Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33455 LG9 42579248 42582082 PREDICTED: G-box-binding factor 4-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04075 Plant hormone signal transduction [PATH:ko04075]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 42580033 intron_variant
G/T 42580048 intron_variant
A/G 42580446 intron_variant
A/T 42580562 intron_variant
G/C 42581761 3_prime_UTR_variant
A/G 42582019 3_prime_UTR_variant
G/T 42582022 3_prime_UTR_variant
A/T 42582025 3_prime_UTR_variant
C/T 42582033 3_prime_UTR_variant
T/A 42582072 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33455.1
MASSKVVVSTNPDLPRDSSISPLSSLLLSDLHHSTSMDDLLKSITPSAAKTVDDVWKEIVAGAHPHHPAAAVSGDRNAATVNATAPEGYEAITLEDFLTKAGAVREEDVRGVLPPSSSLPFPLPLPAEGSSSSVEPFGNGVAPTNSVPKGKRRVVEEPVDKATLQKQRRMIKNRESAARSRERKQAYTSELEYLVHQLEQENARLVNEEAEMRRQRKKQLLEYIIPVEVMPKPRKKLRRVNSAQSL*


CDS Sequence:
>Vu_33455.1
ATGGCGTCGTCGAAGGTTGTTGTCTCGACGAATCCGGATCTGCCACGCGACTCTTCTATATCTCCCCTTTCCTCTCTTCTCCTCTCCGATCTGCACCACTCAACCTCCATGGACGACCTTCTCAAGTCCATCACCCCTTCAGCCGCCAAGACCGTCGACGATGTCTGGAAGGAGATCGTTGCCGGCGCTCACCCCCACCATCCAGCCGCCGCCGTCTCCGGAGACAGAAATGCCGCCACCGTCAACGCCACCGCCCCAGAGGGCTACGAGGCTATTACCCTGGAGGATTTCCTCACCAAGGCCGGCGCCGTCAGAGAGGAGGACGTGAGAGGGGTTCTGCCCCCTTCTTCCTCTCTCCCCTTTCCTCTCCCTCTGCCCGCCGAAGGCTCATCTTCCTCCGTTGAACCCTTTGGAAACGGCGTTGCGCCCACCAATTCGGTTCCCAAAGGGAAGAGAAGGGTCGTGGAGGAACCGGTGGACAAGGCCACGCTTCAGAAGCAGAGGAGGATGATCAAGAATCGAGAGTCCGCTGCTAGGTCCCGGGAACGCAAGCAGGCTTATACATCGGAGCTTGAGTATCTGGTTCACCAGCTGGAGCAAGAGAACGCCCGGTTAGTTAACGAAGAGGCTGAGATGAGAAGGCAGAGGAAGAAACAGCTCTTGGAGTACATAATTCCAGTTGAAGTGATGCCTAAACCTAGAAAGAAACTTCGGAGAGTAAATTCAGCTCAATCATTGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_33455::LG9:42577248-42579248(+)
GATTACCTATCAATTTTCCTAGGTCTTATACCATCCAATCTCAATCTCAAGTAGAGAAGGGTAGGGGTATCTAGTAAGAGGAGCAAGATCTCCTAGTTTATGGATTTTCCCTTGCCTTAAGACGATTGACAAACTAACCTTGTGTGTGGTAGCTTGGGAGGACAAATTGTTTCACTTCAAATGAATAACTCGTTAGAGTATGATATCAATATATGTATCTAGATAGTCAAGTCTAGAATTTATTATTGTATGTCTTAGGATTTGTTGGTATATCTTCGCCTATGAATTAACATTTACATTTTGTGTTATATATGTATACTCTTTTGGTATAATTAGCTTACTCTTCTATTTTTGTTTTTTTTTTTTTGAGTTTGTATTCTTATTTGTAATGATCAACTAATTGATGTGAGTAGATGAAAATGTGTTGCTTACTACGGTCAGGATGATGATAATATAAGTGTTGAATAAGATGTGGTTTTCTTGTTTTAGCAGTTTTTAATATACTCTATTATAATTTTTATTTAAAGTGTAATTATTCTGAGTAGTTTAAGACCTAGATATATTATGGTGTTATGGTTATATTTAAATAATTATAATAATAATTTATTCATTTTTTTGAGTTAACAACTTTTTTATATTAAATTTATAATATTTTTATAATAGTTAAATATTATTAAAAATAGATGTTACACCATTAATACTTTGTATTTCACATAACAAATGTGTGTAAAGATATATTTCATGTAATAATAAATATTTTAGAATTAAAATATAAAATAATAAAATTGACATAAACAAATATTTTATTGTGACACCAGAAATTATAATTATTTACTAGTCTTTTATAATACATTATATATTATTAATGTATCATGTGTGCATTACAATATTTTTTGTTTTTTTTTCTTTATAATTGAAAAAGTTTAGATGATATGTTATATATGTAATTAAAAAAACTCATTTAAATATATATTTATCTTTTTTAACAAAATCAATATATATTTTAAGAACATATATATACAAATAAATATATATTTTTATAATAAATCATATATATTAACTGTGTTTTAAATAATAATAACAATAACTTTTTTTAATATTAGATTTTATTGTACTTGACAATTTTCTTTCATAGGGAAGAAAACCTCTTCAAAATATGGTTTCTTGATAAAAAAAAATGAAATAAACGTTTTAATTAAATCATGTTTGATTTTACATGTTATAATAACAATGATATCATAATTAATATAATTTATTTTTTCCTTTAATTTATTGACAGTTTTATTTTTATGCTCTTTCAGTTGATATTTTGTTTTTTTTTATGTTTATTGGCATTATATTATAATAATATATAATTTTAGTTTTTAATGATATTAAATATTTAATATTATGATTTTATCAATTTATAAATAAATATATTTACTATATTTGTAGTACTATTTTTATTATTATATTTGAAGTTAAAAATAAGAAAAATTAATTAAAGAAAAAAAAGAAAAAATTGTACCTAAATTTATAATATATGTCAGTTGCTAGTGTGATCTAGATACATACAGAGAGAAAATGCGTATATTATTATTATTATTATTTAAATTATTTAGCAATGCAAATTTGTCTACCCTGCCATTTTGACAAAATAAACTCTTAGAAGTTTTTGCAGTTCCGTTTGAATGGTACTTAGTATTTCATATAAAGAGATATTAGCATGAAGAAAAGACATGAATAAGGAATTAGACGAGAGAAGAGGAAGTAGTAAAAACAGAGAAGTAAATCACGAAAGACATGTGAGCGTTGAAGAGAAATAAGAATGAGATTCATTAATGGCATGTAAAGTGAAAGGAGAGAGTAAGTAGAAAAAAATAACATAAAGAAGAATAACAAGTACATAATCCATGCTTTGCTTTCTTTTTTGTGGGGTTTGTGCCCAAAACTAAAGAAGAAAAAAACATACAGTGAAAGGGTGAATAGATTAATAAGAAAAGAAATGGAAGTAGTCTGTA


Gene Sequence:
>Vu_33455(+)
AATCTTTGGTGACAGTTGAAGTGGAAGAAAGAGAAAGAAGAAGGAAAAAAAGAAGGCTTGAAAAGCGGCATGGCGTCGTCGAAGGTTGTTGTCTCGACGAATCCGGATCTGCCACGCGACTCTTCTATATCTCCCCTTTCCTCTCTTCTCCTCTCCGATCTGCACCACTCAACCTCCATGGACGACCTTCTCAAGTCCATCACCCCTTCAGCCGCCAAGACCGTCGACGATGTCTGGAAGGAGATCGTTGCCGGCGCTCACCCCCACCATCCAGCCGCCGCCGTCTCCGGAGACAGAAATGCCGCCACCGTCAACGCCACCGCCCCAGAGGGCTACGAGGCTATTACCCTGGAGGATTTCCTCACCAAGGCCGGCGCCGTCAGAGAGGAGGACGTGAGAGGGGTTCTGCCCCCTTCTTCCTCTCTCCCCTTTCCTCTCCCTCTGCCCGCCGAAGGCTCATCTTCCTCCGTTGAACCCTTTGGAAACGGCGTTGCGCCCACCAATTCGGTTCCCAAAGGGAAGAGAAGGGTCGTGGAGGAACCGGTGGACAAGGCCACGCTTCAGAAGCAGAGGAGGATGATCAAGAATCGAGAGTCCGCTGCTAGGTCCCGGGAACGCAAGCAGGTACATACCCTTCTAACGTGTTTGATGTTAGACAAAGGGCTAATCTTTGGCAGAGTAGGTTGGGATGAAATCCTTGTTCGAAATGTGTTCACTTTTATTGAACAGGGATTCTTGTGGGAAGTCCAAAATCTTTTGTTCAATGTGGTTTCTAGTTTCGAGGTTGGATTTAGCTGATTGGGATTGGGAACCATGTGGATTAAACTTAGGATTTTTGTCTTGTTTTGATTTCTGGGTTTTGTTCTGGAGCTTATTCTTTGGATGTTCCTTTACTGTGCAGGCTTATACATCGGAGCTTGAGTATCTGGTTCACCAGCTGGAGCAAGAGAACGCCCGGTTAGTTAACGAAGAGGTGAGGGTTTGATGATTTTGTTTTTGTTTATTGAGCTTCTTATTTTTTCAGTATTTGTTAATCATGTCTTGTTTAGTTGTTGTATGGTACATCCTTTGGCAAAGGCGATGTAAGGTTAGTCTTATTTCCTGTTGAAAAAAAATTAAAGCTTGTAAAAACGCTTTAGGTTCTTACTGGGTAGCCTATGCTTCTAAACTTCTAATTGCAGTTATCAGAAAAAAAAAAAAAGGATGGGAATAAATGGTTAGTGCAGTTGGAATTTTTATTCTTTTTTAGTTTGCGCTGGGGGACTCTTGTGTTGAATGATTAGTTTTGTTAAAAGCATAGAATTGGTTTGGTTCAAGCAGTGATTGGGGAGATTCTATTATATGAATATTCTTTGAGTGCAGTTGTGGATTGCATGATTTGGCTTTCTCTATTTGACTGATGAAAGTTGAAACTTCCCTTAGGTTAATACAACTTTATTTGTGAATTTGAATCCTGTCTGTTGTAAACCTTTATTTTGTGGTCAAAGATTGTTTAATTTTGTGTCTGCAATCTGAATTGTTTTCTATTGGATTTTGAAATATTGGGTCTTGAATGCAGGCTGAGATGAGAAGGCAGAGGAAGAAACAGGTCTGTAATGGATATCCTCTCTTTTAGACATATTCATTATCTGATATACTTGAAACTGTGTTGTGATAACATGTATTCATTATAGAAGCGAAGTTATATTAATTTATTTTTTCTTAGAAACGTGGATTCAACAATAAGCATAAGCTTTAGTTCTGAGATAAAAATTATACTAAACTGTCTTAAATGCAATCTATACTCTCTTTTGGGATTAGTTTTTGTCTGTAGTCATCCTTTTCTGCTTGAACTTATTTACTTGCCCTTATCAACTAAACTCTGCATAATAGTGACCATGACTTTTATTCTTATTCTACATTGCATAAAATGTTATGTCTTCTATATTGTCCCTACTATCATACTTATTGAATAGATATCCCTTACTTTCATTACACTTTCATATATTCTTAATTTACACTTTATACATACCGATTTATTGAACCTGTTGTTTATGACATCGGTGTCTAAATTTTATACTTTTTGGTTGAATTTGTGCATCAGTAGCAGAATTTCTATATAACATCTCTTGTGATGAAATAGTCTCTTATCTTCCTGTTTTGCTAGCCTAATCGATTGATTGTTTCTAATTATATAATCTTCTTTTTTGAAGAAATAGATCTATATAATTTATACACCAAGAATGACGACCTCAAGAAGTAGTAATAACAGAAAAATGATATAACCAAGTTTGGAACCTTATGTGTACTGATAATCTAATCTCTATATTCTCTAATTTCATTTCATGTAGCTCTTGGAGTACATAATTCCAGTTGAAGTGATGCCTAAACCTAGAAAGAAACTTCGGAGAGTAAATTCAGCTCAATCATTGTGATGTTTCATCACCCATCTGATCAACAAACTAGGCTGTGACTTGGTGTAGATATAAGGAGGGAAAGATTTAAGAGATTGAATGTCATTGCATTTGCAGGTTGTCGGAGTTACATTGTATAGAAAAAAAAAAAAGCTGGAGTCAATTAATCCAAGTAATTTAATTCAACTAGAAAGTATTCTTCCACTGATCTACAAGGAAGATCCATGGTTCTGGGTGAGGTTTGTCAGGATTAGGCCTTGTAGGAAGAGTTCAAATAAAAGTTTGTGGTGTGATAATTTAGGCAATTTGGATGTCATGATTAGTGGATGAGTTACATGTCAGAGGATTCCATGAATAGTGTTTAGCAGATTTCATGTAAACGGAAAGATCACCTGAATGTCACATGATTAAGACAAGTTACTTTTGCAAAATTATCTATGTC