Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_32591 LG9 22540393 22543437 hypothetical protein PHAVU_008G204800g
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03012 Translation factors [BR:ko03012]
SNP Position Effect Amino acid change
A/C 22540417 splice_region_variant&intron_variant
T/A 22540449 intron_variant
C/G 22541047 intron_variant
T/C 22541268 missense_variant p.Phe28Leu
T/C 22541272 missense_variant p.Phe29Ser
G/A 22541279 synonymous_variant p.Leu31Leu
C/T 22541280 missense_variant p.Arg32Cys
T/C 22541283 missense_variant p.Cys33Arg
T/C 22541303 synonymous_variant p.Arg39Arg
C/G 22541304 missense_variant p.Leu40Val
G/A 22541309 synonymous_variant p.Ser41Ser
C/T 22541323 missense_variant p.Ser46Leu
C/T 22541326 missense_variant p.Ala47Val
G/A 22541331 missense_variant p.Ala49Thr
A/G 22541338 missense_variant p.Gln51Arg
T/C 22541340 missense_variant p.Phe52Leu
T/C 22541348 synonymous_variant p.His54His
G/A 22541353 missense_variant p.Arg56His
C/G 22541358 missense_variant p.Pro58Ala
T/C 22541416 intron_variant
C/T 22541549 synonymous_variant p.Thr87Thr
C/A 22541571 missense_variant p.His95Asn
C/T 22541575 missense_variant p.Ser96Phe
T/A 22541585 splice_region_variant&intron_variant
C/T 22541668 synonymous_variant p.Leu99Leu
T/C 22541683 synonymous_variant p.Ile104Ile
G/T 22541713 missense_variant p.Lys114Asn
C/T 22541875 intron_variant
A/T 22542009 splice_region_variant&intron_variant
A/T 22542017 intron_variant
A/G 22542206 intron_variant
A/T 22542252 intron_variant
C/T 22542453 intron_variant
T/C 22542460 intron_variant
G/T,A 22542595 stop_gained p.Trp204*
G/A 22542912 stop_gained&splice_region_variant p.Trp219*
T/A 22542958 stop_lost p.Ter235Argext*?
A/T 22543021 missense_variant&splice_region_variant p.Ile256Phe
A/T 22543163 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32591.1
MEGQDMEVKVAPPVLCFPPSSELRVFLIFFHCAVSIFTFVSRLLHLQPSRLNFSIFVTLCHFAIPEACDLHNLCVSPFPSPNLRVSPPPSPLDFSILAELVDLAISLFEELELHKVESIVHRSHVLLHGLLDSVNNFFKGEIPQSLRHLRSLQYLRLSNSTLVGECPESLAKMIQLNFLILVESSAEDWREGEEAKDLSRESERLEEREAAKKSAKKKECGKSFVLLNVKSWDDETDMKKLEQAVCSIEMPGLLWGASKLVPVGYGIKKLQIMMTTMDTLVITSRAPQSKECDTLVFFNFVL*


CDS Sequence:
>Vu_32591.1
ATGGAAGGTCAAGACATGGAAGTCAAAGTTGCGCCTCCAGTGCTTTGTTTTCCACCTTCATCAGAGCTTCGAGTATTCTTGATTTTTTTTCACTGCGCTGTTTCCATCTTCACCTTCGTCTCTCGACTTCTTCATCTTCAGCCTTCGCGTCTCAATTTCTCCATCTTCGTAACCCTTTGTCACTTCGCAATCCCTGAAGCTTGTGATTTGCACAACCTTTGTGTCTCTCCATTTCCATCTCCCAACCTTCGTGTCTCACCACCGCCTTCGCCTCTCGACTTCTCCATTCTCGCAGAGCTCGTCGATCTTGCGATTAGCCTTTTTGAGGAGCTTGAGTTGCACAAGGTGGAATCAATCGTTCACCGGAGCCACGTCCTTCTTCACGGCCTCCTCGATAGTGTTAACAACTTCTTCAAAGGGGAGATTCCTCAATCTCTGAGACACCTGAGAAGCCTCCAATACTTGAGGCTCAGTAATAGCACTCTTGTTGGTGAATGCCCAGAGTCTCTGGCTAAGATGATCCAACTCAATTTTTTAATCTTAGTTGAAAGTAGTGCAGAAGATTGGAGAGAAGGTGAAGAAGCCAAGGATTTGAGTAGAGAAAGTGAAAGATTGGAGGAAAGGGAGGCTGCTAAAAAGTCTGCCAAGAAAAAAGAGTGTGGCAAGTCTTTTGTCCTACTCAATGTCAAGTCTTGGGATGATGAGACTGACATGAAGAAGTTGGAACAGGCTGTCTGCAGTATTGAGATGCCTGGTTTATTGTGGGGAGCATCTAAACTAGTGCCAGTGGGATATGGAATCAAGAAATTGCAGATCATGATGACTACTATGGATACCCTGGTAATTACTAGCAGAGCACCTCAATCCAAAGAGTGTGATACCCTGGTATTTTTTAATTTTGTTCTGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_32591::LG9:22538393-22540393(+)
TCATATGTAGTAACCTCATAATGTGTTTTTGCACTAGCCTCACCCAAGCACCAAAACAAAGCAAAAACTTATATCTTGAAAGGTAACTTCGACATACGTAAGAAAAGTTTTTACATTGACAATATGCTACATATCCAACCCTCACACTTGATTTCTACTAGAAAACATGAAACAACTTAGTTTAACTAGTAATTCATTCTAAATTTCCTATGCAAATACTCATTATCCTTCTAATATAAAGATATTGGTTTTTATTCATCATTAGTTATGAGAATGTAATAGACATAGAGTCAATTCCTCTAGAGAGGACATATATATCCTTTAAAGGTAAGCATATCAATTTCACTTAGAATTTGTGTCCCTCAACAACAACAAAACACCTTCAGCGTATAAAATGATACACCTAAACAATTGTTGGTGTAAAAATATCGACCTAAAAGGAAACTTTAAAATATCTAAATAAAATAATTAATGAAAAGAAACATCAAACATATGATTGATATAAACTTACAAACCATATAGAAAGAGTAATCCAAAAATATTTTGAAAATGTGGTCTAACTTTTAAAATTAAGAAAAAAAATCATTTTGATTTAGTCACCCCGTGTGTATCCTCACCACTTCATTAATATTCTTTCTTTTTTTAATACTTTTATTTTTATTTGTAATAATCATGTAGCTAAAATAAAAGTGTGTTTTCAAAAAATATATTAGAGGCATAAGTTTTCCTTTCTATTTTGTTTCCTTCCTATATGATTATTATGATGTAATGAATGTCTACCTTTTTTAGGTATTTGGAAGTTCATTCAAGGTTGTGGGGTGTTATATTTGCATATGGGAAGAAGATGCAAATAATGACACCTAACGTAAGGGAAAGTGATGTTTGTTTTGTGTTTTTCTGATTACTATTTTTTTTTGTGATTCTCGCTATGCCCTATATCAACCCTTCTTGTTTTTGATCAAGATGAAGTCTAGGTTGTGATGAACAATTTCATGAACATATGATGTTTCATATTGTAAAGTAGGGTTATATACTTCCTCTTGGTAGGGTTTGAATGTAAGTACAACACACCAGGTACATGTATTACCTTTAGAATATGGGATTTTGATTTCTCGTTGCACTGTGATGTTATAATGTTTGGCATGTTCAAGTGATGATTGAGCTATGAGTGTGGAATTGGTTGTTTTGTTGGTTTAGCAATGGAAATGCATCCTTGACAATTGGCCATTACTTTTGATCATAATGCAGTGCTTAATAATCTGTTATTGACTATTTCACATGGCCATACCTCTAATTTATTAGGTGTAGCCACCCTAAGACGGTGTTGTGTGTTCCTTTGAACAAACTAATTGTTGTGGTCCATTTCCAGTTTGATTTATGCATTGTCTCTAGTTAATATTGGATTTTTTGGTTGGACCATTATGCAAGAGTGAGTTATAAATTATTTAGGTTGTTTGGATTTGGATTTGGCTAAATGCTATCGTAGGAAGTGGCATCTAGTAACAACATTAGGTGCAAACCATAATTTAGTTTTGATGCAAAATTGATCAAAACTACATGGTGTAGGGGCTAGCTAGAGTATAATTTGATCTTGTGTGTCCTTGATTTGAATGGGTGTTGATTAGATAATTTCTAGCAAACAGTGCAAATTCAGTTTTTGCATTTTTCTTGTTGTTTTGCTTGTTTTATTTCGTGTGTAGGGATTATCCAAGCATGTTTACTAGTGTATCATTGCTTTACTTATATATACCACGAGACCTCTTCAAAGTTAGTAATTATTTATATTTAATTTGTAGTCACGACAGCAATTGGGGAGCTATGAGTGTAGGTATTACGTAATGAAACACGTGCACACCATTATATGTATAAACATTACTGATTCATTGAGGTATTGAAAAACTAACTAAATACTTATCTAATATTTCATTACAATATGATTTTAACTCCATTATTTTATTTGTAGATTTTTAATGATTCATCTCCAATGGAAGGTCAAGACA


Gene Sequence:
>Vu_32591(+)
ATGGAAGGTCAAGACATGGAAGGTAAAGACATGAAAGACATTACAACCAAAGGAGTTTCTTTTATTTTAAGTGTTAGTAACTTGTAGAAACTTGCTACAATTTGGTATTGTATATTAAGTTAATGTAATATTTGGATTGAATATATAGTTTTATGTACACATAATGCTTTAAATATTATTGGACAATTTAATGTATGAAATAAATTCCATATATTATTTATTCGATTGAATTTGTTGTTTTCTAGGTAAATTTATTGGATGAGATGATAAAACAGAGAATGATTTTTTTTTAAAAGACAATATTTATATGACGTACATGACATTATCTATCATTGTATATTAAATGTAAAACAACACCTTAAAAACTTTGAAAAAACAAGCTTTTATGACATACATGATATTATATGTCATAGGTTAATTGTAAATAACACGTATTATCACATGTGAATGAAGGTTTGTTATAGAACATGGGAGATATAATGATAGCTGAAAATAACTGTCATAAAAGTTGAGGTATTATGACAGTGAGGTATTATGCCATGTAAACAGAACCACGCCACAATAAATTTAATATATTACGTCATAAAATGCGTAAACCTTTTATAAGTACTAGAACTATGACGCCACCCACTACAAAAATATAGCAGTATTGTACGGTTTTTTTTCCCGGGGTTTTAAAAACATCGGCTAACTATCCGCGGTTTTACAGAAAACCGTAGTTAAGTTTAATTTTTTTTTAAATATATTTTTAGGGGTTTCTTTGTGAAACCATCGGAAATGTTGTGCCTCTGGTACTTTCCAAAATATTTTGCAGTCAAAGTTGCGCCTCCAGTGCTTTGTTTTCCACCTTCATCAGAGCTTCGAGTATTCTTGATTTTTTTTCACTGCGCTGTTTCCATCTTCACCTTCGTCTCTCGACTTCTTCATCTTCAGCCTTCGCGTCTCAATTTCTCCATCTTCGTAACCCTTTGTCACTTCGCAATCCCTGGTTTCCTTGCCTTCTCCTCCTCCAAATCCCTAATTTCGAAAATCCGGAGTTCACCAACCTTGCGATTGAATTTTTGAGGAGCTCTCCGATGTCGTTTTTGAGAAGCTTGTGATTTGCACAACCTTTGTGTCTCTCCATTTCCATCTCCCAACCTTCGTGTCTCACCACCGCCTTCGCCTCTCGACTTCTCCATTCTCGCAGTTCTTCTTCACTTTGCAATCCCTAGTTCCCTTGTTTTTTCCTGCTTCAAATCTCCAATTCCGAAAACCCAAGCAGCATTAGGAGCTCGTCGATCTTGCGATTAGCCTTTTTGAGGAGCTTGAGTTGCACAAGGTGGAATCAATCGTTCACCGGAGCCACGTCCTTCTTCACGGCCTCCTCGATAGTGTTAACAACTTCTTCAAAGGGGAGATTCCTCAATCTCTGAGACACCTGAGAAGCCTCCAATACTTGTAAGCATACATGAGCTTGGGTTTGATATCTTGAGATGAATCCATCTTCAGTATCAATCTCTAATGTTTAATTCTAAAATTTTCCCAAAATTGTTTCAGGAGGCTCAGTAATAGCACTCTTGTTGGTGAATGCCCAGAGTCTCTGGCTAAGATGATCCAACTCAATTTTTTGTAATACACATGAACTCTTTTGTTTTATACTTGTATCTCATGCATAATTTCAGTTTATATTTTCAGTTTGGTATTCCTAAAGATGTTTCTTATTGTGATTATCATTCAGTGACTTGTCATACAACAATCTTACTATTAATGGACACCACCATTTGTCTCATGCTTTTCCATCAATGATCTCTTATTCTTATTAGTAGTTTACATATGTCGTTATCCCTACTTAATTATTTGAATGCACAATATGAATGAGAAAGAGTTCTCATTTGTTTACCTGATCCATGTATGGCCGCTTACAGGACATGTGATGGATGCACAAGGAAGTCGTTGCCATGCAACACTTCATTTTTGCCAAATCATAATTAGCTCCTAATCTGGGGTCTACCAATTCTTTGACCAGCTTTGCATCCAAAAGTGGTTTGGCCTGATCAAAGCACAACTTGGTCAGTCTCCGTCTTTTTAAAGTTATTAGCATATGCAACATATACTTTTGTAATCCGGTCTTCCCTAATTAAGAATCTTAGTTGAAAGTAGTGCAGAAGATTGGAGAGAAGGTGAAGAAGCCAAGGATTTGAGTAGAGAAAGTGAAAGATTGGAGGAAAGGGAGGCTGCTAAAAAGTCTGCCAAGAAAAAAGAGTGTAAGCTTTCTTAAGAGCATGGTGACAGTAATTTTTGCTCCATGAAACATTTCCCATAACTAAAATATTGATAGAAGTTGTTCTGGACTTTGTTTAATTCAAGTAAAATTGTGTTGCTATTTGGGAAACGTAGAAACTAGGCATATTGCTATATAGTAGAACAATGGTTGAAATTTATGAGAACTTGTCACATACATGGGCTTTTTCTTATCTCTAGATTTTCTTCATTGCTGAAATTGTTGGAAACTGTAACTGAATGATGTTGTATAGGTGGCAAGTCTTTTGTCCTACTCAATGTCAAGTCTTGGGATGATGAGACTGACATGAAGAAGTTGGAACAGGCTGTCTGCAGTATTGAGATGCCTGGTTTATTGTGGGGAGCATGTATGTTCAAAGTTTCATAAACTTTTCTCCCTCAAATTTGTTCCATTCACTATAATGCTATGCATTGTCTGTAAATTTTGTTATCCTATTAGTCAATCAAAAATCAGTGTTAACATGATTTTTAAGACAATTATTGTTTAAGTCCAAAGAAAGCTACTTTACATAGTAGTTTGTGATTGAAAGACATTGTAAACTTGCCTTATAATGTAAGTGTATAATCTATTTTTTTCTTGAAGACATTACAATGTATCTAAAATGGCTTGTTTTAATTGATACAGCTAAACTAGTGCCAGTGGGATATGGAATCAAGAAATTGCAGATCATGATGACTACTATGGATACCCTGGTAATTACTAGCAGAGCACCTCAATCCAAAGAGTGTGATACCCTGGTATTTTTTAATTTTGTTCTGTAA