Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33701 LG9 49214377 49218035 PREDICTED: transcription factor bHLH79-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 49214977 downstream_gene_variant
G/T 49215130 missense_variant p.Gly113Val
A/T 49215313 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33701.1
MDPAAIINAAAANTTSYNLSEIWQFPPPNAQDATAALCLSRAHFGHGLSDFGPGPGSIGHKKRRDSEEEESVKGVSTSNGVKEGGGVGDGKRVKTTGNQKSESAKGEGESSSGKLAEQGGKPPPEPPSKQDYIHVRARRGQATDSHSLAERARREKISERMKILQDLVPGCNKVIGKALVLDEIINYIQSLQRQVEFLSMKLEAVNSRIPSGIEVFPPKDFDQQTFDTTGIAFASQPTREYSRGSSPEWLHMQVGSGFERAT*


CDS Sequence:
>Vu_33701.1
ATGGATCCGGCCGCCATCATCAACGCCGCCGCCGCCAACACAACGTCCTACAACCTCTCCGAGATCTGGCAGTTCCCGCCTCCAAACGCGCAAGACGCTACTGCCGCGCTGTGCCTCAGTAGGGCTCATTTCGGGCACGGCCTTTCGGATTTTGGCCCGGGCCCGGGTAGCATTGGCCACAAAAAGAGGCGCGACTCCGAGGAGGAGGAATCGGTTAAGGGCGTCTCCACCAGCAATGGCGTGAAGGAGGGTGGTGGTGTTGGTGATGGGAAACGGGTTAAAACAACAGGGAACCAGAAGAGTGAGAGTGCGAAAGGTGAAGGAGAAAGCAGTTCAGGAAAGCTTGCGGAGCAAGGTGGAAAGCCACCTCCAGAGCCTCCTTCAAAGCAAGATTACATTCATGTCCGAGCCAGAAGGGGTCAAGCTACTGATAGCCACAGTCTCGCAGAAAGGGCTAGACGGGAAAAGATTAGTGAGAGGATGAAAATTCTTCAGGATTTGGTGCCGGGTTGTAATAAGGTTATTGGGAAAGCTTTGGTTCTTGATGAGATAATTAATTATATCCAATCGCTTCAGCGGCAAGTAGAGTTTTTGTCAATGAAGCTTGAGGCCGTAAATTCAAGAATACCCTCCGGAATTGAAGTGTTTCCTCCTAAAGATTTTGATCAGCAAACATTTGATACAACTGGCATCGCATTCGCTTCTCAACCTACAAGAGAGTATAGCCGAGGTTCATCACCAGAGTGGTTACATATGCAGGTGGGAAGTGGTTTTGAAAGAGCAACATAG


Promoter Sequence:
>Vu_33701::LG9:49212377-49214377(+)
AAGTCTTATAAAAGGAGACTAAGTACAGAATCAAACTTTAATTTTATTGTCATTAACAACGTAATAGTGGTGAAATCCATCACCAACATCAACCGTATAAAAATAGTATCACACCTCACATACTTAATACGTGTACTTTTTCTGACAAAACTTTTTCATATAACTTTTTTTAAAAATTTCTTATAAAACATAATTACATAAGTCTCTTTATTATTATTATTATTATTATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAGGTTATAAACAACAACACTCAAATCAACTTTTTATTTTTATAATAAATTTTTGTTTTGCGTATATTCAAAGTAATACTTTCCTTGATTTTTTTACTTAATAATAATTTCTTTTATATAAAGATATTAACAATAAAGAAACTTGTTATAATTTAAATATAGTTCACGTACAAGTAAAAATAAAAACATAAAATTTATATGATAAAACTTCTATAAATTAACACGTGTCTTATAAAGAAACTTATTTTATCAGTTTATTTATTTTTTAATAGAATTGTCATTTGATCTATGGATAATTGATAATGAATAAGTCTTATTTCACTTTTAAATAAGTTCATTTTTAGACGGTAATCAAATAAGAGAGTAAAAAATATACTTTTTCAAAGTGGCTTAGAGTTAGATAGAAATCGATTTGATTTTATTATAAAATTTTATTTAATTTTTAAGAATAACACATTTATTATGTGTCAAGTTATTTTAGATTGAAAGTTGAGACAAGTTTGTCTAGATTGAAGCTCGAGACAATCTGACCCAGATCGAAGATTGAAAAGAGTTGACCTGAGTCGAAGTTTGAGATGTATTGTCTTGTGCCGAAAGTCGAAATGGGTTGTTCTCAACTAAAGGCCTAGGCAAGTCATCACAAATTGAAAGTTGAGACAAGCTGACTTAATTTGAAGGTTGAAACAGACTGGTCTAGATCAAAAGCTGTGGTAGGTGGCCCAAACCGAAGGTTGATACGGGTCTTCGTAAACCAAATATTGAGACGGGTTGGCCTAGGCTAAAGTTAAGACAAGTCATTCTAAGTTGAAGGTCGAGATAGATCGATCCAAGCCAAAGGTTAAGATAGATTGATCCAGGTCAAAGATCGAGATTAATAGGTCGGGTCGAAGGTTGAAATGGATTGTTCTAAGGGTTGAAACAAACCATCAATGACTAAAAGTCAAGACAAACCATCTCAATCTAAAGGTTGGTTTAGACCGACCTAAGACAAAGGTTGAGATACGTCGTTTTGGATAGAAATTTGAAACAAATTATCTCAGGTCAAAAGTTAAGATTGGACAACCCTAACTGAAAAATCAAAATAATTCAACTTAAACTGAAGGTCGTGACAAATAAATCTAAATAAGAGATAAAGATAAAATGACCCAAAATGAAAATGAGAACAAACATAGCCAGTTTAAAAATTAATATTTTTTGTTAAAAAAATTCATAATCCTTTCCTAACCTATGAAATTTTTGTGGTATGGATTTTTTTAATGAAAAACTTTTTAGTTTTATGAGCTGTTTTATCTCAACCCATATAAATCATAACCAAATATCATCAAATATGGCAAATTGACAACTCTGCCTTTATATAAATTACATAACATAAATCATAACCAAATATGATTAAATATGTCAAATTCACAACTCTACTTTTGTGTAAATTACATATATAAAGTGCATATTCAAACGAAAATACATATTTCCTTCATCAACATAAAAAGAAAAATCTAAATGGCATAAATAGAAGGAGCTGAGGACTAAACGAGATACATGAACTTTGGATTAAAAATTGAATTAGTAAAATGTATGAATATGAATTATCCAGAGAAAGAAAAAAAGAAAAAGGGAGATGAAGTATAAAAAAAATCTTGTAAATTTTGAATGGATGACAATAGATGAGAAGAATATATAGAAAAAGGGGGAAAAGAAATAAAGAAA


Gene Sequence:
>Vu_33701(+)
AAGAAAAAGAAGAGTGAGATGTGGAAGGAAGTGACTTGGGTTTGCGACTCCCGAGGTGAGTGTCTAGTGAGAGTAATGGTGGACAGAGAAGAAACATTGCTTCTTCTCTCACACTAGACACACACTGTGCGCACATCCCTCCACTCTCCAAGGAGATCACAATCCCAAAACCAAAACCAAATACCTTCTCTTCAATGCTACTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTTCCCTTCTCACTGACACTTTTTTTCACCCAATGGATCCGGCCGCCATCATCAACGCCGCCGCCGCCAACACAACGTCCTACAACCTCTCCGAGATCTGGCAGTTCCCGCCTCCAAACGCGCAAGACGCTACTGCCGCGCTGTGCCTCAGTAGGGCTCATTTCGGGCACGGCCTTTCGGATTTTGGCCCGGGCCCGGGTAGCATTGGCCACAAAAAGAGGCGCGACTCCGAGGAGGAGGAATCGGTTAAGGGCGTCTCCACCAGCAATGGCGTGGTACCTCACTCAATGTTCTACTATGAATTAAGAAAAGAAAAAATAAAAAGAATTGAATTGGTTACATTACAATAAAGAAGAAAATGGATCTGTTTTTTTGTTAGCTATAGGTAGAGTTTGTTTGTGTTGAAGATGAAAGTTTTTGGGTATTGGGATTTGTGCAGAAGGAGGGTGGTGGTGTTGGTGATGGGAAACGGGTTAAAACAACAGGGAACCAGAAGAGTGAGAGTGCGAAAGGTGAAGGAGAAAGCAGTTCAGGAAAGCTTGCGGAGCAAGGTGGAAAGCCACCTCCAGAGCCTCCTTCAAAGCAAGATTACATTCATGTCCGAGCCAGAAGGGGTCAAGCTACTGATAGCCACAGTCTCGCAGAAAGGGTGAGTGATTATTAATCATTGCAACTTCCTAATCTTAATCAGTAACTAACCACCCCTTTCAATTATCATCTTCTTTAATTTGCTGTAAATAGCTTTATTATGTTTTTCCATAGTTTTAATTTTTAGTATGAGTTTAATTACTTGTTGAGTTTAACTGGTAAAAATGTTATTTATAGGATGATTAAAATTTGGACCGAAGTATGATACTGATTTAGACTGGTGATTTCATAGCTTATTTTCTTTTAGCAATTGTTTCTTTTTTTACAGTTTTTAGTGACTGTTATGGTGACTTTTGAACAATCAATGAATTCAGACATATTTTGCGATGACGTTTAAGAAAATTATTTAAGGTAAAAAACGTTTATACTGATATACTTAACGTGTGTTACCATTAAAAGTCATACTAATGAAAATATTTTGTTGATGGTGTAAATTTTTTGACATTGACGCTGGACAGAAATTAATCTCCTCAGACAAAAGTTGATAAGCTTATCTTAATCACAATTTTGATTTTAATTTTGGTAAACAAAATGAATTATTCGTAGTAGAGTGAACGCAGCATAAGACGTGCCAAAGTCCCATAAAAACAAAAACTCACAAGCCCTCCTTCCACAATACATGATGATCTTTGGTCATTTGTGATAAAATGATTGTGTAAAATATCATTACACTGTCGGGCAATCCAATTATTTTCTCTAAAACAAAAAATGGAAGAATTATTTTATCTATAATTTAGAAATAATTTGTGGTTTGATATGACTTTTGAAGAAATTACTAGAAAATAAATTAATTTAACATACACGAGTAACATGGCCACATGTGATGTGATTGGTCATTTTTATTAAATTCTTATTTAAAAAAAATTAGGAGAAAAATATGCCATCAATGGTAATGGTTGGGGTATGCGTTACTGGCGTACCAAAAACTTGCTTCACTGCGGGATATCTAGTGTCAAGTGGATTATTTGTTACACGAAAAAGTTGGTTTAAAAAATAATGAAACTGTTATGCTTGTTGGGTCTTTTGGGGGTATTTAAGAAAATATTGAATTATCGGGTCTTTTCCGGTATGAGTCATTGACTTGGTTTTGTAATGGAATGTTGTTGGACAGGCTAGACGGGAAAAGATTAGTGAGAGGATGAAAATTCTTCAGGATTTGGTGCCGGGTTGTAATAAGGTATGGTTTCCTACCTGACTACGTGTGTATTACTGAAAGAGAAAAAAAAAAAGTGTAAATGAAGAAGAAAGAAGTGTTACTGGTCTGTGTATGTACACAAACTAAGCTGTGCTTTCAAGGACATTCTAAATCGATGTATTTCTTTGACTCAGGTTATTGGGAAAGCTTTGGTTCTTGATGAGATAATTAATTATATCCAATCGCTTCAGCGGCAAGTAGAGGTGTGAATTGTGGTGGCATTCTTTTGAAAATATATATGCTTTATAGTTTTTTTAAACTTTACTTTTATGTCACAGTTTTTGTCAATGAAGCTTGAGGCCGTAAATTCAAGAATACCCTCCGGAATTGAAGTGTTTCCTCCTAAAGATGTAAGCATATGCAGCATCTTTGTATTGATCTCTTTGATATAAATAACCAGAAAGCTGGTACTTGAGATCGGAACAGCTGGTTTTGTCCCTCTTATTTTAAACTTTGCCTTTGGTGGATTATGAGTTTAATTGCTTCTGTTATGTTGCAAGTATGCCATTTTGGGTAGAGGCTTCTTTTATACACGCAATTTGTGTCAAGCTCGACCTTTTTAAATGCAAAAGGGTTTTTAACTGAGCTAATATTAAGTGAGAAATAATATAGAATAGTAGACCCGTATGCAAATTAAGTGAGAAATAATATATAATTTTCAATGCTTTTACATTTGAAAAAACATATAGAATAGTAGACCCCTACACATGGATTTATTGTTTTATTCATTTGCACGTATTGCTCTATAGATTTGATTTTTAACTGAGCTAAATGATCTTGTGTGATCTAAGACTTTTGTTGTGTTAAGTGGGCACCTTGCAAATTCTGGGTGGAACGTTATGTTGCTTCCTTCCAAAAATAAAATGAGATACTTTGTTTGTGGTGCTTTAATGGATTGGAATATTGGATAGTCAATGGATTTTTGATATATAAAGTAAATAAATTTTATTGTTGATGGTAGCAACGACTAGGATATGTTGTTCTATATACTAAGATGTAAATAGCTTTAAAGTGTGTAGAAACTCACCTTCAAACAAAATTTTGGGGCTAGTGGAATCAGATTATTGGTGTACTTCAGTTTTTAATCCTTGTGTTGGTGTTCCAGTTTGATCAGCAAACATTTGATACAACTGGCATCGCATTCGCTTCTCAACCTACAAGAGAGTATAGCCGAGGTTCATCACCAGAGTGGTTACATATGCAGGTGGGAAGTGGTTTTGAAAGAGCAACATAGTCTTTGAAATCCCATGACACCTTATAATAAATGCATATAGGATGACTAGTCTCTCCATCAGAGCTCCCGTAAATCATATACTCAAGGTGTTGTTAAGTCCCATGGACACCTCATTCCAGGAGGCATGGAGCCTGTTATTTGTTTCTACAAGATCGCTTCAGCGAGTACTTTAGCAACTCCATTTGTTAGTGCGTTTGGAAAATGAATTCATTTACCAATATGTAGTTTAGTGGACTATAGGCTTTCTATGCTATACTCTTCATAACCGTTAAAATTGTTGTCATTCTTGTAAAACAATGCGGCTTGTACTGAATACATAAAGGCTTACTCATTGTGCTATAGTGTCGACATTGTTGTTTGTC