Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33494 LG9 43148563 43149828 NAC domain-containing protein 104
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 43148608 downstream_gene_variant
A/G 43148609 downstream_gene_variant
A/C 43148745 synonymous_variant p.Leu188Leu
T/A 43149026 downstream_gene_variant
C/T 43149054 downstream_gene_variant
C/T 43149055 downstream_gene_variant
T/C 43149082 downstream_gene_variant
T/C 43149278 missense_variant p.Ser98Gly
C/A 43149392 missense_variant p.Gly60Trp
C/G 43149525 downstream_gene_variant
T/G 43149546 downstream_gene_variant
C/A 43149559 downstream_gene_variant
T/A 43149577 downstream_gene_variant
T/A 43149582 downstream_gene_variant
C/T 43149586 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33494.1
MADNNVNLPPGFHFYPTDEELVVHFLQRKANLLPCHPDVIPDLELYPYDPWELHGRALAEGKQWYYYSRRTQNRVTGNGYWMPMGMEEPVITSSSNKRVGMKKYYVFHVGEAPDGNTTNWIMQEYRLLDSASSSRSSRRRPQPKPDHSKWVICRVYERDNDDDDGDGTELSCLDEVFLSLDDLEEIIKAFSSLASIVISEVAIARFPHSSLSSGALGQSWKFHAL*


CDS Sequence:
>Vu_33494.1
ATGGCAGATAACAATGTCAACCTCCCACCCGGCTTTCACTTTTATCCCACAGATGAAGAGCTTGTCGTTCATTTCCTTCAAAGAAAGGCAAATCTTCTACCTTGCCATCCAGATGTCATCCCTGATCTTGAACTCTACCCTTATGATCCTTGGGAACTTCACGGTAGAGCTTTGGCAGAGGGAAAGCAATGGTACTACTACAGCAGGAGGACACAAAATAGGGTCACTGGGAATGGCTATTGGATGCCAATGGGAATGGAAGAGCCAGTGATTACAAGCTCAAGCAACAAGAGAGTTGGCATGAAGAAATATTATGTTTTCCATGTGGGAGAAGCCCCTGATGGTAACACCACCAATTGGATAATGCAAGAGTATCGTCTATTAGATTCTGCTTCCTCTAGCAGATCATCCAGAAGAAGACCACAACCAAAACCGGATCACAGTAAATGGGTGATATGTCGAGTTTATGAGCGGGATAACGATGATGATGATGGTGATGGAACAGAGCTCTCTTGTTTGGATGAAGTTTTCTTGTCATTGGATGATCTTGAGGAAATAATTAAAGCCTTTAGCAGTTTAGCTTCCATTGTAATCAGTGAAGTCGCTATAGCTAGATTTCCACATAGCAGCCTTTCAAGTGGGGCACTAGGTCAATCTTGGAAATTCCATGCTCTTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_33494::LG9:43149828-43151828(-)
AGTCATGAAATAGAATTGCAGCAATCTTTTTTCACTCGTAATACTACTTCTGTTTGCATAAGTGGCACGCATTATTGGAATACTCTAAAAAAAACATTTTTTCAAAGAACTAGCAATATATGTGACATCTATGCAAAATATCAACATCTTGACAGTAAAAGATTTGAAATATAAGTAGTAAGCTCTGAAGAAGAATTTTTCAGTCAATTTTAGATTAAATATTTACGCATACTTTCAACATGCAAGATCAGTTTCATTGTGGAAGAAGCACCGACAACCAATCTGATGACTAAGGCTAAGTAGCAAAGTCAATGGCCATGTGGAATGTGGATGAAAAGCTAAGTTGATATACACTTGGGAATGCTGCTTACTGGGCCTTATGGATAAAATATGGCTTATAGACGGTTGTTCCTCAACCCTTGGTCCACCAGAGCCCAGAAATGGGGCATGGATATGAAGGTACAAAAGATACAAGATGATGGTGCTTCCACATCTATGCTCTTTATTCCTTTAGAGAGGATCAAGGATTACATCTAAAATTGGTGCAAGTAACTTTCAAACCTAGCACCAAGACTTAGGAATTAAAATTAACATGATATGGCACCAAGATTTTGAAACTAAAACTTGATGTTTTTTGTTGCTGATGCCCTGTGGTTTGGTTGTAGTCTCACGGAGGTTGGTACCACCTTAAAGGGAGATAATGACATAAAAGAAAAACACTGTAACACCTTGTACTGCAAATAGTAACTTCCTAACATTTTATATCTCGATATGGTTATAATTGGCCTCAAATGGTACTATAAAATTTGAGATTAGCCATCAGAAACAGAATAATGTTGTCTACTTTAATGGAAGAATTATAATTGCTGAGCTCCTAAATCAGAAGAAAATATATAATAATAGAGCTGAAAAATGTAATTTATGGTTGGAAAAGTTATAAGCAAAGTAGTTGTTTCATAGTAGAGTTTTATATGTTTGTTTCTTTCTTATGCAAGATTTAATAATTGATTAATTATATAAATAATGTGGGGGCTTCTTTGGCCCCCCCAATGACCCAAGCAAATCAGTTAAACTCGTGGCCCCTTACCCTCCAAAAAAAAATTAGCTCATTCACTTGATTGCTTTGTTTCATGTGGAATGTATGTGCAGTTCCCACTGTGCTACTCCTACTACTAATCCATTGATTACAAAGCAAGGCAAAAGCATATGGGTAGAAAGCAAACAAAAAGACCTTGTATTTTAATTCTAATTTAAAATCCTATGATAATTGCTAATAATCATGAAGCATATATAGGTATACTCCAACAGGTCGGTCACCCCAATTCAACTCTCCCACACCAAAACCATACTCTTGCGACACGTTCATAACGCTCATCCATGATATCAGCATGAAGTGTGATCATAACCCACAACACACAAAATACAAATTCAGGATACAAGTATGCAAAATTTTATATCCATAAACAGTAACAACATACAAAATCTTAAATAGTGCTTATAAGAGTATGTATGTGCCTAACACACATATCGTCCTAAAATCAATTTTCACATGTTTCTGTCTAAAAGTTCTCGTAAACCTGTGCAAATTCCAAATTGAAAAGAAAAAATCAATAAGAAACTTTGAGAGCAACAGCTGCAACATTTTCTGTCTCACACACAAGCCTCTCTCCAACACAGTTTTGGAGATCTCGTTTTAGCTAAGTGGTACATCACGTTCCGTTATCCGCCGCCTTGCTTGCTTGATGTTGAGTGCTGAAAGTACTCTAAACTTTTATCAAACACTTGATAAAATATTGAGATGTATCAGTATTGTATTGTATTTGTATGTGATAAACGCCAACTTCAGTTTCACGTCAGTCTCTTATATGTCCATTTAGTCTTTCTCTCCCTCCCTTCTTTGCATTACAATTCTATAAATACCACACCTTACCTTGTTACTCACCACCTTCATTTTCCATTATTGCTCTTTCACTCCACCTTTCTTCCTTGCTCTAGAAAGC


Gene Sequence:
>Vu_33494(-)
ATGGCAGATAACAATGTCAACCTCCCACCCGGCTTTCACTTTTATCCCACAGATGAAGAGCTTGTCGTTCATTTCCTTCAAAGAAAGGCAAATCTTCTACCTTGCCATCCAGATGTCATCCCTGATCTTGAACTCTACCCTTATGATCCTTGGGAACTTCACGGTACATATATTTTATTCTTTATTACTTCATGTCTCAATAGAAAGGTTCAAATTTCTTTTGAGGGAGGTGAGCATGTTTAGTATACAACAATGTCTTAAACACAATTGTTTTTGAAAGTGAATGCTATTTAGGGTCAATTTGAAAATCTCAATACATGAGAAAATTTCATGCCAATTTGACATGAAAAATAGGTAGAGAATAAATGAAAGTTGGTGTGTTTTAATCAATTGTGGGTGGGTGGTTTTGCATTGCTGCAGGTAGAGCTTTGGCAGAGGGAAAGCAATGGTACTACTACAGCAGGAGGACACAAAATAGGGTCACTGGGAATGGCTATTGGATGCCAATGGGAATGGAAGAGCCAGTGATTACAAGCTCAAGCAACAAGAGAGTTGGCATGAAGAAATATTATGTTTTCCATGTGGGAGAAGCCCCTGATGGTAACACCACCAATTGGATAATGCAAGAGTATCGTCTATTAGATTCTGCTTCCTCTAGCAGATCATCCAGAAGAAGACCACAACCAAAACCGGTTAGTACGTAGTGCAGTACAGATAGTACATGAAAATTTTACCCAAAAATTGAAATTTGATATGTGTACTAATGCTTTCTTGGATAGTAGATTGTTTATATATTAATTTGATTTTCTTTGGTTGTTTGATTCAGGATCACAGTAAATGGGTGATATGTCGAGTTTATGAGCGGGATAACGATGATGATGATGGTGATGGAACAGAGCTCTCTTGTTTGGATGAAGTTTTCTTGTCATTGGATGATCTTGAGGAAATAAGTTTGCCAAATTAAATTATGCAAGTGATCTAGTTAGCTACATTACATATCCAAATGGGATATTAATTTAAGCTAATTTTGTTGTTATCATGATCATTATTATTATAGATATTTACTGGTTGTAGTTAAAGCCTTTAGCAGTTTAGCTTCCATTGTAATCAGTGAAGTCGCTATAGCTAGATTTCCACATAGCAGCCTTTCAAGTGGGGCACTAGGTGAAACTCATGGGCAAACCAAACAATATGCAGTGTGACGTTATGCTTTCAAATATCCCATTCACTGGCACAGGTCAATCTTGGAAATTCCATGCTCTTTAG