Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34481 LG10 11578861 11584651 PREDICTED: homeobox protein HD1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 11579117 3_prime_UTR_variant
A/G 11579288 stop_lost p.Ter286Glnext*?
A/G 11584187 5_prime_UTR_variant
G/T 11584436 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34481.1
MQEPRLGMMGGLSGEVSGDHHRQLKAEIATHPLYEQLLAAHVACLRVATPIDQLPLIDAQLSHSHHLLRSYVSHHTHSLSPNDRQELDNFLAQYLIVLCTFKEQLQQHVRVHAVEAVMACRDIENTLQALTGVSLGEGTGATMSDDEDELQMDFSLDQSSAEGHDMMGFGPLLPTESERSLMERVRQELKIELKQGFKSRIEDVREEILRKRRAGKLPGDTTSVLKNWWQQHAKWPYPTEDDKAKLVEETGLQLKQINNWFINQRKRNWHSNSQSVTSLKSKRKR*


CDS Sequence:
>Vu_34481.1
ATGCAAGAACCGAGACTGGGAATGATGGGCGGGTTAAGCGGCGAGGTCTCCGGCGATCACCACCGTCAACTGAAGGCGGAGATAGCCACACATCCGCTGTACGAGCAGCTCCTGGCTGCACACGTCGCATGCCTCCGTGTGGCCACTCCCATCGACCAACTTCCTCTCATCGATGCTCAGCTATCTCACTCTCACCATCTTCTACGATCTTATGTCTCTCACCATACCCACTCTCTCTCCCCCAATGACCGCCAAGAACTCGACAACTTCCTGGCACAGTATTTGATAGTTTTGTGTACTTTCAAAGAACAACTTCAGCAACATGTCAGAGTCCACGCCGTTGAGGCTGTCATGGCCTGCCGCGATATCGAAAATACCTTGCAAGCTCTCACAGGAGTGAGTCTGGGAGAAGGAACTGGGGCAACAATGTCAGATGATGAAGATGAGTTACAGATGGATTTTTCTTTGGATCAATCCAGCGCTGAAGGGCATGACATGATGGGATTTGGTCCCTTACTTCCTACAGAATCTGAAAGGTCACTGATGGAGAGAGTTCGTCAGGAACTAAAGATTGAGCTGAAGCAGGGTTTCAAGTCAAGAATTGAAGATGTCAGGGAGGAAATATTAAGGAAACGTAGAGCTGGGAAATTACCAGGTGACACAACTTCTGTGTTAAAGAATTGGTGGCAGCAACATGCAAAGTGGCCTTATCCTACTGAAGATGACAAGGCAAAACTTGTGGAGGAGACAGGGTTGCAGCTGAAGCAAATTAATAATTGGTTCATCAATCAAAGGAAACGCAACTGGCACAGCAATTCTCAATCGGTTACCTCTTTGAAGTCGAAACGCAAGAGGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_34481::LG10:11584651-11586651(-)
GAAAGAGGTTACATAAATGGAGAAATTGGTAGATACGAGATTGTGGCTCGAAAGGGTTTTGATTCTAATGTTATGGATAAAATGCTTCCTTCTTTTGCACGCAACACGTACTCTTCAAACAAAAGTAATCAGAGACAAAGTAAAAAGAATATTCATTTCAGATTTTTATATGATTTTTTCTTTGCATTTGCTTTATGCATTTTATCCCTTTTCTTTTTCATGATTCAACCACCAGTTTTCTAAAGTAGACAAAAAAAAAAAACCACAAATTTCTGTCTGTGAAGACTTCCGTGACTCGTTTTGCTCTCTTGTGAAAATCAGAAAATAAAATTTAGATAATTAATGAAAAAAATATTTATGATTATGATGTGAAAATGTTTACAGTGAAAGTTGGTGGTGCGTTTAAAGAAAGAGGTTGCTTACAGAACATAAACACTGTCCTTTTCTTTGATTTCAGCCTCCTAAATACTGCAATATATCTATACAAGTAAAGAAGATGGAAGATCACCAATTCTCAGAACCAAACATTGACACCTCAACCTTCGACCCACTTTATCAACAACTAACAAAATTAAACTTAAATGAAGGTTGGTCACATCTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTGCAGTGGAGCTTCACTTTTTTTTTAATATACATCTTTTGCTGTTGCCTATGTATTCAATATCGTCGGTTAATTAATTTAAAACATCATATTATTATAACTAATTGTTTCCTTTTCTATTTGGTACAACTAACTATGGTTGAATTTTGCCCTCCCCACTAATTACTTTAATTAATAATAATATCTTATTTTTAATACGCGTAACTAGTTGTCGAATAAAATTACTCTTCAATTATGAAATAAATATGAAGTATAAGTTAAACAAACTGATAACTGCGCTGTCGGTGATTTGTTTCGTATAATTAAAATGTTGATACAGCGAACAAAAAAAAATGAAAAGTTGATCGTGCCGTTAAATTTCAGAATACGCATTAAATCTGACCTAAATTTATTTATGTAAAAACAAGATCATAATTTTATTTCTACAACTAACATTATTGGTGTGTGACAACAATAGAATAACTGTAAGGCTTCACCCATACACAACACAGAAGCAGTTACGGTTACCCACATTGCTTAAAGCGGATCGTTTTTTTTAAGACGTCTGATTTAATTAATGGAAATAATATAAAGTAATGTTTGGCAGTTTGATGATTTTGATGAGGCCGAAAAACTGCGACGCACATGTTCATAATTCAGGAACAGTTAATTCTGTGTTCTGTTTGGAAGCCTAAAAATGTAGTATGAAGTTTTTTTGTGATCGCAATAGACGAAACATGTTGGTCTTGTTGTTGAGGGAAAATTACTCTGTACGAAGGAGAACCGTTTATAAGGGGACAGAAGGAAAAATATATGTTTATTAATGTTTTACAAATTATGTTAACTTTGACATCTAACATTGAAGAAGCAAGCATGTGGATTGGTATGAAGCTCATACGACGCTCCTTGCCACGTTTGTTATCAAAGTGTCCTACAAGTTTCGTACATGCATGAGGCAATACTTCCACAGGGCTTACTTCATTCTCTTTATACCCTTTTTTTTTTTTAAATAATTGTGATAAATTTTCTTGTATTGAAATTTTGGTACAATAATTGTGATACACGAAGGGCGTATGACGTAAATTTAATGATTAAATGCATTTGAAGAAGGATTGGAAAGAAGATGTGAATGTAAGTGAAAAGCATGATGAAAATGAAAAGTGTTTGACATGTTTAAACAAAGTTTTAGCAGAGTCCTTGAAGTACCTAATTGTTTTGTCTGTTTGTTATCTCTTTTACTTTTAAAGGCACAGATTTTTTTCTTTGGTGGTGATAGGTGTGATAAACCCAAACCATCGTCGCCAATCAAATCAAAGTACCTTAGCCTAAAAATCCATTAATGTTCCAGATAAAAAATAAAAAAAAAATAAAATAAATAAAAGAAGAGGAAAAAGAAACGAAGGT


Gene Sequence:
>Vu_34481(-)
GTCAGGTGACAGAAGCAGCTTTATCTTCTTTTTCTGACCTCGCTTCCATCCCCTTTCATAGTAATGATTCCGCAGCTTACTCTTTTCTCTGTCTCTCTTCCTCTTTCTATTCTCTCTCTCTTAAATAAAGAAAACAAAACTTCAATCTCTCTCACACAAACACACAGCACAAGGCACAGCGCAGAAATCAACCGTGTTTAATGCCTTTGCTTCACCCTCTTTCTCTGTGTATGTAAAATCTTTGTTTTTATCAGAGGTCCTGCAGAAAGTTGTGTCTCAGATCCCTATATACACCGAAAACGATACAACTCTGTGCACTCTGTACTCTGCTTCTTTCTCTCTCTATCTCTGAAAATCATCATTTACAATTTTACACACAACCTATTACCGAATAGGGTGGTCCTCAACCTCGCTCTTTTTTCTTTTTTTTCCCTCTGCCTTCTGCCTGCCCTATATTATTCTGCTCTGCCTTTATCAATCCATCCATCGCGCTTCTCTTTCTCTCTAAAAATTGAGAAAATGCAAGAACCGAGACTGGGAATGATGGGCGGGTTAAGCGGCGAGGTCTCCGGCGATCACCACCGTCAACTGAAGGCGGAGATAGCCACACATCCGCTGTACGAGCAGCTCCTGGCTGCACACGTCGCATGCCTCCGTGTGGCCACTCCCATCGACCAACTTCCTCTCATCGATGCTCAGCTATCTCACTCTCACCATCTTCTACGATCTTATGTCTCTCACCATACCCACTCTCTCTCCCCCAATGACCGCCAAGAACTCGACAACTTCCTGGTAAATAAACCGAACAAACAATATTGTTATTTTCTTTCTCACATACACACAATTTCATGGATCCCTCTTGTTTGCTGTTACCACCGCAGGCACAGTATTTGATAGTTTTGTGTACTTTCAAAGAACAACTTCAGCAACATGTCAGAGTCCACGCCGTTGAGGCTGTCATGGCCTGCCGCGATATCGAAAATACCTTGCAAGCTCTCACAGGTATTTATTTACCAGTAAACTCTATTTTTTTTATCTCCTCTTACTCCATTTTTTTATCTACCATTTCTTATAGAAGAAAATCATCATCCATATTGATAAAAAAACGACGTATGATGTTGCCATTTTTTGTGAGGAGTTAATTAATGTTAATTTTCTGAGCGTGTGAAAGCATTTTTTGTTTCTTGTGATTTACGCGATTTAGCAGAAAGGAAAGAAGGTACATAATAATGGTATACATATTTTTTTCTTTTGTAAAAGTTTCTGTTGTCGAGTTAATTAGACTAAGGAATGGGGTGGTAGGGTCTAGAAATGTTATCTGGTGGAGTGTACACAAATGGCAATGAGAAGAGTTAGTTAGTTTGGTGAGGAATGGTAGACCCTCTTCTCCCACTATGTCACTGCCAACAACCTATAATGCCGTGACCCAATTATTTTCTCCCAGAAAGGATCTCCTATATATATATATTTATCCTATAATGCAACTTTCAGTAAGATTTCTTACACCATCTTGTTTTACTATTTTACTTGTATATTTATATTTGTAAGTATTTGATTAAATCAAGTATGGAAGTGGGGGATGGGAAATGAGACAAATTAATTAGCTTGTTTTAAACATTGGAATGATTTTAAACATCTCCTGACAAAGTATTTAATTGTAGGAGATGACAATGATTTTAAACAGTAGAAATTAGAGATTTTGGAGCCTTCCTAGTTTGTTTTCCCTGCCATATAAAGATCCCACATGAGTTTCTTGTCAATCTGCATCATGTTTCAGTACTGATAGTTCACACATAATATATTTGCTGAGATGAAAGAAAATAGAATAGATAGGATAGGAAGGGTAAAGAGAGAAGAATTCACAAGTTGATGTACTAGAGAAAAACATATATAGGACTAAAAACATTAAGTTGATTATCATCAAAAATATGTCGCCATCTTATGTATAAGGGTTTGAGATAGTGGAGAAAGGATATTGAGAGAATAAAAAAGATGAAGAGTGTTAAATTATATAAAAATAATAGACAAAATAAAAGGAAGGAAAACATTTAAAGAAACGAGTGAGAAAAATATCAAAACTCTTTCTTAAAAGGATCCTATGTTATTGAACATGCTTCCATGGAACTGCATGCTGCGTTCTAATAACCAGGCTGGCCTGTGTCTATAACGCATAAGCAAACGCACCCGAAGCTGAAAATTACATTCGAAGCCTTATATCACAACATTTACTCTTACAAATAATTCAATACGAGTTTAGTCAATCAATCATAGATCGATAGAAAATTTAAAATACTTAATATTAATTAAAAATCGGAGTTTATGAATTGTAGTTATACGACACTATAAAATATCTTCAATTACAGTATATTATTTATTCAGTATAAAAGCTTCTTTATTTATATTTTTCGTACTATAAATGTGTGTTAATCTGAAGGTTGATGAAGGATTAACCAAAGGGTCGATCTTTATTTAATATTTGATATTTGAATGTGTCTTTCTGTTTTTCCGGCCTTGTTATTACAATCCACCATTCAGTTAGTTGCATTAACAGTGGGAACTATTTAGGGTCTGGTTATTATAATTAAACACTAAGTTCTTATGGTTAAAATTAATTTTTACGTATTAACTTATGAATTAGTTAAATAAGAAACGTTACTTTTTTTATTAATTTATAAACAGTATTTTAAAAAAAATCGTGTTACTTGTGTTAGCTTTGGAACAATATATGTAGAGCTAACGTAAATAATTAACCAATTGAACATTTCATATAATACATGCTTTAGAAGACTGCTAAAATAAAGAATTGAAATTTTTGTAGAAAAATATTAGCAATATATTTAACAGTAGTTTTTAATAACATTTTCGTTATATTAATTTTTTTAACTTGTATTCTTAGAACACTCCATTTGACACTCTTTTATTGATTATCCTTGAGACAATTTAAATTGTTTTATTAAATTTATTGTTACTAATATACCAAATACCATGATTTTAAAAAGCCTCTTTTAGTAGTGATTGTTGAATAGTTGTTTTGCTCTTGTAATTTTTACATGTTAGGAATTGAATTTTACTCCAATTATATTACATTAAGTCTTTATTTTTTTATGATTTTGTTTCTTTGGAAATATTTCAGTGGTTATGTATGAATTAATTGTACCAGGGTGTATCAGTGGTTGGTTTAGTTGAGTTGGAAAAACTACACAATAATCACTTGAATTCAATAGAGCGCATTAAGTATTGCCAAGAGTAGGAGTGGGCAAAATTAGTTGGATTGAATTGAAATTTTCAGATCCAGCAAATTAGAAAAGTTAAGGGTCTATAATAAAAAAATTGTCAGTTTAGTTTTGAACATTGAACTGCTACATTTGCTGAACTGATTTATTTCATGACAGTTCAAAAATGAAAAAAATAACAACATGAAAGTGTTGTTGTATTTAGCTATACAACATCAAAACACAAAATATATAGATAAATTAGATTTCGTAAACCTGATAAGAGCTTACCTTATTTGGAATTAGTAGTAACAAATTAGTAGCTCTGCAATATTTTGAATATTTTATTTAAAACATGTTATTAGAAGCAATGAATTGGTTCGAACATAATTCAATTCAATTAGTGTAAAGATTAAGAATAAGTGTCGATTTGAAACTAAAAATAGTAGTCTATAACGGACTGAAAAAAACTCAACTAAAAATTATTTTTTCAGTGTAATTCAAGTATTACACCTGTTAAAAGCTTTGCATAAGTGGTAGATACATGAAGGATTTCTTTCAATATTAGAAAACTATATGGAGAAATTTTCTGGTTTAAGGAGATATGGTAGTAGTAGATATGAGGAATTTTTATGGTTATTTTGATATCCAACTAACGTGCAGCTGATAATTATGAATGATATAACTGCACATATGGCGTATTAAGTGGGATAAAGAAGAGATATTCAACTGTCCCTTTAGGATATCTTCAAAGTATTACTCACTTTAGGATAAAATAATTAACTTGAATTCGCCTGGTCAATGTCATCCCTGAATTATGATTAAAAATAGATGATTAGTCCATTATTGATGTTATCGGCAACTAACTTTATTGCATGCTTTTATGTATGATTAAGATGTGTCGAACATTTTGGCACTATTCAGACCCGTCATTGTTCCACTGACAAACCAAAGGGGCCCTTCTATCTTCACTTCTCTCCCTCATCTGCACTTTCAATTTCAAATCACCAAGTTGCCACCCAAAATTTATGCCATGCATCTTCTGCTCTAGCACATTAAATCCAGCCAAAACAAATTTCCTTTGTAAGACTAATTACTTCTTAAGTGTAATTTCTATGTAGAAGAAGATGATCCCAAGATGTCAGAGAAAAATATTTGGAGTATTGAACAAGAGTTTTATCAACCATATACTATGCTTTGACTACCCTCTTTTCCATGTATTTAGCCATTACGTTGTGTGATGTGTGAAAATATATTTCTGAAGTTGTTTTTGTCGTTACATTCTCAAAATTAAGTCATATGGAATGCTGTTTAATCATATTTCAGGAGTGAGTCTGGGAGAAGGAACTGGGGCAACAATGTCAGATGATGAAGATGAGTTACAGATGGATTTTTCTTTGGATCAATCCAGCGCTGAAGGGCATGACATGATGGGATTTGGTCCCTTACTTCCTACAGAATCTGAAAGGTCACTGATGGAGAGAGTTCGTCAGGAACTAAAGATTGAGCTGAAGCAGGTCATTCTTGTACTCAATATATATACATGCTACCTGTTCTTGCACTTTACATGTGGTTTCATATTTTCAGTAAGTTTGAATCACCAACCAGTTTTACTTTCTGCAGGGTTTCAAGTCAAGAATTGAAGATGTCAGGGAGGAAATATTAAGGAAACGTAGAGCTGGGAAATTACCAGGTGACACAACTTCTGTGTTAAAGAATTGGTGGCAGCAACATGCAAAGTGGCCTTATCCTACTGTAAGTGAACACCTTCTCATCATGTTCCTTTCA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