Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34425 LG10 11101237 11104250 PREDICTED: mitogen-activated protein kinase homolog MMK2-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 11101238 5_prime_UTR_variant
A/G 11101634 missense_variant p.Asp78Gly
C/A,* 11101831 stop_gained p.Tyr116*
G/A 11101835 missense_variant p.Val118Ile
T/C 11101855 synonymous_variant p.Thr124Thr
C/T 11101897 synonymous_variant p.Asp138Asp
T/C 11101925 downstream_gene_variant
C/T 11101942 downstream_gene_variant
T/A 11101945 downstream_gene_variant
A/C,* 11102932 downstream_gene_variant
C/T 11103072 downstream_gene_variant
T/A 11103412 stop_gained p.Tyr281*
A/T 11103413 missense_variant p.Arg282Trp
A/G 11103751 missense_variant p.Ile358Val
G/T 11103758 missense_variant p.Arg360Met

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34425.1
MSSKGKEEEGIKKVMIHGGRYVQYNVYGHLFEVPSKYVPPLRPIGRGAYGIVCAAVNCDTHEEVAIKKIANAFDNIIDAKRTLREIKLLRHMDHENIIAVRDIIRPPRKDAFNDVYIVYELMDTDLHHIIRSDQPLNDDHCQYFLYQLLRGLKYVHSANVLHRDLKPSNLLLNANCDLKIADFGLARITSETDFMTEYVVTRWYRAPELLLNCSEYTSAIDVWSVGCIFGEILTREPLFPGKDYVHQLRLITELLGSPEDASLAFLRSENAKRYIRQLPHYRKQNFSARFPSMSPEALDLLEKMLIFDPNKRITVDEALCHPYLSSLHDINDEPVGPGQFNFDFEQPTCTEEHIKELIWRESVKFNPDPPSQ*


CDS Sequence:
>Vu_34425.1
ATGAGTAGCAAAGGAAAAGAGGAAGAAGGGATTAAGAAGGTTATGATTCACGGAGGTCGATACGTGCAGTACAACGTTTATGGACACTTGTTCGAGGTACCCTCCAAGTATGTCCCTCCGCTTCGTCCCATCGGAAGGGGCGCATACGGCATCGTTTGTGCTGCTGTTAATTGCGATACGCACGAGGAAGTTGCCATAAAGAAGATTGCTAACGCCTTTGACAACATCATTGACGCTAAACGGACTTTGAGGGAGATTAAGCTCCTTCGCCACATGGACCATGAAAATATAATTGCTGTTAGGGATATCATACGACCTCCAAGAAAGGATGCCTTCAATGATGTTTACATTGTTTATGAATTGATGGACACTGACCTTCACCACATTATTCGTTCTGATCAACCTCTTAACGACGACCATTGTCAGTACTTTCTATATCAGCTTTTACGGGGGCTGAAGTATGTGCATTCGGCTAATGTCTTGCACCGAGATCTTAAGCCCAGTAATTTGCTTCTGAACGCGAACTGTGACCTTAAAATTGCTGACTTTGGTTTGGCAAGGATAACATCTGAAACCGATTTCATGACGGAGTATGTGGTCACCCGGTGGTACCGTGCCCCGGAATTGCTCCTCAATTGTTCGGAGTACACCTCTGCAATTGACGTTTGGTCTGTCGGTTGCATATTTGGTGAAATTTTGACCAGGGAACCCTTATTTCCTGGGAAAGACTACGTTCATCAACTAAGGCTTATAACGGAGTTATTAGGTTCACCAGAGGATGCTAGTCTTGCATTTCTCCGAAGTGAAAATGCTAAAAGATATATTCGACAGCTTCCCCATTATAGGAAGCAAAATTTCTCGGCTAGATTCCCAAGTATGTCTCCTGAGGCATTGGATTTACTAGAGAAGATGCTTATCTTTGATCCCAACAAACGCATTACAGTTGATGAAGCACTGTGTCACCCATACCTTTCATCACTTCATGACATCAATGATGAACCAGTTGGTCCTGGGCAATTCAATTTTGATTTTGAGCAGCCAACATGCACTGAAGAGCACATCAAGGAGCTCATCTGGAGGGAATCAGTGAAATTCAATCCGGATCCACCCAGTCAGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_34425::LG10:11099237-11101237(+)
CGTTAAACTTTCCCACTACTTTTTTATGTGACAAAAAAATTAAATTCTTATTACTAATTGATATTTAGTTTTTTTTAACAATTGGAAGACATTAATCACTAACATAAAAATACTTAATTTATATATGTAACTAAAATTTTGTGAAGATTGAAGTTTCACATTCGTAAAACTATACAATCAAAATAGATTTAAGCATAAATTTTTATGTTAAGAAATTAGTGTTATGTTGAGAAAATTTTATACTAAACTCTATCGTCAACTAAAATTTAAAAGAATAACATTTAAACAAAATAATTCAAGTTGCATTAGCTTTACTATGTTAATTTTACTTTATATCTGTTTTTGCAAATATTTTGTCAAAACACATTCCTTATTTGGTAGAAAGGGGAATGGAAAATAATATTGGTGGCTTGATTCAGGGATGAGAGAAGGAAAAAAAACGGTGAATCTACATTATTATTTCTTTCATTTTCATCTTACTCTTTTAAAAAAAAAAACTTAGTTTTTAAAATATGTTTTTTCATTTATTTCAATTTCATCAAACAATTTAACATTAAATTTTATTCTTATCTATTTATCCTTTCTCAATTGATTTTTATAATTTTTAAGTTTGATTTGGACTAGTGTTGTCAGGAAAAGACGTAAAATTTAACTAGAAGAACAAGTTCTAGATAGTTCAAGGGTTTTCGAGACCTAAAGTAAATTTAATAATAAGACATTTTATTTAAAATTTTTTTTGGATTTTTTATTTAAAATTATTTATTAAATTATTGTAATTAGTTTCGATTCATATTTATCTGCTTAAGTGGAGAATTCATCTTTTCTATCCTCCAAGAGCTTAAATTTTAATCAAATTCTAATTTAGTTAATAATTTTACAATTCGATCAACACAAAAAATTTCATAAGTTAAAAAATATAGAGAAAGCAAAATCAAGAAAAGGAAACATATTTCTAATTTTTAATTCTAATACAAATAAAATAAAAAACATTAATCACACAAATAAAAAAATACTAAGATAAAAATATTCATACACATATTAAAATTGATTATAAAATAATAAAAATAGCTAATTATTATTTTTATCTTAAACTAAATTATAATTTATTGAAAAAATAATTTAACTCATTAAATATATTTTTAATATTATTGAAATTAACATATACTTTAATTAAATTTTATTCTCAAACCTAAAGTTTTAATTAATTTAATAGAAATATGTTAGCATTTGAGACTTTTTTTTTCTTAAACAATTTTATAATTAATTTAATAAAGATATATTAGTATTAAAAAATTATTAATTTTCGAAAACATAAATTTTATAATTAATTTAATAAAAAATGTTAATACTAAATTTGTTTTTTGAAACCTTTTCTTCTTTTAATATAATTTACCCTTATACCAATCCTCTAAACAAGTGGTCACTTAGTTTGCAATTTGAGGTCACCTTTGAAACACGAACAGAGTTGGAGGACTACTCTACCATCTTTGGCGTCAAAATTAGATACGCTCAATCGCTTTTGTTTACAACTACTTCATATTCAATACTCACTTGGCGGCGAGTTTCCATGGTTGAAAATTTACATACCAATTATTGCCAAACAATTCATCCTTACAAAACCTTAGACTGAATCTGATTACAGCCTTTACGATTTGGTCAATTTAAAATTAAATTACAATTTGAGAGGACTTTGTCTTTCAGTAGCAAGTCTTTTACGAAATTGAAATGGTAATCAGCTGTTGGCAGTTAAATCATTTAGATAAAGAAAGACAAGAATTAGGAAGCGTGATTATACACGGAAATTAAATTAGCTTTTTTAAATTATAGTTAGGTGAAGAACAAGACTGATTAAAATATTTTGGTTGTGCACTTCATACTCTGACATTAATATTTAACAGTATAGACAGTTGGAGAAATTGAATTGGAGAAAGAGCACGGAATAATTAATGTGAAATGGAGGAGTTGGTGTTTGAATTGAAAAATAAATGAGCGAGTTCACA


Gene Sequence:
>Vu_34425(+)
ATGATGGATTTTCAAAAGAAATAAGAGAGAGAGAGATTTGGCATTTGCAGTGCGTGGTTGAAAGTTAATTTGAAGATGAGTAGCAAAGGAAAAGAGGAAGAAGGGATTAAGAAGGTTATGATTCACGGAGGTCGATACGTGCAGTACAACGTTTATGGACACTTGTTCGAGGTACCCTCCAAGTATGTCCCTCCGCTTCGTCCCATCGGAAGGGGCGCATACGGCATCGTTTGGTATCTATGCCCAACAAACCCTTTTTTCTTCTTCTTCTTTCTTGCTTCGATTAATGGTACCTTACTATGCTATTCTTTTCTTTCTTTCAGTGCTGCTGTTAATTGCGATACGCACGAGGAAGTTGCCATAAAGAAGATTGCTAACGCCTTTGACAACATCATTGACGCTAAACGGACTTTGAGGGAGATTAAGCTCCTTCGCCACATGGACCATGAAAATGTTCATTTTCTTCTCTCTTTTTAATAATCTCTTTTTATTTATATTTCTCTTTCTCTGTTTAGTAATCACTGTTTTTTCGCAGATAATTGCTGTTAGGGATATCATACGACCTCCAAGAAAGGATGCCTTCAATGATGTTTACATTGTTTATGAATTGATGGACACTGACCTTCACCACATTATTCGTTCTGATCAACCTCTTAACGACGACCATTGTCAGGTTTCCCTCTGTTCCTGTCGTTGCCTTTTTCACTTTTGCATTGTATTCATATTTTCTTTGAAAAAAGATCACAAAAAATCCCATTCATTCTGTTGCCGACATATTTTAAAGTGATTATCTCAACCCATGTAGGTTAAATAAATTAAGCACGGTACTGATGTTTCTTGAAATTTGTGCAGTACTTTCTATATCAGCTTTTACGGGGGCTGAAGTATGTGCATTCGGCTAATGTCTTGCACCGAGATCTTAAGCCCAGTAATTTGCTTCTGAACGCGAACTGTGACCTTAAAATTGCTGACTTTGGTTTGGCAAGGATAACATCTGAAACCGATTTCATGACGGAGTATGTGGTCACCCGGTGGTACCGTGCCCCGGAATTGCTCCTCAATTGTTCGGAGTACACCTCTGCAATTGACGTTTGGTCTGTCGGTTGCATATTTGGTGAAATTTTGACCAGGGAACCCTTATTTCCTGGGAAAGACTACGTTCATCAACTAAGGCTTATAACGGAGGTATGTGTTACGGTGCTTCATTTTGACATTACATGTTGCTGAAGCTTTCTAAATAATGTACTGCATTACCTCTCTCTGGCATTAGTCTCTTGGTTGTAAATTTTTTCTTCTTAAGAAACATGTTTAGACTTATGAACCCTGTTTCCTTGACCTTCCAGACATGCTTAATACTCCCAAGTTGCTGGAAACAAAAAGCCATTGGTTTTCATTTTGTACTCCTTGTTTTCTTACCCTTACTATCACTGCTAATTATTAGCTAGATAGTTAACTTTGTGAATTGGGTTCTGTGAGGTTTTCAGACTCTGATTGCATAGAAATAGAAAAATCTGTCGTTGTCCAGAAATGGCACCCTTCACCTTAATGAAGTACAAAACCATGCAGTTAAAATTTTCTTCCGGTTTAGTTGTTTACTTTTCCATTCTAGCTATTACTTATTGAATAGTGTTATTCCTACATTTTCTTACAACACTTTCACAACATTTTTTTTCTTCTTTTATCTTTATGCAATTAACCATCTTAATCCACACTTCTATCTCTTCTCATCTTGACTTTCTCCTTGTTGTGGAAATGAGAGTGAAAAATAATTTGGAAATAACATTACTCTTGCTAATTTACTATTTTTGATAGCTGGAAGGTAAGCATTGTTAATGCTATAAAAAGCCAATATCTTTAGCATCGTCGTGGTTTTGTTTATAAACCAACATATTTGCTGCGTGACATAAATTCCTGTAATATCTATCCAAACCTTCTACCCTTTCTACACTAGGGAATAACGGAGGGTTTGTATTTCCATCTTTGAATGTTGTCATTGTTAGAAAATGGAGGGATTGCATAAGCCGATTTTGCAGTTATGTGTAAATTAGTTTGTAACTTGACACTCTTCTTATGTTTTCCTTTTGCTTAAAAGTTATTAGGTTCACCAGAGGATGCTAGTCTTGCATTTCTCCGAAGTGAAAATGCTAAAAGATATATTCGACAGCTTCCCCATTATAGGAAGCAAAATTTCTCGGCTAGATTCCCAAGTATGTCTCCTGAGGCATTGGATTTACTAGAGAAGATGCTTATCTTTGATCCCAACAAACGCATTACAGGTATGCCTCATGAATTATGTTTCAAGGATGTATTTTTAACTTGCTTATTATTGAATGTAAGTTCATATTTGTTTATACACTTTTTGTAATATTTCACTTATTTCCTCCAGTTGATGAAGCACTGTGTCACCCATACCTTTCATCACTTCATGACATCAATGATGAACCAGTTGGTCCTGGGCAATTCAATTTTGATTTTGAGCAGCCAACATGCACTGAAGAGCACATCAAGGAGCTCATCTGGAGGGAATCAGTGAAATTCAATCCGGATCCACCCAGTCAGTAATTCTTTCTTGAAATATGATCACCTGATCACTCTTGGTCTTGGGTGTACATCTGGAGAGACACGAGAGGAGGGAAAGATAAGTGATTCATATGATTGATGATACAATGAGTGAAGAAGGGAAATAAAGAGAAATGATGGGGTGTAACGTGTGAAACTAATAGTTGAGTGACGAGGGAAACATTAGTATTCTTTCTTATTAGGATAATGTACCATGATACACCTCTTCACTTAAATACAGTGCCTATCCACTATTCAGATTAATTGCTATGTATAGAAATTCAGAAAGTTTCACTGTTGTAATCTAGTCCTAAAGCATTCAGGATAAACCAAAATGAGTAATCATTAGGAATCAAATTGGTAGTCAGGATTTAGGGAAACAATTATGATGACAAATATGGTCTGTCATGGAGCCTTTTGCTTATTATTTATCATTAATTTTTTGTTCTGGTTTA