Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_32666 LG9 24248540 24250486 PREDICTED: WUSCHEL-related homeobox 6
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 24248793 upstream_gene_variant
C/A 24248801 upstream_gene_variant
A/G 24248963 upstream_gene_variant
T/G 24249064 missense_variant p.Ser75Ala
A/G 24249217 missense_variant p.Arg126Gly
G/A 24249518 upstream_gene_variant
T/A 24249690 upstream_gene_variant
C/T 24250185 missense_variant p.Ser206Leu
A/T 24250378 missense_variant p.Gln270His
G/T 24250382 missense_variant p.Gly272Cys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32666.1
MSDSYASTFHSPTPNVTHATPKITTLCSIAQPYCICTHCNHILSFNHRVGNAAEEGTNNTGSHVQSQQSTRWSPTPVQLLVLEELYRQGTKTPSAEQIQQIASQLRQFGKIEGKNVFYWFQNHKARERQKRRRREMEENNAASSSEGLKETGCGVKETKKWASTSNCSLHAEESAALDIAEKGSNGWTQFEERGIQVLRRNISERRSQLQDNMEMPCFPPTTMAALATSHRTLSTQLLIPQSYNRESLNYYDGENADPRTLDLFPHKNDDQDGICLAERKSMFCASASMDTDITSSQFFEFLPLRN*


CDS Sequence:
>Vu_32666.1
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Promoter Sequence:
>Vu_32666::LG9:24246540-24248540(+)
TGAAGCTTTTCCAAGTGAGTTTAAAATGTGCTCTTTGTAAAAGTGTTCTTCTTTGTCATTGAGAATTTATAATCATAGAGAAGATTAAAAAAGTGTAATATAGAAAGATTTGTATATTTTACAAAGTGTTCTTTGTCATTGAGAATTTTTAATCATAGAAAAGATTAAAAAAGTGTAATATAGAAAGATTTGTATATTCGTTATGAAATGAATCAATATAAAATTTTATGTATGCTTGGTCTGTGTTCGGTAGACAAAGTATAGAGTTGAACATAATGTATACGTTCTTTTGGAGTGTATGAAAAACGGAGGAGAAATAAGATAAAAGAGGGGCATGTGATGTGATGAATAAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAATATGATAGAGAAAGCAAGTGTATTTTTATAAATTTTTTGACCTCACTAAATCCCTGAACAATAATAAGTTTTACATCTTTCTCTATAAAAATACCTTATTAAATAATAATCAGTAAAAAAAAAGACGACGGTAGATATATTTATCATTTTTTTCTAAGTAAATAGATTTAACTTTAGAAACAATATATTAGTTTTATTATATCTTGGTGACTAAACATGCTTGTGTTTCCATGGGTATATTGTAAAGTGTTGTAAAAAAAGAAAAACAAAAAAGAAATTATTAGAAGCATTTAATTTCCCAAAAGACCTGTTGCAGTGGAGATGAGATTGATTAAAAGATGAAGAGGGTACAAATGATCATGTCAGGTTGCTAAAATTGTGGTCTGGATTTTTATTTGAAGTATCATCTAACTGTACTGGCAAGCCATAAAAAAATGCAACAGATTGATTTATTATGGAGTTGCTGCCAAGAAATCATGACTTTATTTTAGCCTTCTGCAGTTACGTGAAAGTAAACATTTTGGCGGAAATTAAAGAAGCAGACCTGTTTTGTCCTCAATGTATTTGCCCTACTTCTCTTTGTATAGTTAGCATAAAGTGCTTGTTATTTCTCACACAACATGATTCTCTGACCCCCTGCTTCCCATTTGTTAACTTAGTGCAACAAATTCTAACGCAAAGATTCGTTTACATTCACAAAACGGCAAGTAGAAAACTAGACAACTTATACATCAATAATATATCTTTAAAAAAATCGTATCACTTTAAGATTAATTCAACCATAGTAAACATTCGTTTCTCCAAAACATGCCATTTAACTCAAAATTTTCTACTTGAGGGAGAGGAACAAAAACTTATATTTTTTCTTCATTATTTACAAGGAGCTGTGTGAAAAGATCACATCTTAGATGATCAGAAAATGCGTGGAGTTGCTTAGCAGCATTTAGATAGTTCTTTTTTTCCAATTGTGGGTGTTAAACTTGTGATTGTCCAAAAGTGCAGCGTGTTCATATACAGTGTCAACTGTGAGGTACAAGACAAAGCAAAGAAGTAGTCATACGAAACAGGTCTCCTTTGTGTACTTGTAGGTTGTGTGTCTCAAACGGAGTGGAAGAGAAAGGAAGAGGGAAAAAATAAGTTTAACCATGTGATGTGAGCGTGTTGGTTTAGGATGAAAGAGGAGACATAGGGAAGAAGCAACTTTAATAACACTGCATCATCATCACCATCATCATTATCATCATGCTGTGTCCTTTTTTCAGAAACACACACACACCTTCACTCTCCAAATCTTAGAATTCTACGCTTTCCATTTCCCACCTCTCTCTTTCCTTCTCTCTCTCTCTCCTCATGATTTGAATACATAACTTGGTTTCTGTATTATTACTATTGCACACTATCATACATATTGGTCAACTCTTTTGTTGGTTGCTGCTCCACCTAAAGCTTTTACTACAACGTTCCCTCTCCCTATAAATACACTATCCCTCATCACATATTCCTAACATCTTTCTCACACAGAAACCCTATTTTCAAACTGCAGAAGGAAGAAACCTCGGTAGCCAATGTGCAATATTACGACAAAGATCTCTTAGTGTAGATTACGACCAAGATTCTAAACCTCAACA


Gene Sequence:
>Vu_32666(+)
ATGTCGGATTCTTATGCTAGTACCTTTCACTCTCCCACTCCAAACGTCACCCATGCAACCCCCAAAATCACCACATTGTGCTCAATAGCTCAACCTTATTGTATTTGCACTCACTGTAACCACATCCTCTCCTTCAACCACCGTGTTGGTAAGCCTAAGTCGAATAAAGGGCATGTTTGGATAACTATTCTAAGCATATTTTTGTGTGATGAATGTAGGGATTCTCTTTGTGTTTTTGATTTTGTACATTTGCAACAAGTGCAGTGGTTATCCATACATGCAGGATTCATCAAATTCTCATACATATACATGTCCATATATAGTATACTCATAGTATAGCCTTCTTAATGTTCCTTTTAATGCGGTTAATTAGCATTGACTTGGGTATGGTAAGAAATTTGATTACACTTGGGATAAGCATCTATTTTCCATGTGTCCTGTGGTGCAGGTAATGCAGCAGAGGAAGGGACAAATAACACAGGGTCCCATGTTCAGTCCCAGCAAAGCACAAGGTGGAGTCCAACTCCAGTTCAGTTACTGGTCCTTGAGGAATTGTATAGGCAAGGCACTAAAACACCATCAGCTGAACAGATTCAGCAAATAGCTTCACAGTTGCGGCAGTTTGGGAAGATTGAAGGGAAGAACGTGTTCTACTGGTTCCAGAATCACAAGGCGAGAGAGAGACAGAAGAGGCGCCGCAGGGAGATGGAGGAAAATAATGCTGCTTCTTCTAGCGAAGGTGAGAACAAAAAAGTAGTAAGAAAAGTAGTACGTTGAGGGAAATTCAGAAAAAGGCAATAAGATAGAGGAAGGAGGTACATATACAGCTAGATATTATCATGTTCTAATGCCACAACGTTTTTGTGGCCTTTGGGGCTATTCAAGGTTCTTTTAGCGGTCAAAAGATTCCTATATTATGCATCACTCTTGCACTGATGATTAAAACCACGAGAGAGAGAGAGAGAGTGTGTGTGTGTGGGTGGTTTCTTATGATTTTTTTAGGATGCAAGATTTGACGTTAAATTTTGGGGGTGTTTGGATTTTGGCCACAGGGTTGAAAGAGACAGGTTGTGGAGTTAAAGAGACAAAGAAGTGGGCATCCACTTCAAACTGCAGTCTACATGCAGAGGTCTGTAATTACTCTTGGCTTTGTTCACGGTACTACTATAACATTTTATTCAGCTTTGTTAAGCAAAGATACCCCATATATTATAGGAGACCAATAATAGGGTCTAATTATTTGTTCACAAGGTAAAACAAAAGATAAAGCCAAAATATAAAAATTCACTCTGCATTGACACATAACAAAGAAATAAAAGAAAACAACAAGAGCTTTTGTATCTTGGAAAAAAGGAGAGGTTCAAAAGCTGCTTTTTTTAACTTTCTGTTGGGGCTGTTTTATGCTAGATCAGTTCAGACTTTCTTGGACTTGTGAATTGAATGTGAATTCTGAATTCTCTCCACCCCATTTTCCCACCCTCTCTCTTGTTTTAATTTTAAATTGTTTTTACTGCCAACTTTTACTATCCGTATTTTTCTCAGGAATCTGCCGCACTGGATATAGCAGAAAAAGGCTCTAATGGGTGGACTCAGTTTGAGGAGAGAGGCATACAAGTTTTGAGGAGAAACATATCAGAAAGAAGGTCGCAATTGCAAGATAACATGGAAATGCCTTGTTTCCCTCCCACTACTATGGCAGCTCTCGCAACCTCACACAGAACACTTAGCACACAACTTTTAATCCCTCAAAGTTATAACAGAGAAAGTTTAAACTACTATGATGGAGAAAATGCAGATCCTCGAACCCTCGACCTATTTCCACATAAGAATGATGACCAAGATGGCATTTGTCTTGCTGAGAGGAAATCCATGTTCTGTGCCAGTGCTTCTATGGACACTGATATCACCTCCAGCCAGTTTTTTGAGTTTCTTCCTTTAAGAAACTGA