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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33960 LG10 3614187 3616223 PREDICTED: L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1-like
Map

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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 3614905 missense_variant p.Gly440Val
T/C 3615917 missense_variant p.Lys103Glu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33960.1
MAFFSSSSCSNQTQKQTSFFICIIFFTLFHNTVESVSFNFSSFQQSNLNNQINFTGDAFPSNGVLQLTKNQLDGPITSSVGRASYEQPVRIWDKKTNSLTDFKTHFSFIMKAVNESFIGDGLAFFLAPFDSSIPNNSSGGFLGLFSPDSAFDTKKNQMVAVEFDSFKNEWDPSSDHVGINVNSIQSVANVTWKSNIKNGSVANAWVWYNSTSKTLSVFLTYAKNPTFNSSSSLSYVIDLRDVLPEFVRIGFSAATGKSVEIHNILLWSFSSTLDEVGGKKVKVGLVVGVSVGLGCLACAAGLIWFTFWRRRNRLRGGNEEEIGVDAIDDEFERGTGPKRFTYRELSNATNNFAEEGKLGQGGFGGVYKGLIVNSNLEVAVKRVSKGSKQGKKEYISEVTVISRLRHRNLVQLIGWCHEQGELLLVYEFMPNGSLDSHLFGNRVMLSWVVRYKVAIGLASALLYLHEEWEQCVVHRDIKSSNVMLDGNFNAKLGDFGLARLVDHELAPLPSLPSKLPVPMYFAPPMEITQFSYSSSAVTTTTKDSSPYSSISTGSRKSPL*


CDS Sequence:
>Vu_33960.1
ATGGCTTTCTTCTCCTCTTCTTCATGCTCTAATCAAACCCAGAAACAAACATCTTTCTTCATATGTATCATCTTCTTCACTTTGTTCCATAACACTGTAGAGTCAGTTTCCTTCAACTTTTCCAGCTTCCAGCAGTCAAACTTGAACAACCAAATAAATTTCACGGGTGATGCTTTTCCCTCAAACGGTGTTCTTCAGCTCACGAAGAACCAACTCGATGGCCCCATCACAAGTAGCGTTGGTCGAGCCTCGTATGAACAACCAGTGAGGATATGGGATAAAAAAACAAACAGTCTCACCGATTTCAAAACCCATTTCTCTTTTATCATGAAAGCTGTGAACGAGTCATTTATTGGTGATGGCTTAGCCTTCTTCCTTGCACCCTTTGATTCTTCCATTCCCAACAATTCTTCTGGTGGGTTCCTTGGCCTGTTCAGCCCGGATTCCGCATTCGACACGAAGAAAAATCAGATGGTGGCAGTTGAGTTCGACAGTTTCAAGAATGAATGGGATCCGAGCTCAGACCACGTAGGGATCAATGTTAATTCCATTCAATCAGTTGCAAACGTCACTTGGAAGAGCAACATTAAGAACGGGTCTGTTGCTAATGCTTGGGTATGGTACAACTCCACATCCAAAACTCTATCTGTCTTCCTTACCTATGCTAAAAATCCAACCTTCAATAGCAGTTCCAGTCTTTCTTACGTTATTGATTTGAGGGACGTGTTGCCAGAGTTTGTTAGAATAGGCTTTTCTGCAGCAACGGGAAAATCGGTTGAGATACACAACATTTTGCTTTGGTCATTCAGTTCAACCTTGGATGAGGTTGGTGGGAAAAAGGTAAAGGTTGGCCTAGTGGTTGGTGTAAGTGTTGGTTTGGGTTGTTTAGCTTGTGCTGCAGGTCTAATATGGTTTACCTTTTGGAGAAGGAGAAATAGACTAAGGGGTGGAAACGAGGAGGAAATTGGTGTTGATGCCATAGATGATGAGTTTGAGAGAGGAACTGGTCCAAAGAGGTTCACCTACCGGGAACTAAGCAACGCAACGAACAACTTCGCTGAAGAAGGGAAGCTGGGACAAGGAGGGTTTGGAGGAGTTTACAAAGGTTTGATTGTGAATTCCAACCTTGAAGTGGCAGTGAAGAGGGTTTCGAAAGGGTCAAAGCAAGGGAAAAAGGAGTACATATCAGAAGTGACAGTCATCAGCCGTCTGAGACACAGAAACCTGGTTCAACTCATAGGGTGGTGCCATGAACAAGGTGAGCTCCTTCTTGTATATGAATTCATGCCAAACGGAAGCCTTGATTCTCATCTATTTGGAAATAGAGTGATGCTTTCGTGGGTGGTGAGATACAAGGTGGCCATAGGTTTGGCATCTGCACTTCTTTATCTTCATGAAGAGTGGGAACAGTGTGTGGTCCATAGAGATATCAAGTCAAGCAACGTGATGTTGGATGGAAATTTCAATGCAAAGCTTGGTGACTTTGGTCTTGCAAGGCTGGTAGACCACGAACTGGCCCCTTTGCCAAGTCTTCCATCCAAGTTGCCAGTGCCAATGTACTTTGCACCTCCCATGGAGATTACTCAATTCTCCTACTCTTCATCTGCCGTCACAACCACAACCAAAGATTCCTCCCCGTACTCCTCAATTTCTACTGGCTCCCGAAAGTCTCCCTTGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_33960::LG10:3616223-3618223(-)
AAAACGAACCTGAAAAGCGTAACCCTTAAAGAGAAAACGTGACGAAGATGATGAACACTGAGTGCGCGTAACGGCTGTCTCACGTTCACGATGTTTTAATGCCAAAATTTAGATGTCGGTTCCCCCAATTAACAGACGTCTAAAGTGCTTTAGAAGTCAGAGTGGCAGGATCAGACGTCTAAATAGAGTCAAAAAGTGACTTTTTAAATTTCTGGATTTAAGGTTTAGACGTCGGTTCCCTTAATTAACAGGTGTCTAAAGTGCTTCAGAAGTCGAAGTGGCGGGATCAGACGTCTGAATGGAGTCAAAAAGTGACTTTTTAAATTTCTGGATTTAGGGTTTAGATGTTGGTTCCCTCAATTAACAAACGTCTAAAGTGCTTCAGAAGTCGGAGTGGCGGGATCAAACGTCTAAATGGAGTCAAAAAGTTACTTTTTAAAATTTATGGAGTTAGGGTTTAGACGTCGGTTCCCCAATTAACAGACGTCTAAAGTGCTTGAGAAGTCGGAGTAGTGGGATCAGACGTCTAAATGGAGTCAAAAAGTGACTTTTTAAATTTTTGGAGTTAGGGCTTAGACGTCGGTTCCCCAATTCACAGACGTCTAAAGTGCTTCAGAAGTCGGAGTGGCAGGATCAGACGTCTAAATGGAGTCAAAAAGTGACCTTTTAAATTTTTGGAGTTAGGGCTTAGACGCCGGTTTCCCAATTCACAGACGTCTAAAGTGCTTCAGAAGTCGGAGTGGCGGGATTAGACGTCTAAATGGAGTCAAAAAGTGACTTTTTAAATTTCTGGAGTTAGGGTTTAGACGTCGGTTCCCTCCATAACAGATGTCTAAATAAAATAAAAAAAAATTTTTTTTAACTTTTTCGTTTAGTTTTGACGTCTATTCGGGGAAGCCGACGTATATGAGTATTTAGACGTCAGACTCTTCCATAACCGACGTCTAAATAGTTGTTTTATTTACGAAAAATGTCATTGATCATTTTTTACGTTAGATATTCGAGGGTCAGATGTCTAAAGAGTAATATTAAATGTCTTTTTTGCACTAGTGGTAGTTTACAATAAGACACATTTGAACTTTCCATGTCCGTTTCAACATGTCACCTTCAATTTTAACTAAGCAATTTTCACCGAATGTATAACCTCCATCTCTATATATTATTTCATTGATCATTTGATAAAGTTACCCTCAATCATTTATTTAGTTTACTCTTTATATGTTTGGCTTAGCGAACCAATATATTTAATAATAAATTGATAAAAAAAACCTTTTGATTTTTGTTTACTCGTTAATTGTCACTTTAATTATGTAATATTATTGCTGCTATTAGCAATAATATTAATGTTTTCTTATATAATTTAAAATTTAAAAATAAACACTTTTAAATATATAAAATATACATTTTAATTAAAATATATTGTAATAAGAAACCTAAGCATACAAATTATATTATGTTTAGAAATTTATATTATGTTTTATATTATAACAAAAGATTATTTTTAATCATAGTTATTTTTAAATATTTTAAAATTCAATTATAGAAAGTGTAGGGAAAATATATTATAAAAATTCATGGAGGGAAGCTACTTAAAAAGAAAAAACTCTTGTTATTAAAAATAATTCCTAAAATGCTTTGATTTAGTATTATGATTTTGATTTTATACATAAAACGATGGTAGGTTATCCCTAGACACGGGAAAAGACAAAGGAGTGAAATTTCGCATCGCTGAACATGTTGTCTAGGGCCAGGACAATAGAGAAGTTTAGAACGATTCTCCAGAAAAGGTGTAAGAGTATGTATGTTCATGTATTAGTAATTAATTCGTGAAAGCAACATATTTTTAATTCACCAAATACCTACTTAGGAACAGTTCAAAACATGTTTTGTTATCATCATTATTCCATTAATTTAATCGACAAACTTTGAAAGTGGATGCATATAGTTGCTATATTCTTTGTTCACATCAACACCATCAAAATCTTCTATCCCTCTCTACC


Gene Sequence:
>Vu_33960(-)
ATGGCTTTCTTCTCCTCTTCTTCATGCTCTAATCAAACCCAGAAACAAACATCTTTCTTCATATGTATCATCTTCTTCACTTTGTTCCATAACACTGTAGAGTCAGTTTCCTTCAACTTTTCCAGCTTCCAGCAGTCAAACTTGAACAACCAAATAAATTTCACGGGTGATGCTTTTCCCTCAAACGGTGTTCTTCAGCTCACGAAGAACCAACTCGATGGCCCCATCACAAGTAGCGTTGGTCGAGCCTCGTATGAACAACCAGTGAGGATATGGGATAAAAAAACAAACAGTCTCACCGATTTCAAAACCCATTTCTCTTTTATCATGAAAGCTGTGAACGAGTCATTTATTGGTGATGGCTTAGCCTTCTTCCTTGCACCCTTTGATTCTTCCATTCCCAACAATTCTTCTGGTGGGTTCCTTGGCCTGTTCAGCCCGGATTCCGCATTCGACACGAAGAAAAATCAGATGGTGGCAGTTGAGTTCGACAGTTTCAAGAATGAATGGGATCCGAGCTCAGACCACGTAGGGATCAATGTTAATTCCATTCAATCAGTTGCAAACGTCACTTGGAAGAGCAACATTAAGAACGGGTCTGTTGCTAATGCTTGGGTATGGTACAACTCCACATCCAAAACTCTATCTGTCTTCCTTACCTATGCTAAAAATCCAACCTTCAATAGCAGTTCCAGTCTTTCTTACGTTATTGATTTGAGGGACGTGTTGCCAGAGTTTGTTAGAATAGGCTTTTCTGCAGCAACGGGAAAATCGGTTGAGATACACAACATTTTGCTTTGGTCATTCAGTTCAACCTTGGATGAGGTTGGTGGGAAAAAGGTAAAGGTTGGCCTAGTGGTTGGTGTAAGTGTTGGTTTGGGTTGTTTAGCTTGTGCTGCAGGTCTAATATGGTTTACCTTTTGGAGAAGGAGAAATAGACTAAGGGGTGGAAACGAGGAGGAAATTGGTGTTGATGCCATAGATGATGAGTTTGAGAGAGGAACTGGTCCAAAGAGGTTCACCTACCGGGAACTAAGCAACGCAACGAACAACTTCGCTGAAGAAGGGAAGCTGGGACAAGGAGGGTTTGGAGGAGTTTACAAAGGTTTGATTGTGAATTCCAACCTTGAAGTGGCAGTGAAGAGGGTTTCGAAAGGGTCAAAGCAAGGGAAAAAGGAGTACATATCAGAAGTGACAGTCATCAGCCGTCTGAGACACAGAAACCTGGTTCAACTCATAGGGTGGTGCCATGAACAAGGTGAGCTCCTTCTTGTATATGAATTCATGCCAAACGGAAGCCTTGATTCTCATCTATTTGGAAATAGAGTGATGCTTTCGTGGGTGGTGAGATACAAGGTGGCCATAGGTTTGGCATCTGCACTTCTTTATCTTCATGAAGAGTGGGAACAGTGTGTGGTCCATAGAGATATCAAGTCAAGCAACGTGATGTTGGATGGAAATTTCAATGCAAAGCTTGGTGACTTTGGTCTTGCAAGGCTGGTAGACCACGAACTGGGTTCACAAACGACTGTTTTGGCTGGAACCATGGGGTACCTAGCCCCAGAGTGTGTGACAACAGGGAAATCAAGCAAGGAATCTGATGTGTACAGCTTTGGTGTTGTGGCACTTGAGATCACATGTGGTAGAAAACCAGTGGAGGTGAAAGAAGAGGCTGGTAAAGTTAGGCTTGTGGAGTGGGTGTGGAACCTCTATGGAAAAGGGAAAGTACTAGAAGCAGCTGATGAGAAACTGAATCGGGAATTTGAAGAACAGCAAATGGAATGTTTGATGATTGTGGGGTTGTGGTGCTGTCACCCTGATCATACAATGAGGCCTTCCATTAGGCAAGTGATAAGTGTGCTTAACTTTGAAGCCCCTTTGCCAAGTCTTCCATCCAAGTTGCCAGTGCCAATGTACTTTGCACCTCCCATGGAGATTACTCAATTCTCCTACTCTTCATCTGCCGTCACAACCACAACCAAAGATTCCTCCCCGTACTCCTCAATTTCTACTGGCTCCCGAAAGTCTCCCTTGTAG

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