Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33577 LG9 46017895 46018878 proline-rich receptor-like protein kinase PERK8
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SNP Position Effect Amino acid change
G/C,* 46017904 missense_variant p.Glu4Gln
T/A 46018248 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33577.1
MAPEYATSGKLTEKSDVYSYGVVLLELITGRKPVDASQPIGDESLVEWARPLLSEALEKEDFEILVDPRLGKNYDRNEMFRMIEAAAACVRHSSVKRPRMSQVVRALDSLDEFTDLNNGMKPGQSSVFDSAQQSAQIRMFRRMAFGSQDSSSFFNESQSSWRSRDQHSATMISQNKTGSWNV*


CDS Sequence:
>Vu_33577.1
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Promoter Sequence:
>Vu_33577::LG9:46015895-46017895(+)
TATTTGACATAATAATTCTCTTCTTTTGAATGTTAAATGTAATATTGCCTTGAGGTGGTAAATATTAGATATTTCATATTAGAAGATTCTTAGAAACAGAAGAATCAAATTATATAATTGAAGGTTGATTAAAATTATTGAGAAATTGAATTCAAATCAATATGAAAGTTAATATAAAAACTTAGGTAGAACGAACACTTTTATCATGTTTTAATTAGTTGTTTTGAGACGTGGTTGCATTATCCTTCTATATTTGGAGATCGTGAGAAGGTAGTACGAATTTTTTTTCTCTTGCTTATTATATTATATATCATTTTATTCTAGTATAACCTTTCTCTTATGGACAAATTGAGTTACTTTAAGATTATTTCTAGTAAATGAGTGAATATCCAATTTTACTAAAAGTTTTAAGTGTTGGTTTGATAGTTTCATCAATAATAATTTCATACAAATGAGTTTATGAAAATTCTTTTATCACGAATACAAGTATTTTTTTGTTAATAAAATCTTTAATAGAAATATAAATGTGTAATATTAATAATTTTATTTCCATTTAATCATTTTATGCTAGGAGAGAAATAAACATGCTGAATTAATCAGTAATATTTCTTAAACGAAGCCTAAAGCCATAAAATAATTCTTACATCTAAATGAAGCATCACAAACTTATTCTATTACACTTTACTCTACCATTACTATCAATTAACTCTTACATCTCTAGTATCATCATGTGTCATACTACAACAATTATATTTCACCAAAATACACCACCTTTTGTAATTTCATAAATTAAATCCCTAAACTCTAAACTCAAACTCAGAATCACAAAACTAAATGTTTAAAAAAAACAAAAAAAAAATTATGCAAAAAATCAATTTTTTCCTTGAAGTTTATTTTTTGTGCAATAGGTTTTCAAATTAAACAAGTAAAAAATGGTTGAGAAACAAAAAATTAATGAAAACTTCAAGTATACATAAGTGATTTTTTTAAAAGATTTTAAACATTTATATGTATTTAAGTCTTGTGTTACTTTGCATCGCACATACCTTTGAAGCCGCGTAGAAGTGAAAAATGTGTCTATCTAACATTTAAATCTTACCACACTGTTTACCCAATCACTAAAGCATAGTAAAAATGTTATTCTGGTTCTTGTGTTATTTTATTATTTTAAAGGATAACGTTGCATTAATATGCTTTGCTGTCTATACTATTTTTGTTCATCGGTAAAAGTTATGTTTCGGCTTCTCCATTTAATGAACGGAGACTAACAAAAGATAATTAATCATATCTTTGTAGGTGCTGAACAATGTGTTTCAAAATGGAAGGATTCGAGTCCATCTAACTGAATTTAATTATTTTTAAAACTGTCTGAAATTTTTTAATTTTTCATTATCTGAACTTAATGTATTCATGTTGCAATAGATCTTTTATTTTAGTTCAAGGAATAAAGGCACGTTATTCAGTAAAAAAGAAAAATTCGTTTTATTGTGAACTCATTTAATTAAATTGATTCACACTTAAATGTCAGCTTGTGCTGCATCAGCATCTCAGACTATTTTCTTTATTGTGACATTTTGATCATCAGGTTTCGGACTTTGGGCTTGCAAAACTGGCATTAGATTCAAATACACATGTGACAACACGAGTAATGGGAACCTTTGGGTAGGTTATATTGTTGCTCAAGTCACATAATTTAGCGTTTATTATTGGAATCCTTTCTTATTATTAGCCATTAAATTTTACTATGTAGTTTGACTATCTGCATTTCTTATCTGACGAAATTTAAATTCCAATGGAAACGTTTTCATAGTATTTTTTTTCTCTCTCGGACTGTATTTTGTGTGGATATTATTTATTGATCTTTGATCTATTATACCTTTGTTTTAAGGCTGTTTATGGCATATAAATCTTTTAGAGTGTTTTGGATATTGGTGAAGTATAGTGTTCCTATTGTGAGTTTACATACCTGAGAGGAATAATGGTCTGAATTGACAGGTACA


Gene Sequence:
>Vu_33577(+)
ATGGCACCAGAATATGCAACAAGTGGGAAACTAACGGAAAAGTCTGATGTATATTCCTACGGTGTTGTGCTTTTGGAGTTAATTACGGGTAGGAAGCCTGTAGATGCATCTCAACCAATCGGTGATGAGAGTCTGGTTGAATGGGTGAGTCACATTATTCTTTTGATCATTATTATGCATAGCTTTTTTAAAATTTCTGGTTACATCGTTTGAAATTTCTGAAAACCAGAAGTAAAACGAATCCATAGTAAAAATTTTACAATTATCAATGAAAACATAAACCTGAAAATGTGAACAGAGCAAACCAAGCGAGCTCAATTTTTCCTTGTTTTCTTTGTGCAGTGATGAATTATTAGAGGAACTTGTGCTTACCTTATTTTAAATCACATGCATTTTGTAAAGATTATAAAAGAAAACAGGACAAGGGAATGGATTACCTATAAACTGTTCATTTTAATAATTAAGAAACTTGTTTCTAGGCTCGGCCTTTGTTGAGTGAAGCACTTGAGAAGGAGGACTTTGAAATCTTGGTGGATCCAAGACTGGGAAAGAACTACGACAGAAATGAAATGTTCAGGATGATCGAGGCTGCTGCAGCCTGCGTACGCCACTCGTCGGTGAAGAGGCCACGGATGAGTCAGGTAAGTTTATCGTGTGTATAGAGCATGCAATGCAGGTGAGCATGAAGATGTATATTTGTTGTGATTTTGAAGATGCTGAGTGTGCATTGGTGGTTGGCAGGTGGTGAGAGCTTTAGATTCCTTAGACGAGTTTACGGATCTGAATAATGGAATGAAACCGGGGCAGAGTTCGGTGTTTGATTCTGCACAGCAATCTGCACAGATCAGAATGTTTAGAAGGATGGCTTTTGGGAGCCAAGATAGTTCAAGTTTCTTCAATGAATCTCAGAGTAGCTGGAGGAGTAGAGATCAGCACTCAGCAACCATGATTTCCCAAAACAAAACTGGGTCTTGGAATGTTTGA