Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33217 LG9 36080335 36084725 PREDICTED: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO2 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 36080445 intron_variant
G/A 36080451 intron_variant
A/T 36080685 missense_variant p.Phe576Leu
A/T 36080839 downstream_gene_variant
A/C 36080959 downstream_gene_variant
A/G 36081258 synonymous_variant p.Asn524Asn
T/G 36081520 splice_region_variant&intron_variant
G/C 36081526 missense_variant p.Thr508Ser
G/T 36081595 missense_variant p.Thr485Asn
A/T 36081677 downstream_gene_variant
T/G 36081734 downstream_gene_variant
G/C 36081737 downstream_gene_variant
G/C 36081741 downstream_gene_variant
A/T 36081746 downstream_gene_variant
A/T,* 36081930 downstream_gene_variant
T/A 36082122 downstream_gene_variant
A/G 36082123 downstream_gene_variant
A/T 36082132 downstream_gene_variant
C/T 36082168 downstream_gene_variant
A/T 36082169 downstream_gene_variant
G/T 36082177 downstream_gene_variant
G/A 36082192 synonymous_variant p.Cys422Cys
C/T 36082193 missense_variant p.Cys422Tyr
G/A 36082207 synonymous_variant p.Tyr417Tyr
T/C 36082214 stop_retained_variant p.Ter415Ter
T/C 36082219 synonymous_variant p.Gln413Gln
G/A 36082228 synonymous_variant p.Phe410Phe
A/T 36082257 missense_variant p.Ser401Thr
T/C,* 36082284 missense_variant p.Lys392Glu
T/G 36082289 missense_variant p.Tyr390Ser
A/C 36082290 missense_variant p.Tyr390Asp
C/A 36082432 downstream_gene_variant
C/G 36082490 downstream_gene_variant
T/A 36082533 stop_lost p.Ter376Leuext*?
A/G 36082652 downstream_gene_variant
A/T 36082770 missense_variant p.Tyr360Asn
G/C 36082894 missense_variant p.Ile318Met
A/T 36082895 missense_variant p.Ile318Asn
T/C 36082964 downstream_gene_variant
A/T 36083024 downstream_gene_variant
A/T 36083938 downstream_gene_variant
A/G 36084059 missense_variant p.Val99Ala
G/C 36084061 missense_variant p.Ser98Arg
A/C 36084064 missense_variant p.Cys97Trp
C/A 36084452 downstream_gene_variant
T/G 36084455 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33217.1
MAEDNLFDEITRKVLLGSTCSSHGNWVEVKSSFTLSYLNGPLGCWKAEREALWGLNARFGFPLSWQWDDTDCCEWEGVECNSTTGRVAKLDLQRLWSVAFIPSDWHLNYADLVVFKDLKSLNLSRSSGIFDCADSEGWENLEVLDLSYSNMDVTDILVCLNGLPSLKSLYLSYNRFHATFNVFETLSSQLLRLEILDISQNTLTNDMLPSLGGFTSMKELYLSDTGLDSDNHIQGLCSMLKNLEVLDLSGNNFNDSDIASALSQLSSLKSLNLGNTQLTPRSILNISKIRSLEILDLEGNQLNESILRRLENNGFTWPSNLQVLKLSSNSFTNEFLPSLTGLQRLKFLDLNYNQLNGSLDISGLLALTSLEILDLSNNRISSFVVHQDYNMINGSKLRESLQAFSSIRMLSMNNNKITGTITAGDFRDLGNLEQLTLDNNYDLDNEFFRSIGELTSLKVLSVFGCGINGTLPPADNQFEVPVSFTPFANHSNLKFIYGEGNKVILDLQPSEILLPLHPLTKMRRIDVSNNNITGQIPRSIPTRLVELENLSYLDISDNNLTGSVPSFINASVNYIHLSHNRLSGLSKRMFSNRSFLMMLDLSYNEITGSIQDMMQDLAHARLNILLLKGNRFTGRLPEQLCQLGAHSMGLFVEKMHIQGF*


CDS Sequence:
>Vu_33217.1
ATGGCAGAAGACAACTTGTTCGACGAAATTACGAGGAAAGTATTGCTTGGTAGTACTTGCAGTAGTCACGGCAATTGGGTTGAGGTCAAGTCATCCTTCACACTTAGCTACCTTAATGGACCTTTAGGGTGTTGGAAGGCAGAGAGGGAAGCTCTTTGGGGTCTGAATGCCCGTTTTGGCTTCCCTTTGTCTTGGCAGTGGGATGACACAGATTGTTGTGAATGGGAAGGAGTAGAGTGCAACTCCACCACAGGGAGAGTGGCCAAACTTGATCTTCAACGCCTGTGGAGTGTAGCGTTCATCCCATCAGATTGGCATTTAAATTACGCTGATCTTGTTGTCTTCAAAGATTTGAAGAGTCTCAACTTGAGCCGTAGTTCTGGGATATTTGATTGTGCAGACAGTGAAGGGTGGGAAAATCTGGAAGTCCTTGACTTGAGTTACAGTAATATGGATGTCACCGACATTCTTGTTTGTTTGAATGGCCTTCCATCTCTCAAGTCTCTGTATTTATCATACAACAGGTTCCATGCAACATTCAACGTTTTTGAAACTCTGTCATCGCAGTTGCTTAGATTAGAGATCCTTGACATAAGTCAGAACACTTTGACTAATGACATGTTGCCATCTCTCGGGGGATTCACATCTATGAAGGAACTGTATTTGTCTGACACTGGATTGGACTCAGATAATCATATCCAAGGTTTATGCTCTATGTTGAAGAATCTTGAGGTCCTTGACTTGTCTGGCAATAACTTCAATGACAGTGATATTGCATCTGCTCTTAGTCAACTTTCATCTCTCAAGTCTTTAAATTTAGGAAACACTCAATTGACTCCAAGATCAATTCTTAATATATCAAAAATAAGGTCTCTGGAGATTCTTGACCTAGAAGGGAACCAGTTGAATGAGAGTATCTTGAGGCGTTTAGAGAATAATGGATTTACATGGCCATCCAATTTACAAGTCCTAAAGCTGAGTTCGAACAGTTTTACCAATGAATTTCTCCCTTCTCTAACTGGGCTTCAACGTCTCAAATTCCTTGATTTAAACTACAATCAATTAAATGGGTCGCTCGATATAAGTGGATTATTGGCTTTAACCAGTTTGGAGATTCTTGATCTAAGTAATAACCGAATTAGCAGTTTTGTTGTCCATCAAGATTACAATATGATAAATGGAAGCAAACTGAGGGAATCACTTCAAGCTTTCTCATCTATTAGGATGCTTTCTATGAACAATAATAAGATTACAGGAACAATCACTGCAGGAGATTTTCGTGATTTAGGTAACCTTGAACAATTGACACTGGACAATAATTATGACCTTGACAATGAATTTTTCAGAAGTATTGGGGAATTGACTTCTCTAAAAGTTTTATCTGTTTTTGGATGTGGAATAAATGGCACCCTTCCTCCTGCTGACAATCAGTTTGAAGTTCCTGTTTCTTTTACACCATTTGCCAATCATTCAAACCTTAAGTTCATATATGGTGAAGGCAACAAAGTCATATTGGACTTACAACCTAGTGAAATCCTGTTACCATTGCATCCCCTTACTAAGATGAGGAGAATTGATGTGTCCAACAATAACATAACCGGCCAAATCCCCAGGTCTATTCCGACAAGGCTAGTGGAACTTGAAAATTTATCGTATCTAGATATCTCAGACAATAATTTGACGGGTTCTGTGCCATCTTTTATCAATGCTTCGGTGAATTACATCCATTTGAGCCACAACAGGTTAAGTGGTTTATCCAAAAGAATGTTCAGCAATAGATCTTTCTTAATGATGCTAGACCTTAGCTACAATGAAATAACTGGTAGCATTCAAGATATGATGCAAGACCTTGCTCACGCAAGGTTGAACATACTCCTTTTGAAAGGTAACCGCTTTACAGGACGTTTACCGGAGCAGCTATGCCAATTGGGGGCGCATTCAATGGGTTTATTCGTGGAAAAAATGCACATTCAGGGATTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_33217::LG9:36084725-36086725(-)
TTAGGCAGACAACTTCGAGCAACAATGCATCATCGTCATAAACACCATAAAATTATTGGTGGTTTTCCCCCTTAATCCCATTTCACATCCCCAATTACAATGCAACAAAAAACAAAAGAAGAATGATCAATACAAGTAGGGAATAACACCCTTCCTTTGCTTCGGATAATCCTCTCCAAACTTTTCCAAATACCACCTGCGGTTGGCACGTGCCCTGGGCCCGAGGTTAGCAAAAGTATAAAGAAAAAAGCCAAGCCCAGCCCATGACCAAGTCATGACAGCCCAGCCCAACCACTCCACAATCTCCCCAAAGTAATTAGGACACGCAACGAGGTCGAACAACCCTCCCCTGGGCACCACGTAGCCCTTCCCCTCGCTCTTCAGCCGCAGCAAAACCCTATCGGCCCACACATTAATCCCCATCCCACACAAAAACACCAAAAGCCCAATAAAAAATCGGACCCAGAAAAAGCCCGAGGAAGTATAATGGGCGTGGTAGTGGGAGATTGAACGGGTCTGGAGATAGGAATTGAGAAGGTTGAAGACGAAGGCCATGAGGGCGACGGAGAGTGGGAAGCCCGAGGCGGTTTTTCTGGAAGGGGTGAAGAGGAGACGGAGAGGGTAGATGATGGTACGGTTGAAGTAGTGGAGGAGGAAGGGGGTGATGAGGGTTTGGGCTTTGGGGTTGTGGGAGTGGAGACCATGGGGGAAGAGAAGGAGGGTGAGCCAGAGCGTTGGGCTTTCCATGAGGAGCCAGGCGAGGGGGGGCGGGAGGTTGGGCCCCCAGCCGGGCCTGTGGTGCTTGCCGTAGGGGGCTTGGAGGAAGGTGAGGGAGAGGAAGGTAGGGGGTGCAATGAGGAAGAGAGCGAGGAGGGAGTTGTGGAAGAGGGATGCCTCGTCTTGGATCATAATTGTTGCACTGAGAAAGTGAGATTTCAGAGTATGATTACAGATAGTGGAACGAAGGAGTTCTCTTATTATTGTTCTTGGGGTTTGGTCAGACTGTCATGACTAATAAAAAGCGAATGGGGGAATGGGGGATTGGGGGAAGGGGACCTGTGGAAAGGACAGAGGGAAGTTTTCATTTCATGCCAGCATTAATTATAAATTATTATTGCAGTAAATTTATTATCGTCTTACTCTTTCGACTCATTTACATTTTAAAAAAATAATTAAAATAGATTTAATTAAGATTTAATTCACTCATAAATATAAATATTTTTAATTAAATATCTTTTGAAATATTGGTTTTTGATATATTTATATCTTTTAATGATTATCTTTATTTATTTTTTGTTATTTTATATGTCATTTATTATTGAATATGAAAATAATATTTTATATGTTATTTGAACAGTAAATTCATATAACTCAACACAATCTAAATGTCTTGAAATAATATTGTGACTAAAAAGATTAAAAAAATTATAAATAACCTTAAACTACTAGTATATATGTGGTGGAGTCTTTTCAAAATTCCTTCGTCCTCCTTCTTTATATTTTTCATGTTATTTAGAGAAAAATTAAGAGTGAGATTTTTCCTGAGAATATCTAAGATTTTGTATTTTTCTATTTTACAGACAAATGTTTGTTTTGACTAAGTGAAGTTTTGTTTTTCTCTATTATATTTCTTCATCAATCCCTTCTTCTATTTTCCTTTTCTTCTGGTCTAACTCAAATGTTTGTCTTTAGAAATATAGATAAGGAAATAAAAACTTCCATTTTGGGTATACGCTTACACAAAAGTGGTCTCAAAAGGTATTAATTCCCACCATCATTATGATTGACGAGCACAACTTGTTCGACTAAATTACGAGGAAACTTTTTGATATATAATATAATATAACATGTAGAAGAAGTACAAGTAACTTGAGCAAGCTATCCAGGATTGAGATTGTTCAAAATATGGAGCCAAACATCATGAAAAACTACATGACAACCTCACCAGAATTCACCCAAACAGAAAAAAAAGTTATAAACCACCCAAAATCATTGCAATC


Gene Sequence:
>Vu_33217(-)
ATGGCAGAAGACAACTTGTTCGACGAAATTACGAGGAAAGTATTGCTTGGTAGTACTTGCAGTAGTCACGGCAATTGGGTTGAGGTCAAGTCATCCTTCACACTTAGCTACCTTAATGGACCTTTAGGTATATTAAAATAATACTTTGCCAAGAAAAAAAAGCTGAACAATAGAATTTATTTATGTATACACAAAACCGTGGAAGTGATTTCTAGAAAATGTTGTGTTCTTTTCTTTTTCAATTTCGAATTCATCAAATAAAAAATATATATAGATATATTAATATACACTGTTTAAAAGTGTTGATGAAGAGAACAAGCTTAGTAGGAAACCGCGGTCGCCACCAACTTTGACTCAGCCATAAAATAGTTTACTTTAATTGGTTCATTCTTATTTAAACGGCCAAATCCTTTGTTACGAAATATGAAGACGAAAATGAAGAAGGTTAGTGTGACTTTATTGATTTTTGTTTTGGTGGAAGTGATATGGTGTGAAGGGTGTTGGAAGGCAGAGAGGGAAGCTCTTTGGGGTCTGAATGCCCGTTTTGGCTTCCCTTTGTCTTGGCAGTGGGATGACACAGATTGTTGTGAATGGGAAGGAGTAGAGTGCAACTCCACCACAGGGAGAGTGGCCAAACTTGATCTTCAACGCCTGTGGAGTGTAGCGTTCATCCCATCAGATTGGCATTTAAATTACGCTGATCTTGTTGTCTTCAAAGATTTGAAGAGTCTCAACTTGAGCCGTAGTTCTGGGATATTTGATTGTGCAGACAGTGAAGGTTATTCTCTTACACATTCTATTTCTTGATCATTCTTTACTCACTAAAAAGCAAAGTATGAGTAATTATTTCCATTTAATTTTAATACTTTGTAGGGTGGGAAAATCTGGAAGTCCTTGACTTGAGTTACAGTAATATGGATGTCACCGACATTCTTGTTTGTTTGAATGGCCTTCCATCTCTCAAGTCTCTGTATTTATCATACAACAGGTTCCATGCAACATTCAACGGTAAGGATATAGATTATTATGATGATGGCGACGGCGTGATAAGCATCTTTTTAATATTTACTTCAAAATTGGTTGGCTTCTTCTACAACCTTTGACTAATACATTGTATACCTTTAGTTTTTGAAACTCTGTCATCGCAGTTGCTTAGATTAGAGATCCTTGACATAAGTCAGAACACTTTGACTAATGACATGTTGCCATCTCTCGGGGGATTCACATCTATGAAGGAACTGTATTTGTCTGACACTGGATTGGACTCAGATAATCATATCCAAGGTGGAATAATTTTCCCATTTCATTTGTAAAGCAAAGGATACTGATAATAGCTTCAGGATAATATATATACGTATGTAAGACACTTTACCTTGCAGGTTTATGCTCTATGTTGAAGAATCTTGAGGTCCTTGACTTGTCTGGCAATAACTTCAATGACAGTGATATTGCATCTGCTCTTAGTCAACTTTCATCTCTCAAGTCTTTAAATTTAGGAAACACTCAATTGACTCCAAGATCAATTCTTAGTATGTCACACTTCCTATAATTCAAATCTTCGTCGTTGCTTTTGGTTGAAAATATATGTGAGCGTGATCAGTTTATATGTTGCCAGATATATCAAAAATAAGGTCTCTGGAGATTCTTGACCTAGAAGGGAACCAGTTGAATGAGAGTATCTTGAGGCGTTTAGGTTAGTTGTCCTTATTCTTTACTTAATTAGAGTAGATTTGACTCTGAAAATATTCATGCTCCTTCTTTAGTGTGTACACTCATTACCATATGCTGTCAATTCTGTTTTTATCAGAGAATAATGGATTTACATGGCCATCCAATTTACAAGTCCTAAAGCTGAGTTCGAACAGTTTTACCAATGAATTTCTCCCTTCTCTAACTGGGCTTCAACGTCTCAAATTCCTTGATTTAAACTACAATCAATTAAATGGGTCGCTCGATATAAGTGGTTAGTATAATTAATTTAATGTATTCGATTGGTTGATCACGTTGGCAGTGACTTCTCGTAATAATTATTTTATGGCGGTTGGACTTAGACTGTGAAACAGAGAATTATTTTTATGTTGTATTAGCAAAAGAGTAATACTCTTATTCTCTGAATGATTATAACATCCATTCTCTGTTTGTCTCTAACAGGATTATTGGCTTTAACCAGTTTGGAGATTCTTGATCTAAGTAATAACCGAATTAGCAGTTTTGTTGTCCATCAAGGTATTTAAAGCAATTGATAAATAAAGTCTTAATCGGTTGTCTTCAGAATACAATTTTAATCCTGTTGGAAAGCATGTTATTTATTTCTTTACTGTGTTTAGTTGTTGTATTTGCTATTTCATGTTTTTCCAAATTAAACACCATTTTCATGTTTTAGTTTCAGGCTCAAAAAGTCTAAGCAAATTGGATGTCCTTACCTTAGATTACAATATGATAAATGGAAGCAAACTGAGGGAATCACTTCAAGCTTTCTCATCTATTAGGATGCTTTCTATGAACAATAATAAGATTACAGGAACAATCACTGCAGGAGGTAGAAATACTTTTGATTGTACTCTAAACTAAATTAGTTTCATTGTTATACTAATTATAACTTTATTTTCCATTGTGCAGATTTTCGTGATTTAGGTAACCTTGAACAATTGACACTGGACAATAATTATGACCTTGACAATGAATTTTTCAGAAGTATTGGGGAATTGACTTCTCTAAAAGTTTTATCTGTTTTTGGATGTGGAATAAATGGCACCCTTCCTCCTGCTGGTAATTAAATTTGTCATTATAGTTTTTGGATTTCCTCGTTAAGCATCACATATTTATCCTACACTTTTTTTCTCTGAAAATTTATATCATTTACACCGTGTTCTCATTAAGATGATTTATATTTTCAAAATTTCATATTGCAGATTGGTTTAAATTGAAGAATCTCGAAGAGTTAGATCTAAGTCAAAATCTATTTGTGGGATCACTTCCTTCTTCTTTCTTAAACATGACATCTCTCCGAAAGTTGGAACTTTCACGAAATCAATTTAGTGGAGAATTTGATTCTAATATTGCTAGTCTTACATCACTTGAATCTTTTGGTTTTACAGACAATCAGTTTGAAGTTCCTGTTTCTTTTACACCATTTGCCAATCATTCAAACCTTAAGTTCATATATGGTGAAGGCAACAAAGTCATATTGGACTTACAACCTAGTATGCAAACTTGGATACCTAAATTTCAATTACAAGTGCTTAGTTTGCCTTCAATAACTGATATTGATTCTCTTCCGCTCCCCAGGTTTCTTCTATATCAAAACAATTTGACTAGCTTAGATTTCTCTAGTTGGAGGTTGGAAGGAAAGTTTCCTCACTGGTTGTTTAACAACAACACAAAATTGACTGAGCTTCTTGTTAGAAATTGCTCTTTCACAGGTGAAATCCTGTTACCATTGCATCCCCTTACTAAGATGAGGAGAATTGATGTGTCCAACAATAACATAACCGGCCAAATCCCCAGTAACAATATTAGTTCAATTTTACCAAATTTGCAATCTCTAAACTTGTCCACAAATCACATCCAAGGTTCAATTTCTCCTGAGTTTGGGAAAATGAGCTTATTGCAGACTTTGGATTTATCAAATAATCATTTATCAGGAGAGATTCCAAAGAACTTATCCGGGCATGGGTCATTGCTTAAATACTTGAAACTTTCACAGAATAAGCTAGATGGACCCATATTTCCAACTTTGAAATACTTGGAGGAGTTGTATTTAGATTACAATAGCTTTTATGGTAGCATACCAAGTAGCTTTCTTGACTCATCTCTCATTCACTTGGATCTAAGCTATAATAATTTAGTGGGGAAACTACCAAGTGTGGTTGGAAATTTGTCATACTTGCAAACACTTTCATTGTCCAACAATGATCTTGAAGGGTCTATTCCGACAAGGCTAGTGGAACTTGAAAATTTATCGTATCTAGATATCTCAGACAATAATTTGACGGGTTCTGTGCCATCTTTTATCAATGCTTCGGTGAATTACATCCATTTGAGCCACAACAGGTTAAGTGGTTTATCCAAAAGAATGTTCAGCAATAGATCTTTCTTAATGATGCTAGACCTTAGCTACAATGAAATAACTGGTAGCATTCAAGATATGATGCAAGACCTTGCTCACGCAAGGTTGAACATACTCCTTTTGAAAGGTAACCGCTTTACAGGACGTTTACCGGAGCAGCTATGCCAATTGGTAGATTTAAATATACTAGACCTTTCTTATAACACTTTTTATGGTCCAATACCCAATTGCTTAGGTAAAATGCCTTTTGAGAATGATGACTCATTAGGGGGCGCATTCAATGGGTTTATTCGTGGAAAAAATGCACATTCAGGGATTTTGA