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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_32521 LG9 19924770 19930413 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 19927572 downstream_gene_variant
T/C 19927611 downstream_gene_variant
A/G 19927879 downstream_gene_variant
T/G 19927888 downstream_gene_variant
G/A 19927889 downstream_gene_variant
A/G 19927892 downstream_gene_variant
T/C 19927894 downstream_gene_variant
T/C 19928086 downstream_gene_variant
T/G 19928434 downstream_gene_variant
A/T 19928977 downstream_gene_variant
A/T 19929130 synonymous_variant p.Leu428Leu
C/T 19929256 synonymous_variant p.Thr386Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32521.1
MKLLSAKEFLTPFLLLTLLYPCCHTLHNTITTGQPLKDGDVLLSDGLGNFALGFFSPSNSTTRYVGIWYNKISEQTVVWVANRDAPLNDTSGVLSMDNHGNLVLHSNNTRNLDPVWSSNASMASTNVSAKLLDTGNLVLIQADKIGFRWQSFDYPSNTMLPFMKLGLNRKTGLDRFLTSWKSANDPGTGNLTYKIDPTGFPQLFLYRGDAPLWRVGSWTGQRWSGVPEMTPNFIFNVSYVNDEKEVSIMYGVKDPTVFSRMVLEETGHVTRFTWQGREHRWFSIWDAPKEECDNFRRCGSNANCDPYHEDKFECECLPGFEPRSEREWFLRDGSGGCIRKSNVSTCGSGEGFVEVPRVKVPDTSKARVVAMIGMRECRERCLKDCTCAAYTSANENSESGCLTWHGDMEDTRTYTQVGQSLYVRVDALELAKYAKHPYGSLGKKGMVVILTIAILMILFLAVTFVCWSVKDRKQDESKRSQLDWKKRFDIICGIARGILYLHQDSRLRIIHRDLKASNVLLDSALNPKIADFGMARIFGGDQIEANTNRVVGTYGYMSPEYAMEGQFSIKSDVYSFGVLLLEIITGRKNSGQYEDITATNLVGHIWELWREGKTMEIVDQSLGESLCDLEVQRCIQIGLLCVQDYAADRPSMSAVVFMLGNDSTLPDPKQPAFIFKKTNYESSNPSTSEGIYSVNDASITMIEAR*


CDS Sequence:
>Vu_32521.1
ATGAAGTTGCTTTCAGCTAAAGAGTTTCTCACCCCATTTCTTCTTCTGACGCTTCTTTACCCTTGTTGTCATACACTCCACAACACCATAACCACAGGCCAACCCTTGAAAGACGGCGACGTTTTGCTCTCCGATGGGTTGGGAAACTTTGCACTCGGTTTCTTCAGCCCATCAAACTCCACAACCCGATACGTTGGGATATGGTACAACAAAATTTCGGAACAAACGGTAGTGTGGGTTGCCAACAGAGACGCTCCGCTCAACGACACTTCCGGTGTTCTATCCATGGACAACCACGGAAACCTCGTACTCCACAGCAATAACACCCGAAACCTCGACCCCGTTTGGTCTTCAAACGCTTCCATGGCATCGACGAACGTTTCGGCCAAGCTTTTGGACACTGGAAACCTAGTTTTGATCCAAGCCGACAAAATTGGTTTTCGTTGGCAGAGTTTTGACTATCCTAGTAATACTATGCTTCCGTTCATGAAACTCGGGTTGAACAGAAAAACCGGTCTGGACCGGTTTTTAACTTCTTGGAAATCGGCCAACGACCCTGGAACCGGGAACTTGACGTATAAAATCGACCCAACCGGGTTTCCGCAGCTGTTTCTTTACAGAGGGGATGCCCCGTTGTGGAGGGTCGGGTCATGGACGGGTCAGAGATGGAGCGGGGTGCCCGAGATGACTCCGAATTTTATCTTCAACGTTAGCTACGTGAACGACGAGAAAGAGGTTTCGATAATGTACGGAGTGAAAGACCCGACGGTGTTCTCGAGAATGGTGCTGGAGGAGACTGGGCACGTGACGAGGTTCACGTGGCAGGGTCGCGAGCACAGGTGGTTTTCGATATGGGACGCGCCAAAGGAGGAGTGCGACAACTTCAGGCGGTGCGGGTCGAACGCGAACTGCGACCCGTATCACGAGGATAAGTTCGAGTGCGAGTGTTTGCCGGGGTTCGAACCGAGGTCCGAGAGGGAGTGGTTTCTTCGTGACGGGTCGGGTGGTTGTATTCGGAAGAGTAATGTGTCCACGTGTGGAAGCGGAGAGGGGTTTGTGGAGGTGCCACGTGTGAAGGTCCCGGACACGTCGAAGGCGCGTGTGGTGGCAATGATCGGAATGAGAGAATGCAGAGAGAGATGTTTGAAAGATTGCACGTGTGCGGCTTACACGAGTGCGAACGAGAACTCGGAGAGTGGGTGTCTTACTTGGCACGGTGACATGGAGGACACGAGGACCTACACGCAAGTAGGACAGAGCTTGTACGTGCGAGTGGATGCGCTTGAATTGGCTAAATATGCAAAACATCCGTATGGTTCTCTTGGAAAGAAGGGAATGGTGGTAATTTTGACCATTGCTATTCTTATGATATTGTTTTTGGCAGTGACTTTCGTGTGTTGGTCTGTTAAAGACAGGAAACAAGACGAATCTAAAAGGTCACAACTAGACTGGAAAAAGCGATTTGATATCATCTGTGGGATTGCTAGAGGAATTTTATACCTTCATCAAGATTCACGATTGAGAATCATTCATAGAGACCTAAAAGCCAGCAATGTCTTGCTGGACTCTGCATTGAACCCAAAAATTGCAGATTTTGGTATGGCTAGAATATTTGGTGGAGACCAAATTGAAGCAAACACAAACCGTGTTGTTGGAACCTATGGCTATATGTCACCAGAATATGCCATGGAAGGACAATTTTCAATAAAGTCTGATGTATACAGCTTCGGAGTTTTACTTCTAGAGATCATTACAGGCAGAAAGAACAGTGGTCAATATGAAGACATTACAGCCACAAATTTAGTTGGACATATATGGGAACTATGGAGAGAAGGAAAAACCATGGAGATCGTTGATCAATCATTAGGAGAGTCGCTCTGTGACCTTGAAGTCCAAAGATGCATACAAATTGGTCTTTTGTGCGTGCAAGATTATGCCGCCGACAGACCATCTATGTCAGCAGTTGTTTTCATGCTGGGTAATGACTCCACTCTTCCTGACCCAAAACAACCAGCATTTATTTTCAAGAAAACTAATTATGAGAGCTCAAATCCATCAACCAGTGAAGGAATTTATTCAGTAAATGATGCGAGTATAACTATGATTGAAGCTCGCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_32521::LG9:19930413-19932413(-)
GAAGTCATTGTTGAAAAGCAACCACAATTATAAATAAACTAACAAAAATCATCTTTGCCACGAAAGAAAAAGCATATAGATAGCTCAAACGCAATGGTAACAGAAGGGAAGTCAGAAGAGACAACAATGAAAGAATTCATGGATGAACAAGAGAGAGAAACCTTAAAAATCCATTATTCTTCAATCAAGGCACCTGAAAAAGGAAAAATAGCGCTTCAACGCTCTGAATAACTACTTGAGAGGAGACGAGACGTACAACCACATGCACCAAATCTGAAAGAGGAAAAAGAGCGACATCGATGCTCTGAATCATTGCATAAGAAGAGATTAGGTGTACCACTATGCACGACGAAAAAGGGAACAAATCCACAACTTTAAAAGGCGATGAGAGCGCATAGGAGCTCCGATGAAGGCGTCGTTGACACGATGGTCGCCTAGCAGAGACGACCAAAATTGTGTGATCGTCGGTCAAAATTGGAACTCCAATAGCGGTAGTGGTAGACAAAAACAATAGATAATGACGCTATTGACAGTGGCATATGTAGTGACAAAGGTAACAATTTTTTTTTCCTAAAAATAACCTAGCTCTAGATACTATATTGAATACAGTGAAAAGCTATATATGTGAATAATCTCCCTGTTTTGAATTTACACATAAGGTCCTTTTAATAATAGAAAAAATATAAGTTAAGCCTAAAATACAAATAAAAAATAATAGCAAACTAACTAAAGATAAAATATACAGAAAAGATAAATATAATATATCTAACATATATCAATTTATAAACTAAAATTATTGATAACTAAAATAGTTTCTATTATGAATAAAAAATTTGAATTGATTTTTAATTCGATACTAAAATAGTTTTTATTATGAATTTTTACATAAATTAGTCACTAAAATTAACTATTAAGCAAAGAAATTGGTTTGTAATTAAGCTAATGGCATGAAAGTTGATCTCTAAACACATTTTTCGTCACTAAAATTGATTTTTATTTATGAATTTTGTTGCAGTAAAATTTTAGAAACCACTTTCATAAAAAAAATATTATAAGATTTGTAAGTGGGATTGACGTAATAATTTTAAGATATTTTTCATAATATTAAAAAAAGATATTAAATACTATTTCGATTCCAATGGAATGACGTAATTATATTGAAAGTAAATAATAATTCCAGGTCACATTTGTAAAAATATTTTAATTTCTATTTAACTTTACTTTTAAAGCGTAATTTATCACTTATACCCTTTCTATTTAATATTTTAAATTTACATATATGCTAATGAAGGAAGAAAAATAATATTAAGTTAAAAAATTATTACGTAATTTTGAATTTATAAAGTAAACCTTATAAATTAGTTTAAGGAATATCGAAGTTTTTTTGAACTCTCTTTTTTCAAGTCATGATCGCCATTTATCCACAGTATTCCACAGTCAAATATCGCCACAAAATCATGACTTCAAGTGGCATCCAACACCTGGTTACCATTGTTTTAAGTGTGCGTAGAAGTTTTTTGAAAAAAAAAACCGAAAATCACAAAAATAACCACTACTCTTAATCTTTGTCGTTTTTATTTTTCCTTTTTATTGAACTTTAGCCAACATAAAATAAATTTTGGTACTGGATTTGACAAAGTGAAGGTTGTTATTTAGATAACTTAGAATTATTAATGATGAACATTAAGTTTGATCGACTACATAAAATGGATTAGCTAAAGCAACTTATATATCCTAACCTATTTGTCTATGTGTTTGTGGGGCACATGAGAAACAAAGTATTTAATGTGAAACAACCACCAATGTTTAGTTGTGTGTCTCAATCACTCTCTCTTTACATGCACAATCCTGAATAAAACAACTCATGCATATCAATTTTCACGGAAAAATATCAGCTACCATCATAAATACCGATTCAAGAAGCGCCTCCAATCATTTATAACCTTTCTCCAAATAAATACTCCGTTCACTCACAAACATAGAACTACAACACCATTATC


Gene Sequence:
>Vu_32521(-)
ATGAAGTTGCTTTCAGCTAAAGAGTTTCTCACCCCATTTCTTCTTCTGACGCTTCTTTACCCTTGTTGTCATACACTCCACAACACCATAACCACAGGCCAACCCTTGAAAGACGGCGACGTTTTGCTCTCCGATGGGTTGGGAAACTTTGCACTCGGTTTCTTCAGCCCATCAAACTCCACAACCCGATACGTTGGGATATGGTACAACAAAATTTCGGAACAAACGGTAGTGTGGGTTGCCAACAGAGACGCTCCGCTCAACGACACTTCCGGTGTTCTATCCATGGACAACCACGGAAACCTCGTACTCCACAGCAATAACACCCGAAACCTCGACCCCGTTTGGTCTTCAAACGCTTCCATGGCATCGACGAACGTTTCGGCCAAGCTTTTGGACACTGGAAACCTAGTTTTGATCCAAGCCGACAAAATTGGTTTTCGTTGGCAGAGTTTTGACTATCCTAGTAATACTATGCTTCCGTTCATGAAACTCGGGTTGAACAGAAAAACCGGTCTGGACCGGTTTTTAACTTCTTGGAAATCGGCCAACGACCCTGGAACCGGGAACTTGACGTATAAAATCGACCCAACCGGGTTTCCGCAGCTGTTTCTTTACAGAGGGGATGCCCCGTTGTGGAGGGTCGGGTCATGGACGGGTCAGAGATGGAGCGGGGTGCCCGAGATGACTCCGAATTTTATCTTCAACGTTAGCTACGTGAACGACGAGAAAGAGGTTTCGATAATGTACGGAGTGAAAGACCCGACGGTGTTCTCGAGAATGGTGCTGGAGGAGACTGGGCACGTGACGAGGTTCACGTGGCAGGGTCGCGAGCACAGGTGGTTTTCGATATGGGACGCGCCAAAGGAGGAGTGCGACAACTTCAGGCGGTGCGGGTCGAACGCGAACTGCGACCCGTATCACGAGGATAAGTTCGAGTGCGAGTGTTTGCCGGGGTTCGAACCGAGGTCCGAGAGGGAGTGGTTTCTTCGTGACGGGTCGGGTGGTTGTATTCGGAAGAGTAATGTGTCCACGTGTGGAAGCGGAGAGGGGTTTGTGGAGGTGCCACGTGTGAAGGTCCCGGACACGTCGAAGGCGCGTGTGGTGGCAATGATCGGAATGAGAGAATGCAGAGAGAGATGTTTGAAAGATTGCACGTGTGCGGCTTACACGAGTGCGAACGAGAACTCGGAGAGTGGGTGTCTTACTTGGCACGGTGACATGGAGGACACGAGGACCTACACGCAAGTAGGACAGAGCTTGTACGTGCGAGTGGATGCGCTTGAATTGGGTATGTTATCTTTCTTTTTTTTAAATAGATAGTTAAAACTAAGATACACATTAGTAATAACTTGAACGAAACATGTAAATAGTTAACGAAGAGTTATTTTATATTTAATACAAATATAAAGATTCTACTTTTTTTTATTTAAAAATAGTGTAATTAAAGTAATCTAGGTGTGAACTAAAATAATAAAAGACAAAAACATTACTTGACTAATTAATTAGTTAAGAAGGGACCTTCATTACAAAATCGGATAAGATATTTGTTATGAGTGAAAAATTTAAATTTATTATCCTGACAATGTATTAAATATGTTATGTATCAAAAGTTATTTGATTGCATATGTTTATAAAGAAGTGAGAAATTGATTTAATTTATGCAAGATATTTTAAGTCACATGTAACAAAAAAAAAATGACTATCAATAATTTTAAACTTTATATATTGATAACATATTAAATATTATAAATAACGTGAAAAACTTGTTATTTGTTTTTATGACTCGTTTTTTCATGAAATTTTAGTTCTATATATTGAATAAAGATAACTTTGACCATATAAATACGAAACATAGCGATAGTATGTAAAACGGAAGAGTAGTGAAGAGAAAAAGAACAATTTTATACTCTATATCATATTTAATAACAAATATATGAAAATACGAACGTCCATCATCATATTCATATGTGCTATCGACAAAAAATCCATTGTATTTAGAGTATGAATTTGTTCAAAATTGTTTCGGGTATGAGTTAAGGTTACTTCCTCAAAACACCAAGTTGTTCTGAATACTGGATAGGCTTCCTAGTGGTCTTCATTATGAAAGTTACGTTTGTTTGCTCTCTCTCCATCTTGTCCAATTTGTGTGAGTGGATATCTGTCAAAGATACTCGATGCTCAAGTCAGTAATATAATCGAACGGTTAGCACAAGAATAAGTGATGCATATATTGTGTATAATGATCCTAAAGTAATACCTCAGACCCTTATTTATACAAGTTGCGATGAACCTTTATTCTTTCCTAGCTAATGACGACCCAATCAAACTTTAATATGCATTAGGGACTTAATGAGTCATTACTACTGATAATCTGACCATACTATTAGGTCATAGTAGTACGACCTAGGTCTGGGTGACCTGGATGGATGACCTAGGTGGACGACCTAAGAGGACAGTTTGAGAGGACAGCCTAGGAAGACGGACTGGATAAACGACTTGAGAGGTCGGACTAAGAAAATAACATGGGAGGATGACCTGGATAGACGACTTGAGTGTTCAACCTGGGTGGTGCTTGGTCCAAGACAGACCCTACGTTACACATGGTGTGGCAGACTGTACATCACACACGATGTGACAAATTGTACGATACACATAGTATGGCAGACCGTACGAACAAAAATCAAATTAAATTCATGACTTACCACTAAGTAAACATAATCACAACACCGAAACAACTTCAACTCAAATATTATTTTTCTTATAATAACGAGGTCCTCCTTCATTGCATCATTCTACTATATATGCATTGAAGCTTCTTCAAACTAAGAAAGCTGGATTTTTCATAAATTTTAGCCAGAGACTTGGTTTTTTAGCACTAGATAATTAGATTCAACAATTTGACTTTCATCTTCCCTTGTAGCTTGCTGAGTTTAAGTGTTCACGCTTCTTTGAACTTGATTATTTTTCCAATTCAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTCTTACCAAATTGAATATATACAGATCACATTCTGTTTAGACTTATCTTTGGAGCTTCCAACATACCATAGGAAAGTTCCCATTTCAGCTTTGCCAATTTGGATCTTTTAGTTGCTGCAACATGTAATATAACATATTTAAAGTTCTGGGTTTAGGTTAACTCAGTATGTATTCAAGAGATATATTGTTGTAAAATAAATTCCTTCAAGCTGAAAGTTTTTCGGTGATTTTTTTTTTCTACAATTAAACATCTTGTTATATCCACAACTTTTCCAGTGGCATAATGTTGGTAAATAGCTCCTCTGTCAAAGTTAAATGTAGACATGAAACAACTTCGTACTTCGTCATGGAGTCCTTCTCATGTTGCTTGATTTGGGCAATAGTAGGATTAACTCTCAATGGTGGGGCTTGCTTGTCATGATCTGCATACTCCAATAAGTCAAAAGACTTTAAACATTGTCTCATTTTTATAATTCATATGATAAAAATTCCCAGAAAATTGAGGAATTACAAAATCAATAGGACTCCCTGAAGCCACTGAATTCTCATGAGTAATACACTAGAAATGACAGCCTATAATCTTATCCATACATGCTGTCAGCAAATGATCAGGTACCCACAACATTTATAGTACAATATGTCCAAAATCAGAGTAAATCGATGACTGAACATTACCACTAGCATAAGCAAAGTAATTGAAATAAGTAAGCAAAATTATAGCAGTGAAAAGAAAAGTTTTACAACCCATTAATCTAGCAGTATATAGTTGATTTATCTGTCATTATTTCTTCTGTACTTATAACATCTTTACATTTGAATTTTGCAGCTAAATATGCAAAACATCCGTATGGTTCTCTTGGAAAGAAGGGAATGGTGGTAATTTTGACCATTGCTATTCTTATGATATTGTTTTTGGCAGTGACTTTCGTGTGTTGGTCTGTTAAAGACAGGAAACAAGGTAAGTTTTAAAATTATTATTTACCACGTTAGGGGTTCTCAATTCTAAATTAATTACGTGCTCAAATGTATTTGTTTCCTTGTTTGATGAAAAGGGATAAAAAGGAATCGCAAGTATTCCTTTCGTCTTAACTTGGAGGACTCTACCGATCTACAAGAATTTGACTCTACAAAAAATTCAGATTTGCCATTCTTTGATCTTAGCTCCATTGCTGCTGCCACAGACAATTTCTCTGATTCTAACAAGCTTGGTCAAGGGGGCTTTGGTTCTGTTTATAAGGTAGCTATTCTTCTTTAACAAGTTCAAATTCAACTACAAATTTACTTTTTATAATGCCTGGTATCCATATATATCACATTACATATATTATTAAAATTACCTTGGATGATGACTTCAGGGTCTACTGAGTAATGGAATGGAAATAGCAGTGAAGAGGCTGTCAAAGAACTCTGGACAAGGCATAGAAGAGTTTAAAAATGAGGTGGTTTTGATCTCAAAGCTCCAACACAGAAATCTTGTGAGGATCTTAGGTTGCTGCATTCAAGGACAGGAGAAGATGTTAATCTATGAGTATTTGCCTAACAAGAGTTTGGACTCTCTAATTTATGGTATGTTTTTGTTTTCATCTTGGCTGCTTAGTACTTTAGCTCTCACTTTGGAGGTAGCCATGTCCATACCTAACCATTTACAGTAACAAGTTCATCCATAAATTACCAGAACAATGAATGATACCTTAAATTTTTGGCCCAGACGAATCTAAAAGGTCACAACTAGACTGGAAAAAGCGATTTGATATCATCTGTGGGATTGCTAGAGGAATTTTATACCTTCATCAAGATTCACGATTGAGAATCATTCATAGAGACCTAAAAGCCAGCAATGTCTTGCTGGACTCTGCATTGAACCCAAAAATTGCAGATTTTGGTATGGCTAGAATATTTGGTGGAGACCAAATTGAAGCAAACACAAACCGTGTTGTTGGAACCTAGTAAGTAATTAACAACAAACAATATTAATAATCTTCATTGTATTATTTGTTACTCAGACAGTACATATGTAAACAGTTCACATCATATAGTGATTTCCTTTTGTTTTACTTTTGTAGTGGCTATATGTCACCAGAATATGCCATGGAAGGACAATTTTCAATAAAGTCTGATGTATACAGCTTCGGAGTTTTACTTCTAGAGATCATTACAGGCAGAAAGAACAGTGGTCAATATGAAGACATTACAGCCACAAATTTAGTTGGACATGTTAGTATTTTTATGAGAACTTCTGCTGCAATTTAAATATACCCTTCAATGGTCCAACTGATATGATTTTCAATTAATGTAGATATGGGAACTATGGAGAGAAGGAAAAACCATGGAGATCGTTGATCAATCATTAGGAGAGTCGCTCTGTGACCTTGAAGTCCAAAGATGCATACAAATTGGTCTTTTGTGCGTGCAAGATTATGCCGCCGACAGACCATCTATGTCAGCAGTTGTTTTCATGCTGGGTAATGACTCCACTCTTCCTGACCCAAAACAACCAGCATTTATTTTCAAGAAAACTAATTATGAGAGCTCAAATCCATCAACCAGTGAAGGAATTTATTCAGTAAATGATGCGAGTATAACTATGATTGAAGCTCGCTGA

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