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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_32517 LG9 19866711 19875227 PREDICTED: probable serine/threonine protein kinase IRE isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 19870606 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32517.1
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CDS Sequence:
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Promoter Sequence:
>Vu_32517::LG9:19864711-19866711(+)
TTCCACATTGTTTAGGCCAAAATAGAGAAAATTATTTGGCATGTGATTAATGGAGTTTATTGGTATCAATAAAAGACATGAAAAGTGGACATCAGTAAAGTATTATATTTCATACACTATCAGGCATTTCAAGACTTGTCAACGTATTATAGATCTAGGCATGAAAAGTTAAAAGCAGTGAACCGGTGACCTTCAAATGGATATATGTGTGTTTGTGTTGTGTTGTAGAAATTTGAGTTCCCCTAGACCCTCCTGGTTATATATGCCTCCCCTTATTTTCATGTTCGTATAAATTGTTTCCATATTTAATATTTTATATTATTGGGTTTTTCATTGCTAAGGTTGGACCGAAGGATCACCAACGCTTTCAAGCTTCTTATGCAACTATATTGAAGGCCCACATGACTGCTCTAAAGAAGAGAGAAAGGAAAGACAAGAAGAAGCCTGCAGAGGCTGATAAAAGAGAAGGGAGTTCGAAGAGATCGAAGAAGTCTTAAATAATCTGCTGACCTTCTGTGCAAACTGAGTTTTCTGCTGACTCTGTTTTTGTTTTTCCCCAGATATTTTGTTGTTTTCGATATTAGAGTGAGGTGAAGAGGAAGGGGAAAAGAAGGGAAGGGAAAAGGATAAAAGGAGGAGAGACAAAGATTAGTGAATAATTCTTGCATTTAATCTTTACATAGATATTCATTTAGTGGCAATTTGTGAAAATTTTCTCAGTTCCCCAAGAGGTTATAAAGCGAATCTTTAGGATACTTTTCTCTTCTATTGCACGGTTCAACACATTCCGAGTTAATCTTCCTGTGGCAAATTCTTACTCAGTCATGGGGTTTCTTGTTCGAAAGTATATACTTAGTCGTTGCTAAAATCGAACGGCTTTTATTATTTTTGTTGTATATAAATCACTTCTGCATTTTTTTTTCAAACTTTACAGGGTAATTTTTGCAGTCGCGTCTTGCCCCTTTTATTCTATTTTCTAAAACCCAACTAAGTGTTGTTACATTAAGTTATTAACATGTCAATAACGCAGTGGATCCAGTCAACTTGTTCAATTTGGCTTGTGTATATATGCAAGAAGTTGAAACATTGAGTCTGAATTTAATGTTGTGCAGATACAAATTGATAATTCTTGTAACAAGGGAAAAAACAGAGCTTGCGCGGATCCACTTAACACAGTTATTGTTAAGTTTGGTTGTCCTATCTGCATGATAGATTGTGATTAGATAATTATGTTTATCGTTACCAAGTTGTGTATTGTCTATGACTTCCACCGTGAAGGAAGAAAGTATAGATACATTAAAATAATAATTATAGATACGTTAAAATAACAATTGTTATATACGTGTATGTCACACATTTACAGTGGTTTTAATATGTATTTTAGAATTTATATATTAAGATACCTATAAAAAACGGCCGCATTAGTAAGAGAAATGGTAACATTTTATCTAAAAAGTGACCAATGATTATTTTTATATATGGAAATTTGTTTTTGTATATGAAGTTTTATGCTTTAATTATTACAACGGTGTTGAGAATTGGTTTTTGTAATTTTTTTATACAGCATGTTGTAACTGAAAATCAAATTTCATTGATGAAGTATGTAAAATTACCTTGAATTTGAAAAATATAAAATTATTTTGTTAGTATAAAATAAAGTTTTTGGGATGGAAACGGTTAGGTAAATTGGAGAGGTCTTATTCCCTCCAACAAGAAACGCACAGATACCACGTAATATTGAACAAACATGGTTCGCGGGAAGCACGTTTGACATTGATATTCCTTGTTTATTCTTCAACGAACTGGGCTTAACTGAAAATCCCGTTTTGCTGTCATCTTCTGGTTCTGCTTTCCGTGAATTTCTCATATCATATTTTCCACACACCATTGATCCTTTCAATTCATCTTTTATTCATTCAAATCTCTCTCTACAGTCTCTCTCACACCACACAATCATACACTCACAATGCCATGAAGAATCCCAAACACATCATCCTCCA


Gene Sequence:
>Vu_32517(+)
ATGTCGTCCAACCCTCCCCCGCCGCCGCACTCTTCGCACAAACCCGGTCAAGACCATCCTGCCCCTGGAAAACCGTCATCGCCAGCCGGAAGAGCTAAGCTCCTGAAGATCCCGCCCATTCCTATTCGACGGAGTAATTTAGGCAATGAAGAGGAGAAAGAAGAGGAAGATGAATGCTCTGAATCTTCTTCCATCTTGCTGGCGTCCTCTTTAGGGCTCAATAACATTCGAACGCGTTCTTCCGCGTCGCCTCTTCGCTATTCCTCCTCCGTTGGCGCTCCTTCCTTTCTCACACAGAATGCTGCTGTCACCATCAATGACGCCAGATTTAGACCAAGATTGAATTCCCATCCACAAAGAGACCACCTAGGTCTGCATCTCCTATTATATTGTTAAATCTGGCCTCAATTCCACTTTCATTTCCTATCTGGGACCGAAATGGTTCGTGATTATTTCCTGCTTGCTTTCGCTAATATAGTTGTTCTTTTAGGGGAAAAAGTTCATTTGAATCAATCCAGATCGCTCAGAGCTCATTCGCAACTCATTCCTGTGCTAGAGGTGATAGACATGATGTATTATTGTGCACGATAATATTTACTGAATTAGTGTTTTTCTTATTTAATTGTTTCCTTTTTATGATTGATAGTTGGAGAAATGTAGGTTGCTCAGGTTCATTGCATGTGTTTTGCACAGGGTCATCATGGAGCTTTCGCCAAAGAAATGCAATCCCCACGTTTTCAGGAAATCCTGCGACTTACAAGTGGACGCAAAAAGAGAAATCCTGATATCAAAAGCTTTTCCCATGAACTCAACTCCAAGGGAGTCAGACCATTTCCAATCTGGAAACATCGTGCCTTTGGCCACATGGAGGTACTCTCCCTTTAACTTGTTCAAGTTTCCTGTTCCTGTTCATTAATTTAAAATGAATAAAATTGTTCAATACTTGTTTCCCCCCAAAATAAAATATTGCAGGAAGTCATGGGGGCGATTAGAGCTAAGTTTGAGAAATTGAAGGAAGAAGTTGATTCTGACTTGGGTGGTTTCGCTGGAGATTTGGTGGGCATTCTTGAAAAAAACTTAGTGTGCGATCGTGAATGGAGAGAGAGGCTCGAGGATCTGTTGATTGTTGCTCAACAATGTGCAAAGATGTCTCCTACCCAGTTTTGGATCAAATGCGAATCTATAGTTCAAAATCTAGATGACAAACGTCAAGAATTGCCAGTGGGGATACTCAAGCAAGCTCATACACGTCTACTGTTTATTCTCACTCGTTGCACTCGATTAGTGCAATTTCAGAAGGAAAGCGGAATTGAACAAGACCACATTCTGGGTCTTCACCAACTCAGCGACCTTGGGGTCTATTCTGAGCAAATTTTGAAGGCTGCACAGCAAAATTCTAGTATTCCACCTGCTGGACACGAGACCGCTGACAAACAGTTAAAAATGTCACGTAGTAAAGAGAAAGACAAACCGATAACAACACAGGGTAAAGCTGACCAACAAGTAAGTGTGGCGATTGACAACCCGGAGGTTAGTACAACCAAGAGTGTTGAATCAACTTCTGGCAGCTATAGGATGTCTTCTTGGAGAAAGTTTCCAACTGCTGAGAAAAGGCGAAAAGATCAAGATGCTGCAGATACCCCATCCAAAGGTGAAATGGACCACTTGTTAATAAATGCTGAAAATTTGGATAATTCCTCTTGTCATCCTGAACATTCACAATCATCATCAAGAACGCGAAAGGTTTCTTGGGGATTCTGGGGAGATCACCATACTCTTACATACGGGGATTCAATGATATGCAGGATTTGTGAGGTTGAAATACCGATTGTACATGTGGAGGAGCATTCAAGAATATGCACAATTGCGGATAGATGTGATTTGAAAGGTTTAACTGTAAACGAACGGCTTGAAAGAGTTTCTGAAACCATTGAAAGGATAATGGAATTCTGGACACCAAAAAGCACACCCAAAAGCACTGATACTCCTGGAGAAAGCTTTGACCTTGCCGCTTCAAATGTGCTTGAAGAGTTCAATGATTTATCTCTAGAGAGAAATAACCTGACACTTAGATGCTCTGAAGACATGCTCGACTCTACAGATCTTGACAATACTTTTCTCATGGACGATCTGAACCTTTCACCCAGAACATCATGCGATGCTCGCATCTGTGTAAAACCTGATCACGGAACAAAGGTATCTTCAGCTGGGAGCTTGACACCGAGATCACCATTGATAACACCACGAACCACTCAGGTGGAATTGTTACTAAGTGGACGGAGAACATTGTCTGAACTTGAAAGTTGTGAACAGGTATACACTTACCAGTGTTGTAATTCTTCATTTATATTTTTGCACAGGAAATATTAAATTGGATGAAAACGTACTATCAATGTGTATAGTCTATGAAGTCTTCTGTCATAAGGATAAGGAACCTTAATATCTTCATTAATATTCTAATTATATGATTTTTTATTTTTTAATTTATATCAATATATATTATATTATTAAAATAAAGTTGTTAAGTGAGTTTTTTTACAATGGTGTGAAAAGTATAATTTTTCTATTTTACTCATTTATTTTTGGAAATTTTATATTCAAATGACAGATAAGCAAGCTAGTTGAAATAGCCCGTGCTGTCGCAAATGTGAACAACTGTGACTACAGTGCTCTGGAGTATATGCTTGATCGCTTAGAAGACCTGAAATATGCCATTCAAGACAGAAAAGTGGATGCCCTTATTGTGGAGACTTTTGGACGACGAATAGAGAAACTTTTGCAGTGAGCACCTGTGACTTTTTTATTTGATCTACGACAGACACTTATTTTTTTATTCTATTTCGGAAGTTTCTGTAAGATTTTCTAGAGCCACTGTTTTGCTCTAGCATTTCTAATTTATTTTCTGGAACTGGCATGGTGCTTAAACGTAACCTTGAATTTGCTACTTCATTTTGCAGGGAGAAATATATATCCCTTTGCGGGCAGATAGAAGATGAAAAGGTGGACTCATCAACTAGCGTAGCTGATGAGGAGAGTTCGGTGGAAGATGATGCAGTTCGTAGCCTTCGTGCTAGCCCTATTAATACTTGTTCCAAGGACCGAACCTCTATTGAAGACTTTGAAATAATAAAACCCATAAGTAGGGGTGCATTTGGACGCGTTTTTCTTACCCGAAAAAGAGCAACCGGTGATTTATTTGCTATAAAGGTTTGTTTCCTTATCAAATATAAAACCATTTCTTTGCAGAAAGTTAAGAGAAAATTGAGATGAATAGATTAATGAGTTCCGTTGTTAAACGGTACATAGTAGCATTTATTCTTAGGCGGGCAACTAGATTATGATTTAAGAGATTTTTCCTTTTATAAAACAAGTCCTAGTATTGAATCAAAACTTATAAATGATACAAATTGTGATATTTAATTAGGATAATCAATACATTTTTAATATAGTTGTCCAAATTTGATCATGGTCAACATTTACCTACCTGATCTTATAAATGTGTTAGTTATTCAACTTAACATGTAATTTGAAAAATATTAGTATGATCTTATCCATCACAAGTTGGTAAACTATACAGATCAATATACTTAAAGCTTAATACATGAAACTTTTATATTTAAATGTAATACTTTTATATCCATCACAAGCTTAATACAGATCAATATACTTAAATGTAAAACTTTTATATTTAACAAAGCATAATACATGAAAATCAAGACATCGTAGAATGTTATTTCAAGGGATGTGCATATCTCTTTTCCAAAATTACCTACCGAAGTTATCTTTGTCCACTTGGATAAATGCTCACAATCTCTAGCTACTTTTCTGTTCAACTTTTATTTAAACCAATAATTTCCTACTTTATTTTTTACCCAAACCAAAGGAAAAATATATATATTATTCCAACAATCCATGTATTTTAAAAGAAAAATAAAGAAATGTTTCTAACAAAATAATTAATTATCAACACAAATAAACATTAAATTATAACTTATTTAAATAAAATATTATAATTAAAAGAGCACATGTAGGTCACCATGCATGTGATTTCCTTAGTATAAATTAAAAAATATTGAAGATGTTATACCAACTTCACATAAACTTCCAGTTTTAACATAGTTTTGTTTATTAATTTTTTTTACACATTCGATAATAAATTAAAGAATTAAAGTTTTACTTTATTAATATCTTTACTCTTGTGTGATATTTTTTTCTTTTCTTTAAAGTTAGTTTAATGGGTCAACCCAGCCCAACACAATTTCAATCGGAATGGATCAAATTTTAAATGGATTAAGTATAATTTTATATTCTATTGTAAAAATATTTAAGTTTTTGTTCTATCAGACTTAAACTCATGATAGAGTAGATTATCTTGAATCTGGACATCTTTTACTACTCTATAATATTGAAATTTTGGTGTTACTCAATTAAAATTTTAAAACTTATAAAAATGTAAGTATTTAAAAAATATATACATTTGAATTGTTTTTTAAGGAGGACTTTTGATGAATTTCATGTGATATTCTAATAAAATGTATACATATCACACCTTTCAAGCAATCTCATCCAAGTTCTTGAGACTTTCTTCATTCTTTATCTTGTCAAGTTGATTCTCAGATTTTTCTTTTCACATAACTTATTCTCTTGTTGAAGGCAGTAAAGACATTGATGTGGAGTACTGATGATTTTCTTCATAAGAAATGTCATTATGATGACTTCTCAATTGAACTAATAAATAAATTTTCATTTTCAATATTATTAAATAACTTGCTTTCACTGTTTAGAAATTTGGATTGCCTTTCCCAACATAAATGTCTAAAGTCCTTTCCAATCTTTTGATTCTTACAATATAAATCTACTAAAATTCAAACTACATATTTTCAATCATAGTAAAAAATCTTAGAAAATATAGCAATATTGCATAGTTTTGAAAATCTGTAAGACTTTTTTTTAATACCAAAGTAGTCTTTAAAAGTATTAATATATTATTCGTTTTAAGT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