Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33627 LG9 46903661 46906148 PREDICTED: probable L-type lectin-domain containing receptor kinase VII.2
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 46903682 5_prime_UTR_variant
T/C 46903758 5_prime_UTR_variant
G/A 46903761 5_prime_UTR_variant
C/T 46903793 synonymous_variant p.Ser3Ser
T/A 46903810 missense_variant p.Leu9His
A/T 46903832 missense_variant p.Gln16His
A/T 46904427 stop_gained p.Lys215*
A/G 46904546 synonymous_variant p.Leu254Leu
T/C 46904731 missense_variant p.Ile316Thr
T/C 46905162 synonymous_variant p.Leu460Leu
C/T 46905173 synonymous_variant p.His463His
T/C 46905215 synonymous_variant p.Ala477Ala
G/A 46905690 missense_variant p.Gly636Arg
C/T 46905709 missense_variant p.Ala642Val
T/C 46905714 missense_variant p.Trp644Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33627.1
MSSLALFFLVLNLVLQVLISVSANEFVYNRNFNSSNVKLYGNATIQNSILTLTNKTFFSIGRAFYPQKIKTKPSNSSTVLPFATSFIFSVAPCENFPVAHGFAFIFAPVMAVNGALSGNYLGLFNRSTSGNSSNHVFAVEFDDFRNEEFNEENDNHVGVDLNSIISEYSEPAGFWGGREGEEWEDLKLADGRNYQVWIEFEDSVINVTMAPAGKKKPRRPLISKPINLSWVLLDEMYMGFSGATGRMVDYCRILAWSFSNSNFSIGDALNTKHLPVYVHPKNSLFRSNGFIIGVTFGAFFMGGFCALVFFYSLFKIRREEKQENFEDWELEYWPHRISYQEICDATSGFSEEKVIGIGTSGKVYKGVLKGVVVAVKSINHETQYGMREFLAEISSLGRMKHRNLVGFRGWSKRKGGKLILVYDYMENESLDKRIFECEEAMLLSWEERIRVLQNVADGILYLHEGWEVEVLHRDIKACNVLLDKDMNARLGDFGLARLHRQEHVADTTRVIGTLGYMAPELVRIGRPTAACDVFSFGVLVLEVVCGRRPVIADQPPLFDWVFSLMEKGELSCAIDERLKGQIGYNAEEAERMLHLGLLCVGNDPVARPTMRQVVKTLEGIKCTECNDECIHLGLLGKINSAASWSKSSTSSSYVNYPTFDEILQTKFYSTASLSISYPSPQPQSEFVSEGR*


CDS Sequence:
>Vu_33627.1
ATGTCTTCCCTTGCTTTGTTTTTTCTTGTCCTTAATTTGGTTCTTCAAGTTTTGATTTCTGTGTCCGCAAATGAATTTGTCTACAATAGGAACTTCAACTCCTCTAACGTGAAACTCTATGGGAATGCCACCATCCAGAACTCAATTCTCACGCTCACAAACAAAACTTTCTTCTCCATAGGACGTGCCTTTTACCCTCAGAAAATAAAAACGAAGCCATCCAACTCTTCCACTGTTCTTCCCTTTGCAACTTCCTTCATCTTCTCTGTTGCCCCTTGTGAGAACTTCCCTGTTGCTCATGGTTTTGCTTTTATTTTCGCGCCGGTGATGGCCGTAAATGGAGCTCTATCGGGGAACTACTTGGGCTTGTTTAACCGCTCTACTTCAGGTAACTCCTCCAACCATGTTTTTGCGGTTGAGTTTGATGATTTTAGGAACGAGGAGTTCAATGAGGAGAATGATAATCATGTGGGCGTGGACTTGAATTCGATTATTTCGGAGTATTCTGAGCCTGCTGGGTTCTGGGGTGGGAGAGAGGGCGAGGAATGGGAGGATTTGAAACTAGCTGATGGTAGAAATTATCAGGTTTGGATTGAGTTTGAGGATTCGGTGATTAATGTTACTATGGCACCGGCAGGGAAAAAGAAGCCTCGGAGGCCTTTGATCAGTAAACCGATTAACCTTTCTTGGGTCTTGTTGGATGAAATGTATATGGGGTTTTCTGGAGCAACAGGGAGAATGGTGGACTATTGTAGAATCTTAGCTTGGAGTTTTAGCAATTCCAACTTTTCAATTGGTGATGCTTTGAACACCAAGCATTTACCAGTGTATGTGCATCCAAAAAATTCGCTGTTTAGATCAAATGGTTTCATTATAGGTGTAACTTTCGGGGCGTTTTTTATGGGAGGTTTCTGTGCTTTGGTGTTTTTTTATAGTTTGTTCAAAATCAGAAGGGAAGAGAAACAGGAAAATTTTGAAGACTGGGAATTGGAGTATTGGCCACACAGGATTAGCTATCAGGAGATCTGTGATGCAACAAGTGGATTCTCCGAAGAGAAAGTGATTGGGATTGGAACGAGTGGGAAAGTATACAAGGGAGTTTTGAAGGGAGTAGTAGTTGCAGTGAAGAGCATCAATCACGAGACACAGTATGGAATGAGAGAGTTTCTGGCAGAGATTTCAAGTCTTGGCAGAATGAAGCACAGGAATTTAGTGGGTTTCAGAGGTTGGAGCAAAAGAAAAGGAGGAAAACTTATACTGGTTTATGATTACATGGAGAATGAGAGCTTGGACAAAAGGATCTTTGAGTGTGAAGAGGCAATGCTGCTGAGCTGGGAAGAAAGAATTAGAGTTTTGCAAAATGTAGCTGATGGGATTTTATACCTACACGAGGGTTGGGAAGTTGAGGTCTTGCATAGGGACATCAAAGCTTGTAATGTACTACTTGACAAGGACATGAATGCTAGATTGGGGGATTTTGGGCTTGCAAGGCTGCATCGCCAGGAACATGTGGCTGACACAACAAGAGTGATAGGGACTCTGGGGTACATGGCACCGGAACTAGTTCGAATTGGGAGACCCACAGCTGCGTGTGATGTGTTCAGCTTTGGAGTATTGGTTCTAGAAGTGGTGTGTGGGAGAAGACCCGTCATAGCAGATCAGCCACCATTGTTTGATTGGGTATTTTCCCTTATGGAGAAAGGGGAGTTGAGTTGTGCTATTGATGAGCGTTTGAAGGGTCAAATTGGTTATAATGCTGAAGAAGCTGAGAGGATGCTTCATTTGGGTTTGTTATGTGTAGGTAATGACCCTGTTGCTAGGCCAACAATGAGGCAAGTGGTGAAAACATTGGAGGGAATAAAATGCACTGAATGCAATGACGAGTGCATCCATTTGGGTCTGCTTGGAAAAATAAACTCAGCAGCATCATGGTCTAAAAGTTCTACAAGTTCTTCCTATGTAAATTATCCTACCTTTGATGAGATTTTGCAGACCAAGTTTTATTCTACTGCATCTTTAAGCATCTCTTATCCCAGCCCACAGCCACAGTCAGAGTTTGTCTCAGAAGGAAGGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_33627::LG9:46901661-46903661(+)
ACTCGCCTAATTCTAATCTACCTTTCTCACATATCCAATTTGTTTTCTATGATTTGTGAAGTTAAATGTTTTATTTACCATTACATTCTTCTGACTTAATTTTTAATTGGCTAAACTTGGTTTGATTTTGATCTTGGTTTACTAATGATGGTGTGCCTGCTGAGGGGGAGTTTGTAACACAACAAAATTCTAAAATTTAAAAATGAAATTTTTTAATAATAATGAGAAGGGAAAATATATAACACAGTTCTCCAATCAAAAATCAACATCATCAATTATTTTGTTATTAAACTGAGAAACAAATGAACGAACAGAACAAGAGTAACAAATTACGGTGTCACGGGTTGTTGTGTGTGGGTGAGGAAAAATATGGAGATAAAAGAGAAATAAATTGGACAAGTGAGGAAGGTAAATTAAGGTTAGGCGAGTGTTTCTGATTTTTTTCAATTGGGACTAGCGTAAAGATGACAGAGAAAATATTGAGAGAAAAAGGGTTGAGAGAATTTTTTTTTTAAGTTTTGAGAATGAAAATTATTAAAATACCCTTAACCTTATAACTTAGAATCCATGATATATTAGGATATTTTTGTCTACTAAAACCCAATACACATTGTTAATTAAAATGTAGCAACTGAAAAACAGGCCAAGTTAACAAATCCCATATATATATATATATATATACCTTTTATTTTTTCAATTTTACTTTTTTAATTACTACTTTTACAATTTAAATAATTTATAAATATTGAAAAAATTGTTGATGCCTGTATTTACTCTAATTAATTATTAAATAAATTTTAAATATAATTGTTCTAAAAATAATATATTGATAGTGTAATGTATTTTAATTAAATTCAATAAGTATTTAATAGAATAGGTATTTTATTTATACTTTCTGTTTGTCTAATAATTTGAAACGTATACGGCTTTAACTCCCCCAATAACTTTCCACTCAACTTGGACATTCTTATTTTTGTAATTGAACAAATGTATTTTTTCTATTAATCAAATTAAGCATTTACCAAGTTGACATACATCAAAACAAAATATTCATCAAAATATTAAATAATATTGTGTTGTTGGGAACGTATGAGTTAAAGCTATGTTTTCTAATAAAAATCTATTATCATTCACAGTATGTTAAGTTGAGAAGAAAAATATAAACAGAAAAATATAATACATTTATTGACAATATATATTTAAACAAGTGGTCGTGTCACTTAAAAGACATAATCACATAGAAATTACATTAAATATTTAATCACTAATTAATGAATATGTCCATGTGTGAACATTTATATAACATGGTTGTAGCTACTTCTATATAAGTATGAGATGCATTGCATTGCATGAGTGTTAAGTGTGAATATGTAAACATTATTTTGAAAATCGCTTTTATAAAAAAGTTAGTTAGATACTTTTTAGTGGAATCTCTCTTTTTAATTATATTTTTCATATAAAAAAATTCAAATTTCGTAGCAGGAGATCAAGTTGGATACCGTGTTTATTACTTTAAAATTATTTAGATTTTTTAATTATGAGTTGAGATTAAGATATTAAACGATAATTTAAAAATTTGACCACGAATAAACACAAACTAAAGGGTAAATGAGTGTGCATTTTTTTAAAAGGAAAAATAAAATTGAAGTCCCTTTAACTAACCCACTTATTACAAACTACAAATCCATGACTTCTTAGGGCGGTCGGGTCGTTGGATCTTTGTCGGAAAAATAAACAATTTCATCCATCTGTTCTTCCTCAAATTTCACTCTGTTATTTATTTTTAGAAAATGCTTGACCATCACTAGTGTCCACTACTTATTTTATTTAATTAATTTATTTATTTATTTATTTAATTTTGTGATTGTAGCCATTGCTAAGTTTCTTTCTACTTTCCAGGAATTTTTGTCTCGCCGCCAGCTCTACCAACCAATGCCAATGTTCGGCTAAATTCAGGATTCAATGAAACTAAATCTAAATCTTCATCAAAAGTAAACCCA


Gene Sequence:
>Vu_33627(+)
AAGGTCTTCTATTGTACTATGTATATTGTTAATGTTCGGTGTAACTGCATCATTAACTAGGCTTTGACGTATTTGTTCTTAGTTCTTCCTTTTATCTTCAGTTCTCTTGTTCTTGCCACCCACAATGTCTTCCCTTGCTTTGTTTTTTCTTGTCCTTAATTTGGTTCTTCAAGTTTTGATTTCTGTGTCCGCAAATGAATTTGTCTACAATAGGAACTTCAACTCCTCTAACGTGAAACTCTATGGGAATGCCACCATCCAGAACTCAATTCTCACGCTCACAAACAAAACTTTCTTCTCCATAGGACGTGCCTTTTACCCTCAGAAAATAAAAACGAAGCCATCCAACTCTTCCACTGTTCTTCCCTTTGCAACTTCCTTCATCTTCTCTGTTGCCCCTTGTGAGAACTTCCCTGTTGCTCATGGTTTTGCTTTTATTTTCGCGCCGGTGATGGCCGTAAATGGAGCTCTATCGGGGAACTACTTGGGCTTGTTTAACCGCTCTACTTCAGGTAACTCCTCCAACCATGTTTTTGCGGTTGAGTTTGATGATTTTAGGAACGAGGAGTTCAATGAGGAGAATGATAATCATGTGGGCGTGGACTTGAATTCGATTATTTCGGAGTATTCTGAGCCTGCTGGGTTCTGGGGTGGGAGAGAGGGCGAGGAATGGGAGGATTTGAAACTAGCTGATGGTAGAAATTATCAGGTTTGGATTGAGTTTGAGGATTCGGTGATTAATGTTACTATGGCACCGGCAGGGAAAAAGAAGCCTCGGAGGCCTTTGATCAGTAAACCGATTAACCTTTCTTGGGTCTTGTTGGATGAAATGTATATGGGGTTTTCTGGAGCAACAGGGAGAATGGTGGACTATTGTAGAATCTTAGCTTGGAGTTTTAGCAATTCCAACTTTTCAATTGGTGATGCTTTGAACACCAAGCATTTACCAGTGTATGTGCATCCAAAAAATTCGCTGTTTAGATCAAATGGTTTCATTATAGGTGTAACTTTCGGGGCGTTTTTTATGGGAGGTTTCTGTGCTTTGGTGTTTTTTTATAGTTTGTTCAAAATCAGAAGGGAAGAGAAACAGGAAAATTTTGAAGACTGGGAATTGGAGTATTGGCCACACAGGATTAGCTATCAGGAGATCTGTGATGCAACAAGTGGATTCTCCGAAGAGAAAGTGATTGGGATTGGAACGAGTGGGAAAGTATACAAGGGAGTTTTGAAGGGAGTAGTAGTTGCAGTGAAGAGCATCAATCACGAGACACAGTATGGAATGAGAGAGTTTCTGGCAGAGATTTCAAGTCTTGGCAGAATGAAGCACAGGAATTTAGTGGGTTTCAGAGGTTGGAGCAAAAGAAAAGGAGGAAAACTTATACTGGTTTATGATTACATGGAGAATGAGAGCTTGGACAAAAGGATCTTTGAGTGTGAAGAGGCAATGCTGCTGAGCTGGGAAGAAAGAATTAGAGTTTTGCAAAATGTAGCTGATGGGATTTTATACCTACACGAGGGTTGGGAAGTTGAGGTCTTGCATAGGGACATCAAAGCTTGTAATGTACTACTTGACAAGGACATGAATGCTAGATTGGGGGATTTTGGGCTTGCAAGGCTGCATCGCCAGGAACATGTGGCTGACACAACAAGAGTGATAGGGACTCTGGGGTACATGGCACCGGAACTAGTTCGAATTGGGAGACCCACAGCTGCGTGTGATGTGTTCAGCTTTGGAGTATTGGTTCTAGAAGTGGTGTGTGGGAGAAGACCCGTCATAGCAGATCAGCCACCATTGTTTGATTGGGTATTTTCCCTTATGGAGAAAGGGGAGTTGAGTTGTGCTATTGATGAGCGTTTGAAGGGTCAAATTGGTTATAATGCTGAAGAAGCTGAGAGGATGCTTCATTTGGGTTTGTTATGTGTAGGTAATGACCCTGTTGCTAGGCCAACAATGAGGCAAGTGGTGAAAACATTGGAGGGAATAAAATGCACTGAATGCAATGACGAGTGCATCCATTTGGGTCTGCTTGGAAAAATAAACTCAGCAGCATCATGGTCTAAAAGTTCTACAAGTTCTTCCTATGTAAATTATCCTACCTTTGATGAGATTTTGCAGACCAAGTTTTATTCTACTGCATCTTTAAGCATCTCTTATCCCAGCCCACAGCCACAGTCAGAGTTTGTCTCAGAAGGAAGGTGAGAGCTGCAATTGATTCAATCACTATGTTGATATTGAAATGGCAAAGAGCTAATGCAGCTGTGATCAAGTGACAAACATTTGTAAAGTTCGAGCACTTGTTGCTCCAAAAGTCAAGTTATGCTAAAATAGTGATCTCAAGTCTCAACGACTGATGTTGCTAAGTTGGGGTGTTTTTTTTTCCTCTGCTGTGCCATAATTTTATTTTATTTTTCAAATTTCTTTCTTTGGTGTTCTAGTTCTTTGAATAGTACTCATGTTCAACGTTCTTTCTTTGACAAATCTTGAATG