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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_32474 LG9 19515787 19521390 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 19517726 intron_variant
A/G 19517904 intron_variant
C/G,* 19517934 intron_variant
C/T 19518427 synonymous_variant p.Thr208Thr
T/C 19518889 intron_variant
C/T 19518894 intron_variant
G/A 19518900 intron_variant
C/T 19518920 intron_variant
C/T 19518950 intron_variant
C/T 19518954 intron_variant
G/C 19518960 intron_variant
C/A 19518978 intron_variant
G/A 19518995 intron_variant
G/A 19519007 intron_variant
T/C 19519064 intron_variant
C/T 19519099 intron_variant
G/A 19519103 intron_variant
C/T 19519120 intron_variant
T/C 19519129 intron_variant
T/C 19519136 intron_variant
G/A 19520134 intron_variant
C/T 19520345 missense_variant p.Ser429Leu
G/A 19520771 synonymous_variant p.Ser543Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_32474.1
MGCISSKNVVAKTYSPSPTMVEISEPIRASSRGHSGLTILDSKGNVDNERNNNSKIKKISSKKSNGSFSLRHGLVHRNVEAEQNAVGWPPWLTAVAAEAIQGWIPLKADSFQKLEKIGQGTYSSVFRAREVETGKLFALKKVRFDNFQPESIRFMAREITILRRLDHPNIMKLEGIITSRLSNSIYLVFEYMEHDLAGLVSRPEIVFTESQIKCYMRQLLSGLEHCHMRGVMHRDIKVSNILLNNEGVLKIGDFGLANTISTSNKNPLTSRVVTLWYRPPELLMGSTSYGVSVDLWSVGCVFAELFLGKPILKGRTEVEQLHKIFKLCGSPPEEFWKKTKLPHATMFKPQTNYESSLRERCADFPESAIDLLETLLSIDASNRGTSSSALMSEYFNTKPYACNPSNLPRYPPSKEMDVKVQEDSSRKKIEGKVREVATSRRQPRRATKLLHDPNNFGKSSSKENMQNTSQNGHKDDGKTHLTKGRGGGMYKDHAKPAMDTMSETSQMMNVVNGNGYSVPIQVSGSTNDYTWVKRRKQDASSTLSDGSKSKISALDTNFAKGTYDLSNQRVSMDFDPAELVNAQGRRENDVQRAIRKSRFGRGK*


CDS Sequence:
>Vu_32474.1
ATGGGTTGCATTAGCTCCAAGAATGTGGTCGCCAAAACTTATTCTCCATCCCCTACAATGGTGGAAATTTCAGAGCCGATTCGCGCTTCCAGCAGGGGCCATTCTGGATTGACGATTTTGGATTCTAAAGGAAATGTAGACAATGAGAGAAACAACAACAGCAAGATTAAGAAGATTAGTTCAAAGAAGAGTAATGGGTCTTTTAGCTTACGGCATGGGTTGGTTCACAGAAACGTGGAGGCTGAACAAAATGCTGTTGGTTGGCCGCCATGGCTCACTGCTGTTGCAGCAGAAGCCATTCAAGGATGGATCCCTCTCAAAGCAGATTCTTTTCAAAAGTTAGAAAAGATTGGACAAGGTACATATAGTAGTGTGTTTCGAGCTCGTGAAGTTGAAACTGGGAAGCTATTTGCTTTGAAAAAAGTGCGTTTTGACAATTTTCAACCGGAGAGTATTAGGTTTATGGCAAGAGAAATAACCATCCTTCGAAGGCTTGACCACCCAAACATCATGAAATTGGAGGGCATAATCACTTCTCGCCTATCAAACAGCATATACCTCGTATTTGAATACATGGAACATGATCTTGCTGGCCTAGTATCACGTCCTGAGATAGTATTCACCGAATCACAGATAAAATGTTACATGAGGCAACTTTTAAGTGGACTCGAGCATTGTCATATGCGTGGTGTTATGCACAGAGACATCAAAGTATCAAATATCTTATTAAACAATGAAGGTGTTCTCAAGATAGGAGATTTTGGATTAGCAAATACAATTAGTACAAGTAACAAAAATCCTTTGACAAGTCGTGTCGTGACTTTGTGGTATCGTCCTCCTGAGCTATTGATGGGATCGACTAGCTATGGAGTGTCAGTAGATCTATGGAGTGTTGGTTGTGTATTTGCAGAACTTTTTCTTGGGAAGCCTATCCTTAAAGGAAGAACTGAGGTTGAACAATTGCACAAAATTTTTAAGTTGTGTGGTTCTCCACCTGAGGAGTTCTGGAAAAAGACCAAACTTCCTCATGCAACCATGTTTAAGCCTCAAACAAATTATGAAAGCTCTCTTCGAGAAAGATGTGCAGATTTTCCTGAAAGTGCTATAGACCTACTTGAGACTTTATTATCCATCGATGCAAGCAACCGAGGAACTTCCTCGTCTGCCTTAATGTCTGAGTACTTTAACACTAAGCCATACGCTTGTAACCCATCAAATCTCCCAAGATACCCACCAAGCAAAGAAATGGATGTAAAAGTTCAAGAAGATTCATCCAGGAAAAAAATCGAAGGTAAAGTGAGAGAGGTTGCAACATCAAGAAGACAACCAAGACGAGCCACTAAACTTTTGCATGATCCAAACAATTTTGGTAAATCAAGTTCAAAAGAGAACATGCAAAACACTTCTCAAAATGGGCATAAAGATGATGGTAAAACACATCTTACAAAAGGAAGAGGAGGAGGGATGTACAAAGATCATGCAAAGCCTGCCATGGATACCATGTCTGAGACCTCCCAAATGATGAATGTTGTTAATGGTAATGGATACAGTGTGCCAATACAAGTCTCAGGATCTACGAATGATTATACATGGGTCAAAAGAAGAAAACAAGATGCATCATCAACTCTATCGGATGGATCAAAAAGCAAAATTAGTGCACTAGATACCAACTTTGCCAAAGGAACATATGATTTATCTAACCAAAGGGTTTCCATGGATTTTGATCCTGCTGAATTGGTGAATGCTCAGGGTCGTAGAGAAAATGATGTACAACGTGCAATTCGTAAATCAAGGTTTGGAAGAGGTAAATAA


Promoter Sequence:
>Vu_32474::LG9:19513787-19515787(+)
AATTAATATTTTTCAAATGTTGCTAGAATTGTTTGTGTTCTTTATATAGAGGGATGCGTGTTGGGTGTTGGTTGTTATGTTCATATATTTATGGTTTAATTGCTTCCTTTGTCCCCAGTTTGGTTGAATTGTGTCAAATTCATCCTCATTTTTAAAAAAGTTTCATTGTCGTCCTCACGTGGTGTAAAAGTTTCATTGTCGTCCTCACGTGGTGTAAAAGTGTCAATTGAATCCAAACATAGAAAAAATTTGTGTCAAAGTAGTCATTTTTCCTATATCTCTGTGTCTTCCTTTCATACAATCAAGTACAGATATTCATTTTACCTTATCCAATTTAAGGCTTTTCATAGCTCCAGAGAAGTGACATATGAAAGGAAGACACAGATATATAGGAAAAATGACTACTTTGACACAAATTTTTTCTATGTTTGGATTCAATTGACACTTTTATAGCACGTGAGGACGACAATGAAACTTTTTTAAAAATGAGGATGAATTTGACACAATTCAACCAAACTGGGGACAAAGGAAGCAATTAAACCTATATTTATTTATTTTGGGTAAATGTATTTTACTAAATATGTATTGGTAAAAACAAACCAAGTGTGACTTAGATTACAAACTACTTAATATTGGTTGTTTTAACTAATGAAAAATAATTTAATGTATCTCATAGAAGGTTCTAATTGATGTACTAATAACTCTCTTAAATAGAACATAGTTTAGAAGGTTCATAATTACAAATGGTATGATTAATTTAATTAATTAATTATATTTGTAAGCGGCCAAACTTTTCATTAAGAAAGATCTGATGCTTATATTAAACCATTCATATGTCAACATATATTATTATTAATATTATTTCTTAAAACATATAATCTCTAAATAATGGAAAAATATATCTTTTTATAAATTTATCGTGTAAAATAAAATAAAACATTATTTCAAAACTTTAGTTAACTCACTTTTTTTATTGTTTGATGAATAAATGGAAAGTAATGGTTTTCGTTATATTAATATTATTAGTATTCAAATATTGTACTACTTTGGTTTCATTTAAAATGTTTATTGAATATAAATTTAATTTGACTTACCACTATTCTTTATTTTCAATAGGGAATTTATTTATAATATATTGATAATAAAAAAAACTAGTTTATTTATAAATAAAGTTATTTTATGATTATAGTTATATTTTATTTATTAACTCTATAATAATATTTTTTTTTTTAAATAAATTAAATATTGATTCAACATACTTTATAGTTTTAATTTTACAGTATAATTTAGGAATAATGTGTTATTTGCAACAACAAAAAATAAGAATAAAAGCTAGTTTTCATTTTATCATATCCATGTTTGTAATGAAGTGATTCTTAACCACTTTACCATGACATGTTATATATTATACCTTAGTATCATATTTTCTCTCTTCTTATTTAATAAAATGATATCCATTTTTGTTTTCTATAGTTTTCAACAACCAAAATGCAGACTCAATTCTGACCCATGAGTTTCTAATTCTCTCCTTAAAATTCCTCCAACCCCTTATTCCTTCCGAAATCAATGGAAGACAGAGAGAGAACAGGGGAGGAGAGAGAAAATTTGGTGAAGGAGGGGGTCGTTCGTTTCCTTGTTCTATTCCACAACAAAGCTACCATTTTTCCATGTGCGTCTCGCACACCCTCTTGGGAAAACCCAAAGGGTTGCATTGAATTATATAGAACAAAGACGAAGAGACTCAAAATCAGGGAAGAGGAGAAAAGAAAACCGACAAGAACAACAACAAAGGAGGAGGAACAAAGAACAAAGTTGTTGTTTTTGTCGAATTCGAAATGCCCCTGTTTTCTGGTTTTTCTCATCTCCCTGTATTCTGAGCTCCTCTGTTCTGGGTGTAGCAACCACATTGGAGGTGTTGATGTAGGGGAAATTCTCCCCTACAATCGCCATCGTCCATTTTCTTCTTTCTCTTCGTCGTGATCATCTTCTTCTTGATCAAA


Gene Sequence:
>Vu_32474(+)
ATGGGTTGCATTAGCTCCAAGAATGTGGTCGCCAAAACTTATTCTCCATCCCCTACAATGGTGGAAATTTCAGAGCCGATTCGCGCTTCCAGCAGGGGCCATTCTGGATTGACGATTTTGGATTCTAAAGGAAATGTAGACAATGAGAGAAACAACAACAGCAAGATTAAGAAGATTAGTTCAAAGAAGAGTAATGGGTCTTTTAGCTTACGGCATGGGTTGGTTCACAGAAACGTGGAGGCTGAACAAAATGCTGTTGGTTGGCCGCCATGGCTCACTGCTGTTGCAGCAGAAGCCATTCAAGGATGGATCCCTCTCAAAGCAGATTCTTTTCAAAAGTTAGAAAAGGTAACAATAATCATAATCATAATCATAATAACATGTGTAGTGTTTATGTTTCTTATGTTATTTTGTTCTTTTTCATGTTCAATCCCTAAAGTTTATGTGGATAATCAATCTAGTTAATATAGGTTATGATAAAAGTAATCATAAATTACTCTCATATGGAACTTCAATTCTAATAGGAATCCAACACCAAAAGTTATATTTAAATTTTATCTATGAAAAACACAATTTGGAAAATTTTGTGATTTGTTGTCATCTAATTTTTACTATAAAATCAGCTTTTAGAGTTTGGTTGTTTGGTAAGATAGAAGAAAAATAACCAATAAGATAATTTTTTTATTTAAATTAAATAGAGGGTGGAAAGAAGAAAAATAATTAAGAGTAGGTTTTATTTTTCATAGGTTTTGAAATAAACAAATAAATAGACTTGTTTGATAAGTGGAAATATTTTTATCATAATTTTGTTCTTATGTTTAGTTTTGAAAAGTTGTAAAGTTTAGACATTATGACATAACTCATCGAGAAGTGATATGTTTTCAAAGGTCTAAGTAAAAAGACTTTATTGTTTATCTTTTTACTATGTCATCGTTTTAATTAATTATTTAGAGGGACCTTTAAAACCTCTTCAACAGTTTCCATTGATAAATGAAAAGAACAACATCTTTAAGTTTTTTTTTTATCCTTTTATTTCTTTTAAAATATTTGAAAACAATTATTGTATTTTCAATAAAATTCATATTGTAAATTAATTTATAATTAAATAATAATTGTTTAAGAAAATAATTTTAAAAAAATCAATCAAATAAAATTTTCTTTCATTTTCTTGTCGTCTCCCACCAAAGAAAAATAAATAAATAATTAATGTATTTTGGTTGCTATTTTCTTCATCTTCATTTTCTTTCATTAATTAAACATAATTATATTGTGAAAGTTATCAAGGTCAAACTTTTAATATTGAATATTGATATTTCTTAATATTATAACATTTTACATTAACATTTGTAACATTAGTCATTGAATTAATATTATATTGTATTACATTTAATAGAAAAAAGGTAATATTAAAACTAAATAAAGTAGAGTACTTTTAATCATGAAAATTGTTATGATGACATTTATCATAGCAAGAAAATTTATCAGTAATAAAGGAGTAATGTAAAAATTAGATAAATTGCTAAATTAATATTTGAATATGCATGTTGTGGACAATTTAGTCCTTGAATGAAAAAAAAATTAAATAACCCTCACATGTTGATGACCACATAGGAGAACATCATGAAGGACTAATTTTTTTTATGTGGGATGCTATTTTTTTTCCGAGGCATTATTTATTTATTGTTGTGTATGTTTGGAACTCAAATTTAGGAAAATCTAAAAGTAAAAGAAAAATGTGAAGGCTTGTTTTAGTGACTTTGAATGACACTCGTCATTGATAATTAAAGTGTTCAAACCTTAATAATCTTTGGATTGTTATGACAAAGTTGTTAGAAAGTTTCCTATTTTGTAGACTAATTATGAATTTTCCTTATTAAAGGATGAAAGTATTTGCAAGACACACATTTGAAGGCAAAATTGATTATTTACCCTATCAAAAATCAACTAACATACTAGTATTTGATATTTATTATATAGTTTATCTACATGAAAATTTAAAATTTCAACTAAAGGATTATAGGTTAGTGTTGACATTTATTACTTATTGTAACATTTTATTTTGACATCACATAAACCATGCATTGAGATAAAGTTTCAATTTTATCATAAAAGTAATTAAAAATCAATTGAAGTGTTATTCTTTAGTTCATGTAATAGTTGTTGCTTGTTGTATTGTTACATTTAAAGTTTTCCCCCACAATATTCTTTTTTATTCCTAATATGTTATTTTAAAATTAATATGAATTATGATATTATTTAACATTTAAGTTTAGAAAATAAATATTTTATGAGTATATATAGTTGTTATAATCTATTAAGATATTTTGAACTAATAATTATATACATATATATTAATTTTTAATAGATTGGACAAGGTACATATAGTAGTGTGTTTCGAGCTCGTGAAGTTGAAACTGGGAAGCTATTTGCTTTGAAAAAAGTGCGTTTTGACAATTTTCAACCGGAGAGTATTAGGTTTATGGCAAGAGAAATAACCATCCTTCGAAGGCTTGACCACCCAAACATCATGAAATTGGAGGGCATAATCACTTCTCGCCTATCAAACAGCATATACCTCGTATTTGAATACATGGAACATGATCTTGCTGGCCTAGTATCACGTCCTGAGATAGTATTCACCGAATCACAGGTTCGTTTACATCTTTCAACTATTTTTAAAACTCGTGTGTCGTTCCTAATATAAATTTGAATGAGGTTTACATTTGTGTGTAATGTTTCCTTTCCATAGATAAAATGTTACATGAGGCAACTTTTAAGTGGACTCGAGCATTGTCATATGCGTGGTGTTATGCACAGAGACATCAAAGTATCAAATATCTTATTAAACAATGAAGGTGTTCTCAAGATAGGAGATTTTGGATTAGCAAATACAATTAGTACAAGTAACAAAAATCCTTTGACAAGTCGTGTCGTGACTTTGTGGTATCGTCCTCCTGAGCTATTGATGGGATCGACTAGCTATGGAGTGTCAGTAGATCTATGGAGTGTTGGTTGTGTATTTGCAGAACTTTTTCTTGGGAAGCCTATCCTTAAAGGAAGAACTGAGGTAATTTTAATAAGGGTTAAATATGTTTTTAGTCCTTAAACTATTGGCCGTTTCTGGTTTTCGTCCCTCTTTCAAAGTAAGGTACAATTTGGTCCTCATTCTTTTCGAAACGTTCGTTTTAGTCCTCGAAAACTAAACACTGTTTAAAAATTTGGTCCTCATTTAGCAACAAATGAGGACTAAAACCAAAATTCTGAGGACTAAAACGAATGTTTCGAAAAGAATGAGGACCAAATTGTACCTTACTTTGAAAGAGGGACGAAAAGCAGAAACGGTCAATAGTTTAGGGACTAAAAACATATTTAATCCTTTTAATAATTGATATGTATGTTATGTATAATTTATCTTTAGTTTGAATATGTTTTTTTGTTTATAAACTATTCTCATAAATTGTATTTCTTGAGTGTATAGGTTGAACAATTGCACAAAATTTTTAAGTTGTGTGGTTCTCCACCTGAGGAGTTCTGGAAAAAGACCAAACTTCCTCATGCAACCATGTTTAAGCCTCAAACAAATTATGAAAGCTCTCTTCGAGAAAGATGTGCAGATTTTCCTGAAAGTGCTATAGACCTACTTGAGACTTTATTATCCATCGATGCAAGCAACCGAGGAACTTCCTCGTCTGCCTTAATGTCTGAGGTAAACATTTCATTGATTTGGACTTTTCTATAATGTATTCTTCATTTTTTAGAAAAATTCTTGTTTTAATCCTATATTGTAAGAAATAGTTGATGTTTTATGCATATGACTTCGTAATTATTTTGCTAGAAATGTTAATTTATTAGGATGTTTGTTTAATGTGGACCAATCATATATGACTAACTTGAATTTCTAATTTTCTTTTCTTTGTATATTCTTTATAGTACTTTAACACTAAGCCATACGCTTGTAACCCATCAAATCTCCCAAGATACCCACCAAGCAAAGAAATGGATGTAAAAGTTCAAGAAGATTCATCCAGGTACACTATTGTGGTATTTCTTGTTTATGAAAGGATAATTAGTCAGTTTAGTAGAATAAATATTGACATATTTCATTTTCAGTATAATAAAACAATATTGTCTTGGTATAAAAACTTTAATTCTATTAACTTTGTTTGAACTCCACTAGTGTTATTTAAACACATGTTTGATCTATAATAATTGTTACATATGTTTATTAAAAGAAAATACGACACTGATAAGCAATTAATCTTGAAGGAACTTTTAAATTTTGCTTTTGTAAATTTGAAATCCTTAGAGATTTTTTTCTAATACATGTTTAGTGTTAATTTTCGTTATGATATACACATGATAATTACTAAAGACAGAATACATGTTTAATTCAAACAAAATTCACAAAATTAAAAAAATTTATACTAAGATTTTAATTTTTTTTATTGTATTAAAAATGAAATATGTAAATATTTGTTGTATTGAATTGATTATTTAATCTTCATAAAACATCTCATTTTTAGGACTAACTCTTGATCCTTACTCTTAGGAAAAAAATCGAAGGTAAAGTGAGAGAGGTTGCAACATCAAGAAGACAACCAAGACGAGCCACTAAACTTTTGCATGATCCAAACAATTTTGGTAAATCAAGTTCAAAAGAGGTACTATTTTTTCAATGGAATATTACTACACGGCTTAAATATCATCATTTTTACAATACTTATCTTGTGTTCTTTGTGTAGAACATGCAAAACACTTCTCAAAATGGGCATAAAGATGATGGTAAAACACATCTTACAAAAGGAAGAGGAGGAGGGATGTACAAAGATCATGCAAAGCCTGCCATGGATACCATGTCTGAGACCTCCCAAATGATGAATGTTGTTAATGGTAATGGATACAGTGTGCCAATACAAGTCTCAGGATCTACGAATGATTATACATGGGTCAAAAGAAGAAAACAAGATGCATCATCAACTCTATCGGATGGATCAAAAAGCAAAATTAGTGCACTAGATACCAACTTTGCCAAAGGAACATATGATTTATCTAACCAAAGGGTTTCCATGGATTTTGATCCTGCTGAATTGGTGAATGCTCAGGTAAACATTATCCCAACTAAATATTTTAAATTATTAAGTCACAAAACCTTCAAATTTACCATTGTTACTTAAATTAATCTTAAGGTGTCAATATAAGAAGCTTGAGTTTACGTTTAATATCGAGTAATAAAAATAAATTCATTATTTTAATTTTTTTGTTAAAGGTAATGTTAATCACTAATTTCTCATTATTATTAAATTTCTCCTATCAATTTCCTTCAAAAATACTCATTAATTACTACATGGTATAATGTTATAATTGTCTTAGATGACAATCTCTAGATGACACACGAGTTTTATAATTTTGTTTTCTTGTTAGTTAAAAAAGTAAGTTAGATGTTAATTTCTATAGTGACAATGAACTTGAGTGTGCTAGCTAAATATTTGTGTATTCTATTTATATCAAATTAATTTATATGTTATATTTAACATTTTACAGGGTCGTAGAGAAAATGATGTACAACGTGCAATTCGTAAATCAAGGTTTGGAAGAGGTAAATAA

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