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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33113 LG9 32868163 32872529 PREDICTED: putative Myb family transcription factor At1g14600
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 32870644 intron_variant
G/C 32870804 intron_variant
T/A 32871000 intron_variant
C/A 32871009 intron_variant
C/T 32871011 intron_variant
G/A 32871012 intron_variant
A/T 32871047 intron_variant
G/T 32871744 intron_variant
G/T 32871771 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33113.1
MGSCGREGVVRQYIRSKVPRLRWTPELHRCFVYAIETLGGHHKATPKLVLQLMDVKGLTISHVKSHLQMYRSMKGDSCRQDKTSTQHRKQDDDEVGDVGFYSCFKSIGKESDSQPSCSNFSLKRARIEKTSFLSGFPQCSQRNPYTTFYDYLQSMAEQKRIKKICAGSILQTKPLSTTFLPMLPSQASDFLQVAYLNDEQGLNEVEKSCGVEAEDEDDMGGCELSLSISLPQPHPSSQRSNASSVSDISEAFSLCPKFNNNNNNYMGCSTSSNVSNKVNVDLSLAI*


CDS Sequence:
>Vu_33113.1
ATGGGTAGTTGTGGAAGGGAAGGTGTAGTGAGACAGTACATAAGATCAAAAGTCCCTCGTTTAAGATGGACCCCTGAACTCCATCGTTGCTTTGTTTATGCCATTGAAACTCTTGGAGGTCATCACAAGGCTACTCCTAAGCTTGTTCTTCAGTTGATGGATGTTAAAGGGCTGACAATTTCACATGTCAAGAGCCATCTGCAGATGTACAGAAGCATGAAAGGTGATTCCTGCAGACAAGACAAGACTTCCACCCAACATAGAAAACAAGACGATGATGAAGTGGGTGATGTTGGTTTCTACTCTTGTTTCAAATCCATTGGAAAAGAATCTGATTCCCAACCCAGCTGCAGTAATTTCTCCCTTAAAAGAGCTAGAATCGAGAAGACAAGTTTTCTCTCAGGATTCCCACAATGCAGCCAAAGAAATCCATACACTACTTTTTATGATTACCTGCAGAGCATGGCTGAGCAGAAGCGAATAAAGAAGATTTGTGCTGGTTCAATATTGCAGACTAAACCCCTTTCCACAACTTTTCTTCCCATGCTACCAAGCCAAGCATCAGATTTTCTCCAGGTTGCCTACTTAAATGACGAACAGGGTTTGAATGAAGTTGAAAAGAGTTGTGGGGTAGAAGCAGAGGATGAAGACGACATGGGAGGTTGTGAGTTGTCGCTGTCCATCTCATTGCCACAACCACATCCTTCTTCTCAGAGAAGTAATGCTTCTTCAGTCAGCGATATCAGTGAGGCCTTTTCATTGTGCCCTAAGTTTAACAACAACAACAACAACTACATGGGATGTTCTACTTCTTCTAATGTTTCAAACAAAGTTAATGTCGACCTATCTTTGGCCATTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_33113::LG9:32872529-32874529(-)
GTCATTCACAAATTATAATATATATATATATATATATATATATATATATAATATATATATATATATATATATATATATATATATAAGTTAAATATATTTGTATTTTCTAAATTTGAATGTAAAAGCAGAATTCGGTTCCATGAGTTAAAACGTGTCAAACAATATAAATATTTCAAACATCAACTCGAAACCCGGTTTGACATATTTATAAAATTTAATTCATTTAGATTAAAATAATTATATTTATTCATTTATAAAGTTTAAACAAATTATATCAAAATTTAAAACAAAACCAAATTTCAATTTTACATCTAAATTTAAAAATTAAAAATATATTTATTTCTATAAACAAATATTAATTTATAGATGAATATATCGAACTTAGAAAAAGAGAATACTCAAAACTCATAAATAAAGAAGATAATGAACTAGAAAAAAGAGAGAAGAAAGTTGATAGATAAATAAGTTAAACAAAAATTAAATTATACATTTTATATTAGTGAAATATTTATTTTTAATTTGTGAAAGAAAATTATAAAATAATCTTATCTTGCTATTTTCTTCCCTTATTTAATAAATATTAGTAAAAAAGAGTTGTATTTTGAATCAGTACCAAAACAATTTAAACATAATTTTTGAAATAATTATTATAAAAATCTGTAAATCTTATATCTACTTATAAGGTTGATTTGTTTGTTTGAAAAAAATTCTGATTATGAATTCAACTCTCACACCAATAAAATACTAATAACTAATATTTGTCCAAAAAAAAAATTATATCTATTCATAATTATTTCTCACTAACATGAGACATACGGCAAGTCATTCTATTTTTTAAAGAAGAAGACAAAAGATAAATAAATTAGACTCCTTCTAAACTTAAATTTAAGAGAGAAAAATGTGTTATACATATTTTAATTTGCATGCATCGTCATAATGTAAATATTTGCGATGTTAATCAGTAAAATAATATTTTGATAGATTGATAATAATAATAATAGTAATAGTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAGTAATAATGAAGACATTAATATTGATAATAATTCGTAATTGAAGAATATGATTAACCATTTTTCTGATAGAGTCTCTTTTTTCAATTATATTTTCAGTCATGACTTTCAAAATCGAAATTTTTCTTAAAGGTACCAAATCTAGTTTTAGTTTCACTTGTTAGTACTATAATTTGTAACTAAACAATGAAGAAATTGTTTATAGTAATATTAGTCTTATATCTGATAAGTCTATATAAAAATAAAAATAATATACAAGAACATTATCGTGTTTACGCGTCAATGAAACAGTTCTCATGAGAAGAGAACAAAACAAAAACCTGAAAAGTAATTTCATGGCATCCATGTATTCCCCCCAAGTGATTATGACGATGTTGTCGCATATATTACTATTACTGGTCTATCTAGAGAGAGAGAGTGCGTAAAAAGGAAACTAGAAAGAGAGACAAAGGTCAAAGATTGGCAACACACGAGACACTATATATATATTGGCATAACTAGGCATAATCATTTCGTATGAGCAAGCAAAACAACATATATCAGAGTTCAGAAGCCTCCTCGTGATTATTTTTTGGTTTCGTTTCTTTCATTTTTTTACTCTTTCGTTTTTCCTTTTTGTCATTTGGCTAGCTGCGTACACGCTGGAAGCAGCAACAGCACCTACCATAAGGTATTATCAGTGACATGTTCGGGAATTTGCAGGACTTCTTCCCCTGTCATGTCCTTTTCTCTCGATATTTTCCCCTTTCACTATGATGATTCTGTGTTCTCTTCCTCATTTTTTTTTTCTGTTTTCCTAAAGAGAAAAGCTGCATGCATGCCATGCTTTTTTCTTAGTCCTGTGTTGTTCTTGTTATATAAGGAGGTCCAAGTTTTGGAGCACGAATGGTAATTATAGGGGTTTTTCAGAACACCCTTTTGGTTTCAGAAGTGGAAAGTGAAGGTCTTTGAAGAGAAGGAAAA


Gene Sequence:
>Vu_33113(-)
ATGGGTAGTTGTGGAAGGGAAGGTGTAGTGAGACAGTACATAAGATCAAAAGTCCCTCGTTTAAGATGGACCCCTGAACTCCATCGTTGCTTTGTTTATGCCATTGAAACTCTTGGAGGTCATCACAGTGAGTACATTGTTTTCACCCAACTAAAAATTTTCTATGCTTTTCTTCATGTTTCTTTCTTCTTCTTTTTGTTGCTTTTCTTAGATCCCATAAACACAAGGACAAAGCTTATTAGATGCATTATTGTTAATGTTAACTTTTCATCAGAATTGAAGCTTCACTTTATGTAGAAGGAAATGGGGGTGTATGGAGCTGAGGGAATTGAAAGACAGACAAAAATAATAAATGTTGTAGATGACATGAGAAAATGAGGTAGAAAAATAAATTAAATGTGAGAAAAAAGTAAATGTATGTTGGCTATTTTCTTCATTCTTCTTTATCTGTTTTTCATTACTATATACTATGATGAATTTCTAATACGTTTCTACCTCTTTTTTTATTCATATATTGTGCAGAGGCTACTCCTAAGCTTGTTCTTCAGTTGATGGATGTTAAAGGGCTGACAATTTCACATGTCAAGAGCCATCTGCAGGTTCGTTTTAATCTGCTTAATTAGTATAAAATTGGCAATTTCATACATTAATTTGGTGTTCCTGATTAAGCTTTTCTTCCTCTTTTTCAAAAATAACCAGATGTACAGAAGCATGAAAGGTGATTCCTGCAGACAAGGTACCAAACGTTGTTCATTTGACCTTCTTTACTGCAAAACACTATGTCTCTTCAATACTTTTTCCTACCCTCATCTGCCTATGCTTTGTGTTCATAAAGTAGGTTATTTATCTACAGATTTGGATACATAATAATGAAAATGTGTGCATTAAGAAAAGTTAAGGTTTTATATATGGTAATTATGTTAATATGAGCATCAATCATTCTTTCATTACTCTAAAATATTACCTTTTATGTTGCATATTTTATGTGTTATCAACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACTTGTTTTGGTGATCCAAATTTATGAGGTCATACCAGCTTGAAAATAGGACTTGCCAATTGAAAAATAACACCTGCATATTTAACTAAACTAACATAAAATTTTGCATTCTCGAACAGAGAAGACATTTTGATGATGATAGAAAGTGTCTCCACAGCATCCTTTTTATGGTTTACATAAAAAAAATGGACTCACCGAATCAATGGAAAATAGAGAAGTTACCCGCTTTTGGTAAAAATAAAAATACTTTTTTACTATAAAATAGTGGAGAAACATGGTATATATATAAATATAAAGTGTGGAAATTTTTTAGGGTCATAGTATGGTAGACACCCTATTTCTTTTTATACTTGCTTTTGACACTCGTAAAAATTATTATTTTATATTTATTAGTTAAGTATAGTATGTTTTTTCAAAAGGGGTTGTAAAATAAGAGTAAAAGAAACGAGGAGTTTCAAAGAATATTTTTCAACTTTTTAAGTTAAGTGTTCTTATTTATTTATAAAGTAGCTAGGATGAGTTCTTCATCTCCTGGTTTATAAAGTGATTCATTATTTAAAAATGGTTTTTGACATCTTACAATTTTACACTGTGCCCCTTACGTTTCCCTTTTATGGTTAACTGTACAAAAGAAAGAGAAAAGGAAACTGGGTCAGACAGACGAGATATAAAATTATTACGTGTTAATTTTTTTTTCTAGTTGTTAAAAAAACATTTTTCGAGAAGATTATAGTTAAAGTGAAATAAATAGCTTGGTTGAAGCATTGATTGGTCAACAGATTAATATCGATGATCTGCATGTCGTACATTGAATAATGTAGATGATGCTTTCTGCATTGAAAGCATGCAGATAGATATGGAGTCACTCTATCGATGGTTGTTTCTCTTATTGGTTAATAGTTGTGGTTGAAAAGCAGAGGAAAAAGCTATCCTCCATGCATGAGTTTAGCAAATTCTCAACAGCAATGTTGCTCATTAAGTAGTCCCTTTCGTGTCTATAGTTGATGCCAGAATAGACAAAGGAGAATCATAAACCATTCTGCTTTTACCATCTTATAATGGTATTTTTATGAAACCCACAACTTTTCTGCTTTCAACATTTAATATATAAATTCCATTGCTCCTTTAATTTCACCCATGTAAGTTTTCATTCTTCCTCCAATCCTATTATCATACTGTAACTATTCATCAACTTTCTCGATCACTATTTTTGTATAAAGAAATCTATTTCTCTGAAAATCTTTAATGGAAAAAAAAATTAAAGAAAAACAGATAAAAATTAGTTATTTACTGGAATATAAACATAATAAAAGTATTTTTTTAATTTTTAATAATATAATACTCTTTATTTCTTTTATCTTTATTATATTAAGTATTCAAATATATAAGTTAAAAAAATTGTATTGAATAGAAATAAAGTGACATATGAGTAAAATAAAAATCACAAACATTAAATCTTAAACTTTTGTGTTGAAAATAATGTTATATCTTTTCTATGTTTGTCAGTTCATGTCATGTGGTAAAAAGATATTATAATATTTTATGCGAACAAAAACTCATAATTATACAAAATTTTTAAAATATTTTACAAAAAATTTACTTTTTTAAATTTTTTTACCAATATATTTCAATCCTACACCAATCAAAGTGTAGCGGTACATCTTTTACAAACATATTTGTTTTTGCTTTTCATGCACAGAATTTAAATCCCAGAAAAATCTTAAAAGAAGAAAAAGGCTACATGCAGTTTCACTCTAACTAAACGTTAATTTGTTTTAAAATGTTGAATGTTTTCGCTAAATGTTGTTCTACTTTGAATTCCTTGTCTGATGGTTATCTGTGACAGACAAGACTTCCACCCAACATAGAAAACAAGACGATGATGAAGTGGGTGATGTTGGTTTCTACTCTTGTTTCAAATCCATTGGAAAAGAATCTGATTCCCAACCCAGCTGCAGTAATTTCTCCCTTAAAAGGTCAGCTTAACTTCATGTTTCAAATAAACAATACAACGAGTTTTCAATCACAAATCAACATGTATACAACAAATCTCATTATTTTATACTTATTATTTAGAAAGTACACTAAGAAAAGAAGCACGATCAGTCAAGAATATGTAACTTTTTTTACCCTGCATATAAAAAAACTCTGGCTTCTTTGCTTGTTGAAATAATTTGAAACTTTTCAAAGGACTAAAAAGTGGTACAACATATGTAAAGTAAGAAAACAAAAGTGATTGGTCTTTGCTTGATCTCTGACTTTTCTGAGGCAACTTTTACTTTTAAGCAAGAAAAGAAAGAAAAAATCTGAATTAATTAACGTTTGGATTCTCCACAGAGCTAGAATCGAGAAGACAAGTTTTCTCTCAGGATTCCCACAATGCAGCCAAAGAAATCCATACACTACTTTTTATGATTACCTGCAGAGCATGGCTGAGCAGAAGCGAATAAAGAAGATTTGTGCTGGTTCAATATTGCAGACTAAACCCCTTTCCACAACTTTTCTTCCCATGCTACCAAGCCAAGCATCAGATTTTCTCCAGGTACTCTTCTTATAGAGACAATCTATCTATCTTTTTGTACTTCATTTCTCCTCCTTCAACATAAATTATTGAGCTTCAAGTGGAGTGTCTCATTGGTTATGTCTTTATTTCACTGTCATGTGAAAATTTCTCAGCAATAGGACCCCCCCTTTACGAACAAAACACGAAAATGACAGCCTCCTTGTCAAAAACATCAATTCAAATAATCAAAGTTAACTCTTTTTATTTTCTACAGATAATCATGTTCAACTGTTAATGCTATGAAGAATTAATCAGTCTCCTTTCTGCTTCATATATCCAACCTTGTCAGTGGCCTTAGCAAAATCTATTAGCTTTGTTCCCTTAATATTGCCCCCTTTGTGCATATAAAAAAATGATAGACCCTTTTTGTGAGAAAGTCCACGTGAATAACTTTCTGCAATGGCCTTGTCACTTTCTGATGTGTTCCTTTTTCACTATGTTGAACAGGTTGCCTACTTAAATGACGAACAGGGTTTGAATGAAGTTGAAAAGAGTTGTGGGGTAGAAGCAGAGGATGAAGACGACATGGGAGGTTGTGAGTTGTCGCTGTCCATCTCATTGCCACAACCACATCCTTCTTCTCAGAGAAGTAATGCTTCTTCAGTCAGCGATATCAGTGAGGCCTTTTCATTGTGCCCTAAGTTTAACAACAACAACAACAACTACATGGGATGTTCTACTTCTTCTAATGTTTCAAACAAAGTTAATGTCGACCTATCTTTGGCCATTTGA

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