Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34297 LG10 10209392 10213638 transcription factor-like protein DPB isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04350 TGF-beta signaling pathway [PATH:ko04350]
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 10209986 splice_region_variant&intron_variant
T/C 10210042 upstream_gene_variant
C/T 10210061 upstream_gene_variant
T/A 10210067 upstream_gene_variant
C/A 10210387 upstream_gene_variant
A/C 10210399 upstream_gene_variant
G/T 10210695 synonymous_variant p.Pro191Pro
G/A 10210696 missense_variant p.Pro191Leu
G/A 10210697 missense_variant p.Pro191Ser
T/A 10210704 synonymous_variant p.Val188Val
A/C 10210705 missense_variant p.Val188Gly
A/G 10210881 upstream_gene_variant
G/A 10210944 upstream_gene_variant
T/A 10210955 upstream_gene_variant
T/C 10211225 missense_variant p.Asp128Gly
C/A 10211232 missense_variant p.Val126Leu
C/G 10211270 splice_region_variant&intron_variant
T/A 10211305 upstream_gene_variant
G/A 10211378 upstream_gene_variant
C/A 10211525 upstream_gene_variant
A/T 10212085 upstream_gene_variant
A/T 10212287 stop_gained p.Leu97*
G/T 10212295 synonymous_variant p.Ser94Ser
C/T 10212420 upstream_gene_variant
G/A 10212464 upstream_gene_variant
T/C 10212710 upstream_gene_variant
A/T 10212732 upstream_gene_variant
A/T 10212781 upstream_gene_variant
A/T 10212865 upstream_gene_variant
C/T 10212866 upstream_gene_variant
T/A 10212930 upstream_gene_variant
A/T 10212984 upstream_gene_variant
A/C 10213127 upstream_gene_variant
T/A 10213567 synonymous_variant p.Ser24Ser
G/T 10213570 synonymous_variant p.Ile23Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34297.1
MGTQPRQTFREEEEEELPCRGTISGQSMSTSRSVGSPSSRSEQTMATPASDNTFLRLNNLDIHGDDAGSQGAVASKKKKRGQRTVGGDKSGRGLRQFSMKVCEKVESKGRTTYNEQQYDEKNIRRRVYDALNVLMAMDIISKDKKEIQWKGLPRTSLSDIEDLKYIGLQKLIERNEQLYSSGNAPNGGVSLPFILVQTRPHATVEVEISEDMQLVHFDFNSTPFELHDDNYVLKAMKFCERSQNDNKPDNPPDGGEGSSMSSLYHAQIPSSVSNPPARPPSSPPLPGILKARVKNEH*


CDS Sequence:
>Vu_34297.1
ATGGGAACACAACCCCGGCAAACATTTCGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGCTGCCATGCCGTGGAACTATCTCAGGTCAATCAATGTCAACTAGCAGAAGTGTTGGGTCACCATCCAGCCGGAGTGAGCAGACAATGGCAACACCAGCTAGTGATAACACCTTTCTGAGGTTAAATAATCTTGACATACATGGTGATGACGCTGGATCACAGGGTGCAGTTGCTAGCAAGAAGAAAAAGAGGGGCCAACGCACTGTTGGTGGTGACAAGAGTGGAAGAGGTCTCCGCCAATTTAGTATGAAAGTCTGTGAGAAGGTAGAAAGCAAGGGGAGAACAACTTACAATGAGCAACAATATGACGAGAAAAACATCCGTCGGAGGGTGTATGATGCTTTGAATGTTCTAATGGCAATGGATATTATTTCTAAGGATAAAAAGGAAATACAATGGAAGGGTCTTCCTCGCACAAGTCTAAGCGATATTGAAGATCTAAAGTACATAGGTCTCCAGAAACTTATAGAACGAAATGAGCAATTATATAGCTCCGGGAATGCTCCCAATGGAGGTGTATCTTTACCCTTCATTCTGGTGCAGACACGCCCCCACGCAACTGTTGAAGTAGAAATATCAGAAGATATGCAGCTTGTGCATTTTGATTTCAATAGCACTCCCTTTGAGCTGCATGATGATAACTATGTTCTCAAGGCAATGAAATTTTGTGAGAGATCTCAGAATGACAACAAACCAGACAATCCTCCAGATGGCGGGGAAGGTTCTAGTATGTCTAGTTTGTATCATGCACAGATTCCTAGTTCAGTTTCAAACCCTCCTGCGAGACCTCCTTCATCTCCACCACTCCCTGGAATATTGAAGGCAAGAGTTAAGAACGAGCATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_34297::LG10:10213638-10215638(-)
GAAGATTAAGAATTTAGATTATGTTACCGAATTGCAATTCATAACATTACTCAAGAATTAAACTTGGGTGACCAACAATATATAGTTCACAATTTACATCAATGTAATATTGCGCTTTAATCGCATACAACGGAATCTTTTCGATGAAAGTTGGACCTATCTATCTCTATATAATCTATCCATGATACAACAAACTTGGTAGAGAGAAAGAAGAGTATGAGAAGACAAGAAGAAAAGAAGAAACAACAATACGGTTTGAGAAAACAGTTTGATATATTTATGTGCGTATCCAAGACTGCATTTTTTAACTATCAACTCGTGTATACCAGTGGACGATCACGTCCGGGAATTGGGCCACACCCCATTCAGGCCCAATAAGATTACAGTGCGTTCGAAGTAAAACGACGCCGTAGGAACTGTTTAAATATTAAAAACCATAACATTTATATAAAATACAAAACCCGTTAATTAAAGTCTAAAAAACATAAACTTAAAAATTAAAAGAGAAAAAAAAAATTTAACTTGAAAATAAAAACAATAAAGTTATCGTCTTTGTTTTCCAAAAAAAAAAGAAACTTTTGACAATTTTTAAAAATATCAATAATTAAAAAAATCAAAATCTTAAATCAAAACTTAAATAAATTATTATTACTAGAATAAATACTTATACTCAAAGATTTCCAAGATCAGTTCATAAACTGTAATAAGCACATTCATTTTCCCTCCATGCTCTGCATTCAACTCAAACTAAACTCTTTTCATAACAGTGCCACTCCACAAATTAATCATGTTGTTTTGCCAAATAAAGCATACATGAAAGATTTCGTTACACCGTTCATTCAAAGATCAGAAATCAACCATTGATAATAGTATTCTCGAAGGAAAAATCGAGTGAAAAAACCAGAAATCAACTATAAAATACGTTACCGGAGGTGTTCATTTTGAATAATGGGTTTCGGCGCTGCCGGCGACGGTGCTCTCGTCTCTCTGCGGTGGCAGCACCTTCTCTTAGGGCAAGCGTTGAGAGTCAGAAAACAAATCTTAAGTCTCTTTTCGCTTAGGCTTTGGATTCAATAAAAAAATATATTTATTGGCTATTTAAAAAATTCCCGTGGATTTTTTTTTTATAATGGACCGGTTTACTGAACCGGACCGGTAAGTTTTAGAACATGTTAAAACCTAAGCATGCTAGTATCCTTTTTCTTTCTCACTCGCACACGCAAAGATTTGTTGAGGTGGTCCCTCTCTTTGGGTTCTCCTTCATCTTTAACTTTAGGTCTTCTCTGACTCTGAGGGACACTGCTGAGAGTCTTTGGTGAGTATTTGTAGCTTCAATTTGTGGAACTTTCTATTCGTCTGATTGCTTCGGTGTTGATAACTGACTTCTAGGAGCGCTTAATTTGTCAATTTTTGTTTTCCTCGTTTTATCAATTATGGCTTTTTCAATTTCTCAGATTCGTTCTCTTATCATATAACGCTTTACAAAATTGAGAATTGGAAAAAGGGTGTTTTACTATTTGGACAGGTTTGAATCCAGTGCAGGGTTCACACGTTAGGTCTTAGCACAATTGTTTGAGTGTTATTACTTACAATACTTTTGTTTTACTAATTTAATTTTAGTCTATCTTTGAAGTGTTGTCTTATCGAACGCTTTTATTTTCTCTTCTTGTCTTTTTCTTTGCTGTACAAATCAATTGAACAAATGCAACTTCTCATGGTTTATCTTTTTTACAGTTACACCAATTAGTTTGCAGTAAGTTTGCAGTATGTGTGAAATCGGTTGATGGTTTGTGTGTACGTTTTGTGCTTGTAATTTGATGGATGCTGGATTAACTTCTTTCACCCCTGTTATTGTTACACAGTATCTTGGGCTGATCTGAAAACACTATTGGTTTGTTCAGAAACACTGACCAGTTCAGCTTCACCTGGAAACTCTGTTGAGTTGAATTCAGTTTCCAGTGGTAAGTTATTTTCAGGCCTGGGGTAAGCAACTTACCAAC


Gene Sequence:
>Vu_34297(-)
ATGGGAACACAACCCCGGCAAACATTTCGAGAGGAGGAGGAGGAGGAGCTGCCATGCCGTGGAACTATCTCAGGTCAATCAATGTCAACTAGCAGAAGTGTTGGGTCACCATCCAGCCGGAGTGAGCAGACAATGGCAACACCAGCTAGTGATAACACCTTTCTGAGGTTAAATAATCTTGACATACATGGTGATGACGCTGGATCACAGGGTGCAGTTGCGTGAGTTCCCATTGCCCTTTGAGCTTGTAGAAATGTATAATTATGTGATGTGCTGTGGAGCAGATGCCATTTCGTTTGAAGTTTGTGAGTTTTGACATTTCTCATGAATGTACCATTTCAAATAAACATGGATTTGGATAATTTTTCAGCAAACAATTTTTAAATACTTATGAAGACAAACATCGTAAAAGTCAGATTGGAAAAGGAAAATAGTTAAAACAATCACTCATTTGTTAGATAGTCATGAAATATCTTTTTAATCCGCGTGAGGGATAAGAGTGGGAAAAATGTTGTCAAATTTTCCATTTGTTTGCAATCTTAAATGAAAAATTAGATGGTTTTCTTTTATGCCCTAATAATTTCATCTGCTTCTTGTATTTTTCATTTTTCTTGTATGCCCTAAATCCATTCTCATGTGATTTTTTTTTCTGTCTGTATCTATGGCCCATCTAAAGACTTGTCTTCCTTTACAATTGCATTTTGAAGAACAAACCCTGTATGAGCTCAAGGCTTTTGCAGTGGTCTTTTTAGATGTATAAATGTGAGGAAATGTTATGCATAAAGTTCTTGATTCTTGATGCATGTCGTGTCTGATTGTGTAGTTTTACTTTTGTGACACTCAATTGTCATCTTTTTTTTTTGTTAGTTGTTGCCACATACGACATCCTGTATAGTCATCCAAAATTGATTGAGGATTTCTGTTGTTGATGCAATATAGTGTGTATTGTTGTATTGTGATCCTACATTTCATAGTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTAATTTTCCATTGCCTATGTCTCCTGGTATGATGGGTTTTTGTTTTGTCTTATCCTGAGTAGACAGTGAAATAATCGTAGGTTTGTTTAGAGTCATATAAAGGAATATAAAAGTGTATTTATACTTAACTTGGGGCTTTTTGGGCAGTTGGTAATGTTAACACTTTATCCACTAAATACTTTTTGAATTATGTATGCATGAAGTCGTATCTATTACTTGCTCGTGCCTGTGGTCTCAGAATACCATTATATACTGTTATTCTTACCTATTGTGTCCTCTTAACCAGTAGCAAGAAGAAAAAGAGGGGCCAACGCACTGTTGGTGGTGACAAGAGTGGAAGAGGTCTCCGCCAATTTAGTATGAAAGGTCTTTAACCTAATCCCATATGACATTTTCTCTTTAATGAAAAGGTATTTTGACCTTTTCTAGTTTATAGCTTTGGCCTTTCAAAGATGCATATAACAAGCTGTGCAGACTATGATAAGTGTTTGGTTTAATTTATTTTGTAAAAATAACTGCTTTTTACCGGGTTTTTCAGAGAACTTTTTTAATATAAATGATTCCCCACCCCCGTTCCCTCTTCGGAAATAATCTCTTTCCAAAGATACATTAACTCGATCTGCATTTGTGGTATTTTAGTTCATTGTGTTCCTTAGCTTGTCATATTTTTTTAGGACATGGTGATTGTATATTTCCTTACTGGTTTTGTTTCTCATTGATTGGCTGTTCAGTCTGTGAGAAGGTAGAAAGCAAGGGGAGAACAACTTACAATGAGGTCAGCTAGTTACTCTAAGTCAGTTTGTGCTAAACTGGAATTAAATTTTGGATTCAGTTTTATATGCCATATGCACGTATAATGAATGCTTACCATAGCTTCTGCATTTTTGCAATTAATTTCTTAATATATTTTTGTCAATGCATTTGCACTACCATGTTTATGTTTCTAGTTCTAATGTTTTGTACCCAATTTAAATTGTATGCATTGAAAAATTGAATGTTGGTTTGTAAAGGACTTTTATCCAGCATAACCATGATCTATATGAGTCGTAGCCTTTGGCTTCTTAGATGTCTATATGATGTTATTGAGAATTCTTCAAGAACTACTGTCTGTTTATATGGTGTTTCAATGTCACATTTGTAATTCATCGTGTCTCAAATTTTGGTTTGAATTCCTCAAATGAACATATTCTTTATTTTTATAAATTTGATGTGGATTGTGCTTGTATTCAGGTAGCTGATGAACTTGTAGCTGAATTTGCTGATCCAAGCAATGGTGCTTCAACTCCTGATCAGGTTTTTTCTTTTGTATAAATTCTTTCAGACTGAGTGTAAAGATAAATATTATGAACTTGATGTTTTCGGGTTAACATTTGACAGCAACAATATGACGAGAAAAACATCCGTCGGAGGGTGTATGATGCTTTGAATGTTCTAATGGCAATGGATATTATTTCTAAGGATAAAAAGGAAATACAATGGAAGGGTCTTCCTCGCACAAGTCTAAGCGATATTGAAGATCTAAAGGTTTGTAAACTATATTCAGTTGTTTTATTTTTGGTACATGATTTACGGTGATGCTCTCTGTTATTCTAAATAATACAAAAAAAAAATTAGAATTTTAACTCATAATCCATTCAACAGAATGAACGTCTTGGGCTAAGGAATAGAATTGAAAAGAAAGCATCCTATTTGCAAGAACTGGAGGATCAAGTAAGGACCGCTATCAATAGTGGATTTAGTCTGGGTTTGAACTCCTGTGCCTAGTTTACTTTTTGAAATTTGCAACTGTTTTGTAAGAAGGCCCTATGGATTTTTGTCCATAATGATTATTTCTGTTTGCTAACTTTTGTATTAATTTATGAAGTACATAGGTCTCCAGAAACTTATAGAACGAAATGAGCAATTATATAGCTCCGGGAATGCTCCCAATGGAGGTGTATCTTTACCCTTCATTCTGGTGCAGGTATGCTATGATGTTCTGTCATTTGGTTATTTTGTCCACTAGAAATTGTTTGTAATTTTTCCCCTTTGGATCTTATATTTGTTAGATAATGCCTATGCTTATATCTCCTTGGTCTTAAGTCTGATATACCTGGTCACCGTTCACTTAATATGTTGGCTTAATGCCTAAAGTTTAAATTACAAGTGATCTATCAGATGAGACCTCAGTTCTGCTTTTTGGGTAAATTAAGTAGAATATTTTTTTTTCACCATTGTTATGAACATTTGTTAGACTTTGTCATTTGAAAATAAATGTAGTTGCTAGGGTTATTAATAATATTTATTCCATTTTTCGCTTTTCTCAGGTTAAGTTAGTCACTTTTTCTGCTCTAGGCTTATGGATATCTATACAAGATTTACAAGTGACTACGAAGGTTTAGGAAGATCCAGCTCACCCTTAAGCAAGAAAATAACTAACTAAAGAAATATATGTAGAGCACCCAATTGCAAACTGCAATGATTTGTTGGATAACTAACTTCTAGTTTATGGTGGTTTTGTGAAACTAATTTGAGCCTATGAACTTCCTTTCAGCACTTTTTAACTTGTAAGTTTCAAGGAAAAACTTAATATAATATTTTCGTTTTGTTTAAGCTTGTGGATAAGTACTCAATTAAGTTGTTTACTCAAACATGTTATTAATTAATGTTATTCGGGATTGTAGACACGCCCCCACGCAACTGTTGAAGTAGAAATATCAGAAGATATGCAGCTTGTGCATTTTGATTTCAATAGGTAAGAAGGCTTTTATTACACGACTTTTTTTTCTCTTCGAGTAATGTCATCATGTCATCTTACCCCATTTGCTGTCCTGAATGCGATCCTAATTCTCTTGTATTATACATTCAATCATACGTGCATACTATTGTGGACAAACACAGGCAGCATTGGGAAATCCATGTCATTTATTTATTTATAAATCCATGAGTCATTTCTGTATCATCTCTGTTATAACTTTCTATAATTCAAAATATTCGTTTATGTATGCTTACTTTCTATTTGCTCATTCTTTCTCTATAGCACTCCCTTTGAGCTGCATGATGATAACTATGTTCTCAAGGCAATGAAATTTTGTGAGAGATCTCAGAATGACAACAAACCAGACAATCCTCCAGATGGCGGGGAAGGTTCTAGTATGTCTAGTTTGTATCATGCACAGATTCCTAGTTCAGTTTCAAACCCTCCTGCGAGACCTCCTTCATCTCCACCACTCCCTGGAATATTGAAGGCAAGAGTTAAGAACGAGCATTGA