Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_34188 LG10 9415133 9416433 PREDICTED: somatic embryogenesis receptor kinase 2-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 9415239 downstream_gene_variant
A/C 9415240 downstream_gene_variant
A/G 9415271 downstream_gene_variant
G/C 9415471 downstream_gene_variant
C/A 9415510 downstream_gene_variant
A/T 9415534 downstream_gene_variant
G/T 9415597 downstream_gene_variant
T/C 9415710 downstream_gene_variant
T/A 9415748 stop_gained p.Leu76*
C/G 9415756 missense_variant p.Leu79Val
T/G 9415757 missense_variant p.Leu79Arg
G/A 9415762 missense_variant p.Ala81Thr
C/G 9415884 missense_variant p.Cys94Trp
G/T 9415907 missense_variant p.Gly102Val
C/T 9416011 missense_variant p.Arg137Cys
G/A 9416035 downstream_gene_variant
G/A 9416076 downstream_gene_variant
T/A 9416078 downstream_gene_variant
G/A 9416165 synonymous_variant p.Leu157Leu
A/C 9416385 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_34188.1
MSGLVFLSVLFLLLQLPLSSLSNSESDALYAFRKGLSAPDHIFDSWDPSNVDPCTWFHILCDSNNHVVRIDLYNYNIVGTLSPELGRLPYLQYLMLNGNKLSGKIPPELGNLGNLRSMDLSDNQLEGNIPVSFGNLKSLKFLWLQNNKLTGSIPKEVIDLHLPVFNVSGNHIHGADGNIPRKINFLMI*


CDS Sequence:
>Vu_34188.1
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Promoter Sequence:
>Vu_34188::LG10:9413133-9415133(+)
GAATATAATGCAGCATCTAAAAATAATAATAAAAAAAATTATAATGACAAAAGTAATTAATTAATATTAGTATTATTTTTTTATAATTCAATATTTAATTAAAATTATTTCTAAACAACAACATTTTATTTTAAATTAATTACATCTCTTATTTTTTTTTTTACAGAAAAATCATCCAGGTTTTATTTTAAACTAATTTTAAATAATTGTAATTTATCTTTTATTAATTTATATAATCTTATCATTTAATTTATTCAATTTTTTTTATCTATTACTTTCATCAAATTATTCACAAAATTTTATAGTTGTTTCCAAATCTTTTAAAAAGAAAACCTTACTTCATCTTTCATTTTTTCCTCAAATTCTTTCATTGAATCTTCTTCAGATCATCTCCCTCAAAAGTAACAGAGCAAGACTTTGTTCACTTCGATGGATTTGGAGGAGAGTGATTGAAGGGATTTCAGAGAATTTGAAAATAAATTTTTGTTGTTGTTTATTTGGGTAGATTTGAAAGTAAATGAGAATGAATTTGGAAATAAATTTTTCTAATATGTCACATCAATCAAATCTTATACTAATTCTCACAAATTTTATTTCCAAATCCATTCTCATTACTTTCAAATCCACTCAAATAAAAAACAAAAAAATTTACTTTTAAATCATCTCAAATCCTTTCAATCACTCTTCTTCAAATCCATTTAAGTGAACAAAATCTAAATGATACCATATTATACCTGTATCAATATCAGTAAAATGAGATACGTTGTTACTTGTGACATTTTGAAAATGATGATAATGAAACATATCCTTAAATAGGTGTAAACAACATTTTATGTGTGAAATAACATATCATTGGTCCAGTAAGTTTTGTAACTGTGTAGTTTTCAAATTTCAATAAATTTTGAAACGAACTGTCACATTCTTTTCTCTACAGCTAAGGAAATAAATAAATAATTTTCGAAAAAGTTAGTAGCTATTATTTACAGAGTGTTAAAATAGTAAAGTTTTCAATATATTGAATTTATAATTTTAATTTTTTCTTTTTGTATTATTTTAACTTTCTTTCCATTCCAACTTGTTTTATTTAACAAAATTCAATTTTTATATATTTATTATGTAAATAATAATTAATATTCAAAGAGTGCTCCTCTGTTCTCATTTAATAGCAGTGAAATTTATTTCTTTTAATCTGCACTTTTAAAATTAGGATAACAATATTTTTTTTTCAAATATGACTTATTTATATTTTAGTTGTATTTAATATTATTTGGAGAGAGAAAAATAAAAAAAAATATAATATACAACTTATTTAAAATTAAAAATAGAGAAAAGTTAATTTATTTTTATATTTGAGTCCAGAGCAAGAAAGAGGTATTATACTTCCTCTGTCTGTACATAACAGTTATTTATTAAAGAAAAGTTGTTCCTTTTCATTTATTGTTTTTAAAATTTTAAGATAGTGTAAACTTTTTTTTCCCAATTATACTCTTTTTTCCATTTTTATTATGGATGGAAAATTATTTAAAGAGAGAAAAATGAAAAGTTATAACATACAACGTATTCAAAATTGTACTAAAAAAAATTAAATAGTTTCTTTGACTTTGGTTAAAGAAGTCAAACAACTCTTATATAGAAACATAAACAAAAGTGTATCTGCATTAATGACCTTTAAAACATTTTTGTCAATATTCATTAATAAAAATATTCAATAGAAGAAAAATATTGTAACTATAAATACAAAGAAAATATTATGTGAAAAAATATCTTGTAATTAATTCAGAATTAATTATATTAAATATATTAACCAATAAAACATTGATACATAATCTGTTATAAAAAAATTATCAAAAAAATTATTAAAATAATATTTTTCTTTATTTACATGTTTTTAATTAATAACATACCTATGTATATATATATATATATGTCAGGAAATCATCATCTCTCAAAATACATAGAAAAGTGAATCATCGAGGTTATCCAGTCACACATAGGAAAAA


Gene Sequence:
>Vu_34188(+)
ATGTCTGGTTTGGTTTTTCTATCAGTGTTATTTCTGCTTCTCCAGCTTCCTCTGTCATCGCTCTCAAACTCTGAAAGTAAAATATCTCTATTCATTTATTCTTTTCCAAATTTTCGTTGGATAATTAAAACAAACATCACTTTCAGATTATGATTTCGAGTATACTTTTATCTGCAGGTGACGCTCTCTATGCTTTCAGAAAAGGTCTTTCTGCTCCCGACCACATATTTGACAGTTGGGACCCCTCCAATGTAGATCCTTGTACTTGGTTTCATATATTGTGCGACTCCAACAATCACGTGGTTCGCATGTAAGTTGCAACATTTACTTCTTTTTTTGCCATAGTTTTTAGTCTTCGTACAAACAAAATTACACATCAGATAAAATAATACACATGACATACCTCTATTAGGAAAAGATTTATATACACATAACATATTGTAAGTCTTTATGTATGTATTTTTGGTATCATTTTAAAAGATCCTGTACAAATGAAACTATATCTTACGTGTATATTTATCTTTTGTTTTATCTAATATAAGAATTTGATTGTATCAGTTTATGATTTAACTGTGTTTGTGGTTTGAATTTCAGAGACTTGTACAATTATAACATTGTTGGAACTTTGAGCCCAGAACTTGGCCGTTTACCCTACCTTCAATACCTGTAAGCATGTTTGGTTTATCTAATTTATTGGCTACATAAACATAAACATATAATTTGTGATTAATAAGGTCTTCATTGCAGGATGCTGAATGGGAATAAACTATCTGGGAAGATTCCTCCCGAACTAGGCAACTTGGGCAACCTTAGAAGTATGGATTTGTCTGATAACCAATTGGAAGGGAACATCCCAGTGTCGTTTGGCAACTTGAAATCGCTTAAATTTCTGTAATGTTTACGTTGGATGCTCAAAAGCTTAACCTTAGTTATCAAATCAAATGATGTCTGAATTGTGTTTTATTTTGCTTTCATGTATATAGATGGCTACAAAACAACAAGTTGACAGGATCCATCCCAAAAGAGGTCATTGATCTTCATCTCCCAGTCTTGTAAGATTCTCTTTCTGTGTGCTGGAAAATTCAAAATCAATTTCACTTTCTCATTTTATCATTGCTTTATCAACAAATTTCAAACCTCAATTTTGCAGTAATGTATCTGGTAATCACATCCATGGTGCAGATGGCAACATCCCCAGGAAGGTAATATAACCATTACAATTCTTAACAAAGATCATAAGCATGCCTAACATAATAATTGATTGTAATGAATTTTTAAAGATAAATTTTCTCATGATATAA