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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33672 LG9 47609806 47614525 hypothetical protein PRUPE_1G186900
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 47611424 downstream_gene_variant
C/A 47611538 downstream_gene_variant
A/C 47611586 downstream_gene_variant
C/T 47614185 intron_variant
A/G 47614310 intron_variant
A/T 47614359 intron_variant
T/C 47614412 splice_region_variant&intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33672.1
MAIAAPGQLNVNESPTCGSRSVDCFEKLEQIGEGTYGQVYMAKEIKTGEIVALKKIRMDNEREGFPITAIREIKILKKLHHENVIKLKEIVTSPGPEKDEQGRPDGNKYRGGIYMVFEYMDHDLTGLADRPGMRFTVPQIKCYMRQLLTGLHYCHVNQVLHRDIKGSNLLIDNEGNLKLADFGLARSFSNDQNANLTNRVITLWYSFDHHALELLEKMLTLDPAQRITAKDALDAEYFWTDPLPCDPKRQRKSANSNGKMKKWLSVRKCSTHSSTVVFPPFSSPDNMVKCGQDQTNRFMALNPQLLQDPLIIMGNLEVHLVDQEEKYPPNGNQGGGYNHPNRGGQGGGYGTGPYPPQGRGAPYGSNNMPGGGPRGGGGGGSGYGVGAPNYPQQGGPYGGSAAGRGSNMMGGNRNQQQYGWQQ*


CDS Sequence:
>Vu_33672.1
ATGGCTATTGCAGCTCCAGGGCAATTGAACGTTAATGAATCGCCCACTTGTGGATCCAGAAGTGTCGATTGCTTCGAGAAACTGGAGCAAATTGGCGAAGGCACATATGGTCAGGTTTACATGGCTAAAGAGATCAAAACTGGTGAAATTGTTGCTCTGAAGAAAATACGTATGGACAATGAGAGAGAGGGGTTTCCTATAACTGCTATACGAGAAATCAAAATTCTTAAGAAACTACATCATGAAAATGTGATCAAGCTGAAAGAAATTGTGACTTCTCCAGGTCCTGAGAAAGATGAACAGGGGAGGCCAGATGGTAACAAATATAGAGGTGGCATCTATATGGTCTTTGAATACATGGACCATGATTTAACAGGCCTTGCTGACCGACCTGGGATGAGATTTACAGTTCCCCAAATTAAGTGTTACATGAGACAACTGTTGACGGGGCTTCACTATTGTCATGTAAATCAAGTACTCCATCGTGATATCAAAGGCTCAAATCTTCTTATAGACAACGAGGGAAACCTTAAGCTTGCAGATTTTGGACTAGCACGATCGTTTTCTAATGACCAAAATGCTAATCTTACAAATCGTGTCATTACATTATGGTACAGTTTTGATCATCATGCTCTGGAGTTGTTGGAGAAGATGTTGACACTTGATCCAGCACAGAGAATTACTGCGAAAGATGCACTTGATGCTGAGTATTTCTGGACAGATCCATTACCATGTGACCCCAAGAGACAAAGAAAAAGCGCCAACAGCAACGGCAAAATGAAGAAATGGCTAAGCGTCAGAAAATGCAGCACCCACAGCAGCACAGTCGTCTTCCCCCCATTCAGCAGCCCGGACAACATGGTCAAATGCGGTCAGGACCAAACCAACAGATTCATGGCTCTCAACCCCCAGTTGCTGCAGGACCCACTCATCATTATGGGAAACCTAGAGGTCCATCTGGTGGACCAGGAAGAAAAATATCCTCCCAATGGGAACCAAGGCGGAGGATACAATCACCCAAATCGAGGAGGTCAAGGTGGTGGTTATGGCACTGGACCTTATCCTCCTCAAGGGCGGGGGGCACCTTATGGGTCCAATAACATGCCTGGTGGCGGTCCTCGCGGTGGCGGTGGTGGTGGCAGTGGGTATGGAGTTGGAGCTCCAAATTATCCCCAACAAGGTGGTCCATATGGGGGTTCAGCAGCTGGTCGTGGCTCGAACATGATGGGTGGAAACCGCAATCAACAACAGTATGGTTGGCAGCAGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_33672::LG9:47614525-47616525(-)
AGTGTTTTCTGAGAGAAGACGTAGAGGAGGTAGAGAAAAGGAGGAGAAAAAGGGGATTCTTCAGAATTCTGGAAAGAGGGTGCATGCAGAGAGTGGAGTAGATTTTTCTGAAAATTCAAGTTTTGCTCCACATTCGAGAACAAACGTCCCCTCTTCAGCCGACACCTGTTTTCTACTAACTGGTTTCCGACTCCCCTCATCATGACACCTGGCGTCCGTTGTTGAAGTGTCGCGCTCTCAGAGTGACACGCAAACTGCACTGCGCTCCTCACTCCAGACTCCATGCAGCGTGACACCTGGCGTCCGTTGGTGAAGTGTCTCGCTCTGCGGTCGCCACGTACGTTGTTGAGGTGTCTCGTTCTCCAGCTACCACGCGTACTCCAGCGTACGTTATTTTCCAGGGTCTTACATTAGTTGTTCTTGGAAAATTTATTCATGAATCTAATCTCAAATATTTCACGTTTTTACCATACAACATGAAATTAACCTTTTAAATACTAAAATATATATTCAGTCTTCATGTTAACTTTATATTGATGAATTTAGTTAATATAATAACTGAAATTAAAGATAAAGTATAATTTAACATCAATACAAATAGCTCCAAACTAAAAAAAGATCCAAATTTTTATTTGGTGGATCAAATTAGATATGAAATTTAAAATGTAGCACCTAGAGGATCTCGAGAGTTCAATATTAATTTTATATATGAAATATAACAATGGTCTGTACAGTATTTGTATTTTCGTATTCTTTATTAATAAACTATCAATAAAAGCATAAGCACTTGATTTTAATATTTGATCATTTTTAGTGTCTATGACCAATCGTAAGAGTGAATTAAACTCTTATTTAAATAAATGGTAAAAATACAGTAGTAAAATAATGATATATTGTCCTCTTTTTAAAACATGAAATAAGAAGGTATAATATTTTGAAGTTCAGTTTTACTATCAAGACTTTTAATCTTCTAAAGGTCATCAATTAATTGCCATTATATAAAAATTTATTAAAAATAAAATAAAATAAAAGATATAAAGCATAAAAAGACAACACTACACTTCTAAAATATAATCACACTATCTTCTAAACATGATAATATACGTTGTTTGTTATTCTATCTTTTCAAAATATTTTCCTTGCTTTAATAAAATAATTGTAAATAATTCAGTAAAATATTTTTTTATATAAAAAAAAACAATTTTAGGACTGAAAAATAACCTCTTATTTTGGAAAATTGAAAAAAGTAGGTTTTCTTAAATGACTTTTAAATTATCACATTAAAGAGTTTATAAATTATTTTTAGAAATAAAAAGATTTTTATATTATCATTTAATTGTTTTTTTCCACAATTAGTTTTTTTTCTTTAGTACCTATTTTAAAAAATGTAGTGGTCTCATTATAATTTGCACCAATCGAGTTAACTCGGTGATGTGGTAATACCTTCTTCTTCTTATTATTATTATTATTATTTTTATAATTAAAATTAAAAGAACAAAGATTAATTTACAAATACAAAATACTTTTATAATAAAATGTTATACTACTTTGATAAATATGTATAATAGATCATTAAACAGTATTGATTTTTTTTAAATCAAATCTGACATAACGTGAGATTGATATTGATATAAATAGAGTAAAATACATAAAAAGATATGTATCAAATATTACAATTGTAATTTTTCCAGTCTAAAAACTTATATATATTATAATCAAACTAACAATACTTACAGTTAAGTCATACTAATATATATTATTTGATTCTTTTATTAAATGGAAAATAGACTTGAACAATAAAATCAAAATTAAAGATATATTCTTCTGAAAATTACTTATATCTTTACAACTCCTATATCAGAATTTTATCTTTACAGGCTTTATTATTTGATTTGTGGGTAATTTTCGGGAAATTTCGCGCGCGAGAAACCCTAAGCGGAACCCTGATTCATTCGATTCGCTGTTGAATCCGAATTTGGAACTTGGAAGATTAGGGAGCA


Gene Sequence:
>Vu_33672(-)
ATGGCTATTGCAGCTCCAGGGCAATTGAACGTTAATGAATCGCCCACTTGTGGATCCAGAAGTGTCGATTGCTTCGAGAAACTGGAGCAAATTGGCGAAGGCACATATGGGTTAGTTTTCAATTTCTGTACTGCTTAAGCTTTACATTATTTTTGGGTTGTCTTTTTTAATATGGAAGTTGAAAATGTATGTTCTCAATTATAACAAAGCGTGTTTACTATATGCAACACTCTATTGGAACAATCCCATATATTTTGTTAAGCTAGGCTGAAATTCAAAGCAACTTAAACCTGAACATTTAGGGGTCTTGATCTTGAGCACCTATCTCTTATCAATCAGAGCATTTTAGAGTGAAGAAATCGTTATAGTTATTTATTGGTGGGTGCTTTGGGGTTTAATTGTTATATATCCTTTTTTTTTAAATTTATTTATTGGTTCCATGTTTTAAAATTGTGATCACCGTTTCAGTTTTGTTGGCAATCCTTGATGTTGTGTGAAATTGTGAAAAAATGTGGCTGATGGGACCGCATTTCAGTTGCAATGTGGTTGCAAGGACCCTATAACCGTGATGTTTGTGGCTACGATCACGGTTACAGAAGCTTTTGTTAAAACCTCGATCTATTTTCTATGGTTTAGTTGGCTATTACTCTTGTGCAATTTGTTTTCTTATGTTCCCTTGCTCTCTTTCTCTGTGCAGTAGATTTTTTCGCCGCATTAATTTCTTCTATGGAGATAGCTTCCAACTTCATCACGCATAAAATGTCATCTAGTTGTAGCATTGTTCACATCAATGTCATCCGCTTCCTTTCTGATGCATTCTGAAGTGAATTGATATACCTTCATACATTTATGCTTGCAGTCAGGTTTACATGGCTAAAGAGATCAAAACTGGTGAAATTGTTGCTCTGAAGAAAATACGTATGGACAATGAGAGAGAGGGGGTATATCTTTGATTAAAAAAATTCATAATTTATCACATTCCATTCAGTGGACCTAAATCAGAAGTTACAGCACGTTCTGTTGGTACAAATTTTCCTCTGAACTGTGTTGTTAATTTTGCCATTGCAGTTTCCTATAACTGCTATACGAGAAATCAAAATTCTTAAGAAACTACATCATGAAAATGTGATCAAGCTGAAAGAAATTGTGACTTCTCCAGGTACCCTTTTTCAAGATCTAAATTAGCTTCACTATCAAATTTAGACGACTTAGGATTTAAAAGTTTGTTTTATTTATACATCTAGAATGTTATTTTTTTTCTTTCAGGTCCTGAGAAAGATGAACAGGGGAGGCCAGGCAAGTCATTCATTCTTGTATGAGCCCGACTGCTGGGCAGTATCATTACTATGCTTTGTAGTTCTAGTGTGTGAATATTTCCATCAATTTGCTTTGGGGTTAGCATACTAACCCTAGTTTGTCCGCTTTTTATTCTTGTTTTTGGGATTGCAGATGGTAACAAATATAGAGGTGGCATCTATATGGTCTTTGAATACATGGACCATGATTTAACAGGCCTTGCTGACCGACCTGGGATGAGATTTACAGTTCCCCAAATTAAGGTATTACTGTTAATACCAAGTTTTATTTCATATATTAATAGTTGCTTGTTTTATTGTTATCTGAATGGTGTTTCACTTCCTTTCGTAAGTGTTACATGAGACAACTGTTGACGGGGCTTCACTATTGTCATGTAAATCAAGTACTCCATCGTGATATCAAAGGTCTGTATATTGAAAAGATTGTTTTAGTTTAGGATGTAAAATTTTATTATTCTTATTTTATGTATTTTTTTTCTGTTGCAGGCTCAAATCTTCTTATAGACAACGAGGGAAACCTTAAGCTTGCAGATTTTGGACTAGCACGATCGTTTTCTAATGACCAAAATGCTAATCTTACAAATCGTGTCATTACATTATGGTACAGGTAATTACCAAAATGCTGATAAAAACGTTATGGTATAGGTAATTAATGTCATCTTTTGTCATGAGTTATGATTGGACGAGGGATATTTTGAGTGTTTTTTTATATATGTAGACCTCCTGAGTTGCTGCTTGGGACAACAAAGTATGGGCCTGCTGTAGATATGTGGTCAGTTGGGTGCATTTTTGCTGAGCTTCTTCAAGGGAAGCCTATCTTTCCTGGAAAAGATGAGGTTAGTAATATTCTATATATGATAAGTTGAGAGAAATTAGAAGCTAAATTGATGACTGATTGATGTGATATTGAGTGCAACGGACTAGTTATGGTTTTGTCTTGTATTATTATCAGCGAGCTTATGCATAAATGGTATCAAGAAGAGATTCTTTACATTGTAGCTCATCATATTCAGTGTCTTGATACTTGCCACAAGCATAAACTACCTTTCTGTTTCATTAAAATAAATTTTTATTTATTTTGTTTGATTTTAAATATAAGCATTTCTCTGAAAGTTAATTTTAGGTTAAATTAAAAATAAAAAATTTAGTCCTCACCTGTGACTCCAGTTTTTTTTGTAGTCCCGTAATTAAAAAGTTAGTCTTCACTTGTGACACCAGTTTTCGTTGTAGTCCCTGCATGTAAAAACTCGACATATTGTTCTACATTCCATACAGTAATTGGTCTCTGCAGTTTGCTAAAGTTAGTACAAGTGTTAGATATATTTTTTTTTTATTGAGGGACAACAACAGAAAAATTTCGTGTGTCAGGTGTAGATATCAATATTTAGAATTTTTTTTCTCATGTAGGGATGAAAACAAAGTGTATTTTTTGTATAAGAATTAAAACTAAATAAAGTATCTAATATAGATTACAAATTTACTACCAATTAAATATCAGGGTTTCATTTGTAAATATTTTTCATGTAGGGACTCAAATGTAGAGTGTTTCCCTGCAGAAACTGAAATGGACAAGTGTTAGGACTTGAGTCTAAATTTTTATTTTAAAGGTGATTTATATTTTTATCATCAAGAAAAGATGAAATGCTAATGATGATGTTTGTGTACATTGCTGGATCTCTAACCTGCCCAATACTTTGGAAATTTAGTCATTACGTTGCATTACACTCCTGATCTTTTTTTTTTAAATACATGACATTACTGTATATCCTCGTGATAAATTTTTTTCCAGCTTAAATGTAATGCCGGCTTTGTTTGTAACCATTGTAGCCAGAACAATTAAATAAAATATATGAGCTGTGTGGAGCACCAACTGAAATCAACTGGCCTGGGGTTTCTAAGATACCTTATTATAATAAATTTATGCCAACAAGGCCAATGAAAAGACGTTTGAGGGAAGTTTTCCGGCAGTAAGTATCAAAATATACATGCTTTTCTATCCACCAGAAAAGCTAACCTGTATTTCATTTCCTGGGATTTTTTTTTATATTTAAATAGCTTGTTTCCCTATGACTTACAGTTTTGATCATCATGCTCTGGAGTTGTTGGAGAAGATGTTGACACTTGATCCAGCACAGGTATCATTTCTTCACTTATAAGTCTGATTTATTAATTGTTAAATAATCTTGAATTTTTATTTTACAGGGTTCAAATGCCTGTTTTTCGTAGTTTTATTTTTTATCGCTCCATCTATTTTATTATGACATGGTTAACTGTATCTACAATAGCTGGCTTGTTTTATTATATCATGGATGTTGACAAAAATCTCAGTAAACTTAAGAGAAAAGTGCTATGCGTCTGGTTTTTCCTTTGTGAAAAACGGAAAAACATCAATGGCAGTGCTTGCTGGTTCAGACGAATTCTGTAAAGTAATTATATATGTGCTGTAATTGATAAATATGAAGTTGTGTTGGCGTAACCTGAAAATTTTTTGTAACCAAAAAATCTAAGCGAAGTAATTATTTTCCACTTGTTTACGTGATTTTATGACGATTAATTATTTTGTGTTTGTCGATTTGATTTCTTCAGAGAATTACTGCGAAAGATGCACTTGATGCTGAGTATTTCTGGACAGATCCATTACCATGTGACCCCAAGAGGTAAGAACTTCCATGTATTTTAGTTACTTATTTTCAGAATGCCACTTTTTGCGTGAAAATATGTCTTCTTAATAGGAATAAATATCTTCTCATTCACTCCTTTTCCTTTCCTTTTTACTTTATTGTTTCTACTCGACTAATCGTTTTCTGGTCGATACTTTTCAACTTCCTACTCTTATGTACGGCTTAGTTTGCCCAAGTACGAGTCATCGCATGAGTTTCAGACAAAGAAAAAGCGCCAACAGCAACGGCAAAATGAAGAAATGGCTAAGCGTCAGAAAATGCAGCACCCACAGCAGCACAGTCGTCTTCCCCCCATTCAGCAGCCCGGACAACATGGTCAAATGCGGTCAGGACCAAACCAACAGATTCATGGCTCTCAACCCCCAGTTGCTGCAGGACCCACTCATCATTATGGGAAACCTAGAGGTCCATCTGGTGGACCAGGAAGAAAAATATCCTCCCAATGGGAACCAAGGCGGAGGATACAATCACCCAAATCGAGGAGGTCAAGGTGGTGGTTATGGCACTGGACCTTATCCTCCTCAAGGGCGGGGGGCACCTTATGGGTCCAATAACATGCCTGGTGGCGGTCCTCGCGGTGGCGGTGGTGGTGGCAGTGGGTATGGAGTTGGAGCTCCAAATTATCCCCAACAAGGTGGTCCATATGGGGGTTCAGCAGCTGGTCGTGGCTCGAACATGATGGGTGGAAACCGCAATCAACAACAGTATGGTTGGCAGCAGTAA

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