Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_32486 LG9 19622315 19629389 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108336080
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 19626865 stop_gained p.Lys347*
A/G 19626945 missense_variant p.Met320Thr
C/T 19626948 missense_variant p.Arg319Lys
C/T 19627417 intron_variant
A/T 19627748 intron_variant
A/G 19628614 upstream_gene_variant
A/G 19628616 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32486.1
MTPRVDDFGNLSSTDDDDDDDGFKDDMAALSRACRIVVPGAKDNSAAEDGVSSEDPPIDASTATVSVATDSDSDGQDDLECLKRVQSLYQPLSVLPPLAPLALSDDDDDLDDLETVRAIMRRFGDYNEGLHEDGKKVLVEEDQTSSMGCEGDVANGSTHNESDGGKLYPISQDPKEAATEELIENIEMQLSEFVESSEPDAGESSRLPQKRLSFPPVVQCFIDAIKKNRDLQRFLRGKLIELEAKIEENKKIRNRIKILKDFQASCNRRTGNVLSLKKDPRVQLISAKKSSVPKKYKKQKRVPAMCYGPEENSHAANYRMVLERFPLSLDRKKWSKVERDNLLKGIKQQFQEMVLQLSLSIDRTSSEELLREADDMDNIIASVKDLEVTPERIRKFLPKVNWDMIASMYVGGRTGAECESRWLNYEDPLINQGAWTKEEDKSLLLIVQDTGIRNWFEIAASLGTSRTPFQCLSRFQRSLNPSMLNSEWTEEEDAQLYSAVTYFGDGNWQYVASVLERRTGTQCSNRWKKSLCPEKKGSFTQEEDMRLTVAVMLFGRKWNQIAKYVPGRIQSQCRDRYLNSLDPSLKWGGWTEEEDLRLEAAIAKHGYCWSKIAEEVPPRTDSQCRKRWKVLCPEQVPLLQEARKKQRSIISCNFVDRESERPTITLDDFMPLIALAPKSDIGASKLPKKRKSSNVSKKTSSKKRAKRTRRCAKEVQDTEVYNDDEFYAESACSDLPKKNTRSKRHAKRSKICPQELVDISCSDKVETCIEGSENQSTCIANSENQDWDSMTLSSFIRNKSNEILSRFTKKLSQTSFSSRITDVPEQVESQNPSHDQSGSSESCDTVGTINLFVPPNIVSDGRVRNREDTNALTGDDNDDHMTLASFLGNKPKKKCQPKGHHVCSSKLKTGSALLNEEHCASKPTIISDDSGSMSYHVEAMETVLHVCVDKPMDTIVEEKDDELFTSHVQNRPRRERKRPSRFL*


CDS Sequence:
>Vu_32486.1
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Promoter Sequence:
>Vu_32486::LG9:19629389-19631389(-)
AACACAACCCTACCCTTCAACACAACACACATAACCTTAAGAATAATCTTCTCTTTCCTATCTTCTGTACACTTTACTCAACCCAAACTCCTCTTCTAGTTCAAAACACAATCCATATCACACCACCCAAGGCTCTCCTCATAACCACAACCAACATCTATTGCCTCTCCAAAGGCAAACACATATAAAGAATCAAAGTTGTGTTTCCAAGTTTTAAACATGTTTTCCAAACAATTACAAGTATTAGGATACCAATTTAGTCATTTGGAAATGACTTGATACACATATATCAAGAATTAAAGTTGTTGATTTTCTGGTACGGTGCTGAAGGGCTTGGAGTGGCGTTGAGAAGGCCATTGGACTACAAAATGTTGAGTGTTGCAAAAATAGTGAGCTCTTTGTGTTATGAACGCTGGGGTACTCTGAGTTGTTGAGCATTGTGTTGTTTGTTTGGGGACGTTGAGTGGTAAGAAGTAGTGTTGAGCGTCACTTCTGTGTTGCAGGTCTGGGCTTTTGTTTCTCTTATTTCGCTGGGCGGGTGACTTGCTCGCTAGGCCTGAGTCTAGTATAGGGAAGTTTTGGGTTTTTCTTTAAGTTTTATGTATGTTTGTTTAGAATGTTTTATATAGATTAATCATATTGTTGTGGATATTGTATATGTTAATGGTTGATGAATATGGTGATGTGTATGATGATATTTCAAGTATGATATAAAATAATAATGAAATATGGTTGTTGGTATGGTATCAATGTTTGGCTTAATTCCTTGGACCTCATGGTGAGACTCTATGGTGGTGTTTAGTAGTGTGTTGTATTGAAGTAAAGACTCAGTCTTGAAAGTTATCCTGAGACTCCATTAATCATCCTATCTCAAGTAAAGAATGAGGGTTATGTGGTAAGGAGTAGTAGAAGGTCCTAGTCTATGGTTTGATTCTTTGCCATAAGTGGTAAACAGACTAACCTTGTGTGGTAACTTTGGGAAGCCGACTATTCCACAACTACAAGTGTATAACTTACCATAGTTTGACTTTAGTATACACATCTAGATGGTTAGGTCTAAATGTTATGAATTTGGTTAAGTTTTGTTTTGGATTAAGAATGAAATTATTATGTATGGTTGAATTAAATTGTGATTGTTTCCTTATAAAAGTTAGTTTACCCATCTATTTTTTTTATGTTCACTTGTAGTTCTTTTTTGTAATAACTACCTGATTGATGTGAGCAAATGATGATGTTTCAATGGAGCACGTACTAGGTGGCGTTATAAATAATAAGATTAGTTCTTATGTATATTTGAAGTTTTGAAAAAATAATTCGAAAAGTTTATTTTATTTATAGGTATTTTTGGTTTTCAAAACTCGTTATATATAAAAATTGGTTTTGTGGTTATGTTTGAATAATTGTAATGTTCTTGTTTATTAAATATGTGATTATTTTATAATAGGAAAATGACACTTGAACAACCATTTTTGACAACATTTAGACACGCGCACACGTGTCAAAATCTGAGTGGTCCATTTTCATTTAATTTTTCCAACTGGACCACTCAGATTTTGACACGTGTGCGCGTGTCTAAATGTTGTCAAAAATGGTTGTTCAAGTATTATTTTCCTTTATAATAATGTTAAAATTATTAAAATATTCAGAGAATTTTCTTTTTTAAATTAAATTTTTAATTTAAAAATATGTATTTTAAAATTTAAATTTACTAAAAGAAATAGTAGTCAAATTTAAGTATTCAAATAATATTTAGATGTATATAATATGTATGAAGAAAAATAATTAATTTTTTTATTTGTTTAAATAAATTTTAAATGTTTTTACTTTAATTATTTAAAATACCTTTTAAAATTTTTTAAATTTTAATTTATTCATTCAAATAACTCCTTTTATCTCAAAAAAAAGAAAAATTAAATTTACTAAATAAATAAATTACTTTCATGAAAATGATTATAATAGGATTTGATTATTTTTAGAATAATTTAATCAGTGCAGCGGGA


Gene Sequence:
>Vu_32486(-)
AATTCAGAAGAACCCTTGCGTGAAATCCAAATTCAGAGTGAAATTCGGAAGAAACCTTGGTGAATTCAGAAGAAATCCCAATCTAATGACTCCTCGCGTCGACGATTTCGGCAATCTCTCCTCCACCGATGATGACGACGATGACGACGGCTTCAAGGACGATATGGCCGCGCTCTCCCGAGCCTGCAGGATTGTTGTCCCAGGCGCCAAAGATAATTCTGCCGCCGAAGACGGAGTTTCGTCGGAGGACCCGCCCATTGACGCCAGCACCGCCACTGTTTCGGTTGCCACCGACTCGGACTCAGACGGCCAGGACGACCTTGAATGTCTCAAGAGAGTGCAGAGCCTCTACCAGCCTCTATCCGTTCTTCCGCCGCTTGCGCCGTTGGCCTTGTCTGACGATGACGACGACTTGGATGACCTCGAGACGGTGCGCGCCATCATGAGAAGGTTTGGCGACTACAACGAAGGTATTTGAGCTTCCTATGTGCGTTCTCGCTGTTGAATTTTGATTCCGAATACGGTAGTAGTTCTTGTGGGATTCCAGTATGAGAGAGATCCCAAATTCAATCCATCCATGTTTCCCTCTGTTGCAATGCAAACTTTATAATAACTAATTCATCATATAAAATCTCTCATCATTGAATTCGGTTTTGTTACATAGTTTAGATGACTTAGGATTAAACTTTCTGAGATTATGGGCCTAACTTAACTCATTGTTCAAAACCCTTGTATTTAGCGTTATAAGCACTTATCAGGCACTATTTCTAGTTTCTAATCAATGCCGGACCTCAGTTTTCCCTAATAAGGACATACTACTTCTAGTCAACTGGGACTTGGTGTTTTACCTTATAATGTTTGTATATTCTCTTAATTGTCTTGTTACCAGTTCTACTTTAGCTTTTGTAACAAACTTGGCATGGTAACAATATCAGGTTTGCATGAAGATGGAAAGAAAGTGTTGGTTGAGGAGGATCAGACCTCCAGCATGGGCTGTGAGGGTGACGTTGCTAATGGCTCAACACATAACGAATCAGATGGTGGTAAATTATATCCTATTTCTCAAGATCCTAAAGAGGCTGCCACAGAGGAGTTGATTGAAAACATTGAAATGCAGCTTAGTGAATTTGTTGAGAGTTCTGAACCCGATGCAGGGGAGTCATCTAGATTACCACAGAAAAGATTGAGCTTTCCTCCTGTTGTTCAGTGCTTTATTGATGCCATTAAGAAAAATAGGGATTTGCAGAGATTTCTTAGAGGTAAGTTAATTGAGCTTGAGGCTAAAATTGAGGAAAACAAAAAGATAAGGAATAGAATCAAAATTCTTAAGGACTTCCAGGCTTCGTGCAATAGAAGAACAGGGAATGTGTTATCACTGAAAAAAGATCCACGTGTTCAATTAATATCTGCAAAAAAGTCTTCTGTTCCAAAGAAATATAAGGTTAGTTGTGTGATGCTTTTACAGTTTACTGAAGTCTGAATTATTATTTATACTATTTCATTATGAAATAATGGTACCAGTCATTTATAAGTGGATACTGTTCAAGATTCTCTTTCACCTGAAACTTAATTTTTTAATTACGAGAACTATAGATGTTATCTGTTTCATACAGTTTAATGAGTTTGAATGGTAATATGAAGTAGGTATGGAGACATAGGGTTCTCTCCTGTGAAAACCTAGATACTTGAAAACATGGGTAATATAAAAATGGAATGGAGAGGAAAGGTTCTTAAAAGTTCAAGATATGGTACAGCTTATAAATGCTAACATGAATTAAAAGAAAAAAAAAACTACATCATGGTTACCAATCTCAAGTAGTAGCATGTGGCAGTCATTTTTGAAGATACTATAGTGGGAAACAGGGATAACACAGACTAAATAATTTATAGTACACATATACTAAAGAAATACACAAATAAAGGAATTCATGGTAAAAAAAACATTGGTGGCCTTCAAAAAATGAAAACTGGTGGTGAAATTTGTTGAAAAAAACATTGAAAATTAGAGAAAAAAATAGCAAAATTTGAACTGGAAAGTCCAATAGAAGAATGGAGTACAGGAAAAAAAAGATAATCCTGTAACATTTGAAGGAACATAGGTTAAAACAGAGGTAGTTCTTTTGTGGAATGGTTAAAAATCCTTGTGTTTCTGGAGAAAAAAATGCTTTAGAAAATTAGCGAGAAATCACAATTTTACTCCCAAAACCCTAAACAAAAGTTTCAGTGTAAAGCTTGGTTTCAAAAGCATGTAGGTAGTTTAGTTGTAATCTATTTAGTGGCTGGTATCATAGCATTTGTGAGCTTAGTATGTCAGAGTGTCAATTGTCACTGATTAATTTTAATATCGGCAATCCTTGATTTAACTCTTTCCTGGCAGAAGCAAAAAAGGGTACCTGCAATGTGTTATGGCCCAGAAGAAAATTCTCATGCCGCTAATTATAGAATGGTATTGGAAAGATTTCCACTTTCATTAGATCGGAAAAAATGGTCCAAGGTAGAAAGGGACAATCTTTTGAAGGGAATTAAGCAACAGTTCCAAGAAATGGTGCTTCAACTCTCACTTTCAATTGATAGAACTAGGTAATATCAATTCTATTTTGTCCTATGTTACTGAATCACTAACTGCTGCTGGACCAATGTGACCCTTCCCCTGTTGTGTTTTGAATTTTCCCTTGATGCACCTCCTCCTTTACAGTTCAGAGGAATTGCTTCGGGAGGCAGATGACATGGATAATATAATTGCATCTGTTAAAGATCTTGAAGTCACACCAGAGAGGATTAGAAAATTTTTACCTAAAGTTAATTGGGATATGATAGCTTCCATGTATGTTGGTGGCCGTACTGGTGCTGAATGTGAATCAAGGTATATAATTTGTAATTCGTGACCTTTTCATTTATGTTTTCGTGTGCATGAAAAGTTTGATCTTTTCTATGATAAAGTATTTTATGTTTCTGATATTGGTGAACTGGTGCTGAATTTTAATCAAAGTATAATTTTACTAATTGGTGAAGTTTTCTTGTGTGTTTGTATGCATGAAAAGGTGGTTCTTGCTTATTATAAAGTGTTTTATTTTACTGTTATTGTGCTATACTCGTGCTTCATATTTGTTCTAGCTATCTACATTGGTACTGCTTTATTGATACATTGTGGATTGAACGTTTTCAAATTATTTCTATGAACATATATAAGAGCTGCTAACATTGATCTTTAATGAAGTAGGTGAAAGAATAGATTAAGGTAGTATTATGATTTAGTAGAATCATGTTTTGGTGGGTTTGGGGACAACAAATTGACAAAGCGCAATCCCTTTAAATAGGGTCAGCTTGTGATGAAATTATGTAGCTTCCGTATACAACTTGTTTCTTCGGGTTGGGTATTAAAATGCTCTATCAATAATAATTTATCACTGGGGGGATGATCAACTTCTCTCTTAGTTGCATTGTAGATTTGATTAGCTGCTTAATTATAACCTGTGCTGTATCCTTAGTCTTGTCCATACAGTTCTTTGACTACTGTTTCACGTTTATTGCCTTTCCATGAAGAATATTTTTCCACTACATTGCAGACACCTATGACTATCACCATCAGAGTCAGTTTGACATTTTTGGCTTTCAGTAGGAGTTCAAGATCAACACATCATGTAGGTGGGGTTGTACATGGAATGATGTTAACATGGTTGTTCTTAATATGTCTGTGATGGTTGTCACTATCACAGATGTCTGTTATGTAGACCATAGAATAATTTCTATATGTATGAATGGTTGGATTCCATACTTTTGATTCACTGTATTTTAATGGTTTGCAACCACAGGTGGTTGAATTATGAAGATCCTTTGATCAACCAAGGTGCGTGGACTAAGGAAGAGGACAAGTCCCTTTTACTTATTGTACAAGATACAGGTATCAGGAATTGGTTCGAAATTGCTGCATCATTGGGCACAAGCAGGACTCCATTTCAATGCTTGTCACGATTCCAAAGGAGCTTAAATCCTTCCATGCTAAATAGTGAATGGACTGAGGAAGAAGATGCTCAACTCTATTCTGCTGTGACGTATTTTGGTGATGGCAATTGGCAGTATGTGGCTTCTGTTTTAGAACGGCGGACAGGAACCCAATGCTCAAATAGGTTGGTTAGCTATTTAAATTTTGTTCTATATTTGTAATTTAATTTGTGTATGGTTGCAAGACCATTATCGAAATCAAATAATCTTTGACGGTAGGCTTTCACCCTACTTAAGAAAATAAGGTACATTTTATGTGTAGTTCACAGTTTGCTTTGGAATCATCTTTTAAGCTGTTATCATGTGGCCTTGATGATCTGTGGTGATTGTCAAATTCAATTATTTTATTTCAGTTCAGTATAGTTCGAACCATTATAGCTAATTTGTTTATGCAGTATTGTTGAAAAGTGGAAGGTTGAGAAAGGAAGTATTTATTCTTCTGTAGGGTGAGGTAAGATTGGGCATTTGTTTAGTGACATAAAACAATAATACCCTACCCTGTTGTTTTAGTCAGTACTAGGTAATTTACAACAACCCTATTTCAACTGGGAGAGAATTCCCAGTTACATCTTTAGGATTGTGATATTTTATGTATGTCTGGAGGTTGAATTATATAGAAATGCAAATGATGGCATCCTCATATTTAACCTTTGAAGAAGTGCGTTACTTTCGTACCTTGTTTCTCACAATTCATCATAGGTCCCCATCTAAATTTGCTAAGTGATTTGCTTTGATATCTTCATCACAGGAAAACAAGAATATATCTATTCAGAATAGTTCGAGACTCTGTTTATTTATTTCCTTTGTTTCTCTTACCGGTTGCTTTATGTTAAAAACAAAAAGAAACATAATATTGAAAATGAAATGACACTGTTTCAAGAAAATATGGTCATTGATATTAAAAGGTTAAATATGTGCAATTGTGTCTGGTCAATAAATTAACATCAAGTTAAGTTTATTGGAGAACTAGAGTTTATTGGTGGCTGCATTTTGTATGT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