Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33629 LG9 46916064 46920839 PREDICTED: probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 46916159 missense_variant p.Asp671Asn
T/C 46916177 missense_variant p.Ile665Val
G/T 46916186 missense_variant p.Pro662Thr
A/T 46916249 intron_variant
A/G 46916259 intron_variant
A/G 46916391 intron_variant
T/C 46916400 intron_variant
G/A 46916426 intron_variant
G/T 46916518 intron_variant
C/T 46916554 intron_variant
G/T 46916563 intron_variant
C/A 46916617 intron_variant
C/A 46916802 stop_gained p.Glu590*
T/A 46917382 intron_variant
T/A 46917419 intron_variant
T/A 46917683 intron_variant
C/G 46917751 intron_variant
G/A 46918005 splice_region_variant&intron_variant
C/T 46918754 downstream_gene_variant
C/T 46918810 synonymous_variant p.Gly327Gly
G/A 46918852 synonymous_variant p.Tyr313Tyr
C/T 46919647 synonymous_variant p.Arg188Arg
A/G 46919701 synonymous_variant p.Asn170Asn
A/G 46919951 downstream_gene_variant
T/A 46920106 downstream_gene_variant
G/A 46920230 downstream_gene_variant
A/T 46920235 downstream_gene_variant
A/G 46920299 downstream_gene_variant
G/C 46920395 downstream_gene_variant
T/A 46920681 missense_variant p.Leu53Phe
C/A 46920699 missense_variant p.Trp47Cys
C/T 46920815 missense_variant p.Ala9Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33629.1
MGCIASKSAAVDDSREGVARELTSSSRRTSEMKISALGSKKRVDGVWGKDKVLDGADMKVSLIGKESDGSRRLFDSQNGKKKKEKPESAVLDHPGVGRVPKGLEGEQVAAGWPTWLSSVAGEAIQGWIPRRADTFERFGKIGQGTYSSVYKARDLTHQKIVALKRVRFDNFDAESVKFMAREILVLRRLDHPNIIKLEGLITSQTSRSLYLVFEYMEHDLTGLASSPTIKFSEPQVKCYMQQLLSGLNHCHSRGVLHRDIKGSNLLIDNNGTLKIADFGLANFIDPHHKVPLTSRVVTLWYRPPELLLGASNYGVAVDLWSTGCILGELYCGRPILPGKTEVEQLHRIFKLCGSPSEDYWRKLRSPHSTVFRPPHHYRRCVAETFKEYPSAATKLIESLLALDPTLRGTAATSLKSEVSRFCLHSFQRNLFPAIHQVYQNILPAKRWTLNFGKQGADGRKEKKNGPRVRQEKEPQTFILSKDNEGCHISMQQGQRLPNSRSRNEFFNPHREPVSGHLVFPQKVSEDHKSTVNYFSGPLYQRPMHSGPLVPGNGWEMAGKEAGERPHVSNKATLPKLSGVASRTSLSGDKMENPLSSRPRESIQAQRSLESTNAGSESRRRHDKKRHSQRIDHRQIENARVSTQTLIQEGHGPMGNNICHLSGPLLISSNNVDQMLKERDRKIQEHSRRARMKSGEIARANQN*


CDS Sequence:
>Vu_33629.1
ATGGGGTGCATAGCTTCCAAGAGTGCAGCTGTTGATGACAGCAGGGAGGGTGTGGCAAGGGAATTGACTTCATCTAGCAGAAGGACATCTGAGATGAAGATTTCTGCATTGGGTTCCAAGAAAAGGGTCGATGGAGTTTGGGGGAAAGATAAGGTTTTAGATGGTGCTGATATGAAAGTTTCACTAATTGGCAAGGAATCTGATGGTTCGAGGCGGTTGTTTGATTCTCAGAATGGGAAGAAAAAAAAGGAGAAACCTGAATCGGCTGTTCTTGATCATCCTGGTGTTGGAAGGGTTCCGAAGGGTTTAGAGGGAGAGCAAGTTGCAGCAGGTTGGCCAACTTGGCTTTCTTCTGTTGCTGGTGAAGCTATCCAAGGGTGGATACCACGGAGGGCAGATACTTTTGAGAGGTTTGGTAAAATTGGCCAAGGAACCTACAGTTCTGTGTATAAGGCACGTGATTTGACTCACCAAAAGATCGTTGCATTGAAGAGGGTGCGCTTTGATAATTTCGATGCTGAGAGTGTCAAGTTTATGGCAAGGGAAATCCTTGTTCTGCGTAGGCTTGACCATCCAAATATAATAAAGTTGGAAGGATTGATAACGTCGCAGACATCTCGCAGCTTGTACCTTGTTTTTGAATACATGGAACATGATCTTACAGGACTTGCATCAAGTCCTACCATTAAGTTTTCCGAACCACAGGTTAAATGCTATATGCAGCAGCTTCTTAGTGGATTGAATCATTGTCATAGTCGAGGTGTCCTCCACCGTGACATAAAGGGCTCAAATCTTCTTATTGACAACAATGGCACCTTAAAGATTGCAGATTTTGGTCTGGCAAATTTTATTGACCCCCATCACAAGGTTCCATTGACCAGCCGTGTAGTAACTCTGTGGTATAGACCACCAGAACTCTTACTCGGAGCATCTAATTACGGAGTTGCAGTAGATTTGTGGAGCACTGGTTGCATACTGGGGGAATTATATTGTGGCAGGCCTATTTTGCCTGGAAAAACAGAGGTTGAGCAATTGCATAGGATTTTTAAACTTTGTGGCTCACCATCTGAGGACTATTGGCGTAAGCTTCGGTCACCACATTCAACAGTATTCAGGCCTCCCCACCACTATAGGCGTTGTGTTGCTGAAACATTTAAAGAATATCCATCTGCTGCCACAAAGCTCATTGAATCCCTACTTGCTTTAGATCCCACACTTCGAGGAACAGCGGCTACATCCCTGAAGAGTGAGGTTAGTCGTTTTTGTTTACATTCTTTTCAACGGAACCTCTTCCCTGCCATCCATCAAGTTTACCAAAATATCCTCCCTGCAAAGAGATGGACACTAAATTTTGGGAAGCAAGGAGCTGATGGGAGAAAGGAGAAGAAAAATGGACCAAGAGTTCGGCAAGAAAAAGAACCTCAGACGTTTATTTTATCCAAAGACAATGAGGGCTGTCACATATCAATGCAGCAAGGGCAACGCCTTCCTAACTCAAGGAGCCGGAACGAATTCTTCAACCCTCACAGAGAACCGGTTTCTGGACATTTGGTTTTTCCACAGAAAGTGTCAGAGGATCATAAATCAACAGTAAATTATTTCTCCGGGCCTCTTTATCAGAGGCCTATGCATTCAGGTCCATTGGTTCCAGGCAATGGCTGGGAAATGGCTGGAAAGGAAGCTGGTGAGCGGCCTCATGTTTCAAACAAAGCCACCCTACCAAAACTATCTGGAGTGGCATCTAGGACTTCATTGTCAGGAGATAAAATGGAAAACCCTCTTTCTTCAAGGCCCCGAGAATCAATTCAAGCTCAAAGATCTTTGGAGTCAACTAATGCTGGATCAGAGTCAAGAAGAAGGCATGATAAGAAACGCCATTCTCAGAGAATTGATCACAGGCAAATCGAAAACGCGAGAGTCTCGACTCAAACATTAATTCAGGAGGGCCATGGACCGATGGGAAACAATATCTGCCATCTCTCTGGTCCATTACTGATTTCATCAAACAATGTGGATCAGATGCTCAAAGAGCGTGATCGAAAGATCCAAGAACATTCTAGACGAGCACGAATGAAGTCAGGTGAGATAGCTCGTGCAAACCAAAATTAG


Promoter Sequence:
>Vu_33629::LG9:46920839-46922839(-)
CGCGTAAAACTATAATAACTTGACATAACTTCTTACTTAATTTTTTTTAAAGTTATTTCATTTTGATAATTTTATAATAATCATCATAAAATAAAAAAGCATTTGAACTTGTAATACTTGAATATAATTTTTTTATTTGCAATGAATAAGAAAAAAACAGAAAATTTAAAATGTATCCGTTTAAATGGATTTTGTTTTGGTCTTTTATCCGTTTCATTGATTATGAGATGAGATAACCCTTTAAAATTAATATTAATGCAAAACTACCGAAACGTATAAGGAATTTAAATTATGTCCTTTCATTGGCAGGTATACAATATTTTTCCCACCAACATTTAATATAATCTGAGCATTTTACTACGTTACTCTTCTTTAATAAATGAAGTTTATGTATATTTTTTTTAACTATACATGTAAATTAAACTTAGGCATAAGAATGATTTGTGATATAAACTTTCTATCATAAAAAAATATTAAATAAATGTTTAATTAAGTTATTCATTTAAATATTTGTTTCATAGTGCTATAAGTATAATATATTAATTCTGTCAAAAATAGAATACAACATATTAATTAATTTGTTGATAATTAATTACAGTCAGAGGAACTAATTAATTAATAATTTAATATTTTTTACATTCATAAAATTCAAATTCAATACTTACTTAAAGAAACTAGACCTCATTTCACTCAGATTAATATAATGTTGGCTATATAAATGTGTTCTGGAAATAAAATTAAAATTATTTTAAGAATACAAAGTCAAAGTGGACCACTCTTATATTATAAATTAAGAATACAAAATTCAGAATTTTTTTTTACTAAAATAATTTTTAATATTTTCTCACTTGTCTAGGAGATGCATTTCATTTCATGCATGATCCCATGAGACTAGCAAAATAAATTCTTCAAACCATTTCACGGATTTAAAATACCATAAGTATTTTTTAAAAAATATCTAAAATATTAATTGATTACATATCTAAAGCTATGTGTAAAGTATTTTCAGGCTAAATAAGTCGAGCGATTACTAAAATATTACTAATTGCATGATGCATTCTAATTTAGCTTTTAAAAAGTACTAACAAAATCATGAACTTATTTTTTCATGAATAAGGCATGAATAAATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTAGGAAAAGTTGAATATAAATATATTTTTCTTGTAGTATTTTTAATTAATGAAAATATTGAATAAATAAATTAATAAAAAAATTCAGTTATTTGAGATTTACAAATAAAATATTTAGTTTTAAAAATAAAATTAATCCGTCAAAGGGGGAAATTTGTTCCTTGCATAACGTCAATGGCAGACTCGGCCCCTGAGAGAAAAGAGAAGGGTCTGTTGACTGAGTTTAGTCGGCAAAAGCCGTCGTGTTAGGGAGATATTAATATTTCATTTCCCTAATTTATGAAATTATGAATACGCGTTGAACTTTTACCAAAATCCAACAATTTCTTTCATATTAAGCTTTTCACCAACCATTCCATTCTTACCCTTAACCCCATTTTAAAGATCCACTCAAGTTTTTATTTTTCTCGTTCCGACTATTTTCTTTATTAATCATTTTTATCATACCTTGTCTACCAGTGTTAGGATCATCACCACCCTCTTTTTTTGAATGTTGACAATTGTTGGCACAGTGTTACTGGAGGGTTCTGAATTGCGTCTTTGATTGGAATATCTGACTCTGCAATTGGGTCAGTTTGAAAGTTTCAAAAGAGGGCAGAGAAAGCGTGGTTTTTTCCATTTTTTATTTTTAAGGGTTCAAGGAGGGGAAATTCCCAGCTTTATTTTTTGGAAGGACGACAACAAATTGATGCATGAGCATTAGTTGGTGACTTGCATGATGGAGTTGTAGGTGGAAGATTGCGATCGTGGTTCTTGATTGAAGGATAATAATATTATTGTATAGTTTAATAATAGCTTCTTGGTGCAAC


Gene Sequence:
>Vu_33629(-)
ATGGGGTGCATAGCTTCCAAGAGTGCAGCTGTTGATGACAGCAGGGAGGGTGTGGCAAGGGAATTGACTTCATCTAGCAGAAGGACATCTGAGATGAAGATTTCTGCATTGGGTTCCAAGAAAAGGGTCGATGGAGTTTGGGGGAAAGATAAGGTTTTAGATGGTGCTGATATGAAAGTTTCACTAATTGGCAAGGAATCTGATGGTTCGAGGCGGTTGTTTGATTCTCAGAATGGGAAGAAAAAAAAGGAGAAACCTGAATCGGCTGTTCTTGATCATCCTGGTGTTGGAAGGGTTCCGAAGGGTTTAGAGGGAGAGCAAGTTGCAGCAGGTTGGCCAACTTGGCTTTCTTCTGTTGCTGGTGAAGCTATCCAAGGGTGGATACCACGGAGGGCAGATACTTTTGAGAGGTTTGGTAAAGTAAGTTTTCACCTTGGCTGCATACTCTGTGATTGTATTATTATTCAACTGTCGTGTATTTCACCAATTTCTGTTACCTTCATGTGAATGCACTTGTCAATAGTTTCAAAACATTGTATGTTTATGAAATTAATCCTTTGGCTGATGACCAGTGCTTCGTGGATGCGAGGGAAACATGGAAAATTGTTCCCTAATTTTTAAATTTCAGAATATGATACTTTTTGTTAACGACTGTTTCAGAAACCTGTGCTCTTGTTGGTGTATGAAGCTTAGATGCAGCTTATATCTACCTTTTTTTGTATATTTTTCTAACAGCTAAAAAGGAAAGAGCTCAGCTCAACAAGTGACTGGATAGTTTTCATTTTAACTTTTTTTAACAATAACTAAGTCCTTCGTACACTGGACTCTGTACATTTTATTTTGCAGTGATTTGTTTATGGATATGAGTTCAGGATTATTTTTCATTATTAAAGATTTTGTCAAAAGTAGAGAATGAAAAACGTGAGTTAGGGTGATTAAACTTATTTTTGAGTGAAAAAGAAATAGTATTCTCTTCTATTCTAAATGGTTAATGATGTTTTTTGTTCTCACTTATTAAACGACTCGTGGGATGGCATTCGACCATGCAGATTGGCCAAGGAACCTACAGTTCTGTGTATAAGGCACGTGATTTGACTCACCAAAAGATCGTTGCATTGAAGAGGGTGCGCTTTGATAATTTCGATGCTGAGAGTGTCAAGTTTATGGCAAGGGAAATCCTTGTTCTGCGTAGGCTTGACCATCCAAATATAATAAAGTTGGAAGGATTGATAACGTCGCAGACATCTCGCAGCTTGTACCTTGTTTTTGAATACATGGAACATGATCTTACAGGACTTGCATCAAGTCCTACCATTAAGTTTTCCGAACCACAGGTAGTGATGATATATCTTATATTCTTGCAGTCTTCTGTTTTACATGGAGTCAAGATTCCTCTAGTTAAGACGTAATAAAACCATTCATGGCCTTCACTTAACAATTTGAACATCTGGGATATTTTGTCATTGACATGGTATCAAAGCTTTATGAACAAAGTTGCTAGGAATTTGATCTTTGCTTCCTAGATTCTTCTAAAATGAAAAGTTGAATTTCAGCACATGGAAGAATTGCGCCTGTGCATTGTCCCTAATTCAAACATGTTAAAGATGTAATAAAACCATTAATGAGCCTTTGCCTAACAGCTTAAGATTTTGGGATAATTGGTCATTAACTCTTCTGCATACTGATGTCAGATTTAATAGTTGGAAGCACTTATTCTTATGAGTTATTTGATTTCTAAGTGATCTTTCTCTCAGGTTAAATGCTATATGCAGCAGCTTCTTAGTGGATTGAATCATTGTCATAGTCGAGGTGTCCTCCACCGTGACATAAAGGGCTCAAATCTTCTTATTGACAACAATGGCACCTTAAAGATTGCAGATTTTGGTCTGGCAAATTTTATTGACCCCCATCACAAGGTTCCATTGACCAGCCGTGTAGTAACTCTGTGGTATAGACCACCAGAACTCTTACTCGGAGCATCTAATTACGGAGTTGCAGTAGATTTGTGGAGCACTGGTTGCATACTGGGGGAATTATATTGTGGCAGGCCTATTTTGCCTGGAAAAACAGAGGTATTAAGAATCTGGTCTTCATCATAAATACGTTCAATGTTTACTTTCAAGTGGTCTCTTCACTGATGTGAACGGTTTCAATTTCTAAACCAATATAGTCAATTCTCAAATTGATATTATTATAGTAACAGAGCTAGGTGCCTGAAGTTTAATTTCTGTTAATTGTAGGTTGAGCAATTGCATAGGATTTTTAAACTTTGTGGCTCACCATCTGAGGACTATTGGCGTAAGCTTCGGTCACCACATTCAACAGTATTCAGGCCTCCCCACCACTATAGGCGTTGTGTTGCTGAAACATTTAAAGAATATCCATCTGCTGCCACAAAGCTCATTGAATCCCTACTTGCTTTAGATCCCACACTTCGAGGAACAGCGGCTACATCCCTGAAGAGTGAGGTTAGTCGTTTTTGTTTACAGTAAGTGAAGTACTCATGCAATGTTCTTATATACTCATGTGAGTTTTGAGTACCAATTTCTGAGCTTCATGTGTGTGCTTGTGATGATGAAGCCTGCTTTCTGATTCCTGCCTTTGTTACCTTATTTATTGGAAAAAATAATCGAATTTCTTATGCAATATTGTTATTCAATATATTGAAGGAACTCGTTTTCTGTATCAACTTCTATGAGGTCCTTAATTCTCCATTTTGACATTTTACCCCTTCATTGACAGTTCTTTTCAACGGAACCTCTTCCCTGCCATCCATCAAGTTTACCAAAATATCCTCCCTGCAAAGAGATGGACACTAAATTTTGGGAAGTAAGCAACAAGGTACCTGCTGTATGATATGTTTTTTGTATGTAAAAGATGTTGAGGCAAAGACAATTTGATTTGTTTTCAATACTGATATTTTCTGACGTGATTTTAATTTCTCCCAGGTAGTGAAATTGATTTTGTATAAATAGTTGAATTTGACTGTTGAAATCTTTGAAATAGGGGGCATATATTTGATTTCTAAAGCTTTGCAGTCATGTAACTGCAAATATATTTTTCATCATTAATTTTGAATTTTCTTTCTGCTCCATTGGATTCATCTATTTATGGTAGATGGGAACCTTGTTACCTGAGACTTTTGTAAACAAGTATAAATTTTTGTTTATCATCTTAGGCAAGGAGCTGATGGGAGAAAGGAGAAGAAAAATGGACCAAGAGTTCGGCAAGAAAAAGAACCTCAGACGTTTATTTTATCCAAAGACAATGAGGGCTGTCACATATCAATGCAGGTAATGGAAGAAAGAAAGATTAGGCACAATTTCTCCTTATTCATCTTCCTATTTGAAAATTAGGCTCATAGGAGAATACAATAAAGAAATTTTGTATTAGAATTTTGTTAGAACTGGCATAAAAATCAGTAAGAAAGATTGAATTTCGTCGACTGAACATAGGGAAATCCCTCTAGAAAGCACTACACTGTTCCAGATCCCTCTATCATTCACCGAAAGTCCATAACTGGCAGAACTGCGAGTGTCTGCACCTCTCAATGCCCAAATGCCGCTCTAGTTTCAGTAGTTTAACTGCTTTTTTTCTTACCATAATCGTGATTCCTTTTATTTTAGCAATTTAACGGGCTAATAGCAAAATCGTTTCTACTTTTTTCTCTTTTGCCTTGTCTAGTGCTCTGCAATCTGTCTCTTTTTCATCTCACTAAATCATAATTTTATTTGATGCAGCAAGGGCAACGCCTTCCTAACTCAAGGAGCCGGAACGAATTCTTCAACCCTCACAGAGAACCGGTTTCTGGACATTTGGTTTTTCCACAGAAAGTGTCAGAGGATCATAAATCAACAGTAAATTATTTCTCCGGGCCTCTTTATCAGAGGCCTATGCATTCAGGTCCATTGGTTCCAGGCAATGGCTGGGAAATGGCTGGAAAGGAAGCTGGTGAGCGGCCTCATGTTTCAAACAAAGCCACCCTACCAAAACTATCTGGAGTGGCATCTAGGACTTCATTGTCAGGAGATAAAATGGAAAACCCTCTTTCTTCAAGGCCCCGAGAATCAATTCAAGCTCAAAGATCTTTGGAGTCAACTAATGCTGGATCAGAGTCAAGAAGAAGGCATGATAAGAAACGCCATTCTCAGAGAATTGATCACAGGCAAATCGAAAACGCGAGAGTCTCGACTCAAACATTAATTCAGGTTAGTTTTTAACTGTTGTTACCTTCCAATGGTCATAGTGGACTTAAATATAAACAAATTTCAATTTTCTAAATCCTGTTTAATGCTTCTGTTTCAAAAAAGCTTTCATCTTTCGACCTAACCATCATTGTGAATAAAGGAAAAAAAATACATTTTTATCATCTGAAAGCAAGAATATTTAATGAACTTAACTATCATTCTTAATCAATATTAAAGTTGTTAACTTTGGTTATAATGGAGTCCACATGTAGGACTTGTCTGTAATGGCTTTTTCTAGCTAGCAATAAACAATGAAAAACCTTGCGTTTTGTGTCCCCAGTATTCAACATTTTTGTAATTTGTATGCATCTGTCATTTATCTTGGGTTTTTGCTGGTTCTTGATGGTGGTCCCTATTTCAGGAGGGCCATGGACCGATGGGAAACAATATCTGCCATCTCTCTGGTCCATTACTGATTTCATCAAACAATGTGGATCAGATGCTCAAAGAGCGTGATCGAAAGATCCAAGAACATTCTAGACGAGCACGAATGAAGTCAGGTGAGATAGCTCGTGCAAACCAAAATTAG