Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_32873	LG9	27612390	27616563	PREDICTED: uncharacterized protein LOC108340487 isoform X1	Map

Annotations

category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect	Amino acid change
G/A	27612501	5_prime_UTR_variant
T/A	27612507	5_prime_UTR_variant
C/A	27612512	5_prime_UTR_variant
G/C	27612517	5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
C/T	27615693	synonymous_variant	p.Asn535Asn

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32873.2

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>Vu_32873.1

MLKTYQDAAQNQRRKDSSNPPSAYSPLLKEQADQQIDVTGIHISNWDSVERSCRSEDMSSKFSFENDSQVNQPRPVMKKSQSLQSVLDQGIRDGDEDMGLSCDDAKSPIESKMSTSKKYHNGNPVDQYGSNPNIEFAASSGFANDASLFSIGDPTPSDKDAREISDTPLSGEYVGDIPDQTSVPGSVSLRKSHSSPNIRASILSTEKDAFRRALSRSCEDLHALSMRHKEEFINDFNDQIRGDHERENDMGKTEDGHMDNLFDDGFDSYLLTGSAKDWVIPLTYDTGDSKTLQGDSSVEFPNKDFKIKRIEDWVIGLQHCGPPVEETNEVLPEVVKPLADVNTVNGVTAAIVDHKATPGMDAAKRYISSLGPNATTAQLANHGLVVIPFLSAFVSLKVLNLSGNAIVRITAGALPRGLHALNLSRNKISTIEGLRELTRLRVLDLSYNRILRIGHGLASCSSLKELYLAGNKISEVEGLHRLLKLSILDLRFNKISTAKCLGQLAANYNSLQAINLDGNPAQKNVGDEQMKKYLQGLLPHLVYYNRQPIKVSTLKDGAERSVRLGMNSHQFDRSLRSDRKTTRKSSQGGVGSRRSVATSTHVRRNVDSPKVSRGKQALPPSRTKVPTHTRHQFEASTKVLNVTPKLSMRKSRSEGNFGAL*

>Vu_32873.3

CDS Sequence:
>Vu_32873.2

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>Vu_32873.1

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>Vu_32873.3

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Gene Sequence:

>Vu_32873(+)

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