Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33208 LG9 35754906 35758094 PREDICTED: transcription factor MYB108-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 35754977 missense_variant p.Gly356Arg
G/C 35755045 missense_variant p.Ser333Cys
G/T 35755048 missense_variant p.Pro332Gln
C/T 35755130 missense_variant p.Val305Ile
T/C 35755146 synonymous_variant p.Ser299Ser
G/C 35755161 missense_variant p.Asn294Lys
C/G 35755183 missense_variant p.Ser287Thr
A/G 35755227 synonymous_variant p.Ile272Ile
A/T 35755228 missense_variant p.Ile272Asn
G/C 35755302 missense_variant p.Ile247Met
G/C 35755307 missense_variant p.Leu246Val
A/T 35755740 intron_variant
A/G 35755777 intron_variant
T/G 35756531 intron_variant
T/G 35756701 intron_variant
T/A 35756703 intron_variant
T/A 35757213 intron_variant
A/C 35757224 intron_variant
T/G 35757386 intron_variant
G/A 35757711 synonymous_variant p.Ser128Ser
C/G 35757726 synonymous_variant p.Val123Val
T/G 35757769 missense_variant p.Asn109Thr
A/T 35757781 missense_variant p.Val105Glu
A/C 35757909 missense_variant p.Asn62Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33208.1
MEFDPCFQGPQYLSSICPKIPYLNPHAQNMFPSQSSIFIPPSQPIMFNPNHVFHHFQDHIVNVPPFVMDGSNPIVTPMYGNGIPTPSFGDGSFANINSHQPVMLVPKNNSKIEALYDDHKGKVIWDFSQKTMVHPFEASSPNSPSPFCLSNEYGLGMSEFHRDTDRRMVEVENNTHNATHNIIKGQWTPEEDSGLVELVNQFGPKKWSEIAKLMCGRVGKQCRERWHNHLRPNIRKESWSLEEDMILIKAHQEFGNRWSEIAKRLPGRTENSIKNHWNGTKRRQSCRSYNGSKKNPYEGSMLRAYVKRVTAMEESTKVLKKATSKKNLLRFDPSTNEMFIGNSSNYAPLQVKNNNIGVSYGAIGTNAINRGMNPISTKY*


CDS Sequence:
>Vu_33208.1
ATGGAGTTCGATCCGTGCTTTCAAGGGCCACAGTACCTATCTAGTATATGTCCCAAAATCCCCTACTTGAATCCACACGCTCAAAACATGTTTCCATCCCAAAGCTCCATTTTCATTCCTCCATCTCAACCCATCATGTTTAACCCTAACCATGTTTTCCACCATTTTCAAGACCACATCGTGAATGTCCCTCCGTTTGTGATGGACGGTTCCAACCCCATCGTAACCCCCATGTATGGGAACGGGATACCAACCCCTTCTTTCGGTGATGGGTCTTTTGCTAACATTAACAGTCACCAGCCTGTGATGTTAGTACCCAAGAACAACAGCAAAATTGAAGCTTTGTATGATGACCATAAAGGCAAAGTGATATGGGATTTTTCCCAGAAAACCATGGTTCATCCTTTTGAAGCGTCTTCTCCCAACTCACCATCTCCTTTCTGTCTCTCTAATGAGTATGGATTGGGTATGAGTGAATTTCATAGGGACACTGATCGAAGGATGGTAGAGGTGGAAAACAATACCCACAATGCTACTCATAATATAATCAAAGGACAGTGGACTCCCGAAGAAGACAGTGGTCTTGTGGAGTTGGTGAATCAATTTGGACCGAAGAAATGGTCAGAAATTGCAAAGTTGATGTGCGGCAGAGTTGGAAAGCAATGTCGAGAAAGATGGCACAATCATCTCCGGCCAAACATTAGGAAGGAGTCGTGGAGCCTGGAAGAAGACATGATTCTGATCAAAGCCCACCAGGAATTTGGCAACAGGTGGTCAGAGATTGCTAAGAGGCTACCTGGAAGGACTGAAAATAGTATTAAGAATCATTGGAATGGAACCAAGAGACGCCAGAGTTGCAGGAGCTACAACGGGAGTAAGAAAAACCCTTACGAAGGATCAATGCTCCGTGCTTACGTTAAAAGGGTCACTGCTATGGAAGAATCTACAAAAGTGTTGAAGAAAGCCACAAGCAAAAAGAATTTGTTGAGGTTTGATCCATCTACAAACGAAATGTTTATTGGAAATAGCAGCAACTACGCGCCATTGCAAGTTAAAAATAATAATATTGGGGTTTCATATGGTGCAATTGGAACGAATGCAATCAACAGGGGAATGAATCCGATAAGTACAAAATACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_33208::LG9:35758094-35760094(-)
ATATTATAAGTGAAAAGACTAGTAGTGATCGGGTTCAAGAGTGGGGTAGATGTGAAAAACTACATTTTCTTAAAAATAGTTTGTTTTATTGCGTATATTCTCTCGTTTTGATTTTATGAACTTGGTGTTTTAAAAGACTTTTTAAGAAAATATTTGAGAAATATTATAATATAATATGATAATTATTATTGTGTAGTTTTATGTTTTATATCAATATATTGAACACTTAAATTAATAAACGATTTTCTATTAATTTGAAGTGTCTGTATCATCTGATTAACCGAAAAGTCTAACACTTACAACTCAATTGAAAAGCCTTAAAGTTTTTAGAATTCAATATTATACAAAACAAATTTAATAAGGACTCACAAACTTATAAAAAAAACTACTTAATTAAGCCTTTTATTTTTTATTTAATGCACTTAATTCAAAATTACGTATTTTTTAAAATTTATTTTTCTTATTTGCATCGGTCCAATCAATGATTAATGTATTTTTTTTATATTGTCTAACGTCGACTAACTCATGCTTATATTAAAAAAAATATTTTTTTACCAGTTAAATCCACATAGAACTTTTAAGTATTTAATAATTTTTATTAGGACTTACATGGATTACAGGATACTAAAGAATTTATTATTTATTTTAAATTATGAAATTATTTTTTATTTTAATAACAGCAAATTTTTACACTCCTAATTCAATTGAAAATTTAAAAATTTTTTAAAATCCAATAGAGTAAAAAAATTAATAATTAATAAGAATTGGGAGTTTCTAAATTTATTCCGAATTTGAAACTTAATTTAGTGCACTTAGTTTTTAAACCGACTTTATAATTAATATATTTTTAAATTTGTTTTTCTTATTTAACATTGGACCAACCAACACTATGATATAATGTATTTATTTATTTTTATATTACCTACTCAGTATGGACTTCACTCATACTTATATTCATAAAAAAATATTGGATAAGTTAGATCCACACATAAATTTAATATATTTAATTATTTTTATTAGGATTAATAGATGATGTTAAAAAATATGTTATTTATTTTAAATTAAAAATATTTTCTATTTTAATGTTACACATGTTAATGTAAATAACTTTTTTTTAATTTATATTCTCTATTCTTTATTTGCAATAATAATATTATTATATAAGTACACATGAATATTCAATTTACGTCTTAGTTCTCTACATTTACTAGTTATACTGACAAATACTTTTTTTTATATAATAATCAATATACGCATTAATCCAACTTCGGACTGGGTTGGTAATTGTTAACCATTAATGGTAGGTTGGTAAAATTCTCCGCTTCACTAAACATATAAGACTTGACTTTTTTTTTTATTTTATTAAAGAACATTACTGGAAGGGGCAAAATCATCAAAAATATATAAATATAAAAGATAATATACATTTCAATAAACCAAATTATGACTAAGAGATAAAGAGAGAAAAATATAAATATAAATATAAAAGATAATACATTTAAATCAACCAAATTATGACTAATGAAAATTAATGAGGAATTAAGTGTTAACAACAATTAGATGATATATATATATAATATATAGTAAATCCTAGATGATTATGTACCTGTATGGTCTTAACTAATTTGAATGTACTTATTTTAATTTGTAAAAATAATTAATAAAACCTAGTTATTAGATAGAAACAAATTAAAATTATGGTTATCCTTCCATCTTAACAATGTGGTTATAAATTTATGTTTATGATTCTTGTCAAAATTTTAAAACAAGTTGAATAAAGTCACATTTTGTTGCCAACATAGCAAAGAGTGGAACACGAACCGACACAGTGACTATGAATCACGACCGTAGAAAGCATACACATAAATTTCTTCACTGTACAAATCTATGTCCAACACTACATATAACTGTAAGAATCCTCTACTATATCTGCATACATACAAGTTTCTCTCGTTCAGTCTCTGTTTCGTAACCCGCTGAATTGTTGTGAGCATTTTTAC


Gene Sequence:
>Vu_33208(-)
ATGGAGTTCGATCCGTGCTTTCAAGGGCCACAGTACCTATCTAGTATATGTCCCAAAATCCCCTACTTGAATCCACACGCTCAAAACATGTTTCCATCCCAAAGCTCCATTTTCATTCCTCCATCTCAACCCATCATGTTTAACCCTAACCATGTTTTCCACCATTTTCAAGACCACATCGTGAATGTCCCTCCGTTTGTGATGGACGGTTCCAACCCCATCGTAACCCCCATGTATGGGAACGGGATACCAACCCCTTCTTTCGGTGATGGGTCTTTTGCTAACATTAACAGTCACCAGCCTGTGATGTTAGTACCCAAGAACAACAGCAAAATTGAAGCTTTGTATGATGACCATAAAGGCAAAGTGATATGGGATTTTTCCCAGAAAACCATGGTTCATCCTTTTGAAGCGTCTTCTCCCAACTCACCATCTCCTTTCTGTCTCTCTAATGAGTATGGATTGGGTATGAGTGAATTTCATAGGGACACTGATCGAAGGATGGTAGAGGTGGAAAACAATACCCACAATGCTACTCATAATATAATCAAAGGACAGTGGACTCCCGAAGAAGACAGGTATATAAATTTCTGTCTCTCATTTTCTTTGATTTTTCTCATTTTTCCATCATGAAGAATAGAATAATTTAGTAATGAAAACTATTTATCTAGTGGTAATAATATAATGAAAATTATTAAATCATTTAAAAAATTATATGTAAAACTTGTCATTTACTTTTATTTTGTTTTTGACGTGTTTTCAATAAAAATAAAATCAACTAACCGATTGTATTTTAAACTATTCGTAATTTGCTTATATTTTAATTATTGAGAAGTTTTCTTTTCAGTCATCTGCCAATGCTGAAAAAATTATTAATGTTTAATTAAATCGAAATTTCTGGGTTTTGTAGTGGTCTTGTGGAGTTGGTGAATCAATTTGGACCGAAGAAATGGTCAGAAATTGCAAAGTTGATGTGCGGCAGAGTTGGAAAGCAATGTCGAGAAAGATGGCACAATCATCTCCGGCCAAACATTAGGGTTTTTCTTCCTTCCATTGTTTTGAATATAGAACTTTTGGTTATGAGATTGAAGTTTAAACTTATTAAACGAATAACACATAAATTAATGTAATAAATTATACATAAACATGGTGCAGTTAGTGATAATCGTTGTAAAAATAAAAATAAAAATTTACTTAATTAAAGTTGCATTTATATAATTTCTTAGTGATTTTTTTAAGAGAATTAATAATTTCTAATAAGTGTCTGTGTTCCGTACCATTTCAGTTTGTTTATAATTAATAAAGGATTTGTCCATCCTAAGAAAAGGTACGGTTGATTATTTTTAATTTAATTTTATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAGCAGGAAATAATATTTAATGGTCCAAAGTTTTATAAAATACTTATTTTTTGATAAATATTTTTCATTGTGAAATTAAAGAAAATTCTTCTAACTTTAGAGAGAGATATATATTATTTCTTTTATAGACTTTCTTATAGAGATAGTTACTTTTTTCACTTTATAGACCAGATATTTGAATATAATTTCTTTTTAATATTATTTTTATTTTCTAATTTATTATTTTATTTCAGGTTTTTTCTCGTTTACTATTTTTATATTTTAAATAATAATTATATTTTGATAAATATTTTTCATTGTAAAATAAAGACATTTCTTTTAATTTAAGAGAGATATGTTACTTTTTACGGACTTTAATATTAGGAGAATTGTTTCTTTCTCTTTATAAATCAGATATTTGAATATAATTTATTTCTCATTCATTATTTTTATTTTAAAAAAATTACATTGCAAATTTTTGTTAGCCTGTCTTTTAAACTTGATTATAAATAATATATTATGAAATAGTTATTACATTTTAAAAATGTAGTAAGCTAAATTATGAACAGTACACAATTTGAAATACGCTAACAAATTTACTCTAAATAATTTATATTTTTCCTGATTTTTAGACATTATCTATAACAATTTAACATGCAGTCGATTAGGTGCATGAGTCCCAATTGGAGAAACAAATTGTATAGTTGAATTACATTAAAGATTTATTATGATTATTTAAATGCATGGAAAACATACTTTTTAATAAAAGATAAGCTTATTTTAATGACATAATTATTTAGATAAGCTAAATAGACATTGATATTTATACACGTCAAGCATTGATTTTTTTTTAATGAAAATTAAACTTATAATTATGATATATGCGAAACTGATGACCTAAATGTGTGATTTTGATTTTTTTTTCTTAGAATATTTAGTTTATTTTAAATTTATATATAATTTCTCTTTATGATTTAAAAAGTTATTGAAGTTACAAAACCTTTTCAAATGAAATTTTATATATAACAAATCTTGGTTCCGTCATCAATAAGCAAAGTAAATTCAAGAGATCACTTTATTACTGAAACAAAAAACACATGGTATTACATTCATTTAATTTTATGAATGTTTTCTGATTTATCAATTAATTGTCAAAATCAAATAGTTGTTCCTATTTATACTTAACATAAAAATAATCCAACATTTTCTTCATAATTAAATATTACTTAATTATTGATAAATTAGACATCATCTTTAAAAACATATTAATACCAGCCGCAAAGTATGGTTGTCCTGTCTTAAGTATTAGTAATATGGAGCATATAGTAATAATATTTTGGTGTATGAACTAATTTTGCAGAAGGAGTCGTGGAGCCTGGAAGAAGACATGATTCTGATCAAAGCCCACCAGGAATTTGGCAACAGGTGGTCAGAGATTGCTAAGAGGCTACCTGGAAGGACTGAAAATAGTATTAAGAATCATTGGAATGGAACCAAGAGACGCCAGAGTTGCAGGAGCTACAACGGGAGTAAGAAAAACCCTTACGAAGGATCAATGCTCCGTGCTTACGTTAAAAGGGTCACTGCTATGGAAGAATCTACAAAAGTGTTGAAGAAAGCCACAAGCAAAAAGAATTTGTTGAGGTTTGATCCATCTACAAACGAAATGTTTATTGGAAATAGCAGCAACTACGCGCCATTGCAAGTTAAAAATAATAATATTGGGGTTTCATATGGTGCAATTGGAACGAATGCAATCAACAGGGGAATGAATCCGATAAGTACAAAATACTGA