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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34467 LG10 11441652 11447523 hypothetical protein LR48
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 11442218 upstream_gene_variant
A/T 11442224 upstream_gene_variant
C/T 11442231 upstream_gene_variant
G/A 11442232 upstream_gene_variant
G/T 11446793 intron_variant
A/G 11446814 intron_variant
A/G 11446826 intron_variant
C/A 11446854 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34467.1
MNGFEERETTAFRALADRCRSLEEKQAKLKEEFDELLQKKLTVRHDNDNNNEVIADSTTLGFLPGYFSRSPYATLLKCMGHAVHVVRVPSAEIVYWNHAAETLYGWKDHEIIGQSVTKILIAQENYVSLQKILERVVSGVPWSGKFPFKKKSGEVIMALVTKTPLYEDGELVGVITVSSDAAILKCTNSENQTYKSANNGQPGVRRLNFKRIQWPPRPTIAPMPQIASSVSNLASKLLPLLHSTDDTVSKKTSTDAVAGDEKLEKRGIYETKPNSRHFRKENTIVTEASEENESTAEFGQPSKIRGQQSNPAESKYMPEVHLTLKIYMILSMVRSLQAAKLQTGVRAKYGKDNGNMKNNCADDNSGSNRMNYENDSSGGLVPLKGYQDVVNGADKELNLQKCNSSLAMKRAETTACASRASTVSKDYSEATTVVTGDEVQKQQEVSQLPSSRESTGSHESLSGKGDYESNSVSECEIRWEDLQLREEIGQGSYATVYHGIWNGSDVAVKVYFGNGYTEETLQDYRKEVGDFGLSRLKDTTLLNTKSGRGTVMTSLGFFIFKYETADLSSWQLSDVFSFGVILWELMTQSIPWKNLNSLQVVGVVGFMDRRLDLPEDLDPHVASIIDDCWQSDPERRPSFEELIQRTLFLVNRIMRSTNQHIEWQLATLRTFFLPKVERTTRERQTEGGSRR*


CDS Sequence:
>Vu_34467.1
ATGAACGGCTTTGAGGAGAGAGAAACTACAGCGTTCCGAGCTCTGGCGGATCGGTGCCGGAGCCTCGAGGAGAAGCAGGCCAAGTTGAAGGAGGAATTCGATGAGCTACTGCAGAAGAAGCTCACAGTCCGGCACGATAACGATAACAATAACGAGGTCATTGCCGATTCAACAACCCTCGGTTTTCTCCCCGGTTACTTCTCCAGAAGTCCCTACGCAACCCTGCTGAAATGTATGGGCCACGCCGTTCACGTCGTCAGAGTTCCCTCCGCTGAGATCGTGTACTGGAATCACGCGGCCGAAACTCTGTATGGATGGAAAGACCACGAAATCATTGGCCAAAGTGTAACTAAAATCCTAATTGCTCAGGAAAATTATGTATCTCTACAAAAAATTCTGGAAAGGGTGGTTTCAGGAGTTCCATGGTCTGGGAAGTTTCCTTTCAAAAAGAAATCTGGTGAAGTAATTATGGCATTGGTAACAAAAACTCCTCTTTATGAGGATGGTGAGCTTGTTGGTGTTATAACTGTTTCAAGTGATGCGGCTATATTAAAATGTACAAATTCAGAAAATCAAACATACAAATCTGCTAACAATGGCCAACCTGGAGTAAGGAGGTTAAACTTTAAAAGAATTCAGTGGCCTCCACGACCAACGATTGCACCAATGCCGCAGATTGCTTCATCTGTTTCCAATCTGGCATCAAAGCTTCTCCCACTGCTGCATAGTACTGATGACACAGTTTCCAAGAAGACTTCGACAGATGCTGTCGCAGGTGATGAAAAGCTAGAGAAGCGTGGCATATATGAAACAAAACCTAATTCCAGACATTTCCGTAAAGAAAACACAATTGTCACGGAGGCCTCTGAGGAGAATGAGTCTACTGCAGAATTTGGCCAACCTTCTAAAATTCGTGGACAGCAAAGTAATCCAGCAGAATCCAAGTATATGCCGGAGGTCCACTTGACATTGAAAATATACATGATCCTCTCTATGGTTCGATCACTTCAGGCAGCCAAGCTTCAAACTGGGGTACGTGCAAAATATGGGAAGGATAATGGAAATATGAAAAATAATTGTGCAGATGATAATTCGGGAAGCAATAGAATGAATTATGAAAATGATTCATCTGGAGGTTTAGTTCCATTAAAAGGATACCAGGATGTTGTTAATGGAGCAGATAAAGAACTAAATCTTCAGAAATGTAATTCTTCACTTGCAATGAAGAGAGCGGAAACAACCGCGTGTGCATCTAGAGCTTCCACTGTTTCCAAAGATTATTCTGAGGCAACGACTGTGGTAACAGGAGATGAAGTACAAAAGCAGCAAGAAGTGTCGCAACTGCCAAGTTCGAGGGAGAGTACAGGCAGCCACGAAAGTTTGTCGGGCAAAGGGGATTATGAGTCCAACTCTGTTTCAGAGTGTGAAATCCGTTGGGAAGACCTTCAATTAAGAGAGGAGATTGGACAAGGTTCTTATGCAACTGTTTATCATGGAATTTGGAATGGATCGGATGTTGCAGTCAAGGTTTATTTTGGGAACGGATACACAGAGGAGACTTTACAAGACTACAGAAAAGAGGTTGGAGATTTTGGCCTATCTCGGTTGAAGGATACAACTTTATTGAATACGAAATCTGGGAGAGGCACCGTAATGACGTCACTCGGTTTTTTCATTTTTAAATATGAAACTGCTGATCTGAGCAGCTGGCAACTGTCTGATGTATTCAGTTTTGGTGTCATCCTCTGGGAACTAATGACTCAATCTATTCCCTGGAAAAATTTGAATTCCTTACAGGTTGTTGGAGTCGTAGGCTTTATGGACAGACGACTAGACCTTCCAGAGGACCTTGATCCCCATGTTGCCTCCATCATCGATGATTGCTGGCAAAGTGATCCAGAGCGACGCCCATCATTTGAAGAGCTGATCCAGAGAACGTTGTTCCTTGTTAACAGAATTATGAGAAGCACAAACCAACATATTGAGTGGCAACTGGCAACCCTTAGAACATTCTTCCTTCCGAAAGTAGAAAGAACAACTCGAGAGAGACAAACCGAAGGTGGGAGTAGGCGATAA


Promoter Sequence:
>Vu_34467::LG10:11447523-11449523(-)
ACAAGCTGGATCTCTCTCTCTTGTCATCAAATAATCACCTTTTAGTGGAGTAGTTGTAATATAATTAAGTAATGGTTTAATGTCTTGGTAGGTCTTTATTTTCGTTTGGAATTTTAAATAAGTTTTTTTCTTTTTATGCGTCTCAATTGGATCCTTGTTTTTGTAAAATTAAAGTAATTAGGGGCTTTTCGTCAAATTGAGAAGACGCGGTTAAGAAAGATGTTTCGTGACATGCTGACAATGTCTTTTTAAATGATTTGACATTAAAAACGTTTGTGAAGTGTATCTTTTTTAAAATTTGAATTAAAAAATGGAGTGCAAAGAGGGAAAATAAAATTTAAGTAAGGGCAAAGTGGTCATCTCATTTCATAGAACACATGGAAAGGTGGAAGAGCACTGTCAACACCAAACATTGCTCCTGGAATGTCATCCTTCATCTTTTAACCAAATCACAGCCACCGTAGATAGAAATGCAAATTGCAGGAACCCAATCGCGAGTTCGCCCAACATTTTCACCATTGCGAGACGAAATCAGAACCTGCGAAAATTCCCAAATCAAAAACCAGAAAAAAGATGTATGTGAACTGATTCAAAATCGACAAAAAAAAATTGAATCTGTGAAAATTCTCAAATCAACTGCCACTATGAAACATCTTCACCTGACCACCTTGTCAATGCCGTGTGTAGAAACCACTGTCTTCGCAACCTGAAACGTATAAAAACCAGAAACGGCAGAAGAACCCTAAAACACAGAAAAAATCCCCAAATCAGCAAACCCTAGTCGCGCAAGCACGATTAAGAGGAGGCGAAACTCAGGAGTGTGATTCCCTTCGTTTTCCACCATCATCGCGAGAGATAATTAGAATCGTGAAGCACCTGCAAAAATCAAAACCCAACCACAGGAGAATTTTTTCTCTCGCGCATAGAGATCTCCATGGCAATTGGCAACAACACACTTCGCGACAGGTAGAGAAGGCAGAAGCAAGCATTCCAAATCCTAATTCTAAAATCCTAATTTGGGTGAGAGAGGGGCTTCCACATGGCAAACCCCCATTTGATACTTAATTTAATTTGATTTCCCAACTTTACCATTACTTATATTATATTTCCACTATATAAACTTCATTTTTTAATTTAAAAATAAAATAAATACAATTGAGACATGTTTTTAATGCCACATCATTTAAAAAGACATTATCAATATGTCACGTAATACTCTTTTTAATATAATTTTCTTAATTTAACAAAAAAAATCTCTATTTAATTTAATTTTATAAAAATAAGAATCCAATTAAAATCGCGGAAGAAGAAAGGGAGACATTAAACCTAAAGTAATTGAATGTGTTACTATTCATTTGAGTGGAAGCAACGTAAATAATACTCCTCCACTTGCCTCCTATCTTTATCTCTCTCCGTCTGTTTCTATCTGATTTTTTTCATAACATGCATTTATTAGTATAATAGTACAAAGTTATTTTGAGTAAATAATGCACCTATTAATTATAGACTATTATTTATAGTTGTGTGAATTTGATTAATAAAATTAAAAATAATATTGAAAATTGCAATTCAATTTATTTAAAATCGGTCACCCTTGGGAGGGACCCCATAAGGGAACAGAAGCAAAATAGCAAAAAGGAAGGAAGCAACAGGGTTTATAAGTTTCCGGTGAGCAAATCGTGGCTGGCGTGAGTGTTGTCCGAACACAAGAACACAAAAAAAGCAGCGTTCTTTTGTAGACACGCAATTGGTGGTATCTTCCGGCAATCCTATCGGTGTGCGCACCGGATAGCTTCCGTGGCCGGCGACCGACACGTGGCGAAGAGCCTTTAGGCCCAAGCCTCGCATTGGACAGAGACGCAGTCGCAATTAAAACCAATAAAATAAATGAATAAACAAATGCTTTGTGCAGAAGCCAAGCGAGGAACCGGCGAATAAACAAACTAACTGTTATCTAAGCGCATTGCGCACCTCACAACCATAGAGTTCTGTCCAATTCA


Gene Sequence:
>Vu_34467(-)
ATGAACGGCTTTGAGGAGAGAGAAACTACAGCGTTCCGAGCTCTGGCGGATCGGTGCCGGAGCCTCGAGGAGAAGCAGGCCAAGTTGAAGGAGGAATTCGATGAGCTACTGCAGAAGAAGCTCACAGTCCGGCACGATAACGATAACAATAACGAGGTCATTGCCGATTCAACAACCCTCGGTTTTCTCCCCGGTTACTTCTCCAGAAGTCCCTACGCAACCCTGCTGAAATGTATGGGCCACGCCGTTCACGTCGTCAGAGTTCCCTCCGCTGAGATCGTGTACTGGTATAATAATAAATCGTAGAGCCTACATTTTTTTTAATCGTTTCTTCTTTCTGGTAATTTATTTACCCAGAGATTATTCACGGTGTTATAATTTTTAATGGAACAGTTGAACGCTGTAGAGAGGATAGTGAATAGGATGTGTGAGAAACTTGTTTCGAGTTTGGTTAGACATCCGCACGATGTCGTTTAGAGTGCTATATTGGGAATTGAATGAGTTATTTCGATTGAAAGTTTATTTGGTAAAACATGTTTTCAATTATTCATTAGGCGAGTGTTCCCAATTCGGCAATTCCGCAACATAGCAAATAAGAAAGGTTTACGGGGATTACTGTACTGGATCAGTTTACAGGATAAGTTGAACATTTTAAACTGAGGATGGTGGGGGCCTTGGGAATTGAAATTAGAAGTCGTCGTGTGTAACTTATAAAAAAGGACAGAGTATTCGACATTTTAGTTGTGTTGAAATTGGGCATTCTACTGGTAATCACATTGACGTTACTGGGGAAAAGAGACATCGTGTTGCATTTTCTTCAATAATTAGTGGTTTGGTAGGCATGCTTTGCTTAACAAGTGTTAATCGTGTTTAACAATTGTGGATCACTTTGGGGGAAAGTGTTGGAAGCTGATTTTTCATAAAGCTAATTGGATCCGGTGTGTAATTAAAATCACGAAAATCTGTAGTGTAAAAGATATTAAATCTAAAAAGATTAATGGTTAGAAATTGGCTTTTGAACCGTCATAACTTATTAGACTTGTATGTGCTCTCACCGGCTGACAATCAAGGCCAATTTCAGTCAATATTTCACTTTTTATTTTCAAATTTCGAAAAAGTTACCTCTGCAAGTTATTCTTTTGTTTAGATTGCTTTTGAGCCAAACCTATTTCCATTTCAGGAATCACGCGGCCGAAACTCTGTATGGATGGAAAGACCACGAAATCATTGGCCAAAGTGTAACTAAAATCCTAATTGCTCAGGAAAATTATGTATCTCTACAAAAAATTCTGGAAAGGGTGGTTTCAGGAGTTCCATGGTCTGGGAAGTTTCCTTTCAAAAAGAAATCTGGTGAAGTAATTATGGCATTGGTAACAAAAACTCCTCTTTATGAGGATGGTGAGCTTGTTGGTGTTATAACTGTTTCAAGTGATGCGGCTATATTAAAATGTACAAATTCAGAAAATCAAACATACAAATCTGCTAACAATGGCCAACCTGGAGTAAGGAGGTTAAACTTTAAAAGAATTCAGTGGCCTCCACGACCAACGATTGCACCAATGCCGCAGATTGCTTCATCTGTTTCCAATCTGGTTCTCATTAGTGTGATCTTTTTATAGTTTTATTCTTTTTTATTTTAGTTTTTTTTATCATTTCCTTAAATTAAATTATAGAATCCTATTGTTTATATCTACCAGGCATCAAAGCTTCTCCCACTGCTGCATAGTACTGATGACACAGTTTCCAAGAAGACTTCGACAGATGCTGTCGCAGGTGATGAAAAGCTAGAGAAGCGTGGCATATATGTATGTTTTTGTTCATCTCGGGGATGTAGTATCTGAGTAAGTATTTAATTTTGATAACGTTTTAAGTTTTCGTATCCTAAATTCGAATTTCAGGAAACAAAACCTAATTCCAGACATTTCCGTAAAGAAAACACAATTGTCACGGAGGCCTCTGAGGAGAATGAGTCTACTGCAGAATTTGGCCAACCTTCTAAAATTGTAAATAAATCTTACTTTCCCTTTTATTAGTTACTCTAATTGCCTAATTGATAAAGTAATACTTCATCTAAAATCATAAAATTGGAGGCTGAACCTTTGTAGGCACTATGAAGCTTAGATCCCAAATTAAAGCCATTTAAGTATATGCTAGCAGAAACTGAGCATATACCGCAGGCCCACATGAATCTGTAAACTCTGCATTGGTTTGATCTATATAGTACATAATATTTGTTTAAAAAATTGCGTTTGTGAACCTTTGTGGTGTACTTATGAAGCGTGGACAGCAAAGTAATCCAGCAGAATCCAAGTATATGCCGGAGGTCCACTTGACATTGAAAATGTTGCATTGGTTTGAACTGTAGTATATAATATTTGTTTAAAAATTGTGTGACGTGAAACTTCTGTGTAACTTTTTATCCATTTTAGATACATGATCCTCTCTATGGTTCGATCACTTCAGGCAGCCAAGCTTCAAACTGGGGTACGTGCAAAATATGGGAAGGATAATGGAAATATGAAAAATAATTGTGCAGATGATAATTCGGGAAGCAATAGAATGAATTATGAAAATGATTCATCTGGAGGTTTAGTTCCATTAAAAGGATACCAGGATGTTGTTAATGGAGCAGATAAAGAACTAAATCTTCAGAAATGTAATTCTTCACTTGCAATGAAGAGAGCGGAAACAACCGCGTGTGCATCTAGAGCTTCCACTGTTTCCAAAGATTATTCTGGTAAGCCTCTCTCTGGGGAGTGGTGTGAATTTTTGGATTCTCCCATTCCCCATACCCATTGTTAAGATTACACTATCTATTTGATCACAAGAAATTGGAACCAGAGGCAACGACTGTGGTAACAGGAGATGAAGTACAAAAGCAGCAAGAAGTGTCGCAACTGCCAAGTTCGAGGGAGAGTACAGGCAGCCACGAAAGTTTGTCGGGCAAAGGGGATTATGAGTCCAACTCTGTTTCAGAGTGTGAAATCCGTTGGGAAGACCTTCAATTAAGAGAGGAGATTGGACAAGGTAATGAATTCCATTATTATGCATTTTATAGTTCCTCTATGTTAAAGGAGTTCAAATGCTAAAATGTTTTAATTTGTAAATAGCAGCATAAGTTTAGAAAACGAAGGTATATGGAGCAGTCTCAAAATAATATAAATATAATTTTCCCGTCTTAAATCTAAGTGGTCTATAATCCTTTATGCCACAAATAAACTCAATCTTTTTGGAGGAAAATTCAGTGTCTAGTGGGTGATGAATTGTCATAAAGAAGTAGCCAAGAATATTTGCTCAAACATCTCAAGGTAGGACGAGAAATTTCTAATGGATATCTTTTCAAATAATTAGGTTGATCTACCTGCATCTTTTTCTTTAGTAGAACTTGAAACGTGTCTGAATGTTCCTATTTCAACCAATGATTGCTGACATAGTTATGTTCCACTGTGTCCTGTAGGTTCTTATGCAACTGTTTATCATGGAATTTGGAATGGATCGGTATAAAATTACCATATTCTTCTATGTTACTAATAGTATTGACTGGCCATCTGCTCTAAAACTTATTTTCTTTTTCAGGATGTTGCAGTCAAGGTTTATTTTGGGAACGGATACACAGAGGAGACTTTACAAGACTACAGAAAAGAGGTGTGTGTCTCTCTCTCTATGTGTCTTGCTTTAAATAGAAAGCAACTGATTCATGAATCCTTTGTGTATACTTCAGATTGATATAATGAAGAGATTGAGACACCCTAATGTACTACTTTTCATGGGAGCAGTATATTCACCGGAAAGGCTTGCCATTGTTACAGAGTTATTACCTAGGTAAGATTTTCGACATCATCATCTTTTAGCTTATTAAAGGAGTTGCACTGTGTGTAGAAGCACATAAAATATCATGCTTGAAGTATCTATTATATTTGTGACATTGGGTAATAGATCTGTGTATTAGTGAATATGAATATCTCACACGGTGCACAACAAAATCCCCATTTACATGTTTTTTTTTTGTATGCAAATTATAGGAATGGTCTTAAATTGATTTCATTTTGCACGTTAGGGGAAGCCTTTTCAAAAATATACATAGGAACAATCAGACATTAGACATCAGAAGACGTCTAAGGGTGGCTCTTGATGTTGTGCGTGTCCTCTCCCACTTCACATCAATGTTGAGAGCAAGCTGGTGGCTTGTTAAACCTTCATTTTGTATTGTTCTAAATCACATTGTTGTTCATTTCAGGCTAAAGGAATGAATTATCTTCATCACAGAAATCCACCAATTGTGCATCGAGATCTGAAGTCTTCCAACCTGCTAGTAGATAAAAACTGGACTGTAAAGGTGATCAATGCTTCAAAATGCATTTGTCGGGCCTAGGATGGTTCAATATAATGAGTTTTGTTCTTTTCCTTAGGTTGGAGATTTTGGCCTATCTCGGTTGAAGGATACAACTTTATTGAATACGAAATCTGGGAGAGGCACCGTAATGACGTCACTCGGTTTTTTCATTTTTAAATATGAAACTGCTGATCTGAGCAGCTGGCAACTGTAAAATCTTTAGTTTGTTTTTAGTGAATGAAGTTTTATTTCTGTATCTTGCTAACAATCATATTTGTTGTTGAAATGCAGCCTCAATGGATGGCCCCTGAAGTCCTTAGAAATGAACCTTCCAATGAGAAGTAATTACTTGGAACTGTGACTCAACCGATTGTGTTCAGCCTGGAATTTTCTGGAAACTTTGAAAAATGGAGACGATATTCTGAACAACGAATTTTTCCAAAAACTTTTCCAAATTGTCATTTTCCGTAATTATTTGCTAATTGGCCCTAAAGATCTTGAGGAATTGTTAAATCAGCTTTAAATATCCTGTGTTTAAAATCTTTGATTAGAAACTTCTATATAGCTGCAGTTTGAGTTTTGTCAATCACTGTCCTACCTTTTCCAGTTTCCAAAAATATCGCTAGTTTGGAAGTTATTCTGTACTAGCAAATAGTGCCTATATCCTATTGAATTGGTAATGCAGTTGATGCTTCTGAAGTAATGGATTTCTTGCCTTTTTAAAACAGGTCTGATGTATTCAGTTTTGGTGTCATCCTCTGGGAACTAATGACTCAATCTATTCCCTGGAAAAATTTGAATTCCTTACAGGTTTCTCTCTCCTAGAAACACATGTAGTTTCAACATAAACTCGTCTGTACAACTAGTCTACTGCAGAGAGAACATAAACTAATAGTGCTGCTAACTAACACATCACTTGGATTGACCAATTTACCTAAGAGTTTTAATTAAAGTTACACGCTTAGATGGTTAAGTAAATATAGTCTGTTAGTAAATATGTTTAACAATTGATTAATTAAAGTAACAAGTGTAATCTTAACACTGGGATTTTTTTATAACCATTGTATTTCACTTGAAAGGTTGTTGGAGTCGTAGGCTTTATGGACAGACGACTAGACCTTCCAGAGGACCTTGATCCCCATGTTGCCTCCATCATCGATGATTGCTGGCAAAGGTGCTTATACAGACACACTTCAGTTTTAATATGATAGAGATTTCCTTCTTGGTTCTAACTCAGATTTACTTGGTTAAAAATGGGAGCAGTGATCCAGAGCGACGCCCATCATTTGAAGAGCTGATCCAGAGAACGTTGTTCCTTGTTAACAGAGTAACAGCAGTGTCAATTAGGAGAATTGCAGAATCCTAAACGTTTTATATGGTTTGGGTTTTGTTTTCTCAAAATGTGTTTGTTAAAAACAGATTATGAGAAGCACAAACCAACATATTGAGTGGCAACTGGCAACCCTTAGAACATTCTTCCTTCCGAAAGTAGAAAGAACAACTCGAGAGAGACAAACCGAAGGTGGGAGTAGGCGATAA

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