Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33065 LG9 31997004 32005675 homeobox protein knotted-1-like 6 isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 31997391 missense_variant p.Ile257Phe
T/A 31997424 missense_variant p.Thr246Ser
A/G 31997427 stop_lost p.Ter245Glnext*?
T/C 31997510 missense_variant p.Tyr217Cys
A/C 31997679 intron_variant
G/A 31997713 intron_variant
T/A 31997795 intron_variant
A/G 31997797 intron_variant
C/T 31997877 intron_variant
G/C 31997902 intron_variant
A/G 31997919 intron_variant
A/G 31997931 intron_variant
T/A 31997961 intron_variant
C/A 31997981 intron_variant
C/A 31998010 intron_variant
T/C 31998050 intron_variant
G/T 31998166 intron_variant
T/C,* 31998225 intron_variant
G/A 31998258 intron_variant
G/A 31998266 intron_variant
G/A 31998378 intron_variant
C/T 31998486 intron_variant
G/C 31998549 intron_variant
A/T 31998610 intron_variant
G/T 31999028 intron_variant
A/T 31999032 intron_variant
G/A 31999280 intron_variant
C/T 31999411 intron_variant
G/T 31999415 intron_variant
G/T 31999422 intron_variant
G/A 32000049 intron_variant
A/T 32000102 intron_variant
T/A 32000189 intron_variant
A/G 32000208 intron_variant
C/A 32000212 intron_variant
A/G 32000213 intron_variant
T/A 32000214 intron_variant
A/T 32000649 intron_variant
A/T 32000881 intron_variant
A/G 32001115 intron_variant
C/T 32001117 intron_variant
G/A 32001119 intron_variant
G/A 32001129 intron_variant
G/T 32001138 intron_variant
A/T 32001145 intron_variant
C/T 32001149 intron_variant
C/T 32001166 intron_variant
A/T 32001262 intron_variant
T/A 32001272 intron_variant
C/A 32001281 intron_variant
G/C 32001297 intron_variant
C/T 32001302 intron_variant
C/A,* 32001637 intron_variant
G/A 32001664 intron_variant
G/A 32001667 intron_variant
C/T 32001736 intron_variant
T/A 32001756 intron_variant
T/G 32001761 intron_variant
G/C 32002207 intron_variant
T/C 32002208 intron_variant
C/G 32002370 intron_variant
C/G 32002966 intron_variant
C/G 32003343 intron_variant
C/A 32003359 intron_variant
T/C 32003493 intron_variant
G/A 32003613 intron_variant
A/G 32004023 intron_variant
C/T 32004500 intron_variant
G/T 32004618 intron_variant
G/T 32004620 intron_variant
T/G 32005494 missense_variant p.Lys14Gln

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33065.1
MILAVSGTGSRSRKVPEILVRNEAKERSVSFRVAIMDEMYGVPDYADKPLMTPENLIFPPDYPAFLTAARIPIFGSDDLFSGEPSAASASPAGIPRHQDDDVATTVMKAKIASHPHYPRLLQAYIDCQKVGAPPEIARLLEEIRRENDLCKSDVVSTCFGADPELDEFMETYCDMLVKYKSDLARPFDEATTFLNKIEMQLSHLCTGASVSTVSDDGGMSSDEDLSTGDGDGQDGQSKGEDRELKDRLLRKFGSHIGTLKLEFSKKKKKGKLPKEARQTLLQWWNVHYKWPYPTEADKIELAKSTGLDQKQINNWFINQRKRHWKPSENMQFSMMENLNGRFLGDE*


CDS Sequence:
>Vu_33065.1
ATGATACTAGCTGTCTCTGGCACTGGCAGCAGAAGCAGAAAAGTTCCAGAAATTCTGGTAAGGAACGAGGCAAAGGAACGCAGCGTTTCCTTTCGTGTCGCCATCATGGATGAAATGTACGGAGTGCCGGACTACGCCGACAAGCCACTCATGACTCCGGAGAATCTGATTTTCCCTCCGGACTACCCCGCCTTCCTCACAGCGGCCCGGATTCCTATCTTCGGATCCGACGACCTCTTCTCCGGCGAGCCTTCCGCCGCTTCCGCCTCTCCTGCTGGAATTCCGCGCCACCAGGACGATGACGTCGCAACCACTGTCATGAAGGCAAAAATCGCCTCCCACCCTCACTACCCTCGCCTCCTCCAAGCTTACATCGATTGCCAGAAGGTTGGGGCGCCTCCAGAAATCGCGCGTCTGTTGGAGGAAATCCGGCGAGAAAACGACCTGTGCAAGAGCGACGTTGTTTCCACGTGCTTTGGAGCCGATCCCGAGCTCGACGAGTTCATGGAAACCTACTGCGACATGCTCGTGAAGTATAAATCCGACTTGGCTCGCCCCTTTGACGAAGCAACCACTTTCCTCAACAAGATCGAAATGCAGCTAAGCCATCTCTGCACTGGCGCTTCTGTTTCCACCGTTTCTGATGATGGTGGTATGTCTTCAGACGAAGATTTGAGTACAGGAGATGGTGATGGTCAAGATGGGCAATCAAAGGGTGAAGATCGTGAACTGAAGGATAGACTCTTACGGAAGTTTGGGAGTCACATTGGTACATTGAAACTGGAGTTTTCAAAAAAGAAAAAGAAAGGTAAACTTCCGAAGGAAGCAAGACAAACATTGCTTCAGTGGTGGAATGTTCACTACAAATGGCCTTACCCCACGGAAGCTGATAAGATTGAACTGGCTAAGTCAACAGGGCTAGATCAGAAGCAAATTAACAATTGGTTTATTAACCAGAGAAAACGTCATTGGAAACCATCCGAGAATATGCAGTTTTCCATGATGGAAAATCTTAACGGACGGTTCCTTGGTGATGAATGA


Promoter Sequence:
>Vu_33065::LG9:32005675-32007675(-)
TGGATATAGAAGTGACTTTTGATGACAAAATTTGAAGGAGTGATGATATCTATGCTTAAATATAATTTTTAGTTTATAGAGTTTGGGCTAATTTTGGTTGAGCCTCCGAATTAAAAAAAAACATACACTTTCAAAATAAGGTATAATTTAAGCACTAAGTTTACAGAGTTAAAGATAATTTGAAATCTTAAATATTAGATCTTAAAAATTGAACTTAAACCCTAAAAAATCAATATTGTAGAAAATATGATATTATTTACATACTGCTTTTTTTATTAGCGAAATGCTTCATCTTTGTATTGTATGATGATCAAACTATCATCTCTCAAAAAAGTTATCTTTGTGAATGTATGGATTGAAAACATGATGTAATTGTTAGTCCAAAAAAAAATTAACACTAATTATGAGTAATTTGGATTAAATTGTACATATTGTGTCATAATTAAACCATTATTAATTAAAAATATATTTTAAAATCTATAAACATAGATAGGAAATAAAAATGTATGTGATTGTATTTAATACATCGTTCATACTCGAATAACTAAATGTTTACTGATATCAAAATATCTTTTATTTGTATCTTTATAACTCCTCAAACAAACAGGATGAACACATGGACGATTTTACCAAACATTAACTTGAGAGTTTGAAATTAGACATCATACTTGGACGATTGATCTCAATCCCATACCAAAAATAATATTAAAATAATTTTAGTTATGTTATTTATTTTATTCGACGAACAAACAAACATGCAGACGATTTTACCAAACAGTGATTTGAGGATTTTAAATTAGGCATCACACTTGACTATTGACCTCAATCCCGTACCCAAAATAATATTAAATTTTTTTTAGTTATGTTATTTATTTTATGCAATTTTGTCTTTGTTAATAAAAAAGTTCAATCGAACTTATATTAATAAAGAGAACTATTAGTAGAAAATAAACAAACTGACCGAAAAGTTAATTGAATAAAAAAAAAATCTAAGACTAATATCATGATTAATCCAAATTTAACGATTAGCATCATAATTAAACTCGATTACTTGATAACATTTATAGAGCCCAAGTTTCAGTTATTTTGACTATGAAGAGAGGTAAGTGGTGTGCCCCGCTGAATGGGTAAAATCAATCTGGCCACACATTTCTTTAGGCATAAAGATTTGTGAAGCTTTTTCAACGGTGGAAATATATTTGAATAAACATGGTCACACAACATATTTAATATTTTATAGATGCATCGACGTACGATGTTGAGTTAGGGAAATAAAATGATTGGCCACGTATTTCTACTTTCACAAAGGTCTTACATAGAAGCAGGGTGACTGTAACTAAAAATGTTGAAATTCTTGATCTAAGAACATAAGTTTACTTTTGGCCACTTGCACACTAGGCTGGAGCAATTATTAGTTAAAGTTGACCAACAGTGTTAGTTAGTCATTATTTAACTTTTAACATAATCTCTATTATTTGTAGTTATCCTTTAGCCATGATAAAAGGGTAAGAAAAAAAAATGTAATAAGTATTTACTTTTGAAGGAGATTTGAAAGGGAGGGAATATATAGCATTTTGAGGTTTGAAAGTGTGCAGTTGTTAGTATATGTAAATATGCATTTGGAGATTTAATTTTGAAAGCATGGGACAGGTGATGAAAAGTGACCATTCATAGAGAAAAGAAGGGAGGGGGTGAGGTCTAGAGACTAGTATGTAATATTGGTTGGCCTAGACAAACCAACCCAACCCAAACCATGTTTCTATCATTTCGGAAGTCTCCTAAACCCCCACGCACCTCATCATTTTAAATTTATTAGCATTATCCTAAAATATTCAAAAACCAACCTACACTCTCCATTTTAAATGAAAATAATAATACTCTTGACCATTGATTTCAAGACTCCAAAGTCTACTGCAAATCTCATTTTCTATGATTATTCTAAGTAATAGTAAATAATAATTGGATATTTTGCAATGTGGTAGTTCGTGATCTTTGATAGG


Gene Sequence:
>Vu_33065(-)
ATGATGTGAGTGACTGAGTGAGTGCGGCGAGAGGTTTATTTTTGAGAGATATAATAATAATAATAATAATAATTAATTAATAGTAATAAAAAAAGAAAAATGTTAAATGTATTATTTCTGTGTTCCTTATTTCCTTCTCCTTGAAGACTAGCTGTCTCTGGCACTGGCAGCAGAAGCAGAAAAGTTCCAGAAATTCTGGTAAGGAACGAGGCAAAGGAACGCAGCGTTTCCTTTCGTGTCGCCATCATGGATGAAATGTACGGAGTGCCGGACTACGCCGACAAGCCACTCATGACTCCGGAGAATCTGATTTTCCCTCCGGACTACCCCGCCTTCCTCACAGCGGCCCGGATTCCTATCTTCGGATCCGACGACCTCTTCTCCGGCGAGCCTTCCGCCGCTTCCGCCTCTCCTGCTGGAATTCCGCGCCACCAGGACGATGACGTCGCAACCACTGTCATGAAGGCAAAAATCGCCTCCCACCCTCACTACCCTCGCCTCCTCCAAGCTTACATCGATTGCCAGAAGGTGAGTAAAGAAAACCGTATCGCTACGATCGTAACCGTTTCTTGGAGGAAGGGATAACGGTTATAACAAACTACGCAACTACTTTCCGCTGACGGCTGATACTTCTGCTGCTGCTGCTGCAGGTTGGGGCGCCTCCAGAAATCGCGCGTCTGTTGGAGGAAATCCGGCGAGAAAACGACCTGTGCAAGAGCGACGTTGTTTCCACGTGCTTTGGAGCCGATCCCGAGCTCGACGAGTTCATGGTCCCCCCCTTCTTTCTCTCTGCACACGCACGCACGCACACATATAATTATTTATTACAACTTTTGTCGCAGATTGTGATTGTGTCTCCGATTATGCGTTTTTCGTTTTCAGGAAACCTACTGCGACATGCTCGTGAAGTATAAATCCGACTTGGCTCGCCCCTTTGACGAAGCAACCACTTTCCTCAACAAGATCGAAATGCAGCTAAGCCATCTCTGCACTGGCGCTTCTGTTTCCACCGTTTCTGGTTTGTTTTTCTTCCCTCTCTCTCTCTCTCACTCTTTCTCTCTCTCTCTCGCTTCAGTATCTTACTAGCTGTAGCTCTCGCTCACTGCTAGTGCTATTATAATTTCTGAACTCGATGTTCGTTTTTGATATCTGCGCTGCTTTTTTTTTTTTTTTATGGAGAACAAAGCGAAGAACTAGTTTCAATAAACGTTGTGGGGCTTTTGTAGTCACAGGACCCTTAGCTGGCACATCTATAGCGCAGGATCAACTGAGAAGAAATTATTTCTGTCTAACAGTGATCTTAAATGAGTTTAGGTATACGCTTCTCGAGTTATGGGTCTTAAGCAGTAACAGTACCCTTAGCTGGCACATTGATGGCGGATGACACATGTATCAACCGATAAGAGGTTGCTTCAGTTTAACTCATGGTGTTAATTTTGAACGCTGGGTTCGAGATTTCCTAGTGGAATAAGTGTCCTTAGTTGGCTTGTAGAAGCCATATGGAGCAACAGTCGTTGTTTATGTTTTGTTGCTTTGTTTGATCTACCAGATCCTTATCCCCTTGGCTGTTTAACCATTGGTTGAAAACATGAATACCCCTCGCAGAATAGTCTTTATAAGTTAGCAGCAAATATGTGTTTGCAAGAATGAGATTGGGACATGACGCACAGCTTTTTTTCGAAGGAGCACGAGAAAAAGGAAAGGGAAACCCTAACACTTCTCTCTCTTTCTCTGGATTGGTGTTTATGCATGACTGTGCTGAATCTCGCTGCTCGCTGTTAATGTATGTGACTTTCTTTGTGTGCTTTCACTGTTAGACTGTGATCCATGCTTCTTTCGTCATATGAGGAAAAAAAAAAGTTTGGTTGTTTGGTCATTCCGGGATAGTAATGCTGTTTGAACCTTTCACCTTTTCAGTTTCTTCTTTATACGGGTCTTCGAATTAATTGCTAGCTCCTATGGACTTGTGTGGTTTGTTTTGTTTGGCCTTGGAGTTGTTCTCCCCGCACGCTTTTTTTTCCTTCTAATTTTTAAATTCTATTTTTTTTATGCTTTTCCTCCTCTTGAATGTCAAGTTTGACAACAGTCTTCTGCCTTTGGCTCTCCAATTTTGACATTGAAGATGTTCTCAATGACATCTTAAATAGTGGCCTCGATTTAAGACACTGAGCAAACCATAGATAATGCTTTTCAAACACCCAGAAGTTGTTTTTCGTACTACACCTTCCAGCTCACCCATTTGTATTGGTTTATTAGCGCATGCCTACTTTGAACTAGTTGTGTTGAAAAACTTTAGCGCAAAATTCATTCCAGTAAGGCTATGCCTGCTTGTGGATGCTAAACGCGTTATGAACTGTGACTGATAGCCCGCAGTCGATTATCAACGCCCGACTTATGTATTGGTTAGCTAATTGTTAGAGAACGATTCTTCTGTAATAATAGGTTTGTTTTCTTTTACTTAATTCAGTCAAAAAACAAATGCAGGCAGCGAGAATTTTGAAGCCGTAGGTTTACTTGCTTTTCCTCCTAAATTTTATTTCTATTTTTTTTTGTAATATATCATATTCAAATTTTTATCTAATTATAATGTGTCTAACTTGTGACTTAAATTAGGGGTTATGTCTCTGGAAGAATGTAGCTGAAATGGTATTTAAGATTTGTAGTAGTATAAACTAGAAGATTATAGTATATAGCGTGTGATTCATGTATGTTTAAATTATTTTATCGCTATGGAAGGTTGTAGGAGAAGTGCTGTCTAAAATTTATGGCAGTGGACGGTAGAAAATGTTTATTTATCTAACGTGTCATTGATCAATCTGAACAACGCGTTTCCCATATACTAGTAATAACTTAATACTTGTAAGCTTCATTAGTTGTGATGAACTACCTTCTTTGTTCCAGCACACATGAAGCTTACATGTTGAAGACTTATTATGAGAATAACGTTATTTAAATATTATACCTTCTATTAGTAATGCAGTAGTACCCATTTTGGATTAGATGGACATGATCTGACAGTAATGGCATGCAATGATTCTGCTTTCATACTTTACTAATTTATGTATCAAGTTCCAATAGAGCACAGGTAATGCATGTTGTTGGGAGATAAAAAAATGCTCATTGGGAATTGTCTACGGGGCTGATAGTCTGTCTGGAGCTAAAGTGCTCTCTGATTTTTCTAAATAAATGGAGTTAAGTTGCTTTGGGTTATCCTGTTGTTAGTAAAATTAGAAAGAGGAATGAGCTCAGCATTAATGAAGTTAGATTATCCTCGTGTGTGCTTTCATTCCAGAAAATTAAATTTAGGAGTTTACTGGTAAGGTCTTAATCTAGAAGACTCGGCTGATTATAAATTGGTCTTTTATGATGCCCTTTCATTTCTTTGGGATCTTGTTCTCTCATTGTCTGTTCAATCCATGATCACTGATTATGTTTCTCAGTATAATATTCCACCCTTTGTTGCGCATACGCATAATTTATCCTGAATCAGTGCATATGTATGTTTTGGGGTTTCAACTTTATCATTTGTGAATTTTATTTTGGTTACTGAATATTTTCTACGCCAGAAGATCAGTTACAATTCCCATACTGTTTTTGATAATGGTGGAGGATGGAATACAGTAGATTTTCATCGGCTATTTTTTTATTTTTTTAAATTTATAAAAGGGTAGTCATGATCAGGTGGGTTATGGTTGGCAAATATTATTATTTATGCCTGAAAGTACAGATTACCTTTTCAGTTGTGATGTTTATTGGTAAGTGGTTTTGTGCTGCATCCTTAATTTGATGGATTCTCCTTCATGCTTTTTTGCCAACCTATATTCCTTTAGCGGTTGCCGCAAAAGCAAGTTGACAGGATGTGAAATTCTTTGTTTTTAAATTTATTCTTTCTAGTTTTTCTTTTTCTTGTACTGAAATCACTGTGTCAAATTGGATCTTGAAATTGTTAGAAGCATGTCTTAAGGTTATTGGATTGACATCAACTTTATATATGGCAAATTCTTAGCACAACAGTGCAGCATGGTTACCTTTATTTTTGTTTTATCAGTGAAAATCTTATTGGAAAGGAATAGAAAAGGTACTCCCACCTATTTATAAATAGAATGTCGACATTGATTATATGAACAATGAAGTATCTCCAGAATAAATTTCCAATGAGATAATTAACAAACAATTTATGACCTCCTAGCCTGAGAAAATAAAAAATGTTAGCTGGTTCAAATATAGACCCCAACGATAGAGAAGCACCCGAAACTTTTGACTCGATTCAACTCCAGCTTCTAACTTTAATTAGTTCAACTACTTTTTTCCAATCAAAAGCATAGTTGTTTTAGATAGTTTAATTCCCATTTAGTTGAATAGAACAAATGCAGGAGAACTGTAGTAATTGCCAGGAGTGTTCTAAGTTCGTCGTTGTTGACATTTGTCATGAGTGATTATGCTGAACTTTTTTTGTGTATGTGATTTCCAGATCGTCCCAAACTATTTGAATATCTAGTGTGATTTCTAGATGATTTGAATACCTAGATATTTAATTCTTACGAAGCAAAATAGACCAGATGTAGGAGAACCATCGTAATTGCCAGCAATGTTTCAAGTTCTTTCTTCGTTGTTGACATTTATCATCGTTGATGCCGATAAAAAATCATGATTGATCACGCTATGCTTTTTTAATGTATTGCATTTTCAGATCGTCCCAGACGACTTGAACATCTAGTGTGATTTCTAGATGATCCCTTCAAATAAAAGTTTACTCAATTATGCTTCTAAATGGGCTTGATCATTGTGATATACTGCACTCTGATTTGTGTTTTTTGGGCAAAAGCTTGATAGATGGATGTGTTGCTCATAGTATAACGTCTTGCTGCATGATGTTGTTCAAGTCTGTATTTAACTGAAGTTTATTTCTTGACTAAAGGAATTAGTTACGTGCTAAAAAAATCTCCAGGATAGATAAAGACTTCCTTTAGATAAATAATTAGATGTGAACGAAAATAACG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