Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33038 LG9 31681878 31688105 "PREDICTED: ABC transporter B family member 26, chloroplastic isoform X1 "
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/G,A 31682238 missense_variant p.Val632Leu
C/T 31682243 missense_variant p.Arg630Gln
T/A 31682515 synonymous_variant p.Ser572Ser
G/A 31682530 synonymous_variant p.Ala567Ala
G/T 31682794 intron_variant
C/T 31682863 intron_variant
T/A 31682884 intron_variant
T/A 31682889 intron_variant
A/G 31683267 intron_variant
C/A 31683377 missense_variant p.Val471Phe
T/A 31683717 intron_variant
A/G 31683776 intron_variant
C/G 31683820 intron_variant
T/C 31683929 intron_variant
G/A 31683945 intron_variant
G/A 31683973 intron_variant
C/T 31683991 intron_variant
T/C 31684067 intron_variant
T/A 31684131 intron_variant
T/A 31684208 intron_variant
A/C,* 31684371 intron_variant
G/T 31684372 intron_variant
C/A 31684511 splice_region_variant&intron_variant
G/A 31684700 intron_variant
C/T 31684759 intron_variant
A/T 31684841 intron_variant
A/T 31684848 intron_variant
T/A 31684920 intron_variant
G/A 31685111 intron_variant
A/T 31685152 intron_variant
C/T 31685226 missense_variant p.Glu423Lys
A/T 31685227 missense_variant p.Ser422Arg
A/G 31685512 intron_variant
T/A 31685632 missense_variant p.Lys352Ile
T/A 31685782 missense_variant p.Glu332Val
A/T 31685981 splice_region_variant&intron_variant
T/C 31686343 intron_variant
T/A 31686622 missense_variant p.Asp240Val
C/A 31686623 missense_variant p.Asp240Tyr
C/T 31686629 missense_variant p.Gly238Arg
A/G 31686764 intron_variant
C/T 31686772 splice_region_variant&intron_variant
C/T 31686813 synonymous_variant p.Arg208Arg
T/A 31686907 intron_variant
C/A 31687011 intron_variant
A/T 31687051 missense_variant p.Leu201Met
G/T 31687089 intron_variant
G/A 31687153 intron_variant
T/A 31687203 intron_variant
G/T 31687515 missense_variant p.Ala161Glu
C/T 31687516 missense_variant p.Ala161Thr
G/A 31687561 intron_variant
A/G 31687570 intron_variant
C/A 31687654 splice_region_variant&intron_variant
T/C 31688033 missense_variant p.Asn25Asp
T/C 31688044 missense_variant p.Tyr21Cys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33038.1
MPLLLARTPPSSLPPILHHHYNNNNHHLLIAPSQKRFPLIAGPILLPRRILASSPLKCASINGVPILNNPEASTEQVHAGELLQRIRKWLDFLPLILPGGRWWDFSDDVDVQLVAQPVTVWRALGKMWELVARDRWVIIAAFSALIVAAVSEISIPHFLTASIFSAQSADLAVFHRNVRLLVLLCVTSGICSGIRGCCFGIANMILVKRMRETLYSSLLLQDISFFDNETVGDLTSRLGADCQQVSRVIGNDLNLILRNFLQGGGSLIYLLILSWPLGLCTLVICSILAAVMLRYGSYQKKAARLIQEVTASANDVAQETFSLIRTVRVYGTEEEEYGRYNWWLGKLADISLRQSAAYGVWNFNFNILYHSTQVIAVLFGGMSILGGHITAEKLTKFILYSEWLIYSTWWVGDNISNLMQSVGASEKVFHLMDLSPSSQFTEKGIKLQRLMGCIEFLNVSFHYPSRPTVSVVQHVSFAVHPGEVVAIVGLSGSGKSTLVNLLLRLYEPTNGQILVDDIPIQDLDIMWWRERIGFVGQEPKLFRMDISSNIRYGCRDVKQEDIEWAAKQAYAHDFISALPNGYGTLVDDDLLSGGQKQRIAIARALLRDPKILILDEATSALDAESEHNVKGVLRSVRSDSATRSVIVIAHRLSTIQAADRIVVMDGGQIVEARTMKQ*


CDS Sequence:
>Vu_33038.1
ATGCCTCTTCTACTCGCTCGCACACCACCATCTTCACTTCCTCCAATCCTTCACCACCACTACAACAACAACAACCACCACCTTCTAATCGCACCTTCTCAGAAGCGCTTCCCTCTCATTGCAGGGCCAATTCTTCTTCCCCGGCGCATTCTAGCATCATCGCCTCTCAAGTGCGCCTCCATCAACGGAGTCCCCATTCTTAACAATCCCGAAGCTTCCACAGAACAAGTCCACGCCGGCGAGTTACTTCAGAGGATTCGCAAATGGCTCGACTTTTTACCGTTGATACTTCCCGGCGGGCGGTGGTGGGACTTCTCTGACGACGTTGACGTTCAGCTGGTGGCGCAGCCGGTGACCGTGTGGCGCGCGCTAGGCAAAATGTGGGAGCTTGTCGCGCGTGACAGATGGGTGATCATCGCTGCTTTCTCTGCTCTCATTGTTGCTGCTGTTTCGGAGATTTCTATTCCGCATTTCTTGACGGCGTCCATTTTCTCGGCACAAAGTGCGGACCTTGCTGTTTTTCATCGGAATGTACGCTTGTTGGTTCTGTTGTGCGTGACTTCGGGAATATGCAGTGGGATACGAGGTTGCTGTTTTGGCATTGCAAACATGATTCTGGTTAAGAGGATGAGAGAAACGCTATACTCTTCTCTTCTACTGCAGGACATATCGTTTTTTGACAATGAAACGGTAGGTGATTTGACAAGTAGGCTTGGGGCTGATTGTCAACAAGTGTCAAGAGTTATTGGAAATGATCTTAACTTGATATTGCGCAACTTTCTTCAGGGTGGAGGTTCATTAATCTACTTGTTGATTTTATCTTGGCCACTTGGTTTATGTACATTGGTGATTTGCTCCATATTAGCAGCAGTCATGTTACGCTATGGAAGTTACCAGAAAAAGGCAGCAAGGTTGATCCAAGAAGTCACTGCTTCGGCAAATGATGTAGCTCAAGAGACATTCTCTCTTATTAGAACTGTACGAGTTTATGGAACAGAAGAAGAAGAATATGGAAGGTATAATTGGTGGCTAGGGAAATTAGCTGACATCAGCTTGCGACAAAGTGCTGCTTATGGAGTTTGGAATTTTAACTTTAATATCCTTTATCATTCAACTCAGGTTATTGCTGTGCTATTTGGAGGAATGTCTATTCTAGGGGGTCATATCACAGCTGAGAAACTTACCAAGTTTATTCTATACAGTGAATGGTTAATCTACTCTACCTGGTGGGTGGGAGACAATATATCCAATTTGATGCAATCAGTTGGGGCTAGTGAAAAAGTATTCCATTTAATGGATCTCTCCCCTAGCAGCCAATTCACAGAAAAAGGTATAAAGTTGCAGAGGTTAATGGGGTGTATTGAGTTTCTAAATGTATCTTTTCACTATCCTTCGAGGCCAACGGTATCTGTAGTGCAACATGTTAGCTTTGCTGTCCATCCTGGTGAGGTGGTTGCAATAGTTGGACTTAGTGGTAGTGGAAAAAGCACATTGGTGAATCTTTTGCTCCGTCTCTATGAGCCTACGAATGGTCAGATTTTGGTAGATGACATCCCTATTCAAGACTTGGACATCATGTGGTGGAGAGAGAGAATTGGATTTGTGGGCCAGGAACCCAAACTCTTCCGGATGGATATTAGTTCAAACATTAGATATGGATGTAGAGATGTAAAGCAGGAGGATATTGAATGGGCTGCAAAGCAAGCCTATGCCCATGACTTTATCTCAGCACTTCCCAATGGTTATGGGACACTTGTTGATGATGATCTGTTAAGTGGAGGACAAAAGCAGCGAATTGCTATTGCTAGGGCCCTTCTTAGGGACCCAAAAATATTGATCCTTGATGAAGCCACCAGTGCACTTGATGCTGAAAGTGAGCATAATGTCAAGGGTGTTCTTCGGTCTGTGAGAAGTGATTCTGCAACCAGAAGTGTCATAGTCATCGCACACAGGCTTTCTACCATACAAGCAGCTGACAGGATTGTGGTGATGGATGGTGGTCAAATTGTTGAGGCTAGGACCATGAAGCAGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_33038::LG9:31688105-31690105(-)
GCGCAATAACGGTACCGATTGTTCCAACATATCTGATGTTAAGGAGTTGTTTTAAAATCATTACAAACTTGTCTAGAACTTTTATTAACTATAAATCTGATGTTGAGTTGGTAATTAGTTAATAGGTTGTTTTTAATCTATTGTAGGGTTTTAATAGGTGAAAATCTAAAGGAGTAAGCTTGTGATAAAATTGAAGGTTTAGGGTTTGTCGTTAAGTCAATCGTGACTTGTTTTGATATTGATTTTGCTAAATTTTGGTTTATAATGTATAAAATTGGTTATATGTATTTTTTAGTGGTTGGGTTGGTCTAATGCATATTGTTCATGACCAAATGAGCAAAATTTCATCAATAAATGTGTTTTTGCATCAATCCTGGTGTTAGAGAAGTCAATTTGGTCATTTGGATAGGTATAAAGTGCATATAAATTAGAACAACAAGTTTTTGTAATCCGATATGACGTTGAGCGACCATGTGACAATGTTGCCAAAACAGTGAGCCATTGTGCTCCAGGGCGCTAAGCGCTCCATTTTGGTGTTAAGCAGTTTTTTACAAAGGGTTTTTAGGCATTGGGCGAGTCTTGTGTCGCTAGATGAGTTAACAGTGAATAATGGTTGCATGTTTCAGGGACTGAGTGAGAGTTCTCGCTGGGCTTAAATAACTCTCTGTTTGCGCTCTCGTTGGGCATTGGGTGAGCTCATTGGGCGAGCATGGTCTGGCGTTGAGCGCCATGATTCTGGCACTAAATGCCTTGTATTTAGGTTTAGGTTTTTGTTTACTTTTGTTTTGTTTCTTATGTAATGTTTAGTAATATCTATTGAATTATATGATGGTTTATACATGAGGTTATGTATGTGTTTAAGTATGGTTTAAAAAGAGTTTTTAAATGGAAAATCTTAATGGTTGTTTCAAGTAATGTATGTATTATTATAGGAACTCTGGGGGATATCCTAACACTCTAATAGTCATCAATTCTCAAGTATAAAATGGTGAGACATGTGGTAAGAGTAGTAGTAGGTCATAATTTATGACTTTTACCTTTACCTAAGACATTTAATGGACTAACCTTGTATGTGATATGATGAAACTTATTGACAATGGTTCTGTAGAGTAGTAGAAACCATCACAAGTGCATAACGTACCATAACTCGACAATATATGTATCCGGATGTTTGAGTCTATATTTTTAAGATATGTTGTGTTGTGCTTAGTTTGAAAGTGAAATATAATATATGCTAATTTATGAATTTCATGTTTTATTCTTTTGATATTAGCTTACTTTGTTGTGTTTTTATCTTTGTGTATTTGTTTTCTCTTTTACAGATTATAGATTATGTGTGACCATAGGAGTGTTAAGATATAAAATAGAAAGATTAATTTCACTATTCTCTTCTTAATATAAAAACCTTATTATTTGTTGGTTAAGTGTAATAATTGGAATATTAGTGTAATGATTGGAATGTTACTTACATCATAAAAATTTAATATTAATAAAGGTTCATTTAAAATTTTCACTAATTTGAAATTTAATTAATCAATATAAAATTTAAAAGAAAAGATGGAGAAAGAAGGAAATAAAAAGAATTGTAATCCACTCAGAGAAGAAGATCTTGTTGAGTTCAAAATGGTCACTCCCACAAGTTTGGAATTCTGCACGCCTCATTAACACAAGTAATTTTATAAATCCAAGAAAAAGGCAAAAACATTTGTGGACACTTCTTTGACGAATTTCTTGCAGTTCAATCTAAATAAAAATAATAATAATAATTTTGCACGTGTTTAAAAAAATGACGAGGATAAACGACGTCGTTTGGTGGCGTGCGTTTGTGGTGAAGCTAAGGAACAACAAGTATATTCAAGACAGAAGCTGAAGCAACCTTAACCATTTGATTTCCCTCTTCTTTGTTCTCCATACTTATGGTCCACAGCAATATACACACTCCTCTCAAGCTCCCACCGTTATCCCAACCCCATCTTCCTCTTCCCACGCGCTTCACCACC


Gene Sequence:
>Vu_33038(-)
ATGCCTCTTCTACTCGCTCGCACACCACCATCTTCACTTCCTCCAATCCTTCACCACCACTACAACAACAACAACCACCACCTTCTAATCGCACCTTCTCAGAAGCGCTTCCCTCTCATTGCAGGGCCAATTCTTCTTCCCCGGCGCATTCTAGCATCATCGCCTCTCAAGTGCGCCTCCATCAACGGAGTCCCCATTCTTAACAATCCCGAAGCTTCCACAGAACAAGTCCACGCCGGCGAGTTACTTCAGAGGATTCGCAAATGGCTCGACTTTTTACCGTTGATACTTCCCGGCGGGCGGTGGTGGGACTTCTCTGACGACGTTGACGTTCAGCTGGTGGCGCAGCCGGTGACCGTGTGGCGCGCGCTAGGCAAAATGTGGGAGCTTGTCGCGCGTGACAGATGGGTGATCATCGCTGCTTTCTCTGCTCTCATTGTTGCTGCTGTGAGTAGCTTTTTTTTTCTTTGCTGGTTTATTTTTATTCGGTCTGTGCCCATTTTGTGTGGTTCCAAGGTGGGGTCAAAGTTGTGAGTTTTTTCTACGTGGGTTTCAGGTTTCGGAGATTTCTATTCCGCATTTCTTGACGGCGTCCATTTTCTCGGCACAAAGTGCGGACCTTGCTGTTTTTCATCGGAATGTACGCTTGTTGGTTCTGTTGTGCGTGACTTCGGGAATATGCAGGTCAAAATCTTGTATGGTCGAATCTCCCTTCTACTTGCTGAAAGTGATATGATTTTTTTCTTTTCTTTCATTTGTGAGTCTTAATTGATGGTGCTGAAAGAACCTTCCATAAGAAAACGCAATGGATTTGCTCTTTAATCCTTTTATCGTTATTGAGACCAATCATAAAGTCGCTTTTCACGGTTTACCGAGAAGCTAGTAGTTATAACTTGTATAGTATGTTATTAAAATTGAACTTTTTTTTTTTTTTTGCGTTCAATGATGCCCTCAGTTCTGTGTCATTTGAAACTTTTTGTTACCGGTGAGATTTGAGTATTCGTAACAAACATTTTCCTGTGCTTCAGTGGGATACGAGGTTGCTGTTTTGGCATTGCAAACATGATTCTGGTGAGTTTATCTGTCTGATATTTGGGGATGGGGATTCTGTGGTCCATGTAAAATCCTTTAGAGCATAATGGAATAAGAACTGCAGTTATCGAATTAAGATCATGTGCTTCAGCAGTGGCCATGTTGTAGCCTCCCCGTTCCCGATACTTTGACTTTGTGTTTTCTTCAACTCTTGAGTGTAAGTGACCTTTCAAACTTTGGAAATATGTGCAGGTTAAGAGGATGAGAGAAACGCTATACTCTTCTCTTCTACTGCAGGTTTGCCTGCTCTCAGTAACTGATTCTCTTGCTGCATTCATTTATTTCCTTTGTTTGGTGTATGATTTAACTCATTCAGCAGTGTACTTATTGTAGGACATATCGTTTTTTGACAATGAAACGGTAGGTGATTTGACAAGTAGGCTTGGGGCTGATTGTCAACAAGTGTCAAGAGTTATTGGAAATGATCTTAACTTGATATTGCGCAACTTTCTTCAGGTTGATTTAGTTTTGATAGACGTAATGCAAGTAAAATTCATCTCACATATTAGAAGCTTTAATTGTTTTTTCTCATCTTGTTAGGGTGGAGGTTCATTAATCTACTTGTTGATTTTATCTTGGCCACTTGGTTTATGTACATTGGTGATTTGCTCCATATTAGCAGCAGTCATGTTACGCTATGGAAGGTAAACTTATGGTTTATTTTCTTCAAATTCATCCTTTCAAAAACACAAATTTTATTTTGCATTTGTAGTTCCTGCCATTGACTAGTTCAGGCATGTCTGGTGATGAAAATATCAACCAGAATGTGGATCAATGCTAGTCATGTTGAATTTTTCTTAATTAAATCAATTGGTAGACTCTAAATAATTCTCATCTCAAGAAATATGTCTCTGTAAAAGCTAAAGGGCTCTGCCTTCTTTCCAAAATCTGCTACAATGGTGTTATTGAGAATTTGAGATATTTATATATTTGTAAAAACGAAATATCAATGCTTTTAAGTTCCCTTCAAGGCTTCTACCGCTCTCCTTGTGTCTCCTTTATCCTAATGGTATTGATTTGCGCATATTTTTTTGTGTAGTTACCAGAAAAAGGCAGCAAGGTTGATCCAAGAAGTCACTGCTTCGGCAAATGATGTATAGAATAAGATATCTTATATTATACTATATTTTCCTTTATGTTTCCTAAATGCAATCTTAGTAACAAATTTTCTCATAGGTAGCTCAAGAGACATTCTCTCTTATTAGAACTGTACGAGTTTATGGAACAGAAGAAGAAGAATATGGAAGGTGATGATCCTACTACAATTTTGTCGTTTATTATTTTGTATTCCTGTTATTTCTCTGCCATAACACATGCTGTCCATTTCTATCTACAGGTATAATTGGTGGCTAGGGAAATTAGCTGACATCAGCTTGCGACAAAGTGCTGCTTATGGAGTTTGGAATTTTAACTTTAATATCCTTTATCATTCAACTCAGGTATAGCTAAGGTTTTCTAAAATCATATATTTATCCATTTTATTTATTTATTTCATTTTTTTTCCTTTTAACCCTGTATGTAATCTTATTGTTGGAAGAAAGCTTGTTGAATTAGTAATCAATAAACTTTTTGAAGTTTAGTTAAACCTTTATAATTGACTTGTTCTTTTATTGAAACATAAAATCTTATAGGTTATTGCTGTGCTATTTGGAGGAATGTCTATTCTAGGGGGTCATATCACAGCTGAGAAACTTACCAAGTTTATTCTATACAGTGAATGGTTAATCTACTCTACCTGGTGGGTGGGAGACAATATATCCAATTTGATGCAATCAGTTGGGGCTAGTGAAAAAGTATTCCATTTAATGGATCTCTCCCCTAGCAGCCAATTCACAGAAAAAGGCAAGTTCTTTTAGACTCATTTATTTGAATGAACACCTTCATATTAACTTAAGTCCTTTTCGTGCTTTTTTTTTAATCTTTTCAAGTCATCACCTATCCAGGGACTGCCTAGTCCCTGCATTTTCAATTCTTATTCTACTTGTACATTGAGCATTGATATTTTCCCTAGAATTGTAAGGGATAAATTATTATTTTATCAAACTATGCAATAAGTAAACTTTGTAGTTTACTTGTGAGGAATAAGGATGCTCACACTTATACCAACTGTAATTGTTTTAAAACTGTAGATACTTGCTTGACACTGGTGGTCGTCATAAGCAATATAGGTTTTTTGTTTTAAGAAAAACTAGCTACACCTGTAGTGAACTGACTGGGTCATCAAATGAAGTGTCCTGCAGTTATGTCATGTGCCGCTCCCAATTTATTATTCAACTACAGCATGTGCATCTATTGTTATTCCTCTACCAACAACATTACATTGATGAATAAATAACTAGAGAAAGTGAAACATAATGAATTCCCGCATAACTTTTGTTTGTTTTAATTTTACTATATTGAAGTTTGGGTGTAACTTTTGTTTCAGGTATAAAGTTGCAGAGGTTAATGGGGTGTATTGAGTTTCTAAATGTATCTTTTCACTATCCTTCGAGGCCAACGGTAGACCTTTATTTCTCACACCTTCACTTTTTTAGAATTGTAGCTATTTGATTCCATCTGTGTTCCTCGGTTACTTCGCAGAAGGATGAATCTTGCTACAATAGGAATAGAAAAGTTCATTACTGAGATTTTAGGCACTCCCCTCCCCAAAACAAAGTGGGTGCATAAATTGTTCTCTTTATAGTAGTATATGACTGGGAATTGTGCATGTATGCAGTGAAGTTGTATAGTGTCTTACATTTAGGAAAATGCATGTTCAATAGAAGAATGTGCTGATTGAATTTTAAAAATAATATTTTGAGCGGGAGGGCTCTGGGGGGTTGGATTCTAGTGTGTTTATATGATTCTTTGATAGAATACTTAGAGTATATGAAAGAAGAAAGAATAAATGAGTGGAGAAAAGGAGGTGCGGTTGATCAGTTAGTAATACTTGAGATTAAGAACTGTAAAAATATATTCTTGAGGGCTTAACAGATCCCTCTCATTATCTTCTATATATATATTGAAAAATCAAGAGTACATGGAACACCAAGAGTCTACACTAGACCTCTGGGCACAGAACTAGGTACCACTCATTACTGGTCTAGCAGACTAGCCTTAATGATGATATGTAACAGTAATTATTCTAACAGTAATAATTAGTAGGAGGAAAAAGCGGAGCTGTCGGTTAGTCAGTAATAAAGAGGGAAATGGGGTTGTATAAATAGGGGAATGGGTTGTACAGGGGGGTATTCTTTTTGTATACTGTTAGGTATAGACTGGACATCTATTCCAGTGGAGGGAGAGAACCTTCTAGGAGGTTGAGATTGTACATTGTTCATTCTTTCATCAATAATAGGCATTCTTTCATTTCTTGATGGTGTTGGTGTGTGGGTTGTTACGTGTGATTGACTTCTTGACAAAAGAAGTCTATCATTCTTCCCCACTGCACTACACACCTTGTGCATGCATGCAACTTCAACGCAATTTCTCATGTTATATGATGGATATGACTATCTAGCTTTCTCAATTAGCAGGTTACCCAGTGTATTCAATCTGATTGTGCATCTATATGGAATTAAGATTGTCAATGTTATTTGTTAGGTATACTGGCTTAAGTAATGGCAGATATTGTAACAGGTATCTGTAGTGCAACATGTTAGCTTTGCTGTCCATCCTGGTGAGGTGGTTGCAATAGTAAGAAACCACATCTCATCTCTTCAATTCATTCTTTCCATGCACTATGGATGAGATAATCTGCCGTTTCCTTTGACTTGTGTCATAGGTTGGACTTAGTGGTAGTGGAAAAAGCACATTGGTGAATCTTTTGCTCCGTCTCTATGAGCCTACGAATGGTCAGGTAGAGTTAGTTTATCTCATTACATTTGAGTGGACTTGTATGGTTGGCTTAAAAAATTATTGGAAGAGAA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