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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_32784 LG9 26281821 26284997 hypothetical protein LR48
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 26284930 missense_variant p.Ser23Leu
C/T 26284954 missense_variant p.Ser15Asn

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32784.1
MKSQKQHLSFEEPSSKELGSSSSKCNKIAPFEAVEHEQPRIPPIRPTEKRHRVPSAYNRFIKEEIQRIKASNPDISHREAFSSAAKNWAHFPHIHFGLKLDGNSQGKLEQGEGGEKTNGFY*


CDS Sequence:
>Vu_32784.1
ATGAAGTCACAGAAACAGCACCTAAGCTTTGAAGAACCCAGCAGCAAGGAACTGGGATCCTCATCTTCAAAATGTAACAAAATAGCGCCATTTGAGGCAGTAGAGCATGAACAACCAAGGATTCCTCCCATTCGTCCTACAGAGAAGAGACATCGTGTGCCTTCTGCTTATAATCGATTCATTAAGGAGGAAATCCAAAGGATTAAGGCTAGTAATCCAGATATCAGCCACAGGGAGGCTTTCAGCTCCGCAGCCAAAAACTGGGCACATTTCCCTCACATTCACTTTGGGTTAAAGCTGGATGGTAACAGTCAAGGAAAGTTGGAGCAGGGAGAAGGAGGTGAAAAGACCAATGGATTCTACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_32784::LG9:26284997-26286997(-)
TGCTAGTTTGGTCAGCGGCAAGAGATATATATGTATATATATATTTATATTATATATGCAGCCAAAGTAATAGCAGAAAGTTATGAAATTAAATAATTGAAACCCCTACCCGTACCTAACAACACAATTGTGAGAAATAAAGGAATTTTGTGAGTCAGAAGTGGAAGAAATTTTGAGATGCTTAAAAAATGCTTACTAAGGCTCAGCCTTGAGATCTATATACTAGGGTTATTCACAGGTATTAGGGTTCCCCTCTTTTGTTCAACTTTGTAATAAATAATAATTTTTTTTGGCAGAAGAGTAAACAGCAACTAGTATATGAGTATATGATTTGGTTTGGTATATGGTATTTTTTATTCTTTGTTGGTCTGTGTACTTGTGTGCTAAATTAACACGGTTCAGAAAATTAAATCTGAACACAACAAATCCATGTGATGGTACGCAGTGCAGTTTCTCTCTCCTCAGTCTTTGATTTGATCCCTTAATTGCCTTTCTGTGGCGATGAGGGTGAAGCATCATATCGTCTTTTATGATATCGTATATTTCATCAAGTTTTTTCACGGTTTCAGCCTTGTTGCTTCCCTTAAGTACAGAGGCAGTGTCCTCTCTTTCTTTCTACAAGAACTTGTGGGGATTCTGATAAATTCATATTTCACCACCAGAACAAGCTATATCACATCATATCATATGCCCCCTCTCTCCTTTTCTTAAATCTTTCTTGTTACTTTCTTTTGTGTCTCTCCTTTCATCATAGCATGTTGAAATTATAATTACCCCTTTTGAGAAAGCATTCTCTTTTCTTCTCTCCTTCTCAAATGAGATCTTACCATACCTAAAGGGCTAATCTGCTTCATTATGATACATCATTCTCTTCTGGTAGTGGTTAACGGTGGTGTAGCCCTTCAAGGCCTTGATGGTTTCCGTTCCAGTCAAGTCCTTTTCACCCTCTCTCTTTCCACCACACTGTGTGCAACAATTTCTATCTTTTATCATCTTGCCTTGTAGTGTCAGCAAAAAGTGATGCGCACCCACAACAAGGGGACATTGTGAGAGATTGAGAGTACTGAATTTTAAATCGCCCCATGTCAGGTTCAGAGCGTTTGCTGCTATTATATGGATGTATTGAATGTGCCACACCACACCACACTCTCCCTAGCTGGACACTGCACACTACACACCCTTAAAAGTATACCTCTCTCAGAATGAATGAGAAAAAATTACTGCATTCGCTTCCCTCTCTAGCTTATTTATCATCTTCTTATAACCTCTTTCTTCTGGCAGCTATGCATTTTGTCTTTTTCTCTGTTCATTTTTCATTGCAGTGCTGCATGGTGTGCTTTAGAAGCACTTTTCTTGGGAATGTGAAAGCTTCACTTATCCTATACATGTATAAACGTTAACCTCTTTTGACAATGTGAACACCCGTATATGTATGTATGTATACATACACACATATCTATTTCTATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTAAGTGCGTCCATTGGTGATCAAAATTGTGCAGCTTTAAGTTCTTGGTTTTCATTCGTGAATGCATGTTTTACTGTATGCATATAAGTGAAGAGGATGTTCTTATACTCACTTTTCTACTGTATATTGTGTTTATTATGTATTTGAAAACGGGGTGTTGCAGGTTAGTGTTCCATACAACAGTTTGCTAACCATAGTGACGGTTAGATGTGGACATTGCGCTAATTTGCTATCAGTTAACATGGGAGCATCCCTTCAACCATTTCCTCCTCAAGACCTTCAGGTGTGTGTATATATATATATATATATATATGCATATACATTTCAGACTGTATTGGTCAATTCCCTCTTTCTGACGCCATGGGCAACCATAAATGAGATAACATAATTTCTTTATACTCAGAAAAAAAAGAAGAAAAAAGCCTGCAGCTCTTTGAATGAATAACTGTGTGATCCTTTATTAATTCTTCTGTGTAATCTGTTGCTA


Gene Sequence:
>Vu_32784(-)
ATGAAGTCACAGAAACAGCACCTAAGCTTTGAAGAACCCAGCAGCAAGGAACTGGGATCCTCATCTTCAAAATGTAACAAAATAGCGCCATTTGAGGCAGTAGAGCATGAACAACCAAGGATTCCTCCCATTCGTCGTGAGTATACATTCTCACATTTCATGATTAATTTTCCCTCCTTTTGGTATCTGCTTTTGGATCGTATCCTAATTCGCCTAAATCTGAATGAACAAAAAGGCAACATGTATAACTAGACCAGCTAACCTGATGAGGAACTTTTTAATATCAGTGACAAGTTTTAATTAAGGATGAAAAAGACTCAAACTACTCTCTCCATAGCAGCAGAAGCTAATTTAATACAAGCAGCAGCAGAGCAGAACGACCTTATCATTGAGGGCCACTAGTCATAAAAACAAGTTTTTCCAGTTTTTTCAGAGAGTCGGCGTCCATCTGAGTAACCAGTTTTTATGTGCCCAATTGGGGCATCTTGTTTTCTCCATCAATTTTAATGGCCCCCTCTAAGATGGTGACCTTACGTAACAAAAAATTGACCCATCCTTAATTCATTGCTGTCATGCCATGCCCTAAAACAAGAACAAGGACTTGTGTATTTTATATCACACACATATACACATTTGAACGCAATTATCCACGTGTAATTCATTTTACAGTCACAGATTCCTTTCACCATTATATAATAACAGCTCATCATGGTAATTATATTGATACTTGCAAGAAAAAGGTAGTAAGAGGTAGCAGTACTTAAGTTATGTAGTGGTCGATCTTCTCTCGCTGTGAGTGAACTGTACAAAGCAATGACGACAAAAACTGTTTCAGAAATTAGAAAGAAAATCCAATGGACTCTTGGATAAACAACGGAAATTTCAATGCTATTTGAATGCTAGAGCATATAATTGAATGGTCCTCCACAACCCAGTTCCACAGCTTCAGTCTGTCCAGGGAATTTGGCCTTTCGTGTGAAAAATTCCATATCTCAACCAGTTTTTCTGTTGGGGAATCTCTGATGTAAATTTTTTTGGGTTACAGATCTAGTGCAAATTGATGATTCATTCTACTTAATTTTTCTCTTACATCGTTATTCAATATTCCTAATTAATTCATCTCATGATTGTTCAACAGCTACAGAGAAGAGACATCGTGTGCCTTCTGCTTATAATCGATTCATTAAGTAAGTAGTTTTCGCCCTTTGTTATTTTAAAATCAACCTCCTTGCTTCTCCCTAATTACTGTGATATATTATGTAGGATTTGATTAAGGACTGAAATTATCATCATCACCATTATTAGAGATAATTATACGCATTTCGTTAAAGTTATAATGTCAATTATATTTATACTTTCCTGACTTTTACTTTTTTTTTCAGATTATATAAAAATAAAAGTGATGACATGCATAATAATTTAAATTTTTTAAGAGTCAATAAAGTATTATATTGGATAATTTGTCATTGATTAATAACATTTATCATTACATTATTTATTCTAAAAAGTAGTATATATATAAAGATAATAGTAAAGGGTGTAATTACTAAAGAAAGAAACAAGCATTATTAATGTCAAGCGAAATGATTAAAATTTTATTTCGTATTCAAAGAATAAAGATGATCCAACAATCCAAGTAAATAAGTTTCTTAATTCTAAAGTACAGTAGAGATGATTCCATTGAGTAAAAACAAATAGCAAGTCTTTTCAAGTGTCTGATTTTGCAGGGAGGAAATCCAAAGGATTAAGGCTAGTAATCCAGATATCAGCCACAGGGAGGCTTTCAGCTCCGCAGCCAAAAACGTGAGTTTAACCTTAATTACTACATTAATCAGTATATATCATTCTCTGATCCATACAACTGCGTGCTGCACTTTTCTACATTTTTCATGTTTTTTGGAGCCACTTCTGTCAATTTACAGACACTCTTGTCTCTTCTATAAACTTCTTGCTCAAGGTCACAATCCAATATTATTCCTACGGTTATTTCAAACATCCTTCCAAAGTAATCATCTAGCTTGAGGGTATATGTGGGAAATCACATTTTTTAATTGGTTTACAACCCAGGAACATGGTATTTTATGTTATAGCCGTGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTATTGGTCATATACAACATGAGATGTTGATAGAAAAACAATACATACAACATGAGGTTATCCAATCTTGTAAAGACAAAGTTTACAAAAGCTGATGCATTAGAAAAGGGATGTGAATCAACATTTGTTGAGGAATATGTTTAAGCATTTGAGTGGGCAACTATGTTCATTATCATAAAACCGTATCAAATCTCCCTTTTAAAAAGCCTACAACCTGTCAAATTAGGTCAAGTTTGATAGGCCATAGCCACTTTCACTTTCACGTGATCACTTTGTTAACCCTAACACATGCTGTAACCAGTGTCACTTGTCTAATTCGTCTACATGTGATTCCATCACTCTCCTATGTACTACACTGTGCTGCTTTTGAACTCTCTTATTTTTCCTATGTACCATAGCATGTTTTTCACCGCATTTTATTTGGACGCCACACACAGTCCAAGTTGATTGAAAAACCAGACCTGATCGATCACCCTTCTTCAAAATGACCATACCTGTTCAAAATTATGCATGTTAATTTGTACAAGAAAAGCACAAGCATCACAGACATTAGAATTTCCAGAAAAAACTCTCACTTTATCCATCACAACTAATGCCATTGAAAGATATATATATATACAGAAAAAATAACTAATAAAATGGATCTGAAAGTGTTGTAAAGTGAGTTACTATAATAACATGGTCATGCTATAGCCATTTTAAAGACTAATAAGTGAAAATCTGTTCAAAGTTTTGAAGTTAACTTTGGAGTTTATTAGTTATATTATCTGCCAGTTCCTGCAAGAATCTTGACTATATATGGCATAAACAGCAGTTCATTGTTATATATAAATATATATGTTTGTGAGTCCATGAAATTTGTCTTTATGAAGAGTGCTTGATGTTTATATGTGTATGCAGTGGGCACATTTCCCTCACATTCACTTTGGGTTAAAGCTGGATGGTAACAGTCAAGGAAAGTTGGAGCAGGGAGAAGGAGGTGAAAAGACCAATGGATTCTACTGA

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