Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33896 LG10 1674858 1678142 PREDICTED: nuclear transcription factor Y subunit A-9-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09151 Immune system   C 04612 Antigen processing and presentation [PATH:ko04612]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 1675235 intron_variant
A/G 1675417 missense_variant p.Lys53Glu
G/A 1675434 splice_region_variant&intron_variant
G/A 1675470 intron_variant
C/T 1675471 intron_variant
G/A 1675512 intron_variant
A/G 1675522 intron_variant
A/T 1675554 intron_variant
C/A 1675569 intron_variant
C/T 1675628 intron_variant
A/G 1675636 intron_variant
T/C 1675704 intron_variant
A/G 1675749 intron_variant
C/A 1675845 intron_variant
T/C 1675924 intron_variant
C/G 1675976 intron_variant
T/C 1676051 intron_variant
T/C 1676090 intron_variant
C/G 1676099 intron_variant
A/G 1676117 intron_variant
T/C 1676152 intron_variant
C/T 1676163 intron_variant
A/G 1676237 intron_variant
G/A 1676249 intron_variant
G/T 1676264 intron_variant
A/G 1676282 missense_variant p.Ile61Val
T/A 1676326 missense_variant p.His75Gln
A/G 1676333 missense_variant p.Ile78Val
G/C 1676340 missense_variant p.Cys80Ser
A/T 1676438 intron_variant
C/A 1676439 intron_variant
G/T 1676461 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33896.1
MRVREKFSKMPGKPDCDDYGEQIQFHPWWRAIGENASKSSSADRLNGSPSLPETDKTGGKEYQNIKHDLSSISFSMDKYLAPNPHTEFVGHSVVLTSPYSDAQYGQILTTYGQQVMINPPLYGMHQARMPLPLEMEEEPFMSMQSSIMPYLHESRHLHAMRRARGNGGRFLNTKKLENNSSSVTSDEGNNSGANPSANSFNTLHRLTNNENLASSNMVQDMHRVQSFNNGYHNGNCLTALYLSQVNGKKEGGDYFGKERDPLGAFK*


CDS Sequence:
>Vu_33896.1
ATGCGTGTTAGGGAAAAATTTTCTAAGATGCCAGGAAAACCTGACTGTGATGATTACGGTGAGCAGATTCAGTTTCATCCTTGGTGGCGCGCAATTGGAGAAAATGCCTCCAAATCATCTTCAGCTGATCGGTTAAATGGTTCTCCTTCACTGCCTGAAACTGATAAGACAGGTGGTAAAGAATACCAAAACATCAAACATGACTTGTCTTCAATCTCATTTAGCATGGACAAATACCTTGCTCCCAATCCTCACACAGAATTTGTTGGTCATTCAGTTGTTTTGACATCTCCTTATTCAGATGCACAGTATGGTCAAATATTGACTACTTATGGGCAACAGGTTATGATAAACCCTCCATTGTATGGAATGCATCAAGCTAGAATGCCTTTGCCACTAGAAATGGAAGAGGAGCCGTTTATGTCAATGCAAAGCAGTATCATGCCATACCTGCACGAATCTCGTCACCTACACGCCATGAGAAGGGCAAGAGGCAATGGTGGTCGCTTTCTCAACACAAAGAAGCTTGAAAATAACAGTTCTAGTGTCACTTCTGACGAAGGCAACAATAGTGGTGCAAACCCCTCAGCAAACTCATTTAACACTCTGCATAGGCTCACCAACAATGAGAATCTAGCCTCATCAAACATGGTTCAGGACATGCACAGAGTTCAGAGTTTCAACAATGGTTACCATAATGGAAATTGTCTTACAGCACTATACCTTTCACAAGTGAATGGAAAAAAGGAGGGAGGAGACTACTTTGGAAAAGAGAGAGACCCTCTTGGGGCTTTCAAATAG


Promoter Sequence:
>Vu_33896::LG10:1672858-1674858(+)
GATAATGTGAACAACATTTGAAGGTAAAGAGATTCTTGGGCCTTTATTCTTTATCAGATAAATTATTTACAGTGAAAAGGTGATCTTTAAAAAGAAATAATAAATAATATTTGATTATTATCTTGGTATAAAAAAATAAGGCTTTTAATATAAAATTTTGAACTTTAGGTTTGTGAGTGAAGAGTGAGTAAGCTAAGAGAGTTTAGGATGGTGCCACGTTTCTTTGTCGCTTACGCAACACAACACTCATCAAAGAGGTTGAGAAATGCAACTAACACGTGCCTCATGCACGTGTCTTCCCCTCCTTCAATTTGTCCACAAAACGACAGAATTCTCACCATTTTCCAAACTCTGCTATGCCAACTGCAGTTAGTTGCCATTAAATATTTAAATGCATGTCTCTCTCACCTCCAGACAAACTATTCAAATAAATCCACCCAGTCACATCTTATCGTAGCACAAACAAATATTTAAATTATTGAATGGATAAAAATAATTTTTAATTTTTAATTTTAAAATAATAAATTAAAAATTTTACTTTTATCTAATTTTTTTATAAGAAATTTTAATTCATATTTATATTCAAAAATATATATATATATTAATAATTATCATATTTTTAATTGATATAACTTTTAATATGTTTATAGTGAAAAATCAAATATTTTGATAATTGAAACAAAATAATCTATCCATATAAATGTTCATTGGATGGATGGAACTAATTAACTACTAAAATTCATTAAGGTTAATAATTTGATTATAAAAATGTAATTAAACCATCACTAACATGAGATGTGGTTTTCTAAATACTAATCTTGATTAAATTTAGGAAAAAAAATCTAACACAAATTTTTTAACAATATTTTTTATATGATATATATTACTTTTTTACTAATTTATTATTATACTAACATATTTTAAAACTCAATAAAAATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTATTTATTTATTTATTGTGTTAAAATACTGTCAAGAAAAAATTATATGAATTTTTATTATTACCTTAAATTTAGTATAAGTGGAAGGAGACAAGTTGATGGGTCTTTGTGGTGGGGCCATGCACATTGTTTGTGATTGCAACACGTTGTGGAATATATACAGGTGTCACAGTTAGGTGAGAATTTAATTATTATAATTTTAATAATATTTTATCAAATTTTTTATTTTATTATTTTATCTCCAAAATATAAACAATGTTATTCTCTTACGGAATATCCTTTTTACTGCAATAATATATGAAGATTAATTATAATAAAAGTTATATAAGAAGGTAAAACTTTTTACACTTGTAATAAAGCATAGGTGTTCTAAACTTAAAAAAATGAAAGATGAAAAATTGAAGTATTATTCGATATTCTATATTGAGCTAGGTAACATGAAGATGAAGCTAGATATACTTTTCAACAATGTTTCTTCTTAAGTCTCATTCTATAATTGAGAAAAGGTGCAATTTTTGTCAACACATCATTGTTCTTACATTACACTCAAGTAATTAGGTAACGCAGGTTTCATTTTTTATTACATTTTCTCTTAGTTTTCTTCCAAAGGGGAGACATCAGACACTGACAAAGACCTTTGCGTGAAGTAGAAATAAAATATATTTCTTACATTTTCATCTTAGACGACAACAAAAAATTGTTTATTTTTATTTATTCCTTATTATTCGTAAAAGTTAATTCTCATTTTCATCACTGCATCATGCTCCATTGTCTCTGATGAGGTTGCAGGCTTTAGAGAAAGAGAGAGAATGGGTTTCGTCTTAATGCAATTCGGATTCTGAAAACTGAAGCTTTTCACAGTAAGTTCTTCTCAAGTTCCTGCCTTTGTTCTCTCAAGTCACAGTATCTCTAGTTTTTTATTCAAAGTTGACTTTAACTTTCTTGAGGGTGTTTTCTGTTTGCTTGTTTGTTTGTATTCGTTTTCTTCATGATTAATGTTTGGAAAATTTTGTTTTCAGCA


Gene Sequence:
>Vu_33896(+)
ATGCGTGTTAGGTTGGGAAGAAAGCATGGGAAAGGAAATTTTGAGTTTTCAATGGAAAAGGGTAGTCAATAATAGCATTACTTTTTTGTTTTTCCTTTTACAGTATAGGATTCCATGCTAGCTACAATCCCTAATCAAGAACAACAGAACTTGATAAAGCTCAAGTCTTTCTGGGATTTTGAGTGGAGGGTAAATCTTCAAAATTGTTTCAGTTCAGTTATAGATTCATTTTCACGGCATGCAATTCAGTCTCAACATCATTAAGCTTTTCCAGCTCTGTAATGGAGTTAACAGATTGAGATGTATTTGATCCTGAGCATCCTTTTTTCTTTTATGGCATGCTTTTTTCAACTTGATTATGTTCTTGTGCATCCATGGTTTTTGAATTTTGTTGTATCTTTGTGTGGTTCCAGGGAAAAATTTTCTAAGATGCCAGGAAAACCTGACTGTGATGATTACGGTGAGCAGATTCAGTTTCATCCTTGGTGGCGCGCAATTGGAGAAAATGCCTCCAAATCATCTTCAGCTGATCGGTTAAATGGTTCTCCTTCACTGCCTGAAACTGATAAGACAGGTGTCTGTCTATGATCCACCTATATTTCAATTTGTGTCGCATATCTGTATCCGATATTTTGAGATACTTTACTATTTACTGATACTTATCAATCAATAAAGTATCTAAATTATAAAGCTTTAATGTTTTTATGATGACAATAGTTTATGATTTTTTATTTTGACTTTAATTCATTTGATTTTAATTTATATTCACACAATAGCAATCATATATTTTTCATGTTTTTAAGAATTTTGTACATTTTTTAATATGCATACATCACTTATGGTATCTTATTATGTGTCATATCCAATACACGTATCGTATCCATGCATCATATATACATGCATCATAGGTGCCTGTATTTTGGCCAGCATCTTATTAGACTTTTGCTTCATAATAATTTTATTTGTTACTATTTGGAATAACCAACTCCTGTTTTTCTCTTGTAATTCTAACTATTTGGAATAACCAACATGCTAGTGGTAATTTTCCACCATCTATTTGAACAGATAAGAGTGTAATTCTTGAGGTAATTCAGAGATCCAAGGGAATGAAAGACCTTCTTTTGCCCTAATTGGCATTGGGATTCAATTGATTGAGATTCCCTTTCTTGCTTTGGACAGCACTTATTAAGCTTTTGTTGTTGTTAGCAAATGACTTCCATGTATACAGCAAGTAGTTTTTTCAAAGGAAATTCACTGACAAAAGATTCTAACTGTGTTAAAAAAATGAGAAAATTGTGTTTCAAACAATGACTTCTAATTGGTAAATTAAGAGTTCACCTTAATGCCTATCTCCACATGCATCAGCATTATATATGAATATAATGTATACTGATAAGTTTCTTGTTGGCATCAGGTGGTAAAGAATACCAAAACATCAAACATGACTTGTCTTCAATCTCATTTAGCATGGACAAATACCTTGCTCCCAATCCTCACACAGAATTTGTTGGTCATTCAGTTGTAAGGCCTTTAAAATTACTTTTTGTAAGATAGTTAGGTACAGAGAACTTTTGTCACACACTGCATGAACCTTTCATTCATAGTTGTGAGTTTATAGCTCCTTAATATCTCCCATATTATGTAATTTCTTTTACATCTTTAAGGGTTTAAAAGTTAAGATTATAAGCTTCCTCAATATGTGATGCAGGTTTTGACATCTCCTTATTCAGATGCACAGTATGGTCAAATATTGACTACTTATGGGCAACAGGTTATGGTATGATAAGTTGCAATTTTCTGTACAGTATTTGAGAAAATCCCATCTATTTAATGGGCTTGTTTATTTTCAGTAAAAGGAATATTTTTTCGACATTTTATGATTTTGTGTCTCTCTAGTTGTATGTGGATTGATATTACCATTTGTAAGTAGTTTTTCTTTTCTTTGTTTTGAATATGGTTTAGAAGTATTTAAGTAATCATATGTTAGTGGATTAAATATGTTTTTACTCCTTAAACGTAAAATTGAAATTTGTCTTATCCCAAACTTTAATACATTTTTTATTTTCAAACTTAAAGAATGAACAGATATATCAAATTTTGGGATAGAGACGAATTCCAATTTTGTTTGTGTCCAAGTTTAGAGATTAAAAACATATTAACCTATATTAGTTTTTGGTTTTATAAATTGAGCATGCAATTTAATGTAATTCATTTTCTCTTTGGTATGTACTTTTTATAAACAAATTATTTGCACATGTTTTCATGATTGTGTACCATTGACGAGCATTACTTCTGCATCTAAATTTAAGTTCAACCTCCCTTTTCTTTCACTCTTTTGCCTGAGACTTTTATGACTTCTAATATTCTTGTTGAACCAAGTAAATGCAATACTATTTCATTGCTAGTCCTAACAGATACTGGTATGATGCTAGATAAACCCTCCATTGTATGGAATGCATCAAGCTAGAATGCCTTTGCCACTAGAAATGGAAGAGGAGCCGTTTATGTCAATGCAAAGCAGTATCATGGTATTTTGAGGCGAAGACAGTCACGTGCTAAGGCCGAGCTTGAAAAGAAAGTAATCAGAAACAGAAAGGTATGGTTCATATTCAACTTATTTAGGAAGAGGATCATGCAGCTAAGAGGAATGGTCTACTATCATCAAAAGAATTAGAATGAAACAGAGTTGAAAAACAAAATAACTGTGAAGTTTAAACAAAATCACTTTGTTCTCTAAAGTGAATTTCTCCCTCTAGAGAATAAGAATCCAAATTACCTGTTTGTTGTATCAGTTTCACCTTGTCTCACCCTGGTTACTGGTGAGGTGCTTGTGAATGTTTTGTATTCACATAGTTTTATCTCAGTTCTTGCCATTGTTGTGGAATTGATCATTGCCATGGCCTCAGATGTTTCATTCATTTCTTACAGCCATACCTGCACGAATCTCGTCACCTACACGCCATGAGAAGGGCAAGAGGCAATGGTGGTCGCTTTCTCAACACAAAGAAGCTTGAAAATAACAGTTCTAGTGTCACTTCTGACGAAGGCAACAATAGTGGTGCAAACCCCTCAGCAAACTCATTTAACACTCTGCATAGGCTCACCAACAATGAGAATCTAGCCTCATCAAACATGGTTCAGGACATGCACAGAGTTCAGAGTTTCAACAATGGTTACCATAATGGAAATTGTCTTACAGCACTATACCTTTCACAAGTGAATGGAAAAAAGGAGGGAGGAGACTACTTTGGAAAAGAGAGAGACCCTCTTGGGGCTTTCAAATAG