Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_32844 LG9 27041632 27042371 PREDICTED: MYB-like transcription factor ETC3
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 27041691 synonymous_variant p.Leu53Leu
A/T 27041722 splice_region_variant&intron_variant
C/T 27041906 intron_variant
G/T 27042006 intron_variant
A/T 27042078 intron_variant
G/T 27042117 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32844.1
MADIDRSSDNASADSKEKSLQTSTMEFSEAEEILIAMVYNLVGERWSLIAGRIPGRTAEEIEKYWTSRYSTSQ*


CDS Sequence:
>Vu_32844.1
ATGGCTGACATTGATCGCTCATCTGATAATGCTTCTGCTGATTCTAAAGAGAAATCCCTACAAACTTCGACTATGGAATTTTCTGAGGCTGAGGAAATCCTTATTGCCATGGTGTATAATCTGGTTGGGGAGAGGTGGTCTTTGATTGCTGGAAGAATTCCTGGAAGAACTGCAGAAGAGATAGAGAAGTATTGGACTTCAAGATATTCAACTAGCCAATGA


Promoter Sequence:
>Vu_32844::LG9:27042371-27044371(-)
GAATATCGGCTTTAATATTCTGAAAATAAAGAACAGTGCATTAATAAGTATTTTTTTTACTAAAATAATGATAAAATACTTTAACAGTTTTCAAGGGGTATGTTGGAGTGAATAATTAATATAACCTCTCATTCATTACTTGATAATTCAACTCGTATAAATAACCATTTTCAGCTTATTAATTAAAATACTAGTTTTGTTAATATTATTTTACAAATAATGGATGAGCAATTAATAAATAAAAAAGTCATATTCAAATATATTAAAGGTTATTACTTTTTTTATACAAAAAATTGGCTTAATTTGTCAAGTATTTGTAAGATTCTATTTTCTCATGTAAATTGAAAATATCTTCTGAAATTTAAATATTGTATCATAAAATTGATTTAAGAGGTTAGAATAACTTTGTGAGAAGTTAGAAGACACAGTGATTCACTCAAAGATCTGGCCAAATACTTAATAGATTAAATTATCTGTTAACCATGACACTATCTGTTAGTTTTTAGCATATTATTGAATTAAGTATTATGTTGCTGATGATTGGAATATACGATCTTAGAAATTATATTTATTGAAAGAAAATAAGAAAAAATGGTTTTATTGGAACCATTGATTAGAAGAAGTCGTGACAACTTTAGCAGTTTAACACTGTCACCACGTTCTTATCCCTTTCAGGATGACTCAGCCCTATCTATACATAGCATTACAAAACAAAGCATGTTTTTGTTTGATTATAATTGCGTACCATCGTATATAGTAAATTAAGTTTCTCTTACAAAACGTGTACAAGATGTTCTGGTAAACGCAAAGTCCTTTCTAATCATACCAATTTCCCTCCCTTTTTCAACCTTCAACATAATCACTTCCATCTTCAACTTCAACCATAAAAAAACTCAACTTTTTTATTTTTACACTTCATTTTTTTAAAAAGTAACTGCTTTTGTTTTATTTTCCATCATCTTCATCCAAAACATTCTTCTTTCCAATTTGAGTTTTCTGCGTCTAAAAGAAAGAAATCAGTTTTTCTTTGGGTAGCAAAGTAGCGAAAGCGATGTTCGTGCAGGTGTTATATGAGTTTCTAGATGATTGATTGGTCGGAGTTTAGGATCTAGAAGATTGATTACTATATTGTTTTCCTTTTGGGGTGACTTAAAATTTTTCATCAGTGTGTTTTACGAGGTCCTTTGTTTACTTTATTTTGGCATTTCCCTCTTATTGAAGAAAGAGACAGAATCAGTGTAGAATTTACCAGCTACCACCCTCCCAACAACTACTAATTTGCTTCAACTTTTCAAAGGAATTAACAAACTACATCTTTTTTTTGTTTTCATAAACTCTTCCTTAAGCTATATTAAGAATTCATAAATATAAATTATCATATTCTTTAAAAAAAAACCACACTTGTGATGATTAGAATTTTCTTTTTTAAGCACAACTCTTTGTGAAATCCAAAATTCAATGCACAACTATTTCGAGTATTAATTTTAAAAAAAATGTTTTTTAATAACTTTTTTTTATAACCTTTTATAATAATATATATGATAGTTTTGATTGGTCTGTTTGAAATATAAAGACCAATAAAATAATATTATTTAAAAATATCAAAAAATTGTTAAAAAAATTATGAGTGGTCTTAGCTTAATGAACGTACGACCATAAGATATACTTTGTGACAGACATCTTGGTACTATGATAATTTTTCTTAGATATTCGTGTGCATCTAACACCGACACCTTTGTCATCTACAAAATTCCACGCCAACTAACACGTCCAACCCAACTACCATGTGTTCAACTACCACTTTCCACTCTCTCTTTTTCTTCATACCCTCTTCTCTTTATTTCTTCTTCTTCTTCATTTCTATGTACCCTTTCACTCTCCTATGAATTTACACCCTCCTATATATTAATACCGCCGAATCGTTTCTTGTTCTATACACTCTTCTTTTTCAAAACATATTCAATAAAGGTTTTCAAAGCTCTTTTCAACTTGCTGTTGCA


Gene Sequence:
>Vu_32844(-)
ATGGCTGACATTGATCGCTCATCTGATAATGCTTCTGCTGATTCTAAAGGTACCCTTTAAGAACGGAGTCTTCTGATACCTAGACAAGTATATTTTGACATAATTATACTATAACATGAACATACGTACTGATAACTAATCTCTCTGCAGTTTTATCTCAACGCTTGTTTTGGGTCATCATCCTTGTATGCCATTACATTTCTCAAATTTTGAATACTGACAACTGATCTCTCTGCAGAATCCTATTCTCGTTGCATTCTTTTTCTTTTTTGTGACCACCTGAGATTGCCAGCTTCTAGTCTTAATGTGTGATAACTTTTGATATATTGAAAACACAAAGTTGTTCATTGCATTACTTTTAGTAACTAAAACTATTTAATAACAAGGTATATATGATCTTACACTATGTGATATGTGTCTATCAGTGCATTAGAAAAGTTGTTTTCTTTATAAATTTGAAGAGTTGATTTGTGTTATGCAGAGAAATCCCTACAAACTTCGACTATGGAATTTTCTGAGGCTGAGGAAATCCTTATTGCCATGGTGTATAATCTGGTTGGGGAGAGGTGAGTATATGCATGCTTTCTTTTGTTGAAACACTTTTATTTTTTCATTTTAGATGAAGGTTATGAAACATTAAGTTTTTCCTTAGGTGGTCTTTGATTGCTGGAAGAATTCCTGGAAGAACTGCAGAAGAGATAGAGAAGTATTGGACTTCAAGATATTCAACTAGCCAATGA