Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33357 LG9 40124110 40127763 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase AtPK2/AtPK19-like isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04012 ErbB signaling pathway [PATH:ko04012]
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 40124511 5_prime_UTR_variant
T/C 40124532 5_prime_UTR_variant
G/T 40125513 missense_variant p.Arg190Leu
A/G 40125626 splice_region_variant&intron_variant
T/C 40125631 downstream_gene_variant
T/C 40125646 downstream_gene_variant
C/G 40125657 downstream_gene_variant
T/A 40125704 downstream_gene_variant
T/G 40125707 downstream_gene_variant
G/A 40125711 downstream_gene_variant
A/T 40127677 3_prime_UTR_variant
A/G 40127702 3_prime_UTR_variant
G/A 40127741 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33357.1
MVSSQFSVLNENSSPKSFLNQLVLPKGPPDLLPSSNSEDFEFSDVFGPSPVEASITVSSEKHGDSTPTRGSGGKICNDPDCINIRSQSLFAPTTCIGQSLQLRKLNLHETEDALDLVEVLTEAQKEIEHSVNNAAVEKNNLHFNDYCLNNQIIGVEDFELLKVVGQGAFGKVYQVRRAGTSEIYAMKVMRKDKIIERNHAEYVKSERDILTKVDNPFVVRLRYAFQTKYRLYLVLDFVNGGHLFFQLYHQGLFREDLARFYAAEIICAVSYLHANDVMHRDLKPENILLDADGHAVLTDFGLAKQFNGTERSNSMCGTVEYMAPEIVMGKGHDKAADWWSVGILLYEMLTGKPPFCGGNRHKIQQKIIKDKIKLPAFLSNEAHSLLKGLLQKDVSKRLGSGSRSSEGIKSHKWFKSVNWNKLEAREVRPSFVPDVAGKHCVANFEERWTSMSLLDSPASTPKKDDTTFKKFSFTGAPVQ*


CDS Sequence:
>Vu_33357.1
ATGGTTTCTTCCCAGTTCTCTGTCTTAAATGAAAATAGTTCGCCAAAGTCTTTCCTGAACCAGTTGGTTCTACCAAAGGGACCACCTGATCTTTTGCCTTCTTCGAATTCTGAGGACTTTGAATTTTCTGATGTGTTTGGTCCATCTCCTGTTGAAGCCTCAATAACAGTAAGCTCCGAGAAACATGGAGATTCCACACCTACACGAGGTTCTGGTGGAAAGATTTGCAATGATCCTGATTGCATCAACATCCGCTCTCAATCTTTATTTGCTCCCACAACTTGTATTGGTCAGTCCTTGCAGCTGAGGAAGCTCAACTTACATGAGACAGAAGATGCATTGGACCTTGTGGAGGTCTTAACAGAAGCACAGAAAGAAATTGAACATTCTGTTAACAATGCAGCAGTAGAGAAAAATAATTTACATTTCAATGATTACTGTCTGAATAATCAGATTATTGGAGTTGAGGATTTTGAACTTTTGAAGGTTGTTGGGCAAGGTGCTTTTGGAAAGGTGTACCAGGTGAGGAGGGCAGGTACTTCTGAAATATATGCTATGAAGGTCATGCGCAAGGATAAGATCATAGAGAGAAACCATGCTGAATATGTAAAGTCTGAGAGGGATATACTAACAAAGGTGGACAACCCATTTGTTGTGCGGCTCAGATACGCTTTCCAAACCAAATATAGGCTGTACCTTGTGCTTGATTTTGTCAATGGTGGCCACCTTTTCTTTCAGCTCTATCACCAAGGCCTATTCAGGGAAGATTTGGCACGCTTCTATGCCGCAGAGATTATTTGTGCCGTTTCTTATCTTCATGCAAATGATGTAATGCACAGGGATCTTAAGCCTGAAAACATTCTTCTCGATGCAGATGGTCATGCTGTGTTAACAGATTTTGGCCTGGCTAAGCAATTCAATGGCACTGAAAGATCAAATTCTATGTGTGGAACTGTAGAGTACATGGCCCCTGAAATTGTAATGGGAAAAGGTCATGATAAGGCTGCTGATTGGTGGAGTGTGGGAATTTTACTATATGAAATGCTTACCGGAAAGCCTCCTTTCTGTGGCGGAAATAGACATAAGATCCAGCAGAAGATAATTAAAGACAAAATCAAGCTCCCAGCATTTTTGTCAAATGAGGCACATTCACTGTTAAAAGGGCTGTTGCAAAAGGATGTCAGCAAACGCCTTGGCAGTGGATCAAGAAGCAGTGAGGGGATTAAAAGCCACAAGTGGTTTAAGTCTGTGAACTGGAATAAATTGGAAGCCCGTGAAGTCAGGCCAAGCTTTGTGCCAGATGTTGCTGGGAAGCACTGTGTTGCTAACTTTGAGGAGCGGTGGACTAGTATGTCTTTGCTGGATTCTCCAGCTTCTACTCCCAAAAAGGATGACACTACCTTCAAGAAATTCTCATTTACTGGTGCTCCAGTTCAGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_33357::LG9:40122110-40124110(+)
AACAATTCGCTCATTCACGTTAAGTTGATTCAAAGTCATTTCTATTTCAATAGACTTATACTTAAAAATTATAAATTATAAATTATAAAATTATAAATATTATTTATTTTAAAAAATAGACTTATAAAATTTATTATTTATACTAATTTAATTAAATAAAAACAAGGTTATTAAAATCTTGCAGAACCAGACAGAGATATTAGCCCACATTTCTTATGGATGGTGAGTCAATCTTTTTTATAGACCAAAAATACGAACTAAAATGAAACATATTAGCCCGTATTACCACCTCTATTTATGATCAAACGAAAAATAGCGTAAATGGTTTTGGGATTTTCAAAAGAGTTTTGATACGAGGTTCGTCCTTATTAAAAAGGTTTAATAGCCAATTTAGTCCTCACTTTGGTTGAAAAATCTCAATTTAGTCCCTCGTTATAAAAGTGTTTTGAATTAGTCCTAACTTTTAAAATAGTGGGTCAGATTGGTCCTTTATGTTAAATATAAGTTAACAAAATTAATGGATGATGATGTGACACAACTTAAAGCTAACGAGGGACCAATCTAACACATCAGCTTTAAGCTGTGTCACATCATCATCCATTAATTTCGTTAACTTATATTTAACGAAAGGGACCAATCTGACCCACTATTTTAAAAGTTAGGACTAATGTAAAACACTTTTATAACGAGGGACTAAATTGAGATTTTTCAACCAAAGTAGGGACTAAATTGGCTATTAAACCTATTAAAAATGATCGATTTGTCTTCTTCAATCCCAGGTTTTAAAGTTTTGAGTTCACAAACTTTTGGAAACAAAGTTGCTTGCTATCTTGAAAAGCTTATGACTTAAAGAGCTCTATGGAATCATTATTATTAGCAACAGTTTGATTCATGAATGTGTAAATGGGTGGCAAATTAGTATTTGAGAGAGAAAAAATCCAATTTAATCTCTAAATATTGAAAAAATACAAATTTAGTTTTGAATTTTATATCTCAATGTCAAGTGGGTCTATAAAAAAATAAAATTTAGTTTCAAATTGATCATATATTTAATCGTCACACTTTTTAAACATTATTAAAGGACTAAATAAGTTTAAATTGATATCAGATTATATTTTAGGGATCAAAATCACCTTAATGATTGTTTGTTTATTAAAGATGTGCGAAATGAGAAATATCCATTTAGAAGCAAATAAGAAAAAATAATGTTTAGCAAAACTTGCGTTTGAAAACTACTTAAAAGAATCAAACAAAAGAAGCAGGACATGTTCATATGCTATGTTAGTTTAGATGTCAATTTATTCCATTATTGAACAAGATTAGATCATCACACGCGTCAATGACAAAAAAAAGTTACAACACGTGATTTTTGGATTAAATAATAATGAATTTAGAGATGAAATTTTGAAGAACCAAAACATGGAATTTGATTTGCATACGCAAAGAAAAGACATGACAAAGAATTGCGTACAAGTACATCCTCGCTGTATGTGTTCTGTTGCTTTGCTTGAGGTTCATTTAATCAGATCCCAAACGCAAAGCCATATATAGAAGTTTCAATTTTAATTCCATTTTCAAATTTTATATATATTAATGTTAATATAAAAGTTAGTGGTAGTAGTTGCAATAATTAGAAAATTCATGTAACATGTTTTGTGGAAAATTTTGAATCATAATTTAAATAATCCTTAAAAAAATTGTTATAAAACACTTTCTATCTTGTTAAAAAAAGTAAAATCTTATTTTAAACGTGTTTTTTTTCTATTAAAATTCATTTTTCAAAACACTGTTTATCCATGTCTTGATACTTTAACGTTGTCCTCTTTTCCTCAAAGTCAACTAATGTTTATCTGTTGTATTCGACACCGAAGCCGTGAAAAAGAATAACCGCCGCCAAAACTAATTTAATGTTTTAAAAAATATTATGAACAGAAAAGAGGGTAGAAAAAGAAAACCTTTATAGTTTCTTTTGTTAACGGCTCTAGCCTTCATTCTCCTCA


Gene Sequence:
>Vu_33357(+)
AATGTAAGTTAGCTTTCAAACTCTGTGTCCAGAATTTGGTCTATGTTAGTATTTGGGTTTTGTTACTTGTTTTGTGAAAAAAACAAATCTTTCCTGCCTTGTGTTTTATGTATGATGATTAAGTTTCCCTCTGGAATGTCTTCTAAAATTATACTTTTGTCCTTGTTCTTTATACCCTTTTCGATTTCTTAATCATTTGGGAGTTGATTATAACCGAAACAATAATGTCTTTTGGAGTTTATGTTATCTCATCATTTGAACTTCTCTGAATTGTAGTTTTCTATCAGTGTTTGTTGTGATCTGCGAGTGCATGTTTGATCCCATGAACTCCCAATCGAGTTTGTTTGGAACCTAATTTGAAACTGCCAAGAGACGATATTCATTGGGTTCCTCCTCCTCCCACTCGCCCTGCTGCAATTTCATTCCTTTTGTTTTTTCTGAGTTTAAATGTTTGTTGCAATCTGTGATGCTTTTGCGTTTGTATTTTTAATTCCCTCCATTCTACACTTTAATGCAAAAACCTTGAATTCACTGTTTTATTGTCCTGAATTGCAGAATTGACAACCGTTCTTCATGAATTTGACAAGTGTTGATACATCCACCGTTTCCTGTAGAGCGGGAAGCAACAACAAATTCCTTTTCTGGATCTTGGTTTGCTTCTTGCTACCAAGTTTTCTAGAAGCTCCTGAAGTATATGTTCATTCCCAATTGATAGAGCTCATTGTTGGGTTTCCATCTTCCTCAATTTGGGGTGTAATCTTTGGGCAAATCACACCTATAGTTCTAAAGTTTCTTGGTCTCATATTCTGCACTCTCCTTGTTTTATCAAAGAGCTATGGTTTCTTCCCAGTTCTCTGTCTTAAATGAAAATAGTTCGCCAAAGTCTTTCCTGAACCAGTTGGTTCTACCAAAGGGACCACCTGATCTTTTGCCTTCTTCGAATTCTGAGGACTTTGAATTTTCTGATGTGTTTGGTCCATCTCCTGTTGAAGCCTCAATAACAGTAAGCTCCGAGAAACATGGAGATTCCACACCTACACGAGGTTCTGGTGGAAAGATTTGCAATGATCCTGATTGCATCAACATCCGCTCTCAATCTTTATTTGCTCCCACAACTTGTATTGGTCAGTCCTTGCAGCTGAGGAAGCTCAACTTACATGAGACAGAAGATGCATTGGACCTTGTGGAGGTCTTAACAGAAGCACAGAAAGAAATTGAACATTCTGTTAACAATGCAGCAGTAGAGAAAAATAATTTACATTTCAATGATTACTGTCTGAATAATCAGATTATTGGAGTTGAGGATTTTGAACTTTTGAAGGTTGTTGGGCAAGGTGCTTTTGGAAAGGTGTACCAGGTGAGGAGGGCAGGTACTTCTGAAATATATGCTATGAAGGTCATGCGCAAGGATAAGATCATAGAGAGAAACCATGCTGAATATGTAAAGTCTGAGAGGGATATACTAACAAAGGTGGACAACCCATTTGTTGTGCGGCTCAGATACGCTTTCCAAGTAAGACTTTTGATCGTATCATATGTTTCAGTGTCAGGATAGGAAAATGGACAGTGATATCATATTTGCATAACGACAACCTTTTTTTGTTGGACTTACAGACCAAATATAGGCTGTACCTTGTGCTTGATTTTGTCAATGGTGGCCACCTTTTCTTTCAGCTCTATCACCAAGGCCTATTCAGGTATTGTAATTTGTAAGCCACATGCTATGACCATATTATGCTTATACATGTTTGTCTCACACAACTTTTGTCAGGGAAGATTTGGCACGCTTCTATGCCGCAGAGATTATTTGTGCCGTTTCTTATCTTCATGCAAATGATGTAATGCACAGGGATCTTAAGCCTGAAAACATTCTTCTCGATGCAGATGGTCATGTAAGATAACATAAACTTACGTCTGTGATTCTGTCTCTCTGCTTTAGGCATGCCACATGCTTGCTTATTTATTCTGAAGGGATTTGTGATTTGTGATTTGTTTCTAACTTCTATCTTGTTGAATTATGGCATATTTATGTGCTTGATATCAGGCTGTGTTAACAGATTTTGGCCTGGCTAAGCAATTCAATGGCACTGAAAGATCAAATTCTATGTGTGGAACTGTAGAGTACATGGCCCCTGAAATTGTAATGGGAAAAGGTCATGATAAGGCTGCTGATTGGTGGAGTGTGGGAATTTTACTATATGAAATGCTTACCGGAAAGGTTAGAATCTTAGTATTTTTTTTGTCTTGTAGTATAAAATAGTGATTGCACTATATTATTATTTTTCCAACTTGACATATCTCTCTCAAGCATTTACTACTGAAGAAGGAGCTCCAATTTCATGGAAATTGTTAGATAAACTTGATTATCTGAAATGCAATTAAATGTTTTCTACTTTCATGAAAATAACTGAAAGTTATTCGTTGTTCATTATGCTTGGATTACATCATTTTACTCAGGTTTTTACTGAAATGGCTTTGTTTCTAATGAATTGCCAAAATAAGTTTGTATGTCTGATTTGCACGAAATTTATTTTGCTTCTGGAGAAAGAAACATAAGCTAACACAATACTATGTTAACTAACCCTAGAATGATGGCTAATGATATCAATCTCCAACTTTATTCTGCTAAGATTATGGTGAATGATTTCTATTAGCCAGTCAATGACCTGTAGCTCTCCGAAAACTATATCTTACATTTCCTTAAATTGTGGTGCTGTGTCAACTTTGATTGTTTAAACATGATTGTATTTGAAAATCCTGTTTCTAAGTGACTGCCAATAATATCATATTGCTCAAGAGATTGAGAAAGTTATCTAGATCATGTGATTGTTTGTGACATATTTCTGGAGATTTACAAGTCACTTGGATGTATTTATCTAAGGCTGATACTTAAGTTTGCTGATGTTTGAGTGAGTTATTGCAACATTTATATCTAGACTTTATTTTAGTGTTTACTCCAATTGCAGCCTCCTTTCTGTGGCGGAAATAGACATAAGATCCAGCAGAAGATAATTAAAGACAAAATCAAGCTCCCAGCATTTTTGTCAAATGAGGCACATTCACTGTTAAAAGGGGTACAGATTTTCTCCTACATCTAATCATTAGTTTTTTCCCCCTTTTGAGTAATATGGTTATGAAAAACACTCACTCTTGAGGGAAAAGGCTTTTGTTGTTTCTGCATGTATGATTCTGAAAAATCCATTACTTGTATGATAGTGAAGTATTCTTTTATTTAGAACCAATCTTTTTATACACATTGGCTTCACAAAATGGAAGTTTTCTTCTTCAGCTGTTGCAAAAGGATGTCAGCAAACGCCTTGGCAGTGGATCAAGAAGCAGTGAGGGGATTAAAAGCCACAAGTGGTTTAAGTCTGTGAACTGGAATAAATTGGAAGCCCGTGAAGTCAGGCCAAGCTTTGTGCCAGATGTTGCTGGGAAGCACTGTGTTGCTAACTTTGAGGAGCGGTGGACTAGTATGTCTTTGCTGGATTCTCCAGCTTCTACTCCCAAAAAGGATGACACTACCTTCAAGAAATTCTCATTTACTGGTGCTCCAGTTCAGTAATGATAGAAATGCATGATTTCTACAATAAATGTCCAATCAGAGCAGCCAATTCATGTAATTTGTGATGGCTTAGAAAATTATATCTCTGT