Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_33032 LG9 31594539 31597174 PREDICTED: plant intracellular Ras-group-related LRR protein 3-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   microgametogenesis, protein autophosphorylation, protein autophosphorylation, protein autophosphorylation
Cellular Component   is active in   cellular_component
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 31594835 missense_variant p.Arg404Gln
T/C 31595213 missense_variant p.Lys278Arg
G/A 31595245 synonymous_variant p.Val267Val
A/C 31595457 intron_variant
A/T 31595622 intron_variant
C/T 31595734 intron_variant
T/G 31595792 intron_variant
A/G 31596149 intron_variant
A/T 31597158 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_33032.1
MNPNLNDFPLLSLLLHHLHPHTHPPLPTHFHQSLLSKFPHLNHPQVLPSLTQRASTLNVSHTLSLLRTIGPRPDPSAVAAARAKIADPNAPDDETQVFHALVRVDGMHEECVKQLRAAEEMLVEAYAQSVKGVGEEVDEGVVGILRQAEIEEVKKVDLSGSQLRILPEAFGKIRGLVVLNLSQNQLEAIPDSIAGLQKLVELDVSSNVLESLPDSIGLLVNLKILNVSGNKLTALPESIALCRSLVELDASFNNLMCLPTNMGFGLVNLEKLLIHLNKIRLLPSSIGEMKSLRHLDVHFNELHGLPQSIGKLTNLEYLNLSSNFSDMTELPETVGDLVNLRELDLSNNQIRALPYTFSRLKNLTKLNLDQNPIIIPPIEVVSQGVEAVKEFMAKWWLDLIEEARQKSMAETNNQHAQTGWLAWGVSLLNNVAGVSESVVEYFGARKAPRDPWLDQQL*


CDS Sequence:
>Vu_33032.1
ATGAATCCCAATCTCAACGATTTCCCTCTTCTCTCGCTCCTTCTGCACCACCTTCATCCACACACCCATCCACCATTGCCCACACACTTCCATCAATCTCTACTCTCCAAATTTCCTCACTTGAACCACCCCCAGGTGTTACCCTCGCTCACCCAACGCGCCTCCACCCTTAACGTCTCCCACACGCTCTCCCTCCTCCGCACCATCGGTCCCCGCCCGGACCCCTCCGCTGTTGCCGCCGCTCGTGCTAAGATCGCCGACCCCAACGCGCCGGACGACGAGACGCAGGTATTTCATGCGCTGGTGCGGGTGGATGGGATGCACGAGGAGTGCGTGAAGCAGCTTAGGGCTGCCGAGGAGATGCTCGTTGAGGCTTACGCGCAATCGGTCAAAGGGGTTGGTGAAGAGGTGGATGAAGGAGTGGTTGGTATTTTGAGGCAAGCGGAGATTGAGGAAGTGAAAAAAGTTGATCTTTCTGGTTCCCAGTTGAGGATTCTCCCCGAGGCCTTCGGGAAGATTCGTGGTTTGGTTGTGCTTAATTTGTCTCAGAATCAGTTAGAGGCGATTCCTGATTCAATTGCAGGACTACAGAAGCTTGTGGAGCTGGATGTTTCATCTAATGTTTTAGAGTCTCTGCCAGACTCCATTGGATTGCTAGTTAATCTAAAGATCCTTAATGTGTCAGGGAACAAGCTAACTGCTCTTCCCGAATCCATTGCTCTTTGCAGGTCACTAGTTGAACTGGATGCAAGTTTTAACAACTTAATGTGTCTGCCAACGAACATGGGTTTTGGACTTGTCAACCTCGAGAAGCTTTTGATCCATTTGAATAAAATACGATTGCTTCCCTCCTCCATTGGAGAAATGAAATCTCTCAGGCATCTTGATGTTCATTTCAATGAGCTTCATGGTCTGCCTCAGTCTATTGGGAAACTCACAAATCTGGAATATCTAAATCTTAGCAGTAATTTCAGTGATATGACAGAGCTTCCTGAAACAGTTGGTGATCTGGTTAACTTAAGGGAGCTTGACCTGAGCAACAACCAAATCCGAGCACTTCCTTACACGTTTAGTAGGCTCAAAAACTTAACAAAGCTCAACCTGGACCAGAATCCAATCATAATTCCCCCAATAGAGGTTGTAAGCCAAGGGGTTGAGGCTGTCAAGGAGTTCATGGCCAAGTGGTGGCTTGATCTCATTGAAGAAGCTCGGCAGAAAAGCATGGCTGAAACAAATAATCAGCACGCACAGACAGGATGGCTGGCATGGGGAGTCTCATTGTTAAATAATGTTGCTGGGGTTTCTGAAAGTGTTGTAGAATATTTTGGAGCTAGAAAAGCTCCTAGGGATCCATGGTTGGATCAACAGTTGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_33032::LG9:31597174-31599174(-)
TTGACCAATAACATCCTAATTTATTACCTATAGATTACAAATTAATTTATACATAACTTCATTTAAAATTAATTTTTTTTCTTTATATTGAATAAATCATATCCAAAATACCAACATTTACTTGTTTTGGTTATTTTTTCTCTAAACTTTGTCAAAAATGGAAAGTAGAAAAAACAAGAGTTAAATGTTGGAAAATTAAGAAGCTAAGTCAACTTGACACTCCACAATGTTCTTCAAAGTTCTCCTTTTGGATAACCATAAATATCATATTCTTAATTTCAAAAGAAGTACTAATAACACTTTGTCATTTCTCAATAACTCAATGGAATATCTTTACCAATCATACTTCTTCACACATTCTATCACTTTCCTAATCACTATTTCTCCATCTCTTTATTTTTGATGTACATTCTCTTAAGAAGCTTGTAAGACAACAATCACACATTATTCCTTTACCATGTGAAAAGACTTTGCATGAGATGTAGAATGATTCCCACAATCAACTTCTTCTCCCAACAAACACATTCACTCCTTTACCATGTTTTAAACAATAAAAATTAACTGCTGCACGACAAAAACCAGAGATGTAAAGACCAAACAAAATGTGCAACAACCAAATGAACACAACATGAAACATGCAAGAACCACACCAGCTCTTGAGTTAAAACTCCAAAATAGCTACCTCCTCACATTCAGAACTGGTCCAACAAAGGAAACACTCAGTTGTTTGCTCCAAAGACTACCTAAAGGTCACGTTCCCGAACAAAAAAGTAAAGAAACGAAAATACTGCAGCACTTAAATGTAGGACAACACCTAGTCTACATCGAGTTTCTCCTAGAGACATTTATGCTCTCTATTTTGGGTGTAGAGTCGAGTATCTCCGAAGAATACACCTTCACACTTTACTTCACGCTTACTCAGGTAAATACATATGTGTTTAGTCAAAGTCCTTTCTTGTCACCGCTCCAAACCGTCTGAGGGTACCTGTCAAAGACACTCTGATGCTTAAGTCAGTAATTAATCCAAATGGCAGTCAGAGCAAAGTCTTAAATTCACAATAAATGTGATCACCTACCTCTTACCTTTGACCTCTATTTCTAATTTTTGAGATAGGCTTATGATTAACAAAACCCTAACCATGACCCAATCTCAGCTTATTATATGCAGTGGTTCTTTAGAGATGTTTACTGTCAAGATTGTCCGTTCGGTCCTTACCCACGTCTGGCCGCTCGACGCTTGTCTTATTTTCCCAAATTCGCAGGTCCAAACATGTGTGACCACCACCCATTCTCAGTGGTTCTTTTCGCCCGATCCTAGTTACGCGGCCGTCTGGCCATACGACACGCTCTCTAACTCTAGTTCAAGAAACTTGAACTTCAACATGTTTTAACTCTTCTAAAGAACTAGAGTGCTTAACATCTAGTTTTAAGCCTCAAGAGAAATTTTGGATAGAAAGTACCTCACAAAAGAGTTTAGTAATTTGTTTCAAAGATAGAGTGAATTGTTTTGTGCTATCTAAAAATTTTTAATAGTTGTTCTGAACTTTGAAATGTAACCTTAGGAGCTCTAGTAGCTCCTATTTAGTCCATTTTAAGTGAGAAAAATGTTCAATAACAACAACTCACCGTTCTTCTAGCAGCAAAAGAAAAATGTAATTAGATTACTAATTTCGGTTAACTTATTACTGAATATATGTAAACAATAACCATCGAAAGAGAAGACGAAATTAATCACCAATATTCCTAAACTTCGAAAATGAACACCAACAGGAAAACATGCACATAAACTTTGACTACAAAATATCCCAAATCCAATTTTATCTAAAGTAAATACAACTTTTCAATTTTATCCTCAACTCTAACCTATCACTTTTAAAAACAAAACCTACACGTACTCTTTCAATAATAATAAAAGAAAAGTAGCTTTTGTTTCGACCCAAGAGACTTACTCAACGGAAACATATCCAAAAGTAGAAATCAAACAACCATTTTGGCACGCC


Gene Sequence:
>Vu_33032(-)
AACCAACCCAAAACATTCACTGTTTCAATCCAAAACAGCAGTCAGCAGCAAAAGCTAGAAACAACCAAACCTCAACAATCTATCTATCTATCTACCATTCTTTTGGTTTTTTTTTTCCTCTCTGCTTTGATTCTCTTCACAAAAATGAATCCCAATCTCAACGATTTCCCTCTTCTCTCGCTCCTTCTGCACCACCTTCATCCACACACCCATCCACCATTGCCCACACACTTCCATCAATCTCTACTCTCCAAATTTCCTCACTTGAACCACCCCCAGGTGTTACCCTCGCTCACCCAACGCGCCTCCACCCTTAACGTCTCCCACACGCTCTCCCTCCTCCGCACCATCGGTCCCCGCCCGGACCCCTCCGCTGTTGCCGCCGCTCGTGCTAAGATCGCCGACCCCAACGCGCCGGACGACGAGACGCAGGTATTTCATGCGCTGGTGCGGGTGGATGGGATGCACGAGGAGTGCGTGAAGCAGCTTAGGGCTGCCGAGGAGATGCTCGTTGAGGCTTACGCGCAATCGGTCAAAGGGGTTGGTGAAGAGGTGGATGAAGGAGTGGTTGGTATTTTGAGGCAAGCGGAGATTGAGGAAGTGAAAAAAGTTGATCTTTCTGGTTCCCAGTTGAGGATTCTCCCCGAGGCCTTCGGGAAGATTCGTGGTTTGGTTGTGCTTAATTTGTCTCAGAATCAGTTAGAGGTATGCTCGGTCTTTTATGTCGATCTTTGTGTCTTTTGTTTTCATCGTAGCAAAACCTTATATTCACGTGATCATTGCCTATGATGTGTTTTTCTTCTCAATGTCATTTGGTGATGAACCTGTTTTCATCTTCTAGAGGATTAAGGCGGCGCGTTTGATTCAGTCTCTTTTGTCTTGAGTGAGAATTGAAGGGTCGTGTAGTGTATATACATAAGTATAATTTAGCGTTTGATTTAAATCCTCCACCAAATGTTTGAATCCATTGACATGAAGTGACTTAAGTTTAACCAGTAATTGACATTGAACACTGGTTCTACCGATCGAAATAAGGAAATAAAGCACTTGTTACGTTGAAGCGAAGTAACTCTTCTAAAATTTTAATTACATAATATAACAGTAAATTAGATTTTGTTGATCATGGTATAATTCAATTGTTTGTTGTAGCTTATACTTTTGGATGTTTTGGTGCCGTCAAAACAGGCGATTCCTGATTCAATTGCAGGACTACAGAAGCTTGTGGAGCTGGATGTTTCATCTAATGTTTTAGAGTCTCTGCCAGACTCCATTGGATTGCTAGTTAATCTAAAGATCCTTAATGTGTCAGGGAACAAGCTAACTGCTCTTCCCGAATCCATTGCTCTTTGCAGGTCTGTTTCTTCTTCATTCTAAAATTAAGGATTCTTAGATAATATAAATCCGTTTTTGTGTCTTTATCTAATAGTTCAAGTTTTTGGGGATAATTAGTTCATATGTATGTGGTTGTAGTAAATTCTCTGATACACTATTTTTAACACACTTTCTATTATTAATTAATATTTATTGAAAACTACACTAATCATGATTTAAGTTTATTAAAATCGAGATGGACTAACAAAGTTTATGATTTCCAAAAAGGATTTGGTCAATAGTAAAAAGTTATTGCCAGTACTTCACTTAGTTCATAACATGGTATCTGAGCTCATTTGACCAAATGATCTAGAGTTTGATTCTTGTTGCCTCCATTCATTTATGTTGTCATCACAACAAGTCAAAAGGCACTTGTGTGAATTATAACAAAGTTATTATTCATAATATATTTTCACCTAATAGCTTCCTTTTAATTGACACTTCTATTTTGTGCTTCTTTTAAGTTTTTCCTCAATGCAATTGTAGGTCACTAGTTGAACTGGATGCAAGTTTTAACAACTTAATGTGTCTGCCAACGAACATGGGTTTTGGACTTGTCAACCTCGAGAAGCTTTTGATCCATTTGAATAAAATACGATTGCTTCCCTCCTCCATTGGAGAAATGAAATCTCTCAGGCATCTTGATGTTCATTTCAATGAGCTTCATGGTCTGCCTCAGTCTATTGGGAAACTCACAAATCTGGAATATCTAAATCTTAGCAGTAATTTCAGTGATATGACAGAGCTTCCTGAAACAGTTGGTGATCTGGTTAACTTAAGGGAGCTTGACCTGAGCAACAACCAAATCCGAGCACTTCCTTACACGTTTAGTAGGCTCAAAAACTTAACAAAGCTCAACCTGGACCAGAATCCAATCATAATTCCCCCAATAGAGGTTGTAAGCCAAGGGGTTGAGGCTGTCAAGGAGTTCATGGCCAAGTGGTGGCTTGATCTCATTGAAGAAGCTCGGCAGAAAAGCATGGCTGAAACAAATAATCAGCACGCACAGACAGGATGGCTGGCATGGGGAGTCTCATTGTTAAATAATGTTGCTGGGGTTTCTGAAAGTGTTGTAGAATATTTTGGAGCTAGAAAAGCTCCTAGGGATCCATGGTTGGATCAACAGTTGTGATTTACTTCGTAATTTCGTGGGATGTATATAGTTTGCGATAGAACTTTTGGTTACTTGTGACCATTATAAATATGTGATCAATACCCGTGTTTCAACAAACGTACCATGATACAGGAGGCTTGTTTTTCATTTT