Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34510 LG10 11814063 11817431 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 11814072 3_prime_UTR_variant
A/G 11814181 3_prime_UTR_variant
A/T 11814429 missense_variant p.Ser616Arg
C/A 11814508 missense_variant p.Arg590Leu
G/A 11814588 synonymous_variant p.Leu563Leu
G/C 11814737 downstream_gene_variant
A/G 11814800 downstream_gene_variant
G/T 11814941 downstream_gene_variant
T/A 11814977 downstream_gene_variant
A/T 11815229 synonymous_variant p.Ile517Ile
G/A 11815521 missense_variant p.Ser420Leu
T/A 11815885 missense_variant p.Arg299Trp
G/A 11815887 missense_variant p.Ser298Leu
A/T 11815895 stop_gained p.Cys295*
C/T 11816285 synonymous_variant p.Pro204Pro
T/C 11816299 missense_variant p.Asn200Asp
C/T 11816790 synonymous_variant p.Ser94Ser
T/C 11817092 5_prime_UTR_variant
G/A 11817385 5_prime_UTR_variant
G/C,* 11817392 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
T/G 11817395 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34510.1
MEIPCLLSLFLLISFLIPRMVLGTAELRALMELKSSLDPDGKILASWISDGDPCSGSFEGVACNQNQKVANISLQGKGLSGWLSPALAELKCLSGLYLHYNNLSGEIPPHISNLTDLADLYLDVNSLSGTIPPELGNMASLQVLQLGDNQLVGNIPTQMGSLKQLSTLALQYNKLTGQIPLSLGTLEKLRRLNLSFNNFNGTVPATLAHLQHLEVLDVQNNSLSGIVPSALKRLGEGFQGANNPGLCGVEFSTLRACNKDQNLNVNHIDTLDRDQPKKALPEPANVQLHCDHTHCSKSRFPQIVITVGVIAVTLTFVCAGFLTFFRYRRQKQRISNTSSSSSQGKLSPYQPKELYTKSPSALVNIEYYSGWDHLSNGQNADVGGLLNDYLTQFRFNVDEVESATQYFSEASLLGKSKFSSVYKGVIRDGSLVAIRSISVTCCKTEEAEFVKGLDLLTSLRHENLVRLRGFCCSRSRGECFLIYDFATMGNLSRYLDLEDGSDHVLEWSKRVSIIKGIANGIGYLHSNDASKPTIVHQNISVENILLDNQFNPLIMDAGLPKLLADDVVFSALKVSAAMGYLAPEYITTGRFTEKSDIYAFGVIILQVLSGKTTIGSSIRTAVESFRFDDSVDANLRGTYSKSEAATLSKLAIQCTHESPDQRPTVVDVIQELSVSSAHL*


CDS Sequence:
>Vu_34510.1
ATGGAAATTCCTTGCCTTCTTTCTCTCTTTCTTCTGATTTCTTTTCTCATTCCTCGTATGGTTCTTGGAACTGCGGAGCTTAGAGCTCTGATGGAGTTGAAGTCCTCTCTGGACCCAGATGGCAAGATCCTAGCCTCGTGGATCAGTGACGGTGACCCATGCAGTGGCTCGTTCGAAGGGGTTGCGTGCAACCAGAACCAGAAAGTGGCCAACATCTCCTTGCAGGGAAAGGGTCTTTCCGGTTGGCTATCTCCAGCACTGGCTGAACTCAAATGCTTGTCGGGTTTATACTTGCATTATAACAACCTTTCTGGTGAGATACCGCCACACATTTCAAATCTCACTGATCTGGCTGATCTCTATCTCGACGTGAATAGTTTATCTGGAACTATTCCTCCTGAGCTCGGCAACATGGCTAGTCTCCAAGTGCTGCAGTTAGGTGATAACCAGTTGGTGGGGAATATACCGACACAGATGGGTTCGTTAAAGCAGCTTAGTACTCTTGCTTTGCAATATAACAAGTTAACTGGTCAAATTCCCCTTAGCTTGGGGACTCTAGAGAAGTTAAGAAGGCTAAATTTGAGCTTCAACAACTTTAATGGTACTGTTCCGGCAACACTAGCACATCTTCAACATTTGGAAGTTCTAGACGTTCAGAACAATTCTTTATCAGGAATTGTTCCTTCGGCATTGAAGAGACTTGGGGAAGGTTTCCAAGGTGCAAACAATCCGGGCTTATGTGGAGTTGAGTTTTCTACTTTGAGAGCTTGCAACAAAGATCAGAATTTAAACGTCAACCATATTGATACCTTGGATCGAGATCAACCCAAAAAGGCTCTCCCAGAGCCTGCAAATGTTCAGTTGCATTGTGATCACACCCATTGTTCAAAATCAAGGTTTCCTCAAATTGTCATCACAGTAGGTGTTATAGCTGTTACTCTTACATTCGTATGTGCTGGGTTTTTGACATTCTTCAGATACCGCCGTCAAAAGCAACGGATCAGCAATACATCAAGTTCTTCTTCTCAAGGGAAACTTAGTCCTTACCAGCCTAAAGAGTTGTACACAAAAAGTCCTTCTGCACTTGTTAATATTGAGTATTATAGTGGGTGGGATCATTTGTCTAACGGTCAAAACGCTGATGTCGGTGGGTTATTGAATGATTATCTAACTCAATTCAGGTTTAATGTGGATGAGGTTGAATCCGCAACACAGTATTTCTCGGAAGCCAGTTTACTTGGTAAGAGCAAATTCTCATCAGTTTATAAAGGAGTTATCAGAGATGGTTCTCTTGTGGCTATCAGAAGCATCAGCGTGACATGCTGTAAAACCGAGGAAGCCGAATTTGTAAAGGGGTTGGACTTACTAACCTCTCTGAGACATGAAAACCTTGTTAGGCTGAGAGGTTTTTGTTGCTCAAGGAGTAGAGGTGAATGTTTCCTTATCTATGACTTTGCCACCATGGGTAACCTTTCCCGATATCTTGACTTAGAAGATGGAAGTGACCATGTGCTCGAGTGGTCCAAAAGAGTTTCTATTATCAAAGGCATTGCAAACGGCATTGGATATCTTCATAGCAATGATGCAAGCAAACCTACAATAGTTCACCAGAACATTTCAGTGGAAAATATTCTCCTAGACAATCAGTTTAATCCATTGATCATGGATGCTGGACTACCTAAGCTTCTCGCAGATGATGTTGTTTTCTCAGCTCTTAAAGTAAGTGCTGCAATGGGATACTTGGCTCCCGAATACATTACTACCGGACGATTTACTGAGAAGAGTGACATATACGCATTTGGAGTTATTATTCTTCAAGTTCTGTCTGGCAAGACGACAATAGGTAGTTCAATACGTACAGCAGTTGAGTCTTTCAGATTTGATGATTCTGTTGATGCCAATCTTAGGGGAACGTATTCAAAATCTGAAGCAGCTACACTTTCAAAGCTTGCAATACAGTGTACTCATGAATCTCCTGACCAAAGACCAACGGTGGTGGATGTGATTCAGGAGTTGAGTGTGTCTTCTGCTCATTTGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_34510::LG10:11817431-11819431(-)
CCGGATCATCAGGTAACGGTTTATTTTATTACTTTAAATACACACAGCATACCAGAAAAAAGGTACGTTTTTCCCTAAGGAGAATTAAGAAAAGATTTCTTGATCTAATCACTCTCACTGACTTGAGCGTCGGAGTGCCTTTGCAGGTACCCAGCCCACCTTTACCCAAAGAACAGAGCATAGAAAGAGAGAGGAAACATCATCACAGAGTTGAGAAGAGGAAGCAGTCCGGTTTTATTTGGTTTGTATTTCGGTCTCCACATCTCTACTGAAACAACATTATTTATAAATTCATCTCGAAATTTGTAAACATAAATTTGTGATATTCAAAGTGATATTTATTACATATTTATTGTTAATCTTATCGGACATTTACTGATTTTAACATTAAAATATTTTTTATTTATCTATAATATCCGATCTGACTGGACGACAACCCGCACAAAGTAGATAAAAAAAAAATCTTGATATGATTTTGGAGTTTAGAAACCTTTGTAAAAAAAGTAAACTTAACCTCGTTCCGTCCCCTGAAACATTATTATTTTTGTTTTGTATTTGTAAAAAAAAAAGTAAAAGTACATATATTTTAGTCTGATAAGAATTAAAAACGCACATAGGGTTTGGCAAGAAAAAATGGGAAAATAACAAAATGATCCAGCCATGCTATCTTTGTAGGGTATTATTTGTATGACAACCCACGCATAGGTTGTGGTATGTGTTGATAGACGATGTTGTCAGTGTCTTTTCCATCGTGGGGTTTAACTCTTGGACCTCATTGTAATAAAAAAGTTAAAAATAATAGTTTATAGAAACATTTTATATTTCTTATAATTCTCATTATTAGCCTTCATTTATCTTTTACTATAATTATAACTATAAATGTCTGTAAATTAATGCGTGTTTCATCTAAAATAAAAATTATTGATTATTTTATTGTGTAAATATTGTTATATGTATCGTGTTAATCTTGTTTTCTGGGAGAATTCTAGTGCCAGAAACAGTTGTAATTTTGTCTGTTTGCATTGTCTTGTCAAAGAGTTTATTTTAGAAGAGGTTGGAATGCAGTTGAGATTTGAAAATTGGAGAGTAGTCTAATTAATCTGTCAACTCTCTCTTTCTTATACAATTCCCTTACAAATTAGTATTATCCAGCATTATAATTAATAAATAACCAGTCGCCCTTTATTTATGGAGATAGGACTAGATGACACTTAAGAATCTTTCATTTTCTTCTATTTTTAAATAAAATTATATTTATGTCAGTTTTAGTATTTAAATAGACATTGACATTCTTATGTAATTATTTAAATAGTATTTACTCTCTTTACTTTATTTGAAAAAAATGTCAGACAATAACTTAACTAAGAAATTAACTTTTAACTTTTTAAAATGTCAAACTAAAAATATTACAAATAAAACAAGAGAATTATTAAAGATATAAAATAAACAAGTGTTATTTAATAAAAACATGATTGGGATTTTTAAAAAGTATAAAATATATGAATGCAATTTTATAAAAGAAAGGGAAAAATGGATGCTCATATTAAAACTAAAGAGACGTATGTATTTTATGTCCAGAGGCAATCTAATGGGCTACACGTAATTTCCTTCGTTTATTATTACTTGAGAGTTTTCTATTTTACACTTCCTTCACTGTTAGCTGTAAAGTTCCAATAATAGGTGCCAAAAGTTAGGTTAAGGTAGGTTACTTTCCTTGACCCAGAAACTCTTTAAATATGAAAACACACACACACACAAATATATATATATATATATAAAACTGAAAAATTCTTATAGGTTAATTTGAATATATTATTTTTTGAATTACTGCAATGGACACGTAAAGCATATTTGAATTTATTTTGATGCAGATAAATAGTAGGAAACAGTGTTGAATGTTAAACATGATGGGTGACGAAATAGTCAAAGGTGGTGGGGCTGCAATACCCACATAATTATTCAGACTTTAATTAGACGATACAAAAATGTTTGAGAAACAA


Gene Sequence:
>Vu_34510(-)
GGAGTGGGGATAATAATAAGTGGTATGTATGATTAAAATCCTATTTCCCCCCGAAAACCTTCTTCTCTTGCAACAGTCGTTGATGATGCAATATGAACCCTGCTTCTCACTGTCACCAACTCATCAAAAGTTACTTAATTATGCATCCTTTCTCAGTATATCCTTCTGCTCCTTACCCTGTTTCTCCGTCTATAACCACTAACCAACAAACTTTCACTCTAACAAGTTGACCAACATGTTACATTATTTACGGCCACATTTAAAAACCAAACTCAAACTTGGATTATTCAAACTACAGATAAAAGCGCACACACTCGTGTGAGCTCTCTCTCCTTCCAAATTCACACTCAAAAACCAGTTATGGAAATTCCTTGCCTTCTTTCTCTCTTTCTTCTGATTTCTTTTCTCATTCCTCGTATGGTTCTTGGAACTGCGGAGCTTAGAGCTCTGATGGAGTTGAAGTCCTCTCTGGACCCAGATGGCAAGATCCTAGCCTCGTGGATCAGTGACGGTGACCCATGCAGTGGCTCGTTCGAAGGGGTTGCGTGCAACCAGAACCAGAAAGTGGCCAACATCTCCTTGCAGGGAAAGGGTCTTTCCGGTTGGCTATCTCCAGCACTGGCTGAACTCAAATGCTTGTCGGGTTTATACTTGCATTATAACAACCTTTCTGGTGAGATACCGCCACACATTTCAAATCTCACTGATCTGGCTGATCTCTATCTCGACGTGAATAGTTTATCTGGAACTATTCCTCCTGAGCTCGGCAACATGGCTAGTCTCCAAGGTAAGCTATATACAATTGTGTTCGTATGAAGGTTTAATGTTACGAGATAAGTTGTTGCGAGTCTTGAGTTTATTCTGTATGAACAAGATGCCTCTAGTACTGCAAATCGCTGGTGGTTATGTAAGTTTCTTGAAATGAACCCAATTGATAGTTGTCCTTTTTTACTTTTTTTTAGTGCTGCAGTTAGGTGATAACCAGTTGGTGGGGAATATACCGACACAGATGGGTTCGTTAAAGCAGCTTAGTACTCTTGCTTTGCAATATAACAAGTTAACTGGTCAAATTCCCCTTAGCTTGGGGACTCTAGAGAAGTTAAGAAGGCTAAATTTGAGCTTCAACAACTTTAATGGTACTGTTCCGGCAACACTAGCACATCTTCAACATTTGGAAGTTCTAGACGTTCAGAACAATTCTTTATCAGGAATTGTTCCTTCGGGTATGTCCCTCTATCCTCCTTTCCTTGTAACGAAGTTAACTTATTTTCCTCGCATTTCTCTTTGTATCTTTTAGTGTATTGTGTATGCTGATTAAAGTTTTGATGATGAAAATGAAGCATTGAAGAGACTTGGGGAAGGTTTCCAAGGTGCAAACAATCCGGGCTTATGTGGAGTTGAGTTTTCTACTTTGAGAGCTTGCAACAAAGATCAGAATTTAAACGTCAACCATATTGATACCTTGGATCGAGATCAACCCAAAAAGGCTCTCCCAGAGCCTGCAAATGTTCAGTTGCATTGTGATCACACCCATTGTTCAAAATCAAGGTTTCCTCAAATTGTCATCACAGTAGGTGTTATAGCTGTTACTCTTACATTCGTATGTGCTGGGTTTTTGACATTCTTCAGATACCGCCGTCAAAAGCAACGGATCAGCAATACATCAAGTTCTTCTTCTCAAGGGAAACTTAGTCCTTACCAGCCTAAAGAGTTGTACACAAAAAGTCCTTCTGCACTTGTTAATATTGAGTATTATAGTGGGTGGGATCATTTGTCTAACGGTCAAAACGCTGATGTCGGTGGGTTATTGAATGATTATCTAACTCAATTCAGGTTTAATGTGGATGAGGTTGAATCCGCAACACAGTATTTCTCGGAAGCCAGTTTACTTGGTAAGAGCAAATTCTCATCAGTTTATAAAGGAGTTATCAGAGATGGTTCTCTTGTGGCTATCAGAAGCATCAGCGTGACATGCTGTAAAACCGAGGAAGCCGAATTTGTAAAGGGGTTGGACTTACTAACCTCTCTGAGACATGAAAACCTTGTTAGGCTGAGAGGTTTTTGTTGCTCAAGGAGTAGAGGTGAATGTTTCCTTATCTATGACTTTGCCACCATGGGTAACCTTTCCCGATATCTTGACTTAGAAGATGGAAGTGACCATGTGCTCGAGTGGTCCAAAAGAGTTTCTATTATCAAAGGCATTGCAAACGGTTAGTTGCTTCTATTTACCTACCTATTTAGGTAGACTTAAATACGCATCACATGTGTTATTGGTCTTGTTATCTTATCAAAATCGGTATTTCATCTCAATAAAGTCTGCCAATTTTAGTTACTGAAATGAAAGCAACAGTTATAAGATGAAATGGTGATTTTGATGGGATAACATCACACAGTGCCTGTATGTATCTAGATTTTTTCCTTACCTGCATTCTCTTGCAGCATACGGTACGGAAGAAAAGTTTCCTGCCAAAAAGAAAATTCCAGGGATGTCCTATATGCAAATGAATTATAAGTGACAAAAAAGTTCGGTAATAATCATTGTCAAGAGAAGACAATGGACGATACTGATTATCACAATTCAAATATTCAAACAATTTAAGACTGTCTTACAATTCTAAAGTTCAGGAAAACTGAATGACACGCAGCATCAAATTTATTACTCTGGATAATATATGTTTTTATGTATGACATTTGCTATTATTCATTTGACCAGGCATTGGATATCTTCATAGCAATGATGCAAGCAAACCTACAATAGTTCACCAGAACATTTCAGTGGAAAATATTCTCCTAGACAATCAGTTTAATCCATTGATCATGGATGCTGGACTACCTAAGCTTCTCGCAGATGATGTTGTTTTCTCAGCTCTTAAAGTAAGTGCTGCAATGGGATACTTGGCTCCCGAATACATTACTACCGGACGATTTACTGAGAAGAGTGACATATACGCATTTGGAGTTATTATTCTTCAAGTTCTGTCTGGCAAGACGACAATAGGTAGTTCAATACGTACAGCAGTTGAGTCTTTCAGATTTGATGATTCTGTTGATGCCAATCTTAGGGGAACGTATTCAAAATCTGAAGCAGCTACACTTTCAAAGCTTGCAATACAGTGTACTCATGAATCTCCTGACCAAAGACCAACGGTGGTGGATGTGATTCAGGAGTTGAGTGTGTCTTCTGCTCATTTGTAATCATATATACTACTGTCTATTGTTACTGGGAGACGTTTAGACACTTCCCGATAGTTGGGTTGGATTTCATACATGCTACTATTTCCTTGAGCTATATACTTTAAAACTAGCCATTGCCAAATAATTGTGGATCTAAATGGATTCCTTTCCTGTTGTTACGAACTGGGATAGTTG