTTCCAGGATAAAGAGCATATCAAATAAGAAGAGAGAAATGACATTGCTCAAGCCAAATAATGACCATGATAATGAACTATCTGGAGAGTTTGCACCTGATTACAACCAGGGATGTCAAATCTTTGCAGATGAAGATGCAAGCAACCGATCAAGTTCCGGATCAGCTATTTCTAACTCAGAGAGCTGTGCACAATATGGTGCCATGGATGCTTGTGATCTGACAGGTCCTGTTCAGTCAGTGGTTTGGGATGCCATGGTGCCTTCAAAAAAGAGGACATGCGTTGGCCGGCCAAAGGCTTCTTCTGTTGAGAAGCTAACAAAAGATTTATGTACCATTCTTCATGAACAACAGTCTTATTTCTCTGCATCTTCTCAAGAAGATCTTCTTTTTGAAAGTGAAACACCAATGGTCTCTGTTGAGATAGGACATGGAAGCATTCTCATCAGGCATCCTAGCTATATAGTCCGTGATGAAGAGTCCGAGGCTAGTTCTCTTTCAGTTGATAATAAACAATGCCCAACGAGTGAGGCATATTCTTATGTTGGTCCCATTATGATGCATAATGATTCTAGTTACTTGAAGCCATCATCTCTAGAAGTTGAAAAGATCAGGAACTATACTGACCAAGGATGGCAGCCGGAACAACATAAAAGTGATAAGTCTCAACTTGAAAGAGTACAGATCCTTGGCAATCATGAATCACCCCTGTGCTCTATAGATTTAAATGATATAGTAAACTATGAAGAGTTTTTGAGAATCTTGACAAATGAAGAGCAACAACAGTTACTGAAGTTACTTCCTGGGGTTGATACTGCTAAACTTCCTGATAGCCTTAAAGTCATGTTCAATAGTTCTCAATTCAAGGAGAACATAACTTGTTTTCAGCAGCTTCTTGCGGAAGGGGTTTTTGATATCTCTTTGTTGGGGGCAAAACCTGAAGATTGCAAGACTTTGAAAAGACTTGCAATATCCAATCTGTCGAAGTCAAAATGGGTTGAACACTATAATTTTCTCAAGAAATGTAAAAACAAAGGTGGAAAATTTGATTCTTTTGGATCTGCTGTTACAGCAACAACTAATGCTGCAAACAAGAGAACGCGTGACAGCAGAAATCAAAACTTCCCAGAATTGAATACAGAAATGAGGAGCCCAAAAAGAATGATCACAAAGGTTAGCTGTGAGGTGAAAGAGGGTGTAGAAGATGGTGCTTGCTATAGTCCAAAAAGCCTATTTGCTTTGCCTACTGATGCTAGTTCACTCATGCTTGGTTCTTTGAACTTTGTGGAGGAGATCAGTGAGCAGGATCTGCTGCTAGAGGTGCCATCTAACACTTCTTTTCCTCAGGCAGAGCTCTTGCACCCAAGTGCTAGTAGCAGCTCAGTCTACTCACATCTTATTCATCATTAA

>Vu_34586.2
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Promoter Sequence:
>Vu_34586::LG10:12430814-12432814(+)
TAAAATGTATTTGTTTTAATGTTGAGTTTTGATCTATCCTAATCCATTTTAGTTGTGATTGGTAGAAAAAGGAAAATAGTAATTTTATAATTTTGATGTGAAAAAAAAAGTAAAATGAAAAAATAGTAATAGGTGTAAATTGTCAGAATAATTTTTTATTACATATTAAAATAAGTACATTTATCTATGATAATCAGTGTTATACGGTGATCTTCTTGGTTTTGATATTTTTAACACTTTTGTTAGAAAGAAAAAAAAACATAAAAAATAATTTACTCATTTATTGAAATTAATGGAAGACATTACTACTTTATATTGGAGTTAATTGTTTTTTCTTTTGTCTTCTATTTAAATTTTTAATTTTATTATTTTTATAATATTATTTTACTCAAATTGTAAATTATATATCAAATATAACAAAGTGATATTACATATTATTTATTTAAACTAGCCAAAACATATTCCTTCTCGCCCTTGTATGTCTGCATTAATGTAATTTAAAAATATGTATGAAAACAAGGATTTAAAAAATAAAAAATGTATATTTATTTTATTTTAAATGGGAAAGTTCGATAATTATATTTGGTGGATTTTTTTAAATATATGTCACTAGATAATAACATTTTTAAATAAAAATATGATACTAAAATGATTATATCTCTTTTATATAATAACTAACGAAAAAACTGTGTTGATTTTTTTTTTCATGATAACAAATAATAAAATTACTATAATTATAATTATAAAAGAAAGTTTAAATAATTTCTAAATTATAGATCATTTTTACTTTTTTTTAGGTAATTTTTATTATTATAAATAGGCAGTTTAAATTAATAATTAAATTTTAGAAAAAAAAATGATAAAATCGAAAAACTGTTAAATTAAAAAAATCACTTAAAATCTAAACCCATATTTGGTAAACATAAAATTATTATCTACTATTATTTATTGTTTACCATAAATCAGTACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACACACATATATACTATAAAATTATTATGATATTACATAGATAATTATATACATTTAATTGATTGATTATATAAAAAAATATATACATTTTGGAAATTTTAATTAAACATTTTTTATTTTCATTTATTGTAAAATTTTTTATATATAAACATTTATTGTAAAATTATTAGGACTTTTGTGCTGTCTTTCTGATATGTTTACATTGATATATTAAGTTTGAAGACAGAATTAAAAAAATCAATCAAAACCTATAAAAGAAATTGATGTAGTTATTTTCCTTCATTTCCTTTTTCTTAAGCATAAACAAAATACTAATCCCAATGTTAAACTAAAATTACTTAAGTTAATGCTTGTATTTGACTATGTGATTTGGAATTCAGCAGTAACCCCCCATGGCTAATCCATCGATGATAATTAGGTTTCTGACCACACATGACATAGTCACAGATTTATTGTTCTGTTTTTAAAAAACAAAAACACAATTTTAAAACCTTATCAACATCATGTCATCACACACGAGACAATATAAAATTAAGAATTGGTATTCGCATCTTAAACAAAAAACCATTGCATTTCGTAGCAGCAGGAACAAAATTTCGGAAAGGCCAAAAACATCTCCTTGTTTCTTTCTCCCTTTTCAGTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAAAATCTCTTCTACTCGATGCACAAAAAATTCAAGAACTGATGGCAAAGATAGAATACTTTTAAATTTTATTATTATTTGTGAGAATTTAAAAAATGGATGATTAGCAAAGAAGAAAAGTCGATAGTCAACAGGATCTGTGCAATGATATTCCCCTACCCCTTCTGTTCCCTTTATAATAAGATGAGCTCATTATTTTTAATATTACAAAAAGCAAAATTGAAGTGTTTCAAATAAAATCAACAAAAGAGAAAAATAAAAGGAGAAAAAAAAGCATAAAAAGTTGAAACATTTACTTCTTATACA


Gene Sequence:
>Vu_34586(+)
AATACAAGAGGTCATATACAGAGACCTTCACTTCTCTCTTTCTCTCTCAACATTCAACCTTCTTTTCTTTCCCCTTTTCACAACCATTTCTGAGATTCCTTCTCTAGTTTTCTCTTATTGTACAATTCCCACTTACATCAATCCTTTCGGTTGTTGCTAGATTGCTTATGTGAAATTTCTTTAAAGGACTGTAAAAAGACAACCTTTCTGGGTTTATTGGTTCCTGCTTTAAATTTTCTTTCTGGGAACTATCATTTCTGGGTTTGCCTATAAAAGAAAGCATTTATACATAACTATTGTATTTTTTCAGAAAAAAAAACATTTTTTTTTATTGATTTTGTTGTTAAAGATTTTTTTTCTCTCATTTTCCTGCAATTATTTCGTCATATCCTTTAATAAATCTGCGGGAAAGATTGATACATGGGTAAACAAGGTCCTTGCTATCACTGTGGAGTTACAAGTGAGTTCTTGTTTTTTCAATATATAATATTTTCTTTTAAGCTACTTACTGTTTTTTTTCTTTGCAAAGAGTTTATGTATTTGTGAATTGAAATGTGTTGAGGAAAGGGATTATGTTTAATACAAACTATTAAAAAATTATGCGTGCTGTGTGATAGTCTGGATGTATATGAATTAGAAAGAATACAACTGTGCTGTTCTCCATAGTATTTGTAATTGAAAGTTGTGAAAAATCATGTTTGTTTCCTGTTTCTATGTGTTTTTGTATTCTTTTGTTGCTATTTGTTCCCCTATCTATATTCCAAATCCAAGACCATGTAAATGTTGCGAAATTAAGCCTGGAGTGCATTGAATGTGGGTCTCCTTAATTGGAACAACACTCACTGCATTTAAGGTCTTTATCAAAGAGTCAACCCACAGTTCGTGTCTTGCTGTTTGGATGGCAATAAGATAAGGGAATCGTGCGTTTGTAAAATGCCAGAAGTTAATTCATTCATGTATTTGGAAAGACTTTTACAAAATTGTTTTCATTTGCTCTTCAAAGCAGTTTTTCACCGTGCCAGAGGATATTGGAAACATTGCATTCATCTCATCCTTCAGACATGATTTGCTACTCCCTTGCTCTCTGTCTGATGAATAATCGTTACTTGTACCTCTTCATTATTTTCTTTTGAATTATTTTTTAATTGAAACTATTAATTTTGTTTGCAACACTTATTGGTATGACTTGAAGATTTTCATTGCTTTGCTTATAATTCCAATGCACTTTTCAAAATTTTGAAGTTTTTACTACTGGTTTTGTGCTCAGTTTTCTAGCACTGTGTCTTGCACTAACTAAGTACTATGTTTTCAGTCCTTAAAAGAAGGCAATGCGCCATTCAACTTTGTTATATGTATGAGACTTCGCAGTTACTGTCAGCATTTTCAGTTAAATTGCAATAGTTGTTCTCACTATCAGCCTACAAGTGTATTTTTCAGCTAAACTGCAATCATGGACTTCACCATAGTTCTTGAGGTTTTTGAAATCAATGTTGATTTTCCTGCAAAAGGGTATTGACATGTATTACTCTCAGAAATTTAAAACCAGTCGGCTATTAAAAGGAAAATAGTCAACATTTTTTCATTTGATTGATGTTGTTTGTGGTGACAACATAGTTGGAATGACAAACAAAATAGTGATGCCTTAGCACTCTCGTTTCTGTTTGCTTAACTAAAAATCGACAGATGATGATATCTGCACCTTGAAGCTTTTGTTGAATTCAGCTTTCTAGTATATGAAAGATACTAACCAATGTAAAATATTTTAATCCAAGAGGTTTAAGCTATTTCTCAATATCTAACCTGACTTGTATTTTTTGTAATATGAATCATGAATTGGATCGTCAGGAAAATATGATATGTGGTTGTTAGTAGTGTATCCAATCTGAGTTACATCTCTAATTTTGATTACAAGGGCTCTAAATTTTTGTAGGTTTCTGACAATTGAGCATTGCAACAGGCACACCACTCTGGCGCAATGGACCACCCGAGAAGCCGGTACTATGCAATGCATGTGGGTCTCGGTGGAGGACCAAGGGAACTCTTGCAAATTATACCCCTTTACATGCTCGAACAGAAACTGATGCTTGTGGGGATCAAAGGGTTTCCAGGATAAAGAGCATATCAAATAAGAAGAGAGAAATGACATTGCTCAAGCCAAATAATGACCATGATAATGAACTATCTGGAGAGTTTGCACCTGATTACAACCAGGGATGTCAAATCTTTGCAGATGAAGATGCAAGCAACCGATCAAGTTCCGGATCAGCTATTTCTAACTCAGAGAGCTGTGCACAATATGGTGCCATGGATGCTTGTGATCTGACAGGTTGGATTAAGATCTCCATAACTGATTACAGCAGAATTGAGCATTCAACGTTTTGAATAAGTATTGGTTTTATTGCCTGTAAGGATTTATATTAGTACAATCAAGTAGTGTACAATGGAGTGTGGAAAAATGAATAAAGAATTAGATTTTGGAAATGGTTTAGTAATTGTTGATTTTTCCTGGAAGAAAAACAATTGAACTTTGCTGGCAAACCAGAAGCTCTAATTATAACATTTGTAATGACAAGTCCTATATTTAAACAGGGCTTATCTTTTTTTCTTTTTGTTTGGTGTATATCAATATGTAACGCTTTTTCTCGTAATAATAGAATGCGAGCTCTCACATATATGCTTCATCTGTCTAGTTCATTATTAATTGACTTCAAACAAGAATTTGTACTTGTGTTATCATGCAAAGCATATGATCTCCGCTTTTTTCTTTTATGAATACGGGTAACTATAATGTAGATATTTTGGTTGATTTAGGTCCTGTTCAGTCAGTGGTTTGGGATGCCATGGTGCCTTCAAAAAAGAGGACATGCGTTGGCCGGCCAAAGGCTTCTTCTGTTGAGAAGCTAACAAAAGATTTATGTACCATTCTTCATGAACAACAGTCTTATTTCTCTGCATCTTCTCAAGAAGATCTTCTTTTTGAAAGTGAAACACCAATGGTCTCTGTTGAGATAGGACATGGAAGCATTCTCATCAGGCATCCTAGCTATATAGTCCGTGATGAAGAGTCCGAGGCTAGTTCTCTTTCAGTTGATAATAAACAATGCCCAACGAGTGAGGCATATTCTTATGTTGGTCCCATTATGATGCATAATGATTCTAGTTACTTGAAGCCATCATCTCTAGAAGTTGAAAAGATCAGGAACTATACTGACCAAGGATGGCAGCCGGAACAACATAAAAGGCACGCTTTCTCAAACTAGTTTTTGGCATACTTTGCAGACAGCTATGATTGTTTATCATTAATTAATGTGACAAAAAAATCTGTTCTAGTGTTACACTAAGCAGCACATTTTGTTTGTTGCTGTCAAACAAAGTCTTTTGTTTCTGTATGCACGTTATGAATTTTCCTTGCGCATGGCATGAACTTGTAGAAATTGTTTTGAAAAGAGACAAACATACTCTGTCAACATTAATGTTCCTGTTTTTTAAATTTCAGTGATAAGTCTCAACTTGAAAGAGTACAGATCCTTGGCAATCATGAATCACCCCTGTGCTCTATAGATTTAAATGTGAGTTACATAGCCCTTCCCATTGTATTTTGGCTTAAATTGATAAAAAAAATTGCTCATATTTATGTTTGTGTTAACCAATTGGACATGATTTTACATCAGTGGTAGTGCTTCAAATTTTAGCACTATATTTTAATAGTTTTCTTAGATTCCTCATTCATATAACTACACAGTAATCAGGCAGGATAGCACTTCGATTCAAGATTTTTTAGAATGCTCAATATTTCCTCAAAATATTACTTTTTAGTCTAGTGTTTTCTCCTTGTTCAGTATAAATAATGTTATCGGGTAAGGCAGTAGGGCCTTAAATATGTATAATTGTTGAGTACTTAATGTAACCGCTGTTATGTCTTGTTAGGATATAGTAAACTATGAAGAGTTTTTGAGAATCTTGACAAATGAAGAGCAACAACAGTTACTGAAGTTACTTCCTGGGGTTGATACTGCTAAACTTCCTGATAGGTTGGAGGTCTACTCTTTCATTTGCTGTTCATGTTCTTCTTGTAATCGATATAAAAGCTCGCAAATTCCTGTGTTATTTTTATGTAATAGTTTTAAATCTGAATATAATCGCCACCATTGCTTTGATTTCCATCTGAATGTTGTAGCCATTCTGGAATATTTCTGTTTTTCTTAAAGGATATATTATAATTGAAAATGTTCAGACTGAGACAATCAATGTTGACAACTTGTGTGTTGTGTGTGCAGCCTTAAAGTCATGTTCAATAGTTCTCAATTCAAGGAGAACATAACTTGTTTTCAGCAGCTTCTTGCGGAAGGGGTTTTTGATATCTCTTTGTTGGGGGCAAAACCTGAAGATTGCAAGACTTTGAAAAGACTTGCAATATCCAATCTGTCGAAGTCAAAATGGGTTGAACACTATAATTTTCTCAAGGTTTGTACTATGTACTAGTTTTTTATGTCACAAATAGCATCTTGTTTGAGTATGTTGATACCTAAAAGATGTTACTTCTTTCTACGGATGCAGAAATGTAAAAACAAAGGTGGAAAATTTGATTCTTTTGGATCTGCTGTTACAGCAACAACTAATGCTGCAAACAAGAGAACGCGTGACAGCAGAAATCAAAACTTCCCAGGTTAGCTGAAAATCTCGTATATCTAAAATTAGGATACAAACAAAGTCTCACATTGGATAAAATCAAGAGATGAACATGAGTTTATATACACATAAGATATCTTCCTTGATAAGAGGTCTTTTGGAGTAGTACCAAAAACAAATCCGTGAGAACTTTAAATAGAGATTGGACAATATCTTATTATTGTGACAATATATGTGTATTGAACCTCCCTATAGCTAAGACCAATAAAAAAACTTTTCGATTATTTTCTCCCTATTGTAGACAACTTTTACATTGCATTTAGAAAATTGTTACTGGTATTAACTGGTTAAACACACTTAGTTATGATTCCTAAAACTGATCTTGCAAATTTCAGAATTGAATACAGAAATGAGGAGCCCAAAAAGAATGATCACAAAGGTTAGCTGTGAGGTGAAAGAGGGTGTAGAAGATGGTGCTTGCTATAGTCCAAAAAGCCTATTTGCTTTGCCTACTGATGCTAGTTCACTCATGCTTGGTTCTTTGAACTTTGTGGAGGAGATCAGTGAGCAGGATCTGCTGCTAGAGGTGCCATCTAACACTTCTTTTCCTCAGGCAGAGCTCTTGCACCCAAGTGCTAGTAGCAGCTCAGTCTACTCACATCTTATTCATCATTAAGCACACACACTCTTTACCAGTTCATTTGGATGCTTAATTATGGACCATGTTTTACATCTTAAACACATGATGGTTGTGCTTTTGTTTACTTGCAAGTTGCAACCTTCCTTAGCTTGGATTGCCAACTATGAAAGTTGGGTGGCTTTTTCACTTCTTTTTTTTTGTTGTTGTATAGGTTGGTATAAGGTTGTAACATAGCATGACATGAAGAGGGATTATGTAATAATATCCAGAGCTTTTGTGAATAATTTTTCCACTTTTTTTAATTTTTTACTCAAAAATAAAATGAGAAGACATCATTAT