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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33418 LG9 41478011 41483043 somatic embryogenesis receptor kinase 1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 41480350 intron_variant
T/A 41480501 intron_variant
G/A 41481499 splice_region_variant&intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33418.1
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CDS Sequence:
>Vu_33418.1
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Promoter Sequence:
>Vu_33418::LG9:41483043-41485043(-)
AGATTGAGTCAATTACTTTGTGTTGATATGAGAAATTTTAATAATTCTAGAAAATTATGTGATGTTTGAATTATTTGTAATATTTTTTTTAAATATTTGGTTTAAATAAGTAATTAAAACATCTTCTATTTCCAAATTTTCAATAATAATTTAATTTATAATTTGTATTAAAGAAAACATATTTATCAATAATTAACTTTGGAAAATATTTAAAACTTTAAAAGTAAAAAATTAAACACATTTTGAATATTAGTCCATCATAGGAAGAACTAGCCAACTAGAAAAATTATTATCTGTCATCCATTTTTCTAAATTATTTTTCAGGATAAATATTCTTACTTTGATCGTATTATCACCTAAGAGAAAAAACATAATTGTGGGAAAATGATAAAAAAGCGAGAAGATAAAGTCCTATTAACTCCAAACATTCTAGATCAGTTACTAAAATAATTGATATAATATTCAATTTACTATATTAATCATGAAAAAAAACTGATACATAAATATCTATGATATTACTTTTGTTTCTAGTTCAATACATGCAACATATTGTTTCTGCTAGTTGAGCATATGTAACATGTGATCTTTTTATTTACACATGTATTTGATAACTATTGTTTGAAAATTAATGTGGCAAGCAATTTTTGGAAAATATTTTTTTCTGCATTAGTTTTTTACATATAAAATTGAAAGGGAGCATTTATGAAATTGTAAATAAGTATTACAAAAATAGAAATTTTTGTTCTTATTTTAAATTTATAATTTCTTAAAGATAAAAAAATATTTAAATTATTTTAACTCTTGATTTCTAAAGTAAAACTATTATATAAGGTAAAATCGATTCGCAATTGCATCTTTCCATAAAACTTAAACCTAAAATTGTTTACAAAATTTAACAATATCTCGATTTATTGTACAAATTTAACATAAAATTTATGGTTAGTTATTAACAAGAAGTTAGACATATAGTAAACAGTATAAAGTTATCCTATTTGAATTAACTTAATCAGAGTTTAAATGAAAGGGTTCCTGCATTACTAAGCAAAGAAAGAGACACAGTGTAGCACAATGGACCATTAGTTCATGAGCTGCAGATTGCAGAATGTGATTTGTTTCGTTGGTTGATGTTTGTTTTTCCCGAATTCTGAAAAAGTTACATTTTCAAGCCAAAAGCAAACAAAGGAGGAGACAATCCAACCACGTGACCTGTCCAAAAAAACTTACCTGCCTGCAACCATATTTTCTTTTTCATCACCACATCCCATTCCCATAATTCTCATGTCTCTCTCTCTCACTCATCAATCCCACACATCCCTTCACACCACAATCTCCTTTTTTTCAAAGTTAAAAAATGCACCAACCAGTTTTCCATCATTATAATAATTTTTGTTCATTTATTTACTTTTATTCCTGAGAAAAGTTTTTGGTCACTGGGTATAGTTGTGCATCTACATTTGTGTCCACCTTGGCCTTTTGTTTTGTCCTCTGTTTGGTTCTTTGTTTGGTTGGGTTGTGAGCGTGCTCCATGCTCACCTCCTTTTTATTTTCTGCAACTGCAAAGAAAGAAGATAATGGTAGTGTTATCACCGGGAAACAACAACGACACACTCACATGGAATTATTTGTGGGGGCTGTCCACACCTCATAGAACCCAAACCCAACGCTCACAGATCTCAAGGATCTCACAACTTCAGCCTTGAACTTGGGTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTCGCCATTAAAGTTTTGCTCTTTTTGGTGTTCTCAGTGCTCACTCCTCTTGGCTGATTCAAATTTTTAGTTGCCAAGTTGGTCTGTGGTGGCAAAAAAGGAAAAAAAAAACAATTTTGGCATCTGGGTTCTTTTTGGCTTGATGTTCATTGAATTTGGTCTAGTGGAAGTTGCTGTTTTGGTGAGGGTGGGGTTGCTTTGTGTGGGAATCTGATTCCAGAGACTGGCTTTTTCTGTTTGGATAAGGTGATATAGACTGGACCTTCTTTGTGGGA


Gene Sequence:
>Vu_33418(-)
ATGGGGAGAGTTGTTGTTAATTATGGTGGCTTGGAGCACTGGTCAGTGGTTGTGTGAGGGAGACACAGTTGAGGAACTAATTTTAGAGTATGGAACTTAGTAGTTTGGTTTTCTGGCTACTGGGGTTGCTGCTTTTGCAGTTGATGGAGATTTCTTCTGCTGCTCTTTCTCCATCTGGCATAAACTATGAAGGTTAATGTTCTTCTTGGGAATTTTTTTTGTTTGTTTTGTTCATTGAGATCTTTGGTAAAACTTGTGAAGTGAAGGTTTGTGAATTGATTATTTAAGGCACAAAAGTTTTGCATATTGACCAATTTAATTGTGCTGGAAACTAGTAGGCACGGTAGCTCGGTGGTTAAGGTTGATGTAATGTAATGATGCTATTTCTGTCTTGGTTTTTCAGTTTTCATTTTCCTTGAGAATTTAAGTGCTACCTAACTATCTATGACAAAATAGCAGCAGAGAGGTTCTTCTTCCTTTTTTTAATAGGGTTTTTCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCCCCATACCTAGGGTGTTGGGGTGGGGTCTTCAGTTTCCTATTTTATTTTATTTTCTTGGCCGATCAATGTTCTTTTTATCTGTTTGCTGGAGGTACAGGAGGATTTTCGGATGAAACTTCTTATCCCCTCTTCTGTTTGTTCCTTCAACAGTTGTAGCTCTGATGGCCATAAAGGGTGACTTGACTGATCCTCACAACGTTCTGGAAAATTGGGATTCTAGTTCTGTTGATCCATGTAGCTGGAGAATGGTTACGTGTTCCTCTGATGGCTCCGTTTCTGCATTGTAAGTTGCTTGGCCTTTAAGTGGGTTCTAGAGTGATGAAGAAGTTTCAAGAGGCGTTGTTTAGAGAGTGAACCATCCAACTTTTGCTAGTTTGATTTTCAACTAAAGGATTTTCTTTTTCTCTTATCAGGGGATTTCCGAGTCAGAACTTGTCTGGTACACTATCTCCCGGAATTGGAAACCTCACTAACTTGCAATCTGTGTACGTCTGCTATTTTTGTTGAGATTCTTTATATCTTGCTTTCGCTTTGTATGGTGGTTGAGTTTGGCATCAGTGTCTTTTAGTTCTTATTGATCAGCTCTATCCTTTCACAAAATCATACTTCCCCGAATTATAAGCTGAATAAGTGAAAAAATTACAACTATGCTTTATTAATTATACACATGCAGGTTGCTTCAGAATAATGCCATTTCTGGTAGGATTCCTGCTGCAATAGGAAACTTGGAAAGGCTTCACACACTTGATCTTTCCAATAATGCATTTAGTGGTGAGATACCCAGTTCTTTGGGAGGCCTCAAGAACCTGAATTATTTGTAAGTTACAAAAAGCACTTCTGAAGAACCTATTGATTGCAGTGATTATGAGTTATTCATTTGCTTTAGCAGTGACTAATGAAATTATGTTTCTTACTCTATGTAAATTATTTTACTTGCACGCCAGGAGGTTAAACAATAACAGCCTTACGGGATCCTGTCCTCAGTCTCTTAGCAATATCGAAGGTCTAACCCTTGTGTAAGTCCATATCACCTTGTTGCACCATTATTTTTCTTTTTGCTTAATCATATTTCTATCTAAAAGACAGTTATGTTAACTCTTATGACTTGAATATGTACAGGGACCTCTCCTACAACAATCTGAGTGGTTCCTTGCCTAGAATATCGGCAAGAACATTAAAGTTAGTTCATTTCGAATTTGCTCGTCTTTTTTTCTTCTGTATTCAAGTTTAAAACAGGGCAGTGTAGTTTATCTCTTGCTCAATTATTTACTGCAGGATTGTGGGTAACCCTTTAATTTGTGGTCCAAAAGCAAACAACTGTTCTTCTGTTTTACCGGAGCCACTTTCCTTCCCTCCAGATGCACTAAGAGGTGTTAATCTATCATTGAACTCTGCTTTCACATTATTATTTCTTTGAATAAAAATATGGCGTGCTTAATGTGGTGATTTGGTTTTCTAGGCCAATCTGATTCTGGTAAAAAAAGCCATCACGTGGCACTTGCTTTCGGTGCAAGCTTTGGTGCTGCATTTGTCATTGTGATTATAGTTGGGTTTCTTGTTTGGTGGCGATATAGACGCAACCAGCAGATATTCTTTGATGTTAACGGTTAGAACTCTCATTTTTCTTTTTATCTCTTATGCTCTCTATCAGTAAACTTTATGGCAAATTTGCAAAAAATGGGTTGCTCATCATTGCACTGTTACAGCACACAATCGTTTAAGGATATTTTTTTCAAGGAATTCACATCTTAGATGCTCGCTTCAATTCATGTTTGTTACACTGGCAAAGTTAATTGACCCACCTTTACCTAACACTAAGCGACGTTGCTTCCAAAGAACTTTTGTCTGTTTCTGACCATTCAACATGTTGCACTGTTTCTAGATTGTTTATATTATTTTCCAACTACTCTAAGCTCATTAAATCAGCTGTAAGACTTATGCATATAATGAAATGGGACTAAAACTCGGTGGTGACCTTTTGAAACATGACGAACAACAGCTGTCATTGTTCTAAACTTTGAAATTGTTGGAAATCTTAGTTGAAAATTTTATTTGGTGTTATGCAACTTCTGTAATGGTTAATCTAGAAGAGAAAAAATTGAGGGTTAACTGTACCACTTGTGGTATATGTAATGTGTCATCATATATGGACCACCTTCTTTGAAGGGAAGTTAACATTGGCATATTATGTGCATTTTGTAGTTGAAAACAGTATCATTATAAATCCATTCCCTAATGTGATATAAGCATACGTTCTGCTCCTATACCAAAATACTGTGTATGAAAGAGCTTTTACTTCGTTCTCTTTCAATGATGTTCAATTGACACTTGTGTGTGTTTGTTATTTGACAGAACATTATGATCCGGAGGTGCGTCTTGGTCATTTAAAAAGGTTTTCATTCAAAGAGCTTCGAACTGCAACAGACCATTTCAACTCAAAGAACATTCTTGGAAGAGGTGGCTTTGGAATAGTCTACAAGGCATGCCTAAATGATGGGTCTGTTGTGGCTGTTAAGAGGTTAAAGGACTACAATGCAGCCGGTGGTGAGATCCAATTTCAAACAGAAGTTGAGACAATCAGTTTGGCTGTCCACCGGAATCTTCTCAGGCTTTCGGGGTTTTGCAGCACTCAGCATGAAAGGCTCCTCGTTTATCCATATATGTCTAATGGAAGTGTAGCCTCTAGATTAAAAGGTTAGATCTGAGCTTTACAATCTGTTGTTTACCTAACCAGTATACTAATAACTGGCTGGACGTACTGTGTTCAGCCTGTTTTATGTCAACTGACAATAATCTGTCATATGATCATTTGAATCTTACAGTCAGATAACCATATGTAGGTATTTAGATTGTGTTAACTGGCCACTTTAGTTAATACTAATACACTCTAGCCTTTTTGTGCCGAGTTCCTATTCAGTCACAGAAAACCTATTACCTTTTTCTGTTCTTAGCTCTTACTTATAGTTAGTTGGTTTGCTAAGATATTCATGAGCTGCTCATGATTAGGGGTAATAATTATAATTCAATTCCACAAGATCATTTTAAACTTATTTGTTTTTGGTTTTGGATTTATGTACCAGATCATATCCATGGCCATCCGGCGTTAGATTGGACTAGGCGGAAGAGAATAGCTTTAGGTACAGCAAGAGGGTTGGTTTACTTGCATGAACAATGTGACCCTAAGATTATTCACCGTGATGTGAAAGCAGCTAACATATTGCTAGATGAAGACTTTGAAGCTGTTTGTTGGCGATTTTGGTTTAGCCAAGCTTCTGGATCATAGAGACTCCCATGTGACCACTGCCGTGCGTGGCACTGTTGGTCACATTGCTCCAGAGTATCTATCCACTGGCCAATCATCAGAAAAGACTGATGTGTTTGGGTTTGGAATCTTGCTGCTTGAACTGATCACAGGTCACAAGGCTCTAGATTTTGGGCGAGCAGCGAACCAGAAAGGTGTAATGCTTGATTGGGTACGTTTTCCACACACTTTCACTCTTTTCAACGTTTCTTTTCTTCTTCACTTAGCATATCACTCTTTTACAAGTTTTAGAATGTATTTATTCCCACAACTTACAATGAATGATTTGTTGGCACTTGGAGCAACTTTCTTCTTATATGCATAACTTGTCTTCCTAGAAATTTTAATGGAAAGAGTACTTGAATAACTTCTCTAAATAGGAGTTAGTAGTAATAAAACAGTTTGGTTAACATTAATACTTACCAGGTCTGATTGTAAGCAACTAAAAGTGAAATGTCTTTATTAGGAAAGAAAACATTTACTACATCATAAATACAAAAGGTATGATATAAATGTTATTTAATAAAAACCTTACATTTTGAGCTGCTTCAAACCAGCCTTTTAAGTGTATGTGTATTGATTAGAAAGCAACATTTCTTTAGCTTAACTTTACTAATGGTATTATTGAATTGAAGTTCTATGAATGCAACTGGATTAAGAAGAAAACAGTGAGAGTTTTGCTGCATTCAATGATCCTAAAAATAAACTTTACCCTCAATAGGGTGGATTAAACCTCCAATATATTCATCAGGGTTGATTGGTGCTGACAAAAATGCTAAAAGAATTGGCCAGTTTAGTTGAAAGTTATTCTCTCTTGTTCTTGGTAAATGGGTGAAAGAGATAAATTTTTGTCTTAAATAACCATTCTTCGGTTGAATGTGAATGAAACAACTTTCAGGTTAAGAAGCTCCACCAGGATGGAAGATTAAGTCAAATGGTGGACAAAGATCTAAAGGGAAACTTTGATCTGATTGAGTTAGAAGAAATGGTTCAGGTTGCACTCTTGTGCACACAGTTCAATCCTTCACACCGCCCCAAGATGTCAGAAGTATTAAAGATGTTGGAAGGGGATGGCTTGGCTGAGAGATGGGAGGCCTCACAGAGGATTGAAACACCAAGGTTTCGGTCTTGTGAGCCTCAAAGATATTCAGATTTAATAGAGGAATCTTCACTCATAATTGAAGCCATGGAGCTTTCTGGCCCTAGGTGA

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